Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4IC54

Protein Details
Accession A0A3N4IC54    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
298-318GDYDRRPPSPRERIRERTPLABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
184-217GPPPRGRSRSPVRGRYGAPPGRYPPSPPSIPRRG
307-312PRERIR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13, nucl 12.5, cyto 10.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MPAPPAQDSDRLYLGNLPKETTRADVEEFFGKEEMERSVTEIKLLGVFGFVQCKTVLAAREIIPKFHGKLIGENRVSVQMARGIARTGDSFPPGGRPGGKRSSFRMIVTGLPDTSWQDLKDFARKGDPDVVFSEIDRSGSGIIEYGTEAALHTAVKILDGTPYKGKGEDKTRIVACRIDAGGGGPPPRGRSRSPVRGRYGAPPGRYPPSPPSIPRRGYTPPPPRGAGGGYRGYSPREYYESRSPRRQYRGNGYDRERLSPPPRHMYPHPDDYRRREDPYPPKRGYEDERYGPMPGHRGDYDRRPPSPRERIRERTPLAPRGEPDYRSGRRAYEEERPHRGYH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.35
3 0.33
4 0.31
5 0.3
6 0.32
7 0.33
8 0.3
9 0.28
10 0.24
11 0.26
12 0.26
13 0.27
14 0.3
15 0.29
16 0.27
17 0.24
18 0.21
19 0.18
20 0.18
21 0.18
22 0.14
23 0.14
24 0.16
25 0.21
26 0.21
27 0.21
28 0.2
29 0.18
30 0.17
31 0.17
32 0.13
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.13
37 0.12
38 0.12
39 0.12
40 0.13
41 0.13
42 0.16
43 0.17
44 0.14
45 0.18
46 0.19
47 0.29
48 0.29
49 0.29
50 0.28
51 0.3
52 0.3
53 0.29
54 0.31
55 0.22
56 0.31
57 0.37
58 0.44
59 0.41
60 0.4
61 0.38
62 0.36
63 0.36
64 0.27
65 0.21
66 0.15
67 0.16
68 0.16
69 0.15
70 0.13
71 0.13
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.14
76 0.14
77 0.15
78 0.14
79 0.18
80 0.18
81 0.18
82 0.19
83 0.21
84 0.26
85 0.34
86 0.39
87 0.38
88 0.41
89 0.48
90 0.46
91 0.43
92 0.4
93 0.32
94 0.29
95 0.29
96 0.25
97 0.17
98 0.15
99 0.15
100 0.14
101 0.14
102 0.14
103 0.11
104 0.11
105 0.14
106 0.16
107 0.23
108 0.22
109 0.21
110 0.26
111 0.26
112 0.29
113 0.33
114 0.32
115 0.27
116 0.27
117 0.28
118 0.22
119 0.22
120 0.21
121 0.13
122 0.13
123 0.1
124 0.09
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.08
146 0.09
147 0.11
148 0.12
149 0.14
150 0.14
151 0.15
152 0.17
153 0.18
154 0.24
155 0.28
156 0.28
157 0.31
158 0.32
159 0.32
160 0.32
161 0.28
162 0.22
163 0.18
164 0.16
165 0.12
166 0.11
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.09
173 0.12
174 0.14
175 0.17
176 0.17
177 0.24
178 0.32
179 0.42
180 0.5
181 0.55
182 0.57
183 0.59
184 0.59
185 0.57
186 0.58
187 0.51
188 0.45
189 0.4
190 0.38
191 0.38
192 0.36
193 0.34
194 0.29
195 0.3
196 0.31
197 0.32
198 0.37
199 0.42
200 0.45
201 0.42
202 0.43
203 0.42
204 0.45
205 0.52
206 0.54
207 0.52
208 0.52
209 0.53
210 0.48
211 0.45
212 0.41
213 0.33
214 0.28
215 0.25
216 0.22
217 0.22
218 0.23
219 0.23
220 0.22
221 0.21
222 0.19
223 0.2
224 0.22
225 0.26
226 0.36
227 0.43
228 0.48
229 0.56
230 0.59
231 0.63
232 0.68
233 0.69
234 0.67
235 0.68
236 0.72
237 0.7
238 0.72
239 0.69
240 0.69
241 0.63
242 0.6
243 0.51
244 0.48
245 0.48
246 0.48
247 0.49
248 0.5
249 0.51
250 0.52
251 0.54
252 0.57
253 0.56
254 0.58
255 0.6
256 0.59
257 0.64
258 0.66
259 0.71
260 0.66
261 0.65
262 0.58
263 0.61
264 0.64
265 0.67
266 0.69
267 0.63
268 0.62
269 0.59
270 0.61
271 0.59
272 0.57
273 0.55
274 0.49
275 0.51
276 0.49
277 0.47
278 0.42
279 0.37
280 0.33
281 0.27
282 0.27
283 0.24
284 0.27
285 0.32
286 0.4
287 0.48
288 0.5
289 0.53
290 0.54
291 0.59
292 0.66
293 0.71
294 0.71
295 0.7
296 0.73
297 0.77
298 0.8
299 0.84
300 0.77
301 0.76
302 0.75
303 0.73
304 0.69
305 0.64
306 0.58
307 0.55
308 0.57
309 0.49
310 0.46
311 0.48
312 0.47
313 0.46
314 0.47
315 0.42
316 0.42
317 0.46
318 0.45
319 0.46
320 0.52
321 0.57
322 0.63