Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4HRQ7

Protein Details
Accession A0A3N4HRQ7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
393-414LHSGPPPKPKVRKRTNAEMQADHydrophilic
460-479RTLSEIKKKHDEKKEKKEAHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
398-405PPKPKVRK
466-476KKKHDEKKEKK
Subcellular Location(s) mito 13.5, nucl 9, cyto_mito 8.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MTAAAHPITLPGLSAPAFPRVKLSQTPKSHTMAPSASAKYPPGSAPPSKLSGSHNRISTKTRPGASSPLVGANSDLTFPDTPTNLKKKARMSDVGGSGRTTGRPTKKAAAAQARDRELAASSSQKSGDQDKKANIPLKPLEPVPYVITADYILKKFKGSSPSLILHLHPNHFRLEGQEGGYAYTSPMKALLEAIQEGKVPHQFVTELYDVGVPFYDGCLIVQVNDHRTTTVDEKSTIKQKSGTRKIASINNYHECLTPSPLVPFPEQSPAAANTSTSVSTSETPKATSEIVPAKEKPKVKTFTTVLFPNAATLTKDIEAATMKTAISGGGKPGTPMTARTPVTARMAETKLDEATALKLEARALLLQAGQLILEPARNFEHSLKILDALKHPLHSGPPPKPKVRKRTNAEMQADEAAAAEEERMLLVWDEQRYPQSASSGTQAPLSAVANDQENVFKRFRTLSEIKKKHDEKKEKKEAHSMVKIKSTEQAGQSQQSQPTGELAAKQASYVQSHRESMHKQLQITSQQNGMVQHQLSQQTPFTAGVTGMNSFASAAQSPLHPTPPVPQRLPTPAQQQPKSSVPPSSQPTPRQATPVQNTASSPAPPPAPQPVPQQNSTTTEPPPRVPSVQPSMKTPTQQPTPVNVQPKPIAISQSQTPQQSNATLMQRSQSQQQQRQPTQQPQTRPQTPAANLQAQMQARAHNMGLTSNQNQFVQNQIQASQSPVQASAQAQAQVTQAQIQQAQQAQAQNQHAQALLQAQTRSPALSSVNMQTATSSPAGGFIQSPVPGAVPMVRNRTNASQSGPQPNPGFVQPMLNNAGQPGNRDMLAFQLRQQQQQAALLQAQRMQAQAIQQGTPQVVGPSASNQQGFRQSQILRDLMSRGIPQDQAIRMIQQNQAAHVQQQQAMANAAGLAQMNPNMQNLTPQQQQQQLLRLQQMRSHQILLANAQAAGMSPQQYQQLQRQQQMMMQQNGGVPMTQVQRQQFLIRQQQQQVAALAAAQAAQGGNPQAAMMGGVRIMPTGQPMQMQPGMQQVNGVNGVQGGQFQDMNGFVVPAGRGGINMNGMMNMNMGMNMGGLGRGRGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.22
4 0.23
5 0.23
6 0.29
7 0.29
8 0.34
9 0.4
10 0.47
11 0.48
12 0.56
13 0.63
14 0.62
15 0.63
16 0.64
17 0.57
18 0.55
19 0.47
20 0.43
21 0.43
22 0.41
23 0.4
24 0.36
25 0.36
26 0.31
27 0.31
28 0.29
29 0.28
30 0.31
31 0.33
32 0.36
33 0.39
34 0.41
35 0.4
36 0.41
37 0.42
38 0.46
39 0.49
40 0.49
41 0.5
42 0.5
43 0.53
44 0.56
45 0.57
46 0.56
47 0.56
48 0.54
49 0.52
50 0.51
51 0.56
52 0.52
53 0.49
54 0.41
55 0.39
56 0.35
57 0.32
58 0.29
59 0.23
60 0.2
61 0.17
62 0.15
63 0.14
64 0.14
65 0.15
66 0.18
67 0.17
68 0.21
69 0.29
70 0.37
71 0.41
72 0.46
73 0.52
74 0.57
75 0.64
76 0.68
77 0.65
78 0.63
79 0.64
80 0.66
81 0.63
82 0.56
83 0.48
84 0.42
85 0.37
86 0.32
87 0.28
88 0.29
89 0.33
90 0.36
91 0.42
92 0.47
93 0.52
94 0.56
95 0.61
96 0.62
97 0.61
98 0.66
99 0.68
100 0.63
101 0.57
102 0.52
103 0.44
104 0.35
105 0.3
106 0.24
107 0.22
108 0.21
109 0.23
110 0.24
111 0.25
112 0.26
113 0.33
114 0.38
115 0.4
116 0.44
117 0.47
118 0.53
119 0.58
120 0.62
121 0.54
122 0.54
123 0.52
124 0.49
125 0.47
126 0.42
127 0.39
128 0.35
129 0.36
130 0.3
131 0.28
132 0.25
133 0.21
134 0.21
135 0.16
136 0.19
137 0.2
138 0.2
139 0.2
140 0.19
141 0.21
142 0.22
143 0.26
144 0.3
145 0.3
146 0.34
147 0.38
148 0.4
149 0.42
150 0.42
151 0.38
152 0.38
153 0.39
154 0.38
155 0.35
156 0.34
157 0.33
158 0.32
159 0.31
160 0.26
161 0.26
162 0.24
163 0.22
164 0.23
165 0.21
166 0.21
167 0.21
168 0.18
169 0.14
170 0.15
171 0.13
172 0.11
173 0.12
174 0.11
175 0.11
176 0.12
177 0.14
178 0.13
179 0.14
180 0.15
181 0.15
182 0.16
183 0.16
184 0.17
185 0.18
186 0.17
187 0.15
188 0.16
189 0.15
190 0.15
191 0.2
192 0.18
193 0.15
194 0.15
195 0.16
196 0.15
197 0.15
198 0.14
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.06
204 0.06
205 0.08
206 0.07
207 0.08
208 0.12
209 0.15
210 0.18
211 0.2
212 0.2
213 0.19
214 0.2
215 0.24
216 0.24
217 0.26
218 0.23
219 0.23
220 0.26
221 0.32
222 0.39
223 0.36
224 0.34
225 0.36
226 0.4
227 0.49
228 0.56
229 0.59
230 0.54
231 0.57
232 0.6
233 0.61
234 0.59
235 0.55
236 0.52
237 0.48
238 0.47
239 0.43
240 0.39
241 0.34
242 0.31
243 0.29
244 0.23
245 0.2
246 0.21
247 0.22
248 0.23
249 0.22
250 0.23
251 0.2
252 0.24
253 0.24
254 0.22
255 0.22
256 0.21
257 0.22
258 0.2
259 0.18
260 0.13
261 0.14
262 0.14
263 0.11
264 0.11
265 0.1
266 0.13
267 0.16
268 0.19
269 0.18
270 0.19
271 0.19
272 0.2
273 0.2
274 0.18
275 0.21
276 0.23
277 0.26
278 0.29
279 0.31
280 0.33
281 0.37
282 0.41
283 0.4
284 0.43
285 0.45
286 0.43
287 0.49
288 0.48
289 0.47
290 0.47
291 0.45
292 0.37
293 0.34
294 0.31
295 0.24
296 0.22
297 0.17
298 0.13
299 0.12
300 0.12
301 0.11
302 0.12
303 0.11
304 0.11
305 0.12
306 0.12
307 0.12
308 0.11
309 0.1
310 0.09
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.13
321 0.12
322 0.13
323 0.16
324 0.22
325 0.23
326 0.24
327 0.25
328 0.26
329 0.3
330 0.28
331 0.24
332 0.23
333 0.23
334 0.22
335 0.22
336 0.2
337 0.17
338 0.16
339 0.15
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.05
357 0.04
358 0.05
359 0.04
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.09
364 0.1
365 0.12
366 0.13
367 0.18
368 0.17
369 0.19
370 0.18
371 0.19
372 0.21
373 0.2
374 0.21
375 0.21
376 0.21
377 0.2
378 0.2
379 0.19
380 0.18
381 0.22
382 0.28
383 0.31
384 0.4
385 0.45
386 0.53
387 0.61
388 0.68
389 0.73
390 0.76
391 0.78
392 0.75
393 0.8
394 0.82
395 0.81
396 0.76
397 0.66
398 0.58
399 0.48
400 0.41
401 0.3
402 0.2
403 0.11
404 0.07
405 0.06
406 0.04
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.05
414 0.08
415 0.09
416 0.1
417 0.11
418 0.12
419 0.14
420 0.15
421 0.15
422 0.13
423 0.13
424 0.13
425 0.15
426 0.17
427 0.15
428 0.15
429 0.14
430 0.12
431 0.13
432 0.12
433 0.09
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.08
438 0.08
439 0.1
440 0.11
441 0.14
442 0.15
443 0.14
444 0.15
445 0.16
446 0.17
447 0.22
448 0.26
449 0.33
450 0.44
451 0.5
452 0.52
453 0.6
454 0.65
455 0.65
456 0.7
457 0.71
458 0.7
459 0.75
460 0.83
461 0.8
462 0.77
463 0.77
464 0.72
465 0.69
466 0.67
467 0.6
468 0.51
469 0.51
470 0.48
471 0.39
472 0.37
473 0.31
474 0.26
475 0.23
476 0.26
477 0.22
478 0.23
479 0.25
480 0.24
481 0.23
482 0.21
483 0.2
484 0.15
485 0.14
486 0.13
487 0.11
488 0.09
489 0.09
490 0.1
491 0.09
492 0.09
493 0.1
494 0.1
495 0.12
496 0.12
497 0.15
498 0.15
499 0.17
500 0.18
501 0.21
502 0.21
503 0.26
504 0.33
505 0.31
506 0.29
507 0.3
508 0.33
509 0.36
510 0.37
511 0.31
512 0.25
513 0.23
514 0.24
515 0.23
516 0.2
517 0.15
518 0.13
519 0.14
520 0.15
521 0.16
522 0.15
523 0.16
524 0.15
525 0.13
526 0.14
527 0.12
528 0.09
529 0.08
530 0.07
531 0.07
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.06
536 0.06
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.08
545 0.09
546 0.1
547 0.09
548 0.1
549 0.16
550 0.22
551 0.27
552 0.25
553 0.27
554 0.28
555 0.34
556 0.36
557 0.33
558 0.34
559 0.35
560 0.42
561 0.43
562 0.42
563 0.4
564 0.42
565 0.41
566 0.35
567 0.32
568 0.25
569 0.29
570 0.32
571 0.34
572 0.35
573 0.35
574 0.4
575 0.41
576 0.4
577 0.39
578 0.38
579 0.39
580 0.38
581 0.4
582 0.35
583 0.31
584 0.3
585 0.28
586 0.26
587 0.19
588 0.17
589 0.13
590 0.13
591 0.12
592 0.14
593 0.17
594 0.18
595 0.21
596 0.28
597 0.35
598 0.37
599 0.39
600 0.4
601 0.36
602 0.39
603 0.38
604 0.33
605 0.27
606 0.28
607 0.28
608 0.27
609 0.29
610 0.26
611 0.26
612 0.24
613 0.27
614 0.3
615 0.34
616 0.33
617 0.33
618 0.37
619 0.36
620 0.37
621 0.35
622 0.34
623 0.33
624 0.36
625 0.34
626 0.33
627 0.38
628 0.41
629 0.43
630 0.37
631 0.37
632 0.34
633 0.33
634 0.31
635 0.25
636 0.23
637 0.18
638 0.19
639 0.18
640 0.22
641 0.24
642 0.24
643 0.23
644 0.22
645 0.22
646 0.21
647 0.21
648 0.2
649 0.2
650 0.18
651 0.18
652 0.19
653 0.2
654 0.21
655 0.24
656 0.26
657 0.31
658 0.38
659 0.45
660 0.53
661 0.54
662 0.62
663 0.63
664 0.66
665 0.67
666 0.64
667 0.64
668 0.62
669 0.67
670 0.63
671 0.59
672 0.55
673 0.51
674 0.49
675 0.5
676 0.46
677 0.4
678 0.35
679 0.34
680 0.35
681 0.29
682 0.29
683 0.21
684 0.19
685 0.16
686 0.17
687 0.15
688 0.11
689 0.12
690 0.1
691 0.12
692 0.14
693 0.16
694 0.18
695 0.19
696 0.19
697 0.2
698 0.19
699 0.22
700 0.2
701 0.19
702 0.17
703 0.17
704 0.17
705 0.17
706 0.2
707 0.18
708 0.16
709 0.15
710 0.15
711 0.14
712 0.14
713 0.15
714 0.13
715 0.13
716 0.14
717 0.13
718 0.14
719 0.14
720 0.13
721 0.13
722 0.13
723 0.12
724 0.12
725 0.13
726 0.12
727 0.15
728 0.16
729 0.17
730 0.17
731 0.19
732 0.19
733 0.23
734 0.26
735 0.25
736 0.23
737 0.23
738 0.2
739 0.18
740 0.17
741 0.15
742 0.15
743 0.15
744 0.15
745 0.14
746 0.16
747 0.16
748 0.16
749 0.13
750 0.12
751 0.1
752 0.11
753 0.14
754 0.15
755 0.17
756 0.17
757 0.17
758 0.16
759 0.15
760 0.16
761 0.14
762 0.12
763 0.08
764 0.1
765 0.1
766 0.1
767 0.1
768 0.08
769 0.1
770 0.1
771 0.11
772 0.09
773 0.09
774 0.09
775 0.09
776 0.11
777 0.13
778 0.17
779 0.24
780 0.26
781 0.27
782 0.3
783 0.35
784 0.35
785 0.33
786 0.34
787 0.34
788 0.36
789 0.44
790 0.42
791 0.43
792 0.4
793 0.39
794 0.37
795 0.3
796 0.28
797 0.19
798 0.25
799 0.2
800 0.23
801 0.25
802 0.24
803 0.23
804 0.2
805 0.24
806 0.18
807 0.2
808 0.19
809 0.16
810 0.16
811 0.16
812 0.15
813 0.18
814 0.22
815 0.2
816 0.2
817 0.28
818 0.3
819 0.33
820 0.35
821 0.31
822 0.28
823 0.32
824 0.3
825 0.23
826 0.24
827 0.22
828 0.21
829 0.22
830 0.22
831 0.19
832 0.18
833 0.16
834 0.14
835 0.15
836 0.19
837 0.17
838 0.16
839 0.16
840 0.17
841 0.17
842 0.16
843 0.14
844 0.1
845 0.09
846 0.09
847 0.09
848 0.11
849 0.14
850 0.16
851 0.18
852 0.18
853 0.21
854 0.29
855 0.29
856 0.28
857 0.31
858 0.3
859 0.32
860 0.37
861 0.34
862 0.27
863 0.27
864 0.27
865 0.22
866 0.23
867 0.19
868 0.16
869 0.18
870 0.17
871 0.18
872 0.21
873 0.21
874 0.22
875 0.22
876 0.23
877 0.23
878 0.26
879 0.28
880 0.27
881 0.27
882 0.26
883 0.29
884 0.26
885 0.26
886 0.27
887 0.27
888 0.25
889 0.27
890 0.26
891 0.23
892 0.23
893 0.21
894 0.16
895 0.13
896 0.1
897 0.08
898 0.07
899 0.07
900 0.06
901 0.08
902 0.1
903 0.1
904 0.11
905 0.12
906 0.12
907 0.16
908 0.19
909 0.24
910 0.27
911 0.3
912 0.34
913 0.4
914 0.44
915 0.42
916 0.46
917 0.44
918 0.44
919 0.48
920 0.48
921 0.43
922 0.43
923 0.46
924 0.45
925 0.43
926 0.4
927 0.35
928 0.33
929 0.33
930 0.31
931 0.27
932 0.21
933 0.18
934 0.16
935 0.14
936 0.11
937 0.11
938 0.12
939 0.11
940 0.11
941 0.13
942 0.17
943 0.2
944 0.24
945 0.31
946 0.39
947 0.44
948 0.49
949 0.5
950 0.47
951 0.47
952 0.52
953 0.52
954 0.45
955 0.38
956 0.35
957 0.32
958 0.33
959 0.3
960 0.22
961 0.14
962 0.15
963 0.18
964 0.2
965 0.23
966 0.24
967 0.27
968 0.3
969 0.34
970 0.34
971 0.4
972 0.47
973 0.51
974 0.56
975 0.58
976 0.61
977 0.59
978 0.55
979 0.47
980 0.37
981 0.29
982 0.22
983 0.17
984 0.11
985 0.09
986 0.06
987 0.06
988 0.05
989 0.05
990 0.07
991 0.08
992 0.07
993 0.07
994 0.07
995 0.07
996 0.07
997 0.08
998 0.06
999 0.06
1000 0.06
1001 0.06
1002 0.07
1003 0.07
1004 0.07
1005 0.07
1006 0.11
1007 0.12
1008 0.13
1009 0.15
1010 0.16
1011 0.22
1012 0.25
1013 0.25
1014 0.23
1015 0.29
1016 0.29
1017 0.26
1018 0.29
1019 0.23
1020 0.24
1021 0.26
1022 0.24
1023 0.16
1024 0.14
1025 0.15
1026 0.12
1027 0.13
1028 0.1
1029 0.11
1030 0.11
1031 0.11
1032 0.12
1033 0.12
1034 0.13
1035 0.12
1036 0.1
1037 0.08
1038 0.11
1039 0.11
1040 0.1
1041 0.11
1042 0.09
1043 0.09
1044 0.11
1045 0.13
1046 0.13
1047 0.13
1048 0.13
1049 0.13
1050 0.13
1051 0.13
1052 0.12
1053 0.1
1054 0.08
1055 0.08
1056 0.08
1057 0.07
1058 0.06
1059 0.06
1060 0.06
1061 0.06
1062 0.07