FuNGI

A0A3N4IH78

Protein Details

Accession

A0A3N4IH78

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-23	SEPTRIQKRPAPTKVERKPGE	Hydrophilic
122-143	EYAPYQKVPRPQKKTDQRIGTI	Hydrophilic
205-230	GSLTGKERSRERRRGRGKGKEKEKAT	Basic
356-381	ESPATPTDSKRSRRRPPRGGKAREEA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
14-22	PTKVERKPG
210-252	KERSRERRRGRGKGKEKEKATEKPSAAPIVAPKLLARKKSAPT
265-280	PAAAAREREREKRAPR
365-378	KRSRRRPPRGGKAR
529-563	APRGGRRGPRGGGGPMFRGGRGGGGGGGGRGGMHG

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 8, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MASEPTRIQKRPAPTKVERKPGEAPKPAGNSLERLKVVVRRLPPCMTEEEFKELTAGIVDYTNLEWFRFIKGKQPEDINKDKQNARCYLKFKSSEPILALGQALGGKVMQDSKGNQTLPSVEYAPYQKVPRPQKKTDQRIGTIDEDPDFIAFLEAFNAPVPKEDITEKTEVHEKVTTTPLIEYIRQQKAASAAAHGTAGSDKSSGSLTGKERSRERRRGRGKGKEKEKATEKPSAAPIVAPKLLARKKSAPTESASEKASTPTAPAAAAREREREKRAPRPSAVAAILQRDLGIGGGGSRRQRGAAAAAAAAAAASSSATRPAPVVDTNKAKATAQAQSHAPTTPTTNSPNTPTSESPATPTDSKRSRRRPPRGGKAREEAVESATPQAAPAKVAQPIAVLRKQNTMGANGAPKAPAILRRENTAPSVSGNAQNGQKAAAPAPATNSNSIPTGPKGAKGNAPAHGRGGRLSGLTGAAIARKEAKGQPVPPKPQQQPQAATAPATQAAPAAAPANNTPAVPTGPAAGNHAPRGGRRGPRGGGGPMFRGGRGGGGGGGGRGGMHGPRPHQQTPAAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.78
3	0.82
4	0.86
5	0.79
6	0.74
7	0.75
8	0.76
9	0.76
10	0.73
11	0.68
12	0.66
13	0.68
14	0.63
15	0.58
16	0.5
17	0.46
18	0.42
19	0.45
20	0.37
21	0.33
22	0.35
23	0.36
24	0.4
25	0.41
26	0.44
27	0.41
28	0.46
29	0.49
30	0.47
31	0.45
32	0.45
33	0.42
34	0.39
35	0.38
36	0.39
37	0.36
38	0.34
39	0.31
40	0.25
41	0.21
42	0.17
43	0.14
44	0.08
45	0.08
46	0.08
47	0.08
48	0.09
49	0.12
50	0.12
51	0.11
52	0.12
53	0.13
54	0.18
55	0.22
56	0.22
57	0.28
58	0.36
59	0.41
60	0.44
61	0.53
62	0.55
63	0.58
64	0.67
65	0.66
66	0.64
67	0.66
68	0.68
69	0.65
70	0.64
71	0.65
72	0.63
73	0.62
74	0.6
75	0.6
76	0.63
77	0.6
78	0.55
79	0.55
80	0.51
81	0.47
82	0.44
83	0.4
84	0.32
85	0.28
86	0.26
87	0.17
88	0.15
89	0.11
90	0.09
91	0.06
92	0.06
93	0.05
94	0.06
95	0.08
96	0.08
97	0.11
98	0.13
99	0.19
100	0.25
101	0.26
102	0.25
103	0.25
104	0.26
105	0.25
106	0.25
107	0.21
108	0.15
109	0.18
110	0.2
111	0.22
112	0.24
113	0.26
114	0.26
115	0.34
116	0.44
117	0.52
118	0.58
119	0.62
120	0.69
121	0.77
122	0.83
123	0.83
124	0.8
125	0.74
126	0.7
127	0.67
128	0.6
129	0.51
130	0.42
131	0.33
132	0.26
133	0.22
134	0.17
135	0.13
136	0.09
137	0.07
138	0.06
139	0.05
140	0.06
141	0.06
142	0.07
143	0.07
144	0.08
145	0.07
146	0.09
147	0.11
148	0.09
149	0.11
150	0.13
151	0.16
152	0.19
153	0.22
154	0.21
155	0.21
156	0.28
157	0.26
158	0.27
159	0.26
160	0.23
161	0.23
162	0.26
163	0.25
164	0.18
165	0.18
166	0.19
167	0.18
168	0.18
169	0.2
170	0.26
171	0.29
172	0.29
173	0.29
174	0.27
175	0.28
176	0.3
177	0.26
178	0.19
179	0.15
180	0.14
181	0.14
182	0.13
183	0.11
184	0.08
185	0.08
186	0.07
187	0.06
188	0.06
189	0.06
190	0.07
191	0.08
192	0.08
193	0.12
194	0.15
195	0.21
196	0.25
197	0.28
198	0.35
199	0.45
200	0.53
201	0.59
202	0.64
203	0.68
204	0.75
205	0.81
206	0.84
207	0.85
208	0.85
209	0.84
210	0.86
211	0.84
212	0.77
213	0.74
214	0.71
215	0.67
216	0.61
217	0.59
218	0.5
219	0.45
220	0.45
221	0.39
222	0.32
223	0.25
224	0.23
225	0.18
226	0.18
227	0.14
228	0.13
229	0.2
230	0.23
231	0.24
232	0.27
233	0.29
234	0.33
235	0.4
236	0.42
237	0.36
238	0.36
239	0.38
240	0.36
241	0.33
242	0.29
243	0.23
244	0.21
245	0.2
246	0.18
247	0.13
248	0.11
249	0.09
250	0.09
251	0.08
252	0.08
253	0.09
254	0.11
255	0.14
256	0.15
257	0.19
258	0.22
259	0.27
260	0.32
261	0.38
262	0.42
263	0.48
264	0.55
265	0.55
266	0.53
267	0.53
268	0.49
269	0.45
270	0.39
271	0.32
272	0.25
273	0.2
274	0.19
275	0.14
276	0.13
277	0.09
278	0.08
279	0.06
280	0.05
281	0.03
282	0.03
283	0.04
284	0.06
285	0.07
286	0.08
287	0.08
288	0.09
289	0.09
290	0.1
291	0.11
292	0.1
293	0.1
294	0.09
295	0.09
296	0.08
297	0.07
298	0.06
299	0.04
300	0.02
301	0.02
302	0.02
303	0.02
304	0.02
305	0.04
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.06
310	0.08
311	0.11
312	0.15
313	0.18
314	0.22
315	0.23
316	0.24
317	0.25
318	0.23
319	0.22
320	0.22
321	0.23
322	0.2
323	0.21
324	0.21
325	0.22
326	0.23
327	0.21
328	0.19
329	0.14
330	0.15
331	0.15
332	0.16
333	0.19
334	0.2
335	0.21
336	0.24
337	0.26
338	0.26
339	0.28
340	0.25
341	0.26
342	0.26
343	0.25
344	0.24
345	0.23
346	0.23
347	0.22
348	0.24
349	0.28
350	0.33
351	0.41
352	0.48
353	0.56
354	0.64
355	0.72
356	0.81
357	0.84
358	0.87
359	0.9
360	0.91
361	0.89
362	0.85
363	0.8
364	0.73
365	0.63
366	0.55
367	0.44
368	0.37
369	0.29
370	0.23
371	0.18
372	0.15
373	0.13
374	0.11
375	0.12
376	0.09
377	0.09
378	0.11
379	0.12
380	0.14
381	0.14
382	0.14
383	0.13
384	0.16
385	0.2
386	0.23
387	0.23
388	0.23
389	0.27
390	0.27
391	0.3
392	0.28
393	0.25
394	0.22
395	0.22
396	0.24
397	0.21
398	0.2
399	0.17
400	0.15
401	0.14
402	0.14
403	0.17
404	0.2
405	0.27
406	0.28
407	0.31
408	0.34
409	0.34
410	0.35
411	0.31
412	0.26
413	0.19
414	0.21
415	0.2
416	0.21
417	0.21
418	0.23
419	0.23
420	0.23
421	0.22
422	0.2
423	0.19
424	0.17
425	0.16
426	0.16
427	0.15
428	0.14
429	0.19
430	0.23
431	0.23
432	0.24
433	0.24
434	0.22
435	0.21
436	0.22
437	0.2
438	0.16
439	0.21
440	0.19
441	0.23
442	0.25
443	0.27
444	0.31
445	0.34
446	0.37
447	0.37
448	0.41
449	0.38
450	0.39
451	0.39
452	0.35
453	0.3
454	0.28
455	0.22
456	0.18
457	0.18
458	0.14
459	0.11
460	0.1
461	0.1
462	0.08
463	0.09
464	0.09
465	0.1
466	0.12
467	0.12
468	0.17
469	0.2
470	0.27
471	0.32
472	0.39
473	0.48
474	0.54
475	0.62
476	0.65
477	0.72
478	0.7
479	0.72
480	0.74
481	0.72
482	0.67
483	0.64
484	0.62
485	0.53
486	0.49
487	0.41
488	0.35
489	0.27
490	0.23
491	0.18
492	0.12
493	0.11
494	0.1
495	0.1
496	0.1
497	0.09
498	0.11
499	0.11
500	0.15
501	0.16
502	0.15
503	0.15
504	0.15
505	0.16
506	0.15
507	0.15
508	0.14
509	0.16
510	0.16
511	0.21
512	0.24
513	0.27
514	0.27
515	0.31
516	0.29
517	0.28
518	0.35
519	0.37
520	0.4
521	0.43
522	0.5
523	0.48
524	0.51
525	0.54
526	0.52
527	0.5
528	0.46
529	0.42
530	0.39
531	0.37
532	0.32
533	0.29
534	0.24
535	0.19
536	0.17
537	0.14
538	0.1
539	0.1
540	0.1
541	0.09
542	0.09
543	0.07
544	0.06
545	0.06
546	0.07
547	0.08
548	0.14
549	0.19
550	0.23
551	0.31
552	0.39
553	0.41
554	0.44

A0A3N4IH78

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer