Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4HDU6

Protein Details
Accession A0A3N4HDU6    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-62VFFNGRKYEKTRVERRRNFEGWHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 11.5, cyto 10.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
IPR013137  Znf_TFIIB  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF00382  TFIIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51134  ZF_TFIIB  
Amino Acid Sequences MPAERRRPGQGSRVSEDDSTFTWPTTQPTQPTHEPAEYHHVFFNGRKYEKTRVERRRNFEGWIRPVTEGGPAHEANLNRVVICKDCLIVPANITSEDRDGDLVCADCGLVLDKIVSTESEWRSFANDENGVDKCRVGGGESVLFGDSKLELQTSIGPGQNDMARALERAQKNLSGKDGRKAASLAGGFSDIAAFCAKGGFPDSAKEVAQQVYKIFMDEPKRKNFPYAALLGACLVLGCRQAKFGRGFKEICLLCKCTIKEIGRAYKAVVDIIQAHEAKIQEKRAQNIHVNNTIGAYNAEQNSTSALDLIVRMTERLGLPMKVKILADQIASEEEKTIACLAGRRPSTVAASSLLMAIKFMKIDKTTIQVAEVAKISPHTLTKTYKLLNSYADKLIDAKWAKDGSGDFANLKKSDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.51
3 0.46
4 0.39
5 0.31
6 0.29
7 0.25
8 0.21
9 0.21
10 0.21
11 0.24
12 0.28
13 0.32
14 0.33
15 0.37
16 0.44
17 0.47
18 0.51
19 0.51
20 0.48
21 0.44
22 0.42
23 0.47
24 0.41
25 0.38
26 0.34
27 0.3
28 0.29
29 0.31
30 0.36
31 0.35
32 0.35
33 0.38
34 0.42
35 0.5
36 0.58
37 0.65
38 0.67
39 0.7
40 0.79
41 0.83
42 0.85
43 0.85
44 0.77
45 0.73
46 0.7
47 0.69
48 0.64
49 0.6
50 0.55
51 0.46
52 0.44
53 0.39
54 0.37
55 0.28
56 0.24
57 0.24
58 0.21
59 0.22
60 0.25
61 0.24
62 0.21
63 0.25
64 0.23
65 0.18
66 0.2
67 0.2
68 0.18
69 0.2
70 0.18
71 0.13
72 0.13
73 0.16
74 0.16
75 0.16
76 0.15
77 0.16
78 0.16
79 0.16
80 0.17
81 0.16
82 0.14
83 0.14
84 0.13
85 0.12
86 0.11
87 0.1
88 0.11
89 0.1
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.14
105 0.16
106 0.18
107 0.19
108 0.19
109 0.21
110 0.22
111 0.22
112 0.2
113 0.2
114 0.18
115 0.2
116 0.21
117 0.2
118 0.2
119 0.18
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.08
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.06
139 0.08
140 0.1
141 0.12
142 0.13
143 0.12
144 0.12
145 0.14
146 0.15
147 0.13
148 0.12
149 0.1
150 0.09
151 0.1
152 0.11
153 0.16
154 0.16
155 0.18
156 0.19
157 0.22
158 0.24
159 0.24
160 0.28
161 0.29
162 0.29
163 0.32
164 0.35
165 0.31
166 0.3
167 0.29
168 0.24
169 0.21
170 0.2
171 0.15
172 0.11
173 0.11
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.08
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.12
193 0.11
194 0.12
195 0.13
196 0.12
197 0.11
198 0.12
199 0.11
200 0.11
201 0.1
202 0.13
203 0.2
204 0.27
205 0.32
206 0.36
207 0.4
208 0.4
209 0.42
210 0.4
211 0.36
212 0.31
213 0.28
214 0.23
215 0.19
216 0.19
217 0.16
218 0.15
219 0.11
220 0.06
221 0.05
222 0.04
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.1
227 0.11
228 0.16
229 0.21
230 0.26
231 0.29
232 0.32
233 0.33
234 0.31
235 0.38
236 0.34
237 0.33
238 0.31
239 0.29
240 0.26
241 0.3
242 0.3
243 0.25
244 0.32
245 0.3
246 0.33
247 0.37
248 0.43
249 0.4
250 0.4
251 0.37
252 0.33
253 0.31
254 0.25
255 0.18
256 0.12
257 0.11
258 0.12
259 0.16
260 0.13
261 0.13
262 0.15
263 0.16
264 0.17
265 0.19
266 0.22
267 0.24
268 0.27
269 0.31
270 0.33
271 0.38
272 0.42
273 0.45
274 0.47
275 0.45
276 0.43
277 0.39
278 0.35
279 0.3
280 0.24
281 0.18
282 0.13
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.13
289 0.13
290 0.12
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.1
301 0.09
302 0.13
303 0.15
304 0.16
305 0.17
306 0.2
307 0.21
308 0.2
309 0.2
310 0.18
311 0.19
312 0.2
313 0.18
314 0.16
315 0.16
316 0.16
317 0.17
318 0.16
319 0.13
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.09
325 0.09
326 0.12
327 0.15
328 0.22
329 0.24
330 0.24
331 0.25
332 0.27
333 0.29
334 0.27
335 0.26
336 0.19
337 0.19
338 0.18
339 0.18
340 0.16
341 0.13
342 0.11
343 0.11
344 0.1
345 0.1
346 0.11
347 0.14
348 0.14
349 0.18
350 0.2
351 0.23
352 0.26
353 0.26
354 0.26
355 0.25
356 0.25
357 0.25
358 0.23
359 0.19
360 0.16
361 0.16
362 0.17
363 0.15
364 0.17
365 0.18
366 0.23
367 0.27
368 0.32
369 0.38
370 0.41
371 0.43
372 0.43
373 0.42
374 0.44
375 0.44
376 0.44
377 0.41
378 0.38
379 0.34
380 0.32
381 0.31
382 0.32
383 0.29
384 0.25
385 0.28
386 0.28
387 0.27
388 0.29
389 0.29
390 0.25
391 0.27
392 0.28
393 0.24
394 0.27
395 0.33