FuNGI

A0A3N4IPW2

Protein Details

Accession

A0A3N4IPW2

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
55-81	VAADPLRRPQPRQRRPRPPTETRPPIA	Hydrophilic
429-453	LEEMRKKNGKKVKKYLKSLEKNNTY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
61-72	RRPQPRQRRPRP
217-226	SASKRNPFKK
433-442	RKKNGKKVKK
545-554	AGAKLKKRKG

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 3, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSGINRPIGSGAPSQGIPQPQQHAPQSAQTVGPASEQGGGQAPTQAAPKVVRRNVAADPLRRPQPRQRRPRPPTETRPPIANGPTPSLQARLQQQNQLVEKANQKIKEEEEDGTWVDYPLITTKASLLKGLRHHVMRLAAKKPIDPSDPDEFTRPVRLHRRDPRLQPPGKEGDDPAKQPDDGLTPEERAKQEAERIAKDKEREEIQASIAPSKGERSASKRNPFKKKTMQVFHKDEADRKLRYEEYFPWHIEDFDNKNTWVGNLESGLSNGSYAMFVMKERSFQMVPIEKWYKFTQRNVFKNFTIEEAENLIKKKAKPARWLMDDLFKKLDPEAADGQSGIKREPPAMRQMFLVKGERLRQPKKEVADADELDFEDDFQDDEEAPIMDGDEEENKATEKRIKKEYLGANVFDTKDEKEYEEEERENKLLEEMRKKNGKKVKKYLKSLEKNNTYESDSDGNPYFSSEDSDSTTDEEAAKAEAEKIKKEKEAEEEELRKLQIDKEQRQAQLAAAQNGSAGTKRQSPPGSRTDSPAPQKKARTDEALAGAKLKKRKGGDGAGSDYDTGAETEGGNGIRKKAKMGGLQPGSRGASRGASPGTPGGTPGPVSILTEQEIIDLFKKNGLDKGISVKEMTSAFKAKVSTKESKGHFIALIKKITRHQGSMLWLKKEYGGTSY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.24
3	0.27
4	0.27
5	0.29
6	0.33
7	0.34
8	0.41
9	0.43
10	0.44
11	0.42
12	0.45
13	0.43
14	0.4
15	0.36
16	0.31
17	0.29
18	0.24
19	0.23
20	0.18
21	0.15
22	0.15
23	0.14
24	0.14
25	0.15
26	0.16
27	0.15
28	0.18
29	0.17
30	0.16
31	0.19
32	0.18
33	0.17
34	0.2
35	0.28
36	0.35
37	0.38
38	0.42
39	0.42
40	0.46
41	0.46
42	0.52
43	0.51
44	0.47
45	0.49
46	0.52
47	0.59
48	0.58
49	0.61
50	0.62
51	0.66
52	0.71
53	0.76
54	0.8
55	0.82
56	0.87
57	0.92
58	0.9
59	0.89
60	0.89
61	0.89
62	0.88
63	0.79
64	0.76
65	0.68
66	0.64
67	0.59
68	0.54
69	0.46
70	0.42
71	0.41
72	0.38
73	0.36
74	0.33
75	0.3
76	0.29
77	0.35
78	0.39
79	0.41
80	0.44
81	0.48
82	0.52
83	0.53
84	0.51
85	0.46
86	0.41
87	0.44
88	0.46
89	0.47
90	0.43
91	0.43
92	0.43
93	0.43
94	0.44
95	0.41
96	0.34
97	0.3
98	0.29
99	0.28
100	0.25
101	0.22
102	0.16
103	0.13
104	0.12
105	0.1
106	0.1
107	0.11
108	0.1
109	0.1
110	0.13
111	0.18
112	0.18
113	0.21
114	0.2
115	0.24
116	0.3
117	0.35
118	0.37
119	0.34
120	0.34
121	0.35
122	0.4
123	0.41
124	0.42
125	0.41
126	0.4
127	0.4
128	0.41
129	0.42
130	0.4
131	0.36
132	0.33
133	0.36
134	0.38
135	0.4
136	0.39
137	0.39
138	0.35
139	0.33
140	0.37
141	0.32
142	0.32
143	0.4
144	0.45
145	0.52
146	0.6
147	0.68
148	0.69
149	0.77
150	0.79
151	0.79
152	0.78
153	0.71
154	0.67
155	0.65
156	0.59
157	0.52
158	0.44
159	0.41
160	0.4
161	0.39
162	0.36
163	0.31
164	0.28
165	0.27
166	0.26
167	0.21
168	0.18
169	0.2
170	0.17
171	0.17
172	0.2
173	0.24
174	0.23
175	0.22
176	0.22
177	0.21
178	0.25
179	0.29
180	0.31
181	0.31
182	0.34
183	0.36
184	0.38
185	0.39
186	0.36
187	0.34
188	0.32
189	0.31
190	0.3
191	0.28
192	0.25
193	0.26
194	0.25
195	0.22
196	0.2
197	0.17
198	0.14
199	0.15
200	0.15
201	0.15
202	0.18
203	0.23
204	0.34
205	0.43
206	0.52
207	0.59
208	0.66
209	0.74
210	0.76
211	0.78
212	0.78
213	0.78
214	0.79
215	0.8
216	0.79
217	0.78
218	0.8
219	0.73
220	0.7
221	0.62
222	0.56
223	0.53
224	0.5
225	0.41
226	0.36
227	0.37
228	0.32
229	0.32
230	0.32
231	0.3
232	0.31
233	0.34
234	0.33
235	0.32
236	0.29
237	0.28
238	0.25
239	0.25
240	0.23
241	0.22
242	0.23
243	0.21
244	0.21
245	0.2
246	0.19
247	0.16
248	0.12
249	0.1
250	0.08
251	0.09
252	0.09
253	0.09
254	0.09
255	0.07
256	0.06
257	0.05
258	0.05
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.08
265	0.08
266	0.1
267	0.11
268	0.14
269	0.14
270	0.14
271	0.2
272	0.22
273	0.22
274	0.28
275	0.32
276	0.28
277	0.32
278	0.34
279	0.36
280	0.35
281	0.41
282	0.43
283	0.49
284	0.56
285	0.59
286	0.6
287	0.52
288	0.51
289	0.44
290	0.37
291	0.3
292	0.22
293	0.17
294	0.16
295	0.16
296	0.15
297	0.15
298	0.15
299	0.16
300	0.16
301	0.24
302	0.29
303	0.34
304	0.4
305	0.48
306	0.54
307	0.54
308	0.58
309	0.5
310	0.52
311	0.47
312	0.41
313	0.34
314	0.26
315	0.23
316	0.19
317	0.2
318	0.12
319	0.15
320	0.16
321	0.14
322	0.14
323	0.14
324	0.15
325	0.14
326	0.14
327	0.1
328	0.1
329	0.09
330	0.12
331	0.15
332	0.16
333	0.24
334	0.24
335	0.25
336	0.24
337	0.25
338	0.24
339	0.24
340	0.24
341	0.16
342	0.18
343	0.21
344	0.26
345	0.32
346	0.35
347	0.37
348	0.41
349	0.45
350	0.44
351	0.46
352	0.42
353	0.37
354	0.39
355	0.35
356	0.29
357	0.25
358	0.23
359	0.18
360	0.16
361	0.12
362	0.06
363	0.06
364	0.05
365	0.04
366	0.05
367	0.04
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.05
378	0.05
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.07
383	0.09
384	0.15
385	0.2
386	0.25
387	0.33
388	0.35
389	0.36
390	0.44
391	0.47
392	0.5
393	0.46
394	0.42
395	0.36
396	0.36
397	0.35
398	0.27
399	0.23
400	0.15
401	0.15
402	0.15
403	0.14
404	0.13
405	0.15
406	0.18
407	0.21
408	0.21
409	0.21
410	0.22
411	0.21
412	0.2
413	0.18
414	0.16
415	0.17
416	0.21
417	0.29
418	0.31
419	0.38
420	0.46
421	0.47
422	0.53
423	0.57
424	0.62
425	0.62
426	0.69
427	0.73
428	0.74
429	0.81
430	0.83
431	0.85
432	0.84
433	0.83
434	0.82
435	0.79
436	0.72
437	0.66
438	0.59
439	0.5
440	0.41
441	0.36
442	0.29
443	0.2
444	0.21
445	0.19
446	0.18
447	0.16
448	0.16
449	0.13
450	0.11
451	0.14
452	0.12
453	0.12
454	0.14
455	0.15
456	0.14
457	0.15
458	0.15
459	0.13
460	0.12
461	0.11
462	0.09
463	0.09
464	0.08
465	0.07
466	0.1
467	0.13
468	0.15
469	0.19
470	0.24
471	0.27
472	0.3
473	0.32
474	0.33
475	0.36
476	0.42
477	0.43
478	0.46
479	0.46
480	0.45
481	0.45
482	0.41
483	0.35
484	0.29
485	0.26
486	0.25
487	0.31
488	0.34
489	0.41
490	0.47
491	0.47
492	0.48
493	0.46
494	0.4
495	0.37
496	0.35
497	0.29
498	0.22
499	0.21
500	0.19
501	0.18
502	0.18
503	0.12
504	0.1
505	0.1
506	0.18
507	0.19
508	0.27
509	0.32
510	0.37
511	0.42
512	0.49
513	0.54
514	0.47
515	0.51
516	0.51
517	0.53
518	0.57
519	0.61
520	0.59
521	0.58
522	0.64
523	0.65
524	0.65
525	0.61
526	0.58
527	0.52
528	0.5
529	0.5
530	0.47
531	0.41
532	0.38
533	0.37
534	0.35
535	0.38
536	0.36
537	0.35
538	0.34
539	0.41
540	0.44
541	0.49
542	0.52
543	0.52
544	0.55
545	0.5
546	0.48
547	0.41
548	0.34
549	0.26
550	0.19
551	0.13
552	0.08
553	0.07
554	0.06
555	0.07
556	0.09
557	0.1
558	0.13
559	0.14
560	0.18
561	0.23
562	0.24
563	0.26
564	0.3
565	0.35
566	0.39
567	0.43
568	0.49
569	0.51
570	0.52
571	0.51
572	0.49
573	0.45
574	0.38
575	0.34
576	0.25
577	0.21
578	0.2
579	0.22
580	0.2
581	0.18
582	0.2
583	0.21
584	0.21
585	0.17
586	0.18
587	0.16
588	0.15
589	0.16
590	0.14
591	0.14
592	0.13
593	0.15
594	0.15
595	0.15
596	0.15
597	0.15
598	0.15
599	0.13
600	0.14
601	0.13
602	0.14
603	0.16
604	0.15
605	0.17
606	0.19
607	0.2
608	0.23
609	0.25
610	0.25
611	0.24
612	0.33
613	0.33
614	0.33
615	0.31
616	0.28
617	0.28
618	0.28
619	0.28
620	0.24
621	0.24
622	0.23
623	0.26
624	0.29
625	0.3
626	0.36
627	0.41
628	0.45
629	0.48
630	0.55
631	0.56
632	0.6
633	0.58
634	0.53
635	0.48
636	0.45
637	0.48
638	0.46
639	0.5
640	0.44
641	0.47
642	0.49
643	0.55
644	0.54
645	0.48
646	0.46
647	0.43
648	0.49
649	0.55
650	0.56
651	0.51
652	0.48
653	0.46
654	0.46
655	0.44

A0A3N4IPW2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer