Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4HXW6

Protein Details
Accession A0A3N4HXW6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
436-456LLNRQPFYRSHRKQTKYPPGSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, extr 7, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
Amino Acid Sequences MTTTNTSDSLAPFAVSTNRDTFHTTYGSGLKLQSTNYHAWASAMLYILSGANAREIVTGEEAPPPAANTGAVKTYRQRSQQAVNLIYQACGDTERSHIEGIFDPIAMWTRLATIYDALATDDYSRAAVEHQFNNARMGTQFSCTRDYLAHLRTFQRQLAGSPNAIDDAKVIRHLFRTLPPKYRYILTHLRQLPVAEATVDNIEQRLPDEELFIQSGADAVGLDPATSATFANATALSAATANAAFPSFGHHGAHQPQSVVQDQGPRNSADFRDGYRQGMQAQADRARNVNQHAPQQHQQNARGQRQYTGARDYSTMRCHYCNQLGHGRSDCRLRMDTERLNAHRKQTHHSTTFRPSHRSGHWDKQPTQQLGGNANRHHVASRRNFGGHAAVAQAEEDMDPTEIFRDVDCMMAQADQFIDSNDRTLVFIIRSHPPHLLNRQPFYRSHRKQTKYPPGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.21
4 0.22
5 0.23
6 0.24
7 0.29
8 0.29
9 0.29
10 0.3
11 0.26
12 0.26
13 0.28
14 0.28
15 0.25
16 0.24
17 0.23
18 0.22
19 0.23
20 0.24
21 0.26
22 0.28
23 0.29
24 0.29
25 0.26
26 0.24
27 0.24
28 0.2
29 0.17
30 0.15
31 0.11
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.08
41 0.08
42 0.09
43 0.1
44 0.13
45 0.13
46 0.13
47 0.16
48 0.16
49 0.16
50 0.16
51 0.15
52 0.12
53 0.12
54 0.11
55 0.1
56 0.12
57 0.16
58 0.17
59 0.18
60 0.25
61 0.32
62 0.38
63 0.42
64 0.45
65 0.46
66 0.53
67 0.56
68 0.57
69 0.53
70 0.47
71 0.46
72 0.41
73 0.35
74 0.28
75 0.22
76 0.14
77 0.13
78 0.13
79 0.1
80 0.12
81 0.15
82 0.16
83 0.16
84 0.16
85 0.17
86 0.17
87 0.2
88 0.17
89 0.14
90 0.13
91 0.13
92 0.15
93 0.13
94 0.11
95 0.08
96 0.09
97 0.09
98 0.1
99 0.1
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.08
114 0.12
115 0.16
116 0.17
117 0.22
118 0.25
119 0.26
120 0.28
121 0.27
122 0.23
123 0.19
124 0.22
125 0.18
126 0.18
127 0.21
128 0.21
129 0.24
130 0.24
131 0.24
132 0.2
133 0.23
134 0.26
135 0.27
136 0.28
137 0.27
138 0.3
139 0.35
140 0.37
141 0.34
142 0.3
143 0.26
144 0.25
145 0.28
146 0.28
147 0.22
148 0.2
149 0.19
150 0.18
151 0.17
152 0.15
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.13
160 0.15
161 0.16
162 0.2
163 0.29
164 0.31
165 0.39
166 0.4
167 0.42
168 0.42
169 0.43
170 0.38
171 0.37
172 0.42
173 0.35
174 0.42
175 0.41
176 0.41
177 0.38
178 0.37
179 0.3
180 0.21
181 0.19
182 0.11
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.08
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.04
205 0.03
206 0.03
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.03
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.03
233 0.08
234 0.09
235 0.1
236 0.11
237 0.11
238 0.15
239 0.19
240 0.22
241 0.18
242 0.17
243 0.17
244 0.19
245 0.19
246 0.17
247 0.14
248 0.2
249 0.2
250 0.22
251 0.23
252 0.21
253 0.21
254 0.22
255 0.21
256 0.17
257 0.17
258 0.17
259 0.22
260 0.22
261 0.24
262 0.23
263 0.24
264 0.21
265 0.23
266 0.22
267 0.18
268 0.21
269 0.24
270 0.24
271 0.24
272 0.25
273 0.24
274 0.26
275 0.27
276 0.3
277 0.27
278 0.32
279 0.35
280 0.39
281 0.41
282 0.45
283 0.48
284 0.47
285 0.47
286 0.48
287 0.54
288 0.55
289 0.55
290 0.49
291 0.45
292 0.45
293 0.46
294 0.41
295 0.38
296 0.33
297 0.29
298 0.3
299 0.31
300 0.3
301 0.3
302 0.3
303 0.27
304 0.29
305 0.31
306 0.35
307 0.38
308 0.36
309 0.36
310 0.41
311 0.41
312 0.42
313 0.43
314 0.39
315 0.35
316 0.38
317 0.34
318 0.3
319 0.3
320 0.3
321 0.32
322 0.38
323 0.4
324 0.4
325 0.46
326 0.46
327 0.51
328 0.51
329 0.52
330 0.5
331 0.47
332 0.48
333 0.5
334 0.55
335 0.55
336 0.57
337 0.55
338 0.6
339 0.66
340 0.64
341 0.6
342 0.55
343 0.55
344 0.55
345 0.57
346 0.55
347 0.56
348 0.6
349 0.63
350 0.63
351 0.65
352 0.7
353 0.64
354 0.59
355 0.53
356 0.48
357 0.47
358 0.51
359 0.48
360 0.4
361 0.4
362 0.38
363 0.35
364 0.34
365 0.31
366 0.33
367 0.36
368 0.42
369 0.43
370 0.43
371 0.43
372 0.42
373 0.41
374 0.33
375 0.25
376 0.19
377 0.15
378 0.14
379 0.14
380 0.12
381 0.08
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.1
393 0.1
394 0.12
395 0.12
396 0.11
397 0.11
398 0.12
399 0.12
400 0.1
401 0.1
402 0.09
403 0.1
404 0.1
405 0.13
406 0.12
407 0.14
408 0.14
409 0.14
410 0.14
411 0.15
412 0.16
413 0.14
414 0.16
415 0.19
416 0.26
417 0.29
418 0.31
419 0.34
420 0.36
421 0.43
422 0.49
423 0.56
424 0.56
425 0.6
426 0.63
427 0.62
428 0.64
429 0.65
430 0.67
431 0.65
432 0.68
433 0.72
434 0.72
435 0.78
436 0.84