Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1DVV6

Protein Details
Accession A0A0D1DVV6    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
208-232SASRKSPKPSGKTSRKDKKDKDISAHydrophilic
304-324ATESKKDKKRKEVIDRIHRIHBasic
441-463DSAQRPHTTRKLRNKASGKRGGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
209-227ASRKSPKPSGKTSRKDKKD
310-313DKKR
453-460RNKASGKR
578-579KK
647-656KTNGKRARRK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11.5, mito 6, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0070822  C:Sin3-type complex  
GO:0042826  F:histone deacetylase binding  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG uma:UMAG_15099  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MASSLDRQQMGPQLSAPKRHANHPDRYDHPPMPHHLQQDPYQNGPAGYPPGPSYPSRVDPGRPGVPMHHHRPPSPSPMAHRDPRATMGPPGPNGPPPPPGMMGVPPNDRYAMPPYRPSPGPHPPSPPWQNQQLYQPPLPPGASSLPPHLHQSAFNNVPPQHRGSPHMAPHMPLPPPHHGGGPPLAPHAGMPASAISESHAKHLASPASASRKSPKPSGKTSRKDKKDKDISASTAAPASMAKNASTETSGSKRGAAKAEKAAAAAAAAAAAAAAAAAAATSGSTVSAAPAASQAALDAAGAPAATESKKDKKRKEVIDRIHRIHFETIENRESLYQELYHALTSSYATLLSNPARSRHYTLELTRLTLQRDAALRETALLHAHQLESARLAYENEKHKVDEEARLAKRGAREKLLAVVEATKKRLQEDKEGGDVAVDAFFDSAQRPHTTRKLRNKASGKRGGGAAGANDDDVDASSAGARNGVNGNAGMSGSGIASGLQELIALSGFGREEVGGGGGRLGLTSALDLGGLGLTFGGGGDLLSGAGMGDSSYMGGGGRNLSVIGGVNGTIGGVKGSSKKKGASKAAAAAAAAASAAAAREASGTGGDDDAPVVSTTGGRLRWDAGKSLNQLTPAKDFEIESDLINIRKTNGKRARRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.46
3 0.47
4 0.49
5 0.49
6 0.57
7 0.64
8 0.62
9 0.68
10 0.69
11 0.72
12 0.67
13 0.72
14 0.72
15 0.66
16 0.63
17 0.59
18 0.58
19 0.58
20 0.59
21 0.56
22 0.52
23 0.51
24 0.52
25 0.56
26 0.53
27 0.48
28 0.45
29 0.42
30 0.38
31 0.34
32 0.31
33 0.26
34 0.22
35 0.21
36 0.2
37 0.22
38 0.25
39 0.25
40 0.28
41 0.3
42 0.33
43 0.37
44 0.38
45 0.38
46 0.42
47 0.48
48 0.47
49 0.42
50 0.39
51 0.39
52 0.45
53 0.5
54 0.5
55 0.51
56 0.51
57 0.52
58 0.57
59 0.58
60 0.57
61 0.56
62 0.53
63 0.52
64 0.57
65 0.62
66 0.61
67 0.62
68 0.58
69 0.53
70 0.53
71 0.5
72 0.43
73 0.4
74 0.4
75 0.39
76 0.36
77 0.37
78 0.34
79 0.35
80 0.36
81 0.33
82 0.31
83 0.28
84 0.3
85 0.28
86 0.27
87 0.25
88 0.25
89 0.27
90 0.28
91 0.31
92 0.29
93 0.29
94 0.29
95 0.27
96 0.26
97 0.29
98 0.32
99 0.31
100 0.36
101 0.37
102 0.42
103 0.44
104 0.45
105 0.46
106 0.48
107 0.53
108 0.51
109 0.56
110 0.54
111 0.62
112 0.65
113 0.64
114 0.59
115 0.61
116 0.59
117 0.54
118 0.6
119 0.58
120 0.57
121 0.51
122 0.5
123 0.42
124 0.42
125 0.39
126 0.29
127 0.24
128 0.22
129 0.23
130 0.22
131 0.25
132 0.25
133 0.26
134 0.3
135 0.28
136 0.26
137 0.25
138 0.27
139 0.3
140 0.3
141 0.31
142 0.33
143 0.34
144 0.36
145 0.36
146 0.38
147 0.35
148 0.34
149 0.37
150 0.37
151 0.42
152 0.42
153 0.47
154 0.43
155 0.38
156 0.4
157 0.4
158 0.35
159 0.31
160 0.32
161 0.3
162 0.33
163 0.33
164 0.31
165 0.26
166 0.28
167 0.28
168 0.25
169 0.2
170 0.18
171 0.17
172 0.15
173 0.14
174 0.13
175 0.1
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.11
184 0.11
185 0.13
186 0.16
187 0.16
188 0.17
189 0.21
190 0.21
191 0.17
192 0.18
193 0.2
194 0.24
195 0.25
196 0.27
197 0.29
198 0.35
199 0.38
200 0.45
201 0.49
202 0.48
203 0.57
204 0.66
205 0.7
206 0.72
207 0.8
208 0.82
209 0.84
210 0.88
211 0.84
212 0.84
213 0.84
214 0.79
215 0.76
216 0.7
217 0.63
218 0.57
219 0.51
220 0.4
221 0.3
222 0.25
223 0.18
224 0.13
225 0.11
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.14
236 0.16
237 0.16
238 0.19
239 0.21
240 0.23
241 0.28
242 0.27
243 0.28
244 0.29
245 0.31
246 0.28
247 0.26
248 0.23
249 0.17
250 0.14
251 0.11
252 0.06
253 0.03
254 0.03
255 0.02
256 0.02
257 0.02
258 0.01
259 0.01
260 0.01
261 0.01
262 0.01
263 0.01
264 0.01
265 0.01
266 0.01
267 0.02
268 0.02
269 0.02
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.03
282 0.04
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.04
292 0.05
293 0.09
294 0.18
295 0.27
296 0.36
297 0.41
298 0.51
299 0.6
300 0.68
301 0.75
302 0.76
303 0.78
304 0.81
305 0.81
306 0.74
307 0.69
308 0.6
309 0.51
310 0.42
311 0.34
312 0.26
313 0.22
314 0.22
315 0.2
316 0.2
317 0.18
318 0.17
319 0.16
320 0.14
321 0.11
322 0.08
323 0.07
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.06
330 0.07
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.08
337 0.09
338 0.12
339 0.13
340 0.15
341 0.17
342 0.19
343 0.23
344 0.23
345 0.27
346 0.27
347 0.27
348 0.33
349 0.31
350 0.31
351 0.31
352 0.3
353 0.27
354 0.24
355 0.23
356 0.18
357 0.19
358 0.19
359 0.16
360 0.15
361 0.14
362 0.13
363 0.13
364 0.11
365 0.1
366 0.08
367 0.07
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.08
378 0.1
379 0.15
380 0.21
381 0.23
382 0.23
383 0.23
384 0.24
385 0.27
386 0.27
387 0.27
388 0.26
389 0.32
390 0.32
391 0.34
392 0.33
393 0.31
394 0.35
395 0.36
396 0.34
397 0.29
398 0.29
399 0.28
400 0.33
401 0.32
402 0.26
403 0.2
404 0.21
405 0.23
406 0.24
407 0.26
408 0.23
409 0.23
410 0.25
411 0.31
412 0.29
413 0.33
414 0.37
415 0.37
416 0.38
417 0.38
418 0.35
419 0.29
420 0.26
421 0.17
422 0.1
423 0.07
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.05
429 0.06
430 0.09
431 0.11
432 0.14
433 0.19
434 0.28
435 0.37
436 0.46
437 0.56
438 0.65
439 0.69
440 0.77
441 0.81
442 0.82
443 0.82
444 0.82
445 0.73
446 0.64
447 0.58
448 0.49
449 0.4
450 0.31
451 0.22
452 0.14
453 0.12
454 0.09
455 0.08
456 0.07
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.04
461 0.04
462 0.06
463 0.07
464 0.07
465 0.08
466 0.08
467 0.09
468 0.1
469 0.1
470 0.1
471 0.09
472 0.1
473 0.09
474 0.09
475 0.07
476 0.06
477 0.06
478 0.05
479 0.05
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.03
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.07
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.05
506 0.05
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.03
518 0.03
519 0.03
520 0.03
521 0.03
522 0.02
523 0.02
524 0.02
525 0.03
526 0.03
527 0.03
528 0.03
529 0.03
530 0.03
531 0.03
532 0.03
533 0.02
534 0.03
535 0.03
536 0.03
537 0.03
538 0.04
539 0.04
540 0.04
541 0.05
542 0.06
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.06
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.05
556 0.05
557 0.04
558 0.04
559 0.06
560 0.14
561 0.19
562 0.25
563 0.28
564 0.34
565 0.41
566 0.5
567 0.57
568 0.57
569 0.58
570 0.59
571 0.58
572 0.52
573 0.45
574 0.36
575 0.27
576 0.2
577 0.14
578 0.07
579 0.04
580 0.03
581 0.04
582 0.03
583 0.03
584 0.03
585 0.04
586 0.05
587 0.06
588 0.06
589 0.07
590 0.08
591 0.09
592 0.09
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.09
597 0.08
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.09
602 0.13
603 0.15
604 0.15
605 0.17
606 0.2
607 0.26
608 0.27
609 0.29
610 0.3
611 0.36
612 0.39
613 0.43
614 0.42
615 0.41
616 0.42
617 0.42
618 0.41
619 0.37
620 0.34
621 0.3
622 0.28
623 0.25
624 0.27
625 0.25
626 0.2
627 0.22
628 0.22
629 0.22
630 0.24
631 0.22
632 0.2
633 0.28
634 0.3
635 0.37
636 0.44