Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4HHX9

Protein Details
Accession A0A3N4HHX9    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-83MQAEEEKKAKRQKLKEELAKEKNAHydrophilic
102-127EEDALNWVKKQKKRQKKLAQKMAEELHydrophilic
276-305IDPSEVKIKKVKKKKSKSTRRKRDDDDEGLBasic
608-630KGSGKAKTEKRLKKIEDEKKQLABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-84EKKAKRQKLKEELAKEKNAA
110-118KKQKKRQKK
282-298KIKKVKKKKSKSTRRKR
361-373RAAVKKRKVLKPA
608-621KGSGKAKTEKRLKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 15, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MAEESVLSIEETNKIRISLGLKPLKVEPEAAPGADAPLPDEDDHTVEAQERRAYENWKKMQAEEEKKAKRQKLKEELAKEKNAAKRFQVLEGKGLADEDDGEEDALNWVKKQKKRQKKLAQKMAEELAARDEALAQEYTPDQLKDLRVAHDLQDIVEGRDGAILTLKDATIDELEEEGDELEDISLAEQERRDERLSLKKKKPGYNVHEQEDEDGKKSILFQYDEEIDGKKKKKFNLGDVLSVEEREQQRKELGEAAKVKIVNLDIPKAEVLADYIDPSEVKIKKVKKKKSKSTRRKRDDDDEGLFPAPAPAPETETPDADSMQVDGAPIPVAPRVQKRTFQDVSLVDDDDLQTALAQQRRAAVKKRKVLKPADLARKIREETEGATPGAEEAGVEEEVGLVIDETSEFVSRLRAPEEPVKRERPSVTNMDMSPEPEEDTEMQDATKEDSPEPEVQKAVETENKGGITTTGLEEEATLNRGIGATLNMLKQRGLLDDTEESQKANALLRDREKFKLDNRLRQLELEKKAKAQREHDRKTGKYDRMTAREREEQARLENKHRDQQESRDLAARFKNYKPDVKLVYKDEFGRDLSQKEAFKHLSHQFHGKGSGKAKTEKRLKKIEDEKKQLATSSLTSTQGLSTSMAATAKKAKQAGVRLM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.23
4 0.26
5 0.28
6 0.36
7 0.4
8 0.4
9 0.42
10 0.45
11 0.45
12 0.43
13 0.38
14 0.3
15 0.3
16 0.31
17 0.28
18 0.26
19 0.21
20 0.23
21 0.2
22 0.18
23 0.12
24 0.13
25 0.15
26 0.14
27 0.16
28 0.15
29 0.16
30 0.17
31 0.16
32 0.15
33 0.18
34 0.2
35 0.22
36 0.23
37 0.22
38 0.26
39 0.29
40 0.37
41 0.41
42 0.49
43 0.53
44 0.58
45 0.58
46 0.55
47 0.6
48 0.62
49 0.62
50 0.61
51 0.65
52 0.64
53 0.71
54 0.78
55 0.78
56 0.77
57 0.77
58 0.79
59 0.79
60 0.82
61 0.83
62 0.84
63 0.86
64 0.84
65 0.8
66 0.72
67 0.68
68 0.65
69 0.61
70 0.55
71 0.48
72 0.49
73 0.46
74 0.51
75 0.52
76 0.46
77 0.44
78 0.42
79 0.39
80 0.31
81 0.29
82 0.21
83 0.13
84 0.12
85 0.09
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.12
93 0.11
94 0.11
95 0.18
96 0.26
97 0.32
98 0.43
99 0.52
100 0.61
101 0.71
102 0.82
103 0.86
104 0.9
105 0.95
106 0.94
107 0.92
108 0.84
109 0.78
110 0.69
111 0.61
112 0.5
113 0.39
114 0.31
115 0.23
116 0.19
117 0.14
118 0.12
119 0.09
120 0.11
121 0.1
122 0.07
123 0.09
124 0.09
125 0.11
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.14
130 0.15
131 0.19
132 0.21
133 0.23
134 0.23
135 0.24
136 0.25
137 0.25
138 0.24
139 0.19
140 0.21
141 0.19
142 0.18
143 0.18
144 0.16
145 0.12
146 0.13
147 0.13
148 0.08
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.09
154 0.08
155 0.09
156 0.1
157 0.07
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.1
177 0.13
178 0.16
179 0.17
180 0.18
181 0.23
182 0.33
183 0.42
184 0.5
185 0.56
186 0.6
187 0.66
188 0.72
189 0.76
190 0.76
191 0.73
192 0.74
193 0.73
194 0.7
195 0.65
196 0.57
197 0.51
198 0.46
199 0.4
200 0.3
201 0.24
202 0.2
203 0.17
204 0.18
205 0.18
206 0.16
207 0.16
208 0.15
209 0.18
210 0.19
211 0.2
212 0.19
213 0.18
214 0.17
215 0.22
216 0.27
217 0.29
218 0.32
219 0.35
220 0.44
221 0.48
222 0.53
223 0.57
224 0.55
225 0.54
226 0.5
227 0.49
228 0.4
229 0.35
230 0.27
231 0.21
232 0.21
233 0.2
234 0.2
235 0.19
236 0.21
237 0.21
238 0.22
239 0.24
240 0.23
241 0.25
242 0.28
243 0.27
244 0.28
245 0.27
246 0.26
247 0.2
248 0.2
249 0.17
250 0.15
251 0.16
252 0.13
253 0.14
254 0.14
255 0.12
256 0.12
257 0.08
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.13
267 0.13
268 0.15
269 0.2
270 0.28
271 0.37
272 0.47
273 0.57
274 0.61
275 0.71
276 0.8
277 0.86
278 0.89
279 0.92
280 0.93
281 0.94
282 0.93
283 0.91
284 0.86
285 0.83
286 0.8
287 0.75
288 0.67
289 0.57
290 0.49
291 0.41
292 0.34
293 0.25
294 0.17
295 0.11
296 0.07
297 0.08
298 0.06
299 0.1
300 0.11
301 0.16
302 0.16
303 0.17
304 0.18
305 0.17
306 0.17
307 0.13
308 0.12
309 0.07
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.05
320 0.08
321 0.13
322 0.19
323 0.22
324 0.27
325 0.31
326 0.38
327 0.39
328 0.37
329 0.36
330 0.31
331 0.33
332 0.29
333 0.25
334 0.17
335 0.16
336 0.15
337 0.11
338 0.1
339 0.06
340 0.04
341 0.05
342 0.08
343 0.1
344 0.1
345 0.11
346 0.15
347 0.19
348 0.23
349 0.31
350 0.38
351 0.43
352 0.51
353 0.59
354 0.61
355 0.65
356 0.67
357 0.65
358 0.64
359 0.65
360 0.68
361 0.66
362 0.62
363 0.57
364 0.57
365 0.5
366 0.41
367 0.34
368 0.25
369 0.2
370 0.23
371 0.22
372 0.18
373 0.17
374 0.15
375 0.13
376 0.12
377 0.1
378 0.05
379 0.03
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.05
387 0.04
388 0.02
389 0.02
390 0.02
391 0.02
392 0.03
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.05
397 0.07
398 0.09
399 0.1
400 0.11
401 0.12
402 0.15
403 0.24
404 0.3
405 0.34
406 0.39
407 0.44
408 0.44
409 0.47
410 0.47
411 0.42
412 0.41
413 0.4
414 0.37
415 0.35
416 0.33
417 0.33
418 0.3
419 0.27
420 0.24
421 0.19
422 0.16
423 0.12
424 0.14
425 0.11
426 0.13
427 0.12
428 0.11
429 0.1
430 0.1
431 0.11
432 0.12
433 0.14
434 0.13
435 0.13
436 0.15
437 0.18
438 0.23
439 0.25
440 0.23
441 0.21
442 0.2
443 0.21
444 0.2
445 0.2
446 0.19
447 0.18
448 0.18
449 0.2
450 0.2
451 0.19
452 0.18
453 0.15
454 0.12
455 0.11
456 0.1
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.08
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.09
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.1
473 0.12
474 0.14
475 0.14
476 0.14
477 0.15
478 0.15
479 0.15
480 0.15
481 0.13
482 0.15
483 0.16
484 0.19
485 0.21
486 0.2
487 0.18
488 0.16
489 0.17
490 0.15
491 0.17
492 0.17
493 0.18
494 0.24
495 0.3
496 0.37
497 0.39
498 0.42
499 0.42
500 0.44
501 0.45
502 0.5
503 0.51
504 0.54
505 0.59
506 0.62
507 0.59
508 0.58
509 0.6
510 0.57
511 0.57
512 0.54
513 0.48
514 0.48
515 0.53
516 0.57
517 0.56
518 0.57
519 0.6
520 0.64
521 0.7
522 0.72
523 0.74
524 0.69
525 0.73
526 0.73
527 0.69
528 0.64
529 0.67
530 0.66
531 0.66
532 0.7
533 0.65
534 0.62
535 0.63
536 0.61
537 0.57
538 0.52
539 0.47
540 0.49
541 0.52
542 0.5
543 0.49
544 0.54
545 0.54
546 0.58
547 0.58
548 0.59
549 0.55
550 0.6
551 0.62
552 0.57
553 0.54
554 0.53
555 0.5
556 0.47
557 0.49
558 0.47
559 0.42
560 0.41
561 0.49
562 0.48
563 0.56
564 0.55
565 0.57
566 0.58
567 0.6
568 0.63
569 0.59
570 0.58
571 0.53
572 0.51
573 0.46
574 0.41
575 0.37
576 0.36
577 0.34
578 0.31
579 0.31
580 0.35
581 0.35
582 0.34
583 0.39
584 0.36
585 0.34
586 0.41
587 0.46
588 0.47
589 0.47
590 0.53
591 0.48
592 0.48
593 0.55
594 0.5
595 0.49
596 0.47
597 0.5
598 0.48
599 0.53
600 0.57
601 0.59
602 0.66
603 0.68
604 0.71
605 0.75
606 0.75
607 0.77
608 0.81
609 0.82
610 0.82
611 0.82
612 0.8
613 0.76
614 0.72
615 0.63
616 0.55
617 0.48
618 0.39
619 0.36
620 0.34
621 0.29
622 0.28
623 0.28
624 0.26
625 0.23
626 0.21
627 0.16
628 0.13
629 0.12
630 0.13
631 0.15
632 0.14
633 0.17
634 0.24
635 0.27
636 0.32
637 0.33
638 0.36
639 0.41