Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4HRA9

Protein Details
Accession A0A3N4HRA9    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-64VLKKNGPPPYGQRKNWRPRTLEHydrophilic
390-414AREREQLRRERRKEEERKLRMQRMGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
222-238PKFKHKKIPRGPPSPPP
347-362LAGRGGSTRGRSRSRS
393-412REQLRRERRKEEERKLRMQR
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MASISAALTSSLPAPKHKYETEKSSSTAPTSRIVGSETSAQLVLKKNGPPPYGQRKNWRPRTLEDYSDGGSFPEIPIAQYPLDMGRSGSTTSTTKALSLQVDASGKLKYDALVRQGHDESRIIHSSFRDLIPLRQRADVGEISLERPDEETVAAQTEKTRLALEKLVSGAVAAQRPKMVKGTNQREATFVRYTPSSQMGDNTKKTERIIKIVEKQIDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAADQEAWRIPPPVSNWKNPKGFTVPLDKRLAADGRGLQDVSINDNFARLSEALYAADRHAREEVRQRAQMQRKLAEKEKASKEENLRMLAQKAREAALAGRGGSTRGRSRSRSGSVDSRSSRSRSSSRSRSGSDSEDEEAAREREQLRRERRKEEERKLRMQRMGAERRLQVMAKESGRDISEKMALGIAKPTTTSDAQYDSRLFNSTSAFNAGFNEDQVYDKPLFAATDAIAAMYRPRAHLSDDEDEASDRLDRMKKEKRFDVLGRASKSFKGADKTEERTGPIQFEAAEGTVKEDFFNVDSFLERVERGVEEKAGAAAGKKHGLQVEEKGGKRARVEEDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.34
3 0.41
4 0.46
5 0.52
6 0.55
7 0.62
8 0.64
9 0.61
10 0.57
11 0.56
12 0.53
13 0.48
14 0.45
15 0.38
16 0.34
17 0.34
18 0.33
19 0.28
20 0.27
21 0.24
22 0.21
23 0.25
24 0.22
25 0.2
26 0.2
27 0.19
28 0.21
29 0.26
30 0.28
31 0.28
32 0.32
33 0.37
34 0.44
35 0.45
36 0.46
37 0.5
38 0.58
39 0.63
40 0.65
41 0.7
42 0.73
43 0.82
44 0.88
45 0.86
46 0.8
47 0.76
48 0.77
49 0.72
50 0.66
51 0.59
52 0.51
53 0.44
54 0.4
55 0.34
56 0.26
57 0.2
58 0.16
59 0.12
60 0.12
61 0.11
62 0.11
63 0.12
64 0.15
65 0.14
66 0.13
67 0.14
68 0.13
69 0.14
70 0.13
71 0.12
72 0.11
73 0.12
74 0.13
75 0.13
76 0.14
77 0.14
78 0.16
79 0.18
80 0.17
81 0.16
82 0.17
83 0.2
84 0.18
85 0.18
86 0.17
87 0.18
88 0.19
89 0.19
90 0.18
91 0.16
92 0.15
93 0.14
94 0.14
95 0.11
96 0.15
97 0.18
98 0.23
99 0.27
100 0.28
101 0.32
102 0.34
103 0.34
104 0.31
105 0.29
106 0.25
107 0.26
108 0.28
109 0.24
110 0.24
111 0.24
112 0.25
113 0.27
114 0.24
115 0.24
116 0.22
117 0.28
118 0.35
119 0.4
120 0.38
121 0.37
122 0.37
123 0.33
124 0.36
125 0.3
126 0.21
127 0.19
128 0.17
129 0.16
130 0.17
131 0.16
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.11
143 0.12
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.12
148 0.15
149 0.19
150 0.18
151 0.18
152 0.18
153 0.17
154 0.15
155 0.14
156 0.13
157 0.11
158 0.14
159 0.13
160 0.13
161 0.15
162 0.16
163 0.18
164 0.2
165 0.2
166 0.24
167 0.34
168 0.42
169 0.48
170 0.51
171 0.5
172 0.49
173 0.49
174 0.46
175 0.38
176 0.3
177 0.23
178 0.2
179 0.21
180 0.21
181 0.23
182 0.2
183 0.17
184 0.21
185 0.26
186 0.31
187 0.33
188 0.35
189 0.33
190 0.34
191 0.34
192 0.39
193 0.34
194 0.33
195 0.37
196 0.39
197 0.44
198 0.49
199 0.51
200 0.43
201 0.43
202 0.39
203 0.34
204 0.28
205 0.26
206 0.26
207 0.25
208 0.26
209 0.35
210 0.4
211 0.41
212 0.5
213 0.55
214 0.6
215 0.67
216 0.76
217 0.75
218 0.77
219 0.79
220 0.78
221 0.76
222 0.72
223 0.66
224 0.56
225 0.52
226 0.49
227 0.5
228 0.5
229 0.5
230 0.48
231 0.49
232 0.5
233 0.45
234 0.4
235 0.39
236 0.39
237 0.36
238 0.33
239 0.3
240 0.29
241 0.29
242 0.29
243 0.26
244 0.17
245 0.13
246 0.14
247 0.17
248 0.25
249 0.28
250 0.35
251 0.41
252 0.47
253 0.52
254 0.49
255 0.49
256 0.42
257 0.4
258 0.35
259 0.39
260 0.34
261 0.35
262 0.37
263 0.34
264 0.3
265 0.31
266 0.29
267 0.19
268 0.18
269 0.15
270 0.14
271 0.15
272 0.14
273 0.12
274 0.13
275 0.12
276 0.13
277 0.12
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.08
283 0.09
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.1
293 0.09
294 0.1
295 0.12
296 0.12
297 0.14
298 0.22
299 0.29
300 0.31
301 0.34
302 0.35
303 0.42
304 0.49
305 0.51
306 0.47
307 0.45
308 0.45
309 0.47
310 0.49
311 0.46
312 0.41
313 0.45
314 0.47
315 0.47
316 0.44
317 0.45
318 0.44
319 0.45
320 0.45
321 0.39
322 0.34
323 0.31
324 0.31
325 0.28
326 0.25
327 0.2
328 0.18
329 0.16
330 0.15
331 0.14
332 0.12
333 0.13
334 0.13
335 0.11
336 0.11
337 0.1
338 0.11
339 0.11
340 0.14
341 0.15
342 0.2
343 0.25
344 0.28
345 0.32
346 0.39
347 0.42
348 0.43
349 0.42
350 0.44
351 0.43
352 0.48
353 0.45
354 0.42
355 0.41
356 0.39
357 0.37
358 0.34
359 0.36
360 0.36
361 0.43
362 0.48
363 0.52
364 0.55
365 0.56
366 0.55
367 0.53
368 0.49
369 0.42
370 0.35
371 0.3
372 0.25
373 0.23
374 0.19
375 0.17
376 0.15
377 0.13
378 0.13
379 0.14
380 0.18
381 0.24
382 0.33
383 0.41
384 0.52
385 0.57
386 0.62
387 0.69
388 0.75
389 0.79
390 0.81
391 0.81
392 0.78
393 0.83
394 0.84
395 0.82
396 0.75
397 0.68
398 0.64
399 0.63
400 0.64
401 0.59
402 0.56
403 0.49
404 0.48
405 0.47
406 0.4
407 0.3
408 0.27
409 0.27
410 0.24
411 0.24
412 0.22
413 0.22
414 0.22
415 0.22
416 0.18
417 0.15
418 0.16
419 0.15
420 0.15
421 0.15
422 0.14
423 0.13
424 0.16
425 0.13
426 0.11
427 0.11
428 0.12
429 0.13
430 0.14
431 0.15
432 0.14
433 0.19
434 0.2
435 0.23
436 0.24
437 0.21
438 0.22
439 0.22
440 0.21
441 0.17
442 0.19
443 0.17
444 0.16
445 0.18
446 0.17
447 0.15
448 0.16
449 0.17
450 0.15
451 0.14
452 0.14
453 0.12
454 0.13
455 0.13
456 0.16
457 0.14
458 0.14
459 0.14
460 0.13
461 0.13
462 0.12
463 0.12
464 0.08
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.08
469 0.08
470 0.09
471 0.11
472 0.12
473 0.12
474 0.15
475 0.16
476 0.19
477 0.23
478 0.28
479 0.29
480 0.3
481 0.3
482 0.28
483 0.28
484 0.25
485 0.21
486 0.16
487 0.12
488 0.15
489 0.19
490 0.22
491 0.3
492 0.4
493 0.47
494 0.54
495 0.61
496 0.61
497 0.64
498 0.65
499 0.66
500 0.67
501 0.67
502 0.63
503 0.59
504 0.56
505 0.49
506 0.48
507 0.41
508 0.36
509 0.35
510 0.33
511 0.39
512 0.43
513 0.48
514 0.52
515 0.5
516 0.48
517 0.45
518 0.44
519 0.38
520 0.32
521 0.27
522 0.2
523 0.18
524 0.16
525 0.14
526 0.13
527 0.11
528 0.13
529 0.14
530 0.14
531 0.13
532 0.12
533 0.13
534 0.13
535 0.14
536 0.12
537 0.11
538 0.12
539 0.12
540 0.13
541 0.14
542 0.12
543 0.12
544 0.13
545 0.14
546 0.15
547 0.17
548 0.17
549 0.16
550 0.17
551 0.16
552 0.15
553 0.14
554 0.14
555 0.15
556 0.18
557 0.21
558 0.21
559 0.25
560 0.27
561 0.29
562 0.31
563 0.33
564 0.39
565 0.44
566 0.44
567 0.49
568 0.5
569 0.51
570 0.5
571 0.5
572 0.47