Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4IM42

Protein Details
Accession A0A3N4IM42    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-43STERYTCYSTEPRKKKPAQMERDSNTTVHydrophilic
66-90NRDISPPPLKRRKIDKAPDGRQVKEBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
Amino Acid Sequences MVDSLHNQDIDIYKVSTERYTCYSTEPRKKKPAQMERDSNTTVPDDVIFQSSSRGTPSTPSTPSMNRDISPPPLKRRKIDKAPDGRQVKEDSSGLEQATPRHDEMYPTAPPTAPPIHKSPFILTSIRDLPASANKGCISLRQLIGDPWVTKLWCINYLIDVDFIYENIHPNVRDVIDVVFIHGSWKEGDRNKKRINEGVKRHRGATVQQAWMNQAHGVQHSKLFILERADETIEVVIHTANAIPHDWTNMTNAIWRSYPLPKRKSGTTQSNSIGQEFQLRLIDYLKQMGKATADLHKTLSHYDFSAVKARFIGTVPSPPKSSRFPQYNKRQYSVGHEALRDYISQIPSLDPSLPSRIVLQCSSFPRPRANWLKNLFSKFLSNITPERKPAESQFLIVWPTPDEIRSSLNGYVSGTSIHMPWFRYGKDGGLLPLWKEILPFFAGWASSLPLRSIAAAEKTIQIRKAQRGSAAPHIKTFIKFVSPGKADGRTTDGEQVSCNGKTLGQMSFIDEMVSKQQSRPPSKYSELNGTVDDYRTIEYALLTSANLSPQAWGHGSDPDLSKDTYSNYEAGVLIYHDLFRDGDLNWNLRGVYNADEEAECAKLERTTAVRVPYDVPLRMYSKSQAPWSGGVSHHEPDVWGRMWEVDDGRDTSRMQEGESEDDEAVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.22
4 0.22
5 0.22
6 0.25
7 0.28
8 0.28
9 0.34
10 0.42
11 0.49
12 0.58
13 0.64
14 0.69
15 0.76
16 0.82
17 0.84
18 0.85
19 0.86
20 0.85
21 0.86
22 0.87
23 0.81
24 0.8
25 0.74
26 0.63
27 0.55
28 0.46
29 0.36
30 0.26
31 0.22
32 0.17
33 0.15
34 0.18
35 0.16
36 0.14
37 0.16
38 0.17
39 0.17
40 0.17
41 0.17
42 0.15
43 0.19
44 0.25
45 0.29
46 0.3
47 0.32
48 0.35
49 0.39
50 0.43
51 0.46
52 0.43
53 0.36
54 0.38
55 0.39
56 0.42
57 0.47
58 0.5
59 0.53
60 0.6
61 0.65
62 0.69
63 0.76
64 0.78
65 0.79
66 0.82
67 0.82
68 0.83
69 0.85
70 0.86
71 0.81
72 0.73
73 0.66
74 0.6
75 0.51
76 0.44
77 0.38
78 0.3
79 0.29
80 0.3
81 0.25
82 0.24
83 0.24
84 0.23
85 0.26
86 0.27
87 0.23
88 0.23
89 0.24
90 0.23
91 0.26
92 0.29
93 0.27
94 0.25
95 0.26
96 0.24
97 0.24
98 0.27
99 0.3
100 0.28
101 0.29
102 0.33
103 0.36
104 0.39
105 0.41
106 0.39
107 0.35
108 0.35
109 0.33
110 0.28
111 0.3
112 0.3
113 0.29
114 0.25
115 0.22
116 0.21
117 0.26
118 0.29
119 0.24
120 0.23
121 0.23
122 0.25
123 0.24
124 0.25
125 0.22
126 0.23
127 0.24
128 0.23
129 0.24
130 0.22
131 0.25
132 0.26
133 0.22
134 0.19
135 0.2
136 0.18
137 0.17
138 0.2
139 0.19
140 0.19
141 0.2
142 0.18
143 0.18
144 0.2
145 0.2
146 0.17
147 0.14
148 0.13
149 0.11
150 0.1
151 0.1
152 0.09
153 0.11
154 0.12
155 0.14
156 0.12
157 0.14
158 0.16
159 0.15
160 0.14
161 0.13
162 0.12
163 0.13
164 0.13
165 0.13
166 0.11
167 0.1
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.08
172 0.11
173 0.16
174 0.22
175 0.33
176 0.41
177 0.51
178 0.57
179 0.63
180 0.65
181 0.67
182 0.71
183 0.7
184 0.72
185 0.73
186 0.75
187 0.7
188 0.67
189 0.62
190 0.54
191 0.47
192 0.47
193 0.43
194 0.37
195 0.38
196 0.37
197 0.36
198 0.34
199 0.32
200 0.22
201 0.16
202 0.13
203 0.13
204 0.15
205 0.14
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.15
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.15
214 0.14
215 0.15
216 0.15
217 0.14
218 0.14
219 0.12
220 0.09
221 0.08
222 0.07
223 0.05
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.14
239 0.15
240 0.15
241 0.14
242 0.15
243 0.16
244 0.23
245 0.3
246 0.35
247 0.4
248 0.43
249 0.46
250 0.5
251 0.55
252 0.55
253 0.58
254 0.53
255 0.54
256 0.5
257 0.53
258 0.49
259 0.42
260 0.34
261 0.23
262 0.24
263 0.19
264 0.18
265 0.13
266 0.13
267 0.13
268 0.13
269 0.15
270 0.11
271 0.15
272 0.15
273 0.14
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.13
278 0.15
279 0.15
280 0.16
281 0.16
282 0.17
283 0.17
284 0.18
285 0.19
286 0.18
287 0.14
288 0.12
289 0.13
290 0.13
291 0.14
292 0.21
293 0.19
294 0.18
295 0.17
296 0.17
297 0.16
298 0.15
299 0.16
300 0.09
301 0.17
302 0.18
303 0.19
304 0.21
305 0.21
306 0.24
307 0.26
308 0.29
309 0.29
310 0.36
311 0.4
312 0.48
313 0.59
314 0.66
315 0.64
316 0.62
317 0.56
318 0.49
319 0.51
320 0.48
321 0.42
322 0.34
323 0.31
324 0.3
325 0.29
326 0.29
327 0.2
328 0.14
329 0.12
330 0.11
331 0.11
332 0.11
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.11
337 0.08
338 0.09
339 0.12
340 0.12
341 0.12
342 0.13
343 0.14
344 0.16
345 0.15
346 0.15
347 0.17
348 0.21
349 0.26
350 0.26
351 0.27
352 0.29
353 0.3
354 0.37
355 0.44
356 0.43
357 0.46
358 0.47
359 0.53
360 0.53
361 0.55
362 0.48
363 0.39
364 0.36
365 0.29
366 0.28
367 0.21
368 0.19
369 0.21
370 0.24
371 0.25
372 0.25
373 0.27
374 0.26
375 0.26
376 0.26
377 0.29
378 0.25
379 0.24
380 0.23
381 0.21
382 0.22
383 0.2
384 0.18
385 0.11
386 0.11
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.09
391 0.11
392 0.12
393 0.13
394 0.14
395 0.14
396 0.14
397 0.13
398 0.12
399 0.11
400 0.1
401 0.08
402 0.08
403 0.07
404 0.09
405 0.11
406 0.11
407 0.14
408 0.16
409 0.15
410 0.17
411 0.18
412 0.17
413 0.16
414 0.16
415 0.14
416 0.15
417 0.15
418 0.13
419 0.14
420 0.14
421 0.12
422 0.11
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.09
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.09
432 0.08
433 0.08
434 0.09
435 0.08
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.09
440 0.1
441 0.1
442 0.11
443 0.12
444 0.15
445 0.18
446 0.2
447 0.21
448 0.24
449 0.28
450 0.35
451 0.39
452 0.37
453 0.38
454 0.4
455 0.42
456 0.48
457 0.5
458 0.43
459 0.39
460 0.4
461 0.39
462 0.35
463 0.33
464 0.24
465 0.19
466 0.21
467 0.21
468 0.27
469 0.26
470 0.28
471 0.29
472 0.32
473 0.29
474 0.28
475 0.3
476 0.24
477 0.24
478 0.28
479 0.26
480 0.22
481 0.22
482 0.23
483 0.22
484 0.21
485 0.2
486 0.13
487 0.13
488 0.14
489 0.16
490 0.15
491 0.14
492 0.14
493 0.16
494 0.17
495 0.17
496 0.16
497 0.14
498 0.14
499 0.15
500 0.18
501 0.16
502 0.16
503 0.21
504 0.3
505 0.37
506 0.41
507 0.41
508 0.45
509 0.49
510 0.54
511 0.53
512 0.53
513 0.5
514 0.47
515 0.43
516 0.38
517 0.35
518 0.29
519 0.26
520 0.18
521 0.15
522 0.13
523 0.13
524 0.1
525 0.09
526 0.09
527 0.08
528 0.08
529 0.07
530 0.08
531 0.08
532 0.09
533 0.09
534 0.09
535 0.09
536 0.09
537 0.13
538 0.12
539 0.13
540 0.13
541 0.15
542 0.16
543 0.19
544 0.2
545 0.2
546 0.22
547 0.2
548 0.2
549 0.19
550 0.2
551 0.21
552 0.21
553 0.19
554 0.17
555 0.18
556 0.17
557 0.16
558 0.14
559 0.11
560 0.1
561 0.1
562 0.1
563 0.08
564 0.09
565 0.09
566 0.09
567 0.1
568 0.1
569 0.17
570 0.21
571 0.23
572 0.22
573 0.23
574 0.23
575 0.21
576 0.23
577 0.16
578 0.16
579 0.16
580 0.16
581 0.17
582 0.16
583 0.17
584 0.17
585 0.16
586 0.12
587 0.1
588 0.11
589 0.1
590 0.11
591 0.14
592 0.16
593 0.21
594 0.25
595 0.29
596 0.3
597 0.31
598 0.33
599 0.35
600 0.38
601 0.34
602 0.33
603 0.32
604 0.34
605 0.34
606 0.34
607 0.32
608 0.33
609 0.36
610 0.38
611 0.38
612 0.38
613 0.39
614 0.39
615 0.39
616 0.34
617 0.34
618 0.33
619 0.3
620 0.27
621 0.25
622 0.23
623 0.21
624 0.26
625 0.22
626 0.18
627 0.18
628 0.19
629 0.2
630 0.23
631 0.22
632 0.18
633 0.21
634 0.23
635 0.24
636 0.25
637 0.24
638 0.24
639 0.28
640 0.26
641 0.23
642 0.26
643 0.27
644 0.3
645 0.31
646 0.31