Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A3N4IJM1

Protein Details
Accession A0A3N4IJM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
131-155GQSQKDLKERLRRVREKKIRMEYQVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-149RSRRSGTPGQSQKDLKERLRRVREKKI
Subcellular Location(s) mito_nucl 12.666, nucl 12.5, mito 11.5, cyto_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013251  DASH_Spc19  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0042729  C:DASH complex  
GO:0005876  C:spindle microtubule  
GO:0008608  P:attachment of spindle microtubules to kinetochore  
Pfam View protein in Pfam  
PF08287  DASH_Spc19  
Amino Acid Sequences MSESTHSPLSPALYSLSSSVNLMSQTLSSLTTATADFPRLGKVLQVHRPFYMISENELVAAQNSILNSLIPEFETLIRRVENEVQKMDKREQNLRSREELLQGRIDAARKKLDGQNMRLSGGRSRRSGTPGQSQKDLKERLRRVREKKIRMEYQVQRLEMQLEQKKRELRKSGVHGLKGGLSGGAMDYEY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.16
4 0.14
5 0.13
6 0.13
7 0.12
8 0.12
9 0.11
10 0.1
11 0.08
12 0.09
13 0.09
14 0.09
15 0.08
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.1
21 0.1
22 0.11
23 0.12
24 0.12
25 0.14
26 0.14
27 0.14
28 0.14
29 0.18
30 0.25
31 0.33
32 0.37
33 0.37
34 0.37
35 0.38
36 0.36
37 0.31
38 0.3
39 0.21
40 0.19
41 0.19
42 0.18
43 0.18
44 0.18
45 0.16
46 0.1
47 0.1
48 0.07
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.05
55 0.06
56 0.06
57 0.05
58 0.06
59 0.06
60 0.08
61 0.1
62 0.11
63 0.12
64 0.12
65 0.12
66 0.14
67 0.2
68 0.22
69 0.23
70 0.24
71 0.26
72 0.28
73 0.31
74 0.34
75 0.29
76 0.28
77 0.33
78 0.38
79 0.44
80 0.47
81 0.47
82 0.45
83 0.46
84 0.43
85 0.41
86 0.36
87 0.29
88 0.25
89 0.21
90 0.19
91 0.17
92 0.19
93 0.16
94 0.16
95 0.16
96 0.16
97 0.19
98 0.21
99 0.28
100 0.32
101 0.34
102 0.4
103 0.38
104 0.39
105 0.37
106 0.35
107 0.33
108 0.35
109 0.34
110 0.28
111 0.29
112 0.31
113 0.34
114 0.38
115 0.37
116 0.4
117 0.44
118 0.45
119 0.49
120 0.48
121 0.47
122 0.51
123 0.53
124 0.49
125 0.52
126 0.57
127 0.61
128 0.7
129 0.77
130 0.76
131 0.81
132 0.84
133 0.83
134 0.85
135 0.85
136 0.81
137 0.77
138 0.79
139 0.75
140 0.75
141 0.72
142 0.63
143 0.54
144 0.47
145 0.44
146 0.36
147 0.37
148 0.34
149 0.34
150 0.37
151 0.42
152 0.48
153 0.53
154 0.6
155 0.59
156 0.58
157 0.62
158 0.67
159 0.71
160 0.71
161 0.67
162 0.59
163 0.53
164 0.48
165 0.39
166 0.31
167 0.2
168 0.12
169 0.1
170 0.09