Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4IGU4

Protein Details
Accession A0A3N4IGU4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-80VTTPPTQSRLRPSRRNPHPKDVFHDYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
633-660RGGYGGGRGGRGGRGGGRGRGGKNNSRR
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 6.5, cyto_nucl 5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004843  Calcineurin-like_PHP_ApaH  
IPR007708  DBR1_C  
IPR041816  Dbr1_N  
IPR029052  Metallo-depent_PP-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0008419  F:RNA lariat debranching enzyme activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF05011  DBR1  
PF00149  Metallophos  
CDD cd00844  MPP_Dbr1_N  
Amino Acid Sequences MSNLSSNSRNSGFNPNKKMPVKGGTSHNPAYPKTGPKAPPKPSLTGFPFNGFPSVTTPPTQSRLRPSRRNPHPKDVFHDYDAEKPQEAMATTTSSSSACCSSGPEEPCLNYLQHGNLTIAVEGCGHGALTDIYSSIARTASIHKLKVDLLIICGDFQAIRNHNDLPCLSCPAKYRELGDFAPYYSGEKKAPITTVFIGGNHEASNYMFELFHGGWVAPKIYYLGAAGVVNFGGLRIGGISGIYKSGDYGKGCYERVPYVGGMVKSAYHIREYDVFRLFQISEPIDIGLSHDWPEGIVHFGNADALFKVKPHFRLDHENGELGSKPAWGLLRKWRPRFWFSGHMHCKFTALVEHDVLDKQEGLDGRNKPEVKNEEEIDLEMEVDDIDGKDWFEEQAKKKSPSPAKNNEEINLEMDDSSPPPSPSKSTKSEPKPTSSSEAKDPHPATPLPPVNKTTRFLALDKITAQRQFLQLLNIPLDSTTTSTTPPSSATTTKSPQQSPKLCYDPEWLSIVKTFSALIPKPQRPTQRNLEDAVKDLAANRAWVDENIVAKNLLTIPENFEITAPTQAELGPVNIYTEIQSEEQRNPQTAAFCKLLDIDNKIFSSREEKERRVQEWQRAQERERAGEGSYGGGRGGYGGGRGGRGGRGGGRGRGGKNNSRRGGECEGGFGGGYRVGGADDVRGGVMDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.6
3 0.68
4 0.69
5 0.7
6 0.65
7 0.63
8 0.6
9 0.57
10 0.6
11 0.58
12 0.63
13 0.61
14 0.59
15 0.55
16 0.5
17 0.5
18 0.47
19 0.46
20 0.44
21 0.5
22 0.53
23 0.6
24 0.69
25 0.69
26 0.73
27 0.7
28 0.71
29 0.65
30 0.67
31 0.64
32 0.62
33 0.56
34 0.5
35 0.47
36 0.42
37 0.41
38 0.31
39 0.25
40 0.22
41 0.25
42 0.24
43 0.23
44 0.26
45 0.29
46 0.34
47 0.38
48 0.38
49 0.44
50 0.52
51 0.61
52 0.67
53 0.73
54 0.78
55 0.85
56 0.91
57 0.89
58 0.89
59 0.89
60 0.84
61 0.81
62 0.79
63 0.73
64 0.64
65 0.62
66 0.52
67 0.5
68 0.5
69 0.45
70 0.36
71 0.31
72 0.3
73 0.26
74 0.24
75 0.18
76 0.14
77 0.15
78 0.15
79 0.15
80 0.15
81 0.13
82 0.13
83 0.13
84 0.13
85 0.11
86 0.1
87 0.13
88 0.15
89 0.22
90 0.24
91 0.27
92 0.28
93 0.28
94 0.29
95 0.29
96 0.26
97 0.2
98 0.2
99 0.18
100 0.18
101 0.18
102 0.17
103 0.17
104 0.17
105 0.16
106 0.14
107 0.12
108 0.1
109 0.09
110 0.09
111 0.07
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.13
127 0.22
128 0.27
129 0.28
130 0.28
131 0.3
132 0.3
133 0.31
134 0.3
135 0.2
136 0.17
137 0.18
138 0.17
139 0.15
140 0.14
141 0.12
142 0.09
143 0.11
144 0.16
145 0.17
146 0.19
147 0.21
148 0.24
149 0.25
150 0.28
151 0.26
152 0.24
153 0.22
154 0.26
155 0.24
156 0.24
157 0.28
158 0.31
159 0.36
160 0.33
161 0.34
162 0.32
163 0.36
164 0.34
165 0.33
166 0.28
167 0.23
168 0.23
169 0.2
170 0.19
171 0.16
172 0.18
173 0.15
174 0.16
175 0.18
176 0.19
177 0.21
178 0.2
179 0.22
180 0.2
181 0.23
182 0.22
183 0.2
184 0.2
185 0.18
186 0.18
187 0.13
188 0.12
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.11
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.07
208 0.08
209 0.07
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.08
233 0.11
234 0.11
235 0.13
236 0.16
237 0.19
238 0.2
239 0.21
240 0.21
241 0.19
242 0.19
243 0.2
244 0.15
245 0.14
246 0.18
247 0.16
248 0.14
249 0.13
250 0.12
251 0.12
252 0.14
253 0.12
254 0.1
255 0.1
256 0.12
257 0.18
258 0.2
259 0.24
260 0.24
261 0.23
262 0.22
263 0.24
264 0.22
265 0.17
266 0.18
267 0.14
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.07
283 0.06
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.04
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.09
295 0.11
296 0.15
297 0.18
298 0.21
299 0.24
300 0.33
301 0.37
302 0.42
303 0.4
304 0.37
305 0.33
306 0.31
307 0.28
308 0.18
309 0.14
310 0.07
311 0.06
312 0.07
313 0.09
314 0.09
315 0.12
316 0.21
317 0.31
318 0.39
319 0.43
320 0.47
321 0.5
322 0.53
323 0.55
324 0.51
325 0.51
326 0.46
327 0.53
328 0.55
329 0.53
330 0.5
331 0.45
332 0.41
333 0.3
334 0.27
335 0.2
336 0.15
337 0.14
338 0.13
339 0.13
340 0.13
341 0.14
342 0.13
343 0.1
344 0.07
345 0.05
346 0.07
347 0.07
348 0.08
349 0.14
350 0.16
351 0.18
352 0.24
353 0.25
354 0.24
355 0.3
356 0.33
357 0.31
358 0.33
359 0.31
360 0.26
361 0.26
362 0.25
363 0.19
364 0.15
365 0.11
366 0.06
367 0.06
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.03
372 0.03
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.05
378 0.08
379 0.15
380 0.19
381 0.28
382 0.34
383 0.37
384 0.41
385 0.49
386 0.55
387 0.57
388 0.63
389 0.64
390 0.64
391 0.67
392 0.65
393 0.58
394 0.52
395 0.43
396 0.35
397 0.25
398 0.19
399 0.13
400 0.12
401 0.11
402 0.09
403 0.1
404 0.1
405 0.1
406 0.11
407 0.12
408 0.16
409 0.21
410 0.27
411 0.3
412 0.35
413 0.44
414 0.51
415 0.6
416 0.6
417 0.6
418 0.57
419 0.55
420 0.55
421 0.5
422 0.44
423 0.41
424 0.43
425 0.38
426 0.43
427 0.41
428 0.36
429 0.36
430 0.33
431 0.27
432 0.32
433 0.36
434 0.31
435 0.32
436 0.34
437 0.37
438 0.4
439 0.4
440 0.34
441 0.34
442 0.33
443 0.31
444 0.34
445 0.29
446 0.28
447 0.28
448 0.28
449 0.26
450 0.24
451 0.25
452 0.22
453 0.21
454 0.22
455 0.21
456 0.21
457 0.21
458 0.21
459 0.21
460 0.18
461 0.17
462 0.14
463 0.14
464 0.11
465 0.1
466 0.09
467 0.09
468 0.1
469 0.11
470 0.12
471 0.12
472 0.12
473 0.14
474 0.16
475 0.17
476 0.2
477 0.25
478 0.28
479 0.33
480 0.37
481 0.39
482 0.43
483 0.51
484 0.54
485 0.52
486 0.56
487 0.56
488 0.51
489 0.49
490 0.47
491 0.4
492 0.36
493 0.34
494 0.27
495 0.23
496 0.24
497 0.23
498 0.17
499 0.14
500 0.12
501 0.11
502 0.18
503 0.17
504 0.24
505 0.32
506 0.37
507 0.42
508 0.48
509 0.57
510 0.54
511 0.61
512 0.63
513 0.62
514 0.6
515 0.59
516 0.59
517 0.5
518 0.47
519 0.42
520 0.32
521 0.24
522 0.21
523 0.21
524 0.15
525 0.15
526 0.13
527 0.13
528 0.13
529 0.13
530 0.16
531 0.15
532 0.17
533 0.17
534 0.18
535 0.16
536 0.15
537 0.16
538 0.14
539 0.12
540 0.11
541 0.11
542 0.16
543 0.18
544 0.19
545 0.17
546 0.16
547 0.17
548 0.16
549 0.2
550 0.15
551 0.13
552 0.13
553 0.13
554 0.14
555 0.13
556 0.13
557 0.09
558 0.09
559 0.09
560 0.09
561 0.1
562 0.09
563 0.1
564 0.11
565 0.12
566 0.15
567 0.18
568 0.21
569 0.28
570 0.3
571 0.31
572 0.3
573 0.31
574 0.33
575 0.33
576 0.35
577 0.3
578 0.27
579 0.26
580 0.26
581 0.27
582 0.25
583 0.28
584 0.26
585 0.28
586 0.28
587 0.29
588 0.27
589 0.25
590 0.29
591 0.29
592 0.37
593 0.41
594 0.45
595 0.53
596 0.61
597 0.63
598 0.66
599 0.67
600 0.67
601 0.69
602 0.74
603 0.74
604 0.72
605 0.71
606 0.68
607 0.65
608 0.59
609 0.52
610 0.44
611 0.36
612 0.32
613 0.3
614 0.25
615 0.21
616 0.18
617 0.14
618 0.13
619 0.11
620 0.09
621 0.1
622 0.07
623 0.07
624 0.09
625 0.1
626 0.11
627 0.12
628 0.13
629 0.13
630 0.14
631 0.16
632 0.16
633 0.23
634 0.26
635 0.29
636 0.34
637 0.39
638 0.42
639 0.49
640 0.53
641 0.55
642 0.61
643 0.68
644 0.68
645 0.67
646 0.66
647 0.64
648 0.64
649 0.59
650 0.49
651 0.43
652 0.37
653 0.32
654 0.29
655 0.23
656 0.16
657 0.12
658 0.12
659 0.08
660 0.08
661 0.07
662 0.09
663 0.08
664 0.09
665 0.08
666 0.09
667 0.09