FuNGI

A0A3N4IJQ5

Protein Details

Accession

A0A3N4IJQ5

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
76-95	SEPFGPPKPHRTTRRSPISH	Hydrophilic
248-267	AGPHRKQPHRTQPPPPPPPP	Basic
538-557	LDVLRKTRSNPKKDEAKAGK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
548-556	PKKDEAKAG

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 11, cyto 7, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045358 Ty3_capsid
Gene Ontology	GO:0043227 C:membrane-bounded organelle
Pfam	View protein in Pfam PF19259 Ty3_capsid

Amino Acid Sequences

MGDTADNSSGNPAKTAPGGYYPSSPAINISTQGSSVKTEPAIPPARQAADNALRRRTSRLDVNIPADPQQPRSADSEPFGPPKPHRTTRRSPISHLPAPGSSSTSAFPWDTRPVLDLRTPPIPKKELPPNAPIKDAYEKLQRALGASNEDLAQELHQLVEEINNDPSITASKPINIVDALNIRLEQMRDWARINRNNTVNVYNQLQLEKQAHHATRAQLTATLPADNDPNDSSSDEERDPPRSPTDPAGPHRKQPHRTQPPPPPPPPPPPPPPPPGTTWYDPEDPPYRYIPTGILPTDPDSIEIPRSLKIPLQAHPIPVFNGSGDVEAIFKFLKALQHHIRLLDTFNDHQRIRYTTTYFEGAVLQWAVTWRSTTPASGFTWAQFVKDFKEQWLPPTAHYYLSTKLQNLQLRGATNIDQFNHEFTSTLEMMGHSKLSKISEASPYFQLYQSKIKDPAITMTSAANAARPSVPAAKPAKHPGARKPYQAHLKVTDISEPEENEDYTDPELHAVQPAYVRRCHLCLAMDHLMRTCPLKPSLDVLRKTRSNPKKDEAKAGKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.23
3	0.19
4	0.21
5	0.25
6	0.26
7	0.28
8	0.29
9	0.3
10	0.29
11	0.27
12	0.23
13	0.22
14	0.22
15	0.2
16	0.2
17	0.18
18	0.18
19	0.2
20	0.19
21	0.18
22	0.18
23	0.2
24	0.18
25	0.21
26	0.22
27	0.29
28	0.35
29	0.32
30	0.36
31	0.38
32	0.4
33	0.36
34	0.36
35	0.36
36	0.39
37	0.46
38	0.47
39	0.48
40	0.48
41	0.49
42	0.54
43	0.5
44	0.47
45	0.48
46	0.51
47	0.53
48	0.56
49	0.58
50	0.56
51	0.52
52	0.48
53	0.45
54	0.39
55	0.34
56	0.34
57	0.31
58	0.29
59	0.33
60	0.33
61	0.3
62	0.3
63	0.32
64	0.3
65	0.33
66	0.35
67	0.35
68	0.35
69	0.42
70	0.5
71	0.55
72	0.6
73	0.64
74	0.71
75	0.77
76	0.84
77	0.78
78	0.75
79	0.76
80	0.75
81	0.71
82	0.63
83	0.56
84	0.46
85	0.44
86	0.39
87	0.31
88	0.23
89	0.2
90	0.18
91	0.16
92	0.17
93	0.15
94	0.15
95	0.16
96	0.2
97	0.2
98	0.2
99	0.21
100	0.2
101	0.22
102	0.26
103	0.24
104	0.24
105	0.32
106	0.34
107	0.36
108	0.41
109	0.42
110	0.41
111	0.46
112	0.52
113	0.53
114	0.54
115	0.59
116	0.61
117	0.59
118	0.59
119	0.52
120	0.46
121	0.43
122	0.4
123	0.36
124	0.35
125	0.34
126	0.33
127	0.35
128	0.3
129	0.26
130	0.26
131	0.23
132	0.18
133	0.17
134	0.17
135	0.15
136	0.14
137	0.14
138	0.12
139	0.1
140	0.08
141	0.07
142	0.06
143	0.06
144	0.06
145	0.06
146	0.08
147	0.09
148	0.1
149	0.1
150	0.1
151	0.1
152	0.1
153	0.1
154	0.1
155	0.09
156	0.1
157	0.1
158	0.11
159	0.14
160	0.14
161	0.15
162	0.13
163	0.13
164	0.13
165	0.15
166	0.14
167	0.13
168	0.12
169	0.12
170	0.13
171	0.13
172	0.11
173	0.14
174	0.17
175	0.18
176	0.21
177	0.27
178	0.33
179	0.39
180	0.43
181	0.44
182	0.44
183	0.45
184	0.45
185	0.41
186	0.36
187	0.32
188	0.3
189	0.25
190	0.23
191	0.21
192	0.18
193	0.19
194	0.19
195	0.17
196	0.19
197	0.23
198	0.23
199	0.24
200	0.27
201	0.26
202	0.27
203	0.27
204	0.23
205	0.19
206	0.19
207	0.2
208	0.18
209	0.15
210	0.12
211	0.12
212	0.13
213	0.11
214	0.13
215	0.09
216	0.1
217	0.1
218	0.11
219	0.12
220	0.12
221	0.14
222	0.14
223	0.17
224	0.18
225	0.21
226	0.22
227	0.22
228	0.25
229	0.24
230	0.25
231	0.24
232	0.29
233	0.31
234	0.34
235	0.43
236	0.41
237	0.45
238	0.52
239	0.57
240	0.56
241	0.59
242	0.66
243	0.66
244	0.71
245	0.74
246	0.75
247	0.78
248	0.8
249	0.74
250	0.69
251	0.63
252	0.64
253	0.63
254	0.59
255	0.55
256	0.53
257	0.56
258	0.54
259	0.52
260	0.47
261	0.44
262	0.41
263	0.4
264	0.35
265	0.32
266	0.31
267	0.3
268	0.27
269	0.28
270	0.29
271	0.25
272	0.25
273	0.24
274	0.21
275	0.19
276	0.2
277	0.16
278	0.14
279	0.15
280	0.13
281	0.12
282	0.11
283	0.13
284	0.14
285	0.13
286	0.12
287	0.11
288	0.11
289	0.11
290	0.12
291	0.11
292	0.1
293	0.11
294	0.11
295	0.11
296	0.16
297	0.18
298	0.19
299	0.25
300	0.26
301	0.27
302	0.27
303	0.27
304	0.22
305	0.2
306	0.18
307	0.11
308	0.11
309	0.09
310	0.08
311	0.07
312	0.07
313	0.06
314	0.06
315	0.07
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.07
320	0.11
321	0.12
322	0.2
323	0.24
324	0.3
325	0.31
326	0.31
327	0.31
328	0.27
329	0.27
330	0.22
331	0.19
332	0.16
333	0.2
334	0.24
335	0.23
336	0.24
337	0.26
338	0.26
339	0.27
340	0.29
341	0.27
342	0.24
343	0.26
344	0.27
345	0.24
346	0.22
347	0.18
348	0.14
349	0.13
350	0.11
351	0.08
352	0.07
353	0.08
354	0.08
355	0.07
356	0.08
357	0.07
358	0.1
359	0.11
360	0.11
361	0.11
362	0.14
363	0.15
364	0.17
365	0.17
366	0.15
367	0.2
368	0.19
369	0.18
370	0.17
371	0.17
372	0.17
373	0.22
374	0.22
375	0.2
376	0.28
377	0.28
378	0.29
379	0.36
380	0.34
381	0.3
382	0.35
383	0.34
384	0.27
385	0.28
386	0.27
387	0.22
388	0.26
389	0.27
390	0.22
391	0.25
392	0.31
393	0.33
394	0.32
395	0.33
396	0.31
397	0.3
398	0.3
399	0.28
400	0.23
401	0.22
402	0.23
403	0.2
404	0.2
405	0.2
406	0.21
407	0.21
408	0.18
409	0.15
410	0.13
411	0.18
412	0.16
413	0.15
414	0.13
415	0.12
416	0.14
417	0.14
418	0.15
419	0.09
420	0.1
421	0.12
422	0.13
423	0.14
424	0.15
425	0.18
426	0.25
427	0.27
428	0.29
429	0.3
430	0.31
431	0.31
432	0.32
433	0.32
434	0.26
435	0.33
436	0.33
437	0.36
438	0.37
439	0.38
440	0.38
441	0.35
442	0.38
443	0.31
444	0.28
445	0.24
446	0.21
447	0.19
448	0.18
449	0.17
450	0.13
451	0.11
452	0.12
453	0.12
454	0.12
455	0.15
456	0.2
457	0.21
458	0.27
459	0.33
460	0.35
461	0.4
462	0.48
463	0.54
464	0.53
465	0.58
466	0.61
467	0.66
468	0.67
469	0.69
470	0.66
471	0.66
472	0.7
473	0.7
474	0.66
475	0.6
476	0.58
477	0.53
478	0.5
479	0.45
480	0.36
481	0.33
482	0.3
483	0.27
484	0.26
485	0.25
486	0.24
487	0.21
488	0.21
489	0.19
490	0.18
491	0.19
492	0.15
493	0.14
494	0.15
495	0.14
496	0.16
497	0.15
498	0.15
499	0.18
500	0.25
501	0.27
502	0.29
503	0.32
504	0.32
505	0.34
506	0.35
507	0.34
508	0.31
509	0.29
510	0.34
511	0.39
512	0.38
513	0.36
514	0.35
515	0.33
516	0.31
517	0.31
518	0.26
519	0.23
520	0.25
521	0.27
522	0.28
523	0.33
524	0.42
525	0.49
526	0.52
527	0.53
528	0.58
529	0.6
530	0.64
531	0.68
532	0.68
533	0.69
534	0.71
535	0.74
536	0.75
537	0.76
538	0.81

A0A3N4IJQ5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer