FuNGI

A0A3N4HMX5

Protein Details

Accession

A0A3N4HMX5

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-24	MPPKSAIKPKAPPRRKAANDDAST	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-16	IKPKAPPRRK
85-104	ARGAKPGLKFKPKAPVRRSK
133-165	DRGSFRGRGERGGFKSDRGGKGRGGPGKGGFKK

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 9.5, mito 9, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKSAIKPKAPPRRKAANDDASTPATSGEPSSSSAPTADAPGTHVAPVAPMVAPAVPVASLPVAPPVGRLDSMRKPLSINTGAARGAKPGLKFKPKAPVRRSKEELEAIAAQEAIATAAAEGANPAPFAPRDRGSFRGRGERGGFKSDRGGKGRGGPGKGGFKKEEQHAPVATGVFSMGSVVTGRKQVIIERRGDDKKGGLGGLKFGRSTRAPKLEDGNYKDGYVSDDDDGPKIDIDKLEELSGDEFDDVDRETGFPIRVDREVHPESHRVVNTEKIGEARKKTVKKTVKNESTSDTEDLPDAPSPEKDGPTEPELDENGRPIDPSEFAKSQEELYERDFAEDERWKLLEDLGAVLPEDVVDFVDRRAAAQAAGDTDIRPLRIQMPAREQEFFYLQFPQMMKSLVKEEDKSGSPIMMDLTQEEDSKKGIIKSEEPSSTSETDMTDVDKLPYNEEVGRLRFHESGRITIRWGFGDDVRYYDVTRGFENRFAQEIYGFNQEATEFKDDNQNNIGHAYYLGNVAGRLVISTAEESLGMEKEN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.85
2	0.83
3	0.82
4	0.82
5	0.81
6	0.75
7	0.7
8	0.66
9	0.58
10	0.51
11	0.42
12	0.32
13	0.22
14	0.19
15	0.16
16	0.13
17	0.12
18	0.14
19	0.17
20	0.17
21	0.17
22	0.17
23	0.17
24	0.16
25	0.17
26	0.16
27	0.13
28	0.15
29	0.18
30	0.18
31	0.17
32	0.16
33	0.13
34	0.13
35	0.13
36	0.12
37	0.08
38	0.08
39	0.08
40	0.08
41	0.08
42	0.08
43	0.07
44	0.06
45	0.06
46	0.07
47	0.07
48	0.07
49	0.07
50	0.1
51	0.1
52	0.1
53	0.12
54	0.13
55	0.15
56	0.16
57	0.18
58	0.22
59	0.28
60	0.37
61	0.37
62	0.35
63	0.35
64	0.36
65	0.42
66	0.39
67	0.34
68	0.28
69	0.29
70	0.29
71	0.3
72	0.28
73	0.21
74	0.21
75	0.22
76	0.23
77	0.28
78	0.36
79	0.43
80	0.45
81	0.48
82	0.55
83	0.6
84	0.68
85	0.68
86	0.71
87	0.69
88	0.77
89	0.78
90	0.72
91	0.71
92	0.65
93	0.57
94	0.5
95	0.43
96	0.34
97	0.29
98	0.24
99	0.16
100	0.12
101	0.11
102	0.06
103	0.05
104	0.04
105	0.03
106	0.04
107	0.04
108	0.04
109	0.05
110	0.05
111	0.06
112	0.06
113	0.06
114	0.07
115	0.08
116	0.12
117	0.16
118	0.19
119	0.23
120	0.27
121	0.33
122	0.36
123	0.42
124	0.42
125	0.48
126	0.45
127	0.46
128	0.47
129	0.49
130	0.47
131	0.48
132	0.45
133	0.36
134	0.43
135	0.45
136	0.47
137	0.43
138	0.42
139	0.36
140	0.43
141	0.48
142	0.45
143	0.4
144	0.36
145	0.36
146	0.44
147	0.45
148	0.42
149	0.38
150	0.36
151	0.39
152	0.42
153	0.45
154	0.37
155	0.38
156	0.34
157	0.33
158	0.32
159	0.27
160	0.22
161	0.14
162	0.11
163	0.07
164	0.07
165	0.06
166	0.04
167	0.04
168	0.04
169	0.05
170	0.06
171	0.08
172	0.09
173	0.1
174	0.11
175	0.15
176	0.23
177	0.27
178	0.29
179	0.3
180	0.37
181	0.38
182	0.39
183	0.36
184	0.28
185	0.26
186	0.23
187	0.21
188	0.16
189	0.14
190	0.17
191	0.18
192	0.18
193	0.16
194	0.15
195	0.18
196	0.18
197	0.23
198	0.26
199	0.31
200	0.32
201	0.34
202	0.39
203	0.42
204	0.47
205	0.47
206	0.45
207	0.37
208	0.36
209	0.34
210	0.28
211	0.24
212	0.18
213	0.14
214	0.1
215	0.12
216	0.12
217	0.12
218	0.13
219	0.11
220	0.1
221	0.09
222	0.09
223	0.08
224	0.09
225	0.11
226	0.1
227	0.1
228	0.1
229	0.1
230	0.1
231	0.09
232	0.07
233	0.06
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.04
240	0.04
241	0.05
242	0.06
243	0.07
244	0.07
245	0.08
246	0.1
247	0.11
248	0.14
249	0.15
250	0.21
251	0.21
252	0.23
253	0.24
254	0.24
255	0.25
256	0.26
257	0.25
258	0.2
259	0.2
260	0.21
261	0.2
262	0.19
263	0.17
264	0.15
265	0.19
266	0.2
267	0.21
268	0.24
269	0.3
270	0.34
271	0.37
272	0.45
273	0.5
274	0.55
275	0.62
276	0.66
277	0.67
278	0.66
279	0.65
280	0.59
281	0.54
282	0.48
283	0.41
284	0.31
285	0.22
286	0.19
287	0.17
288	0.15
289	0.11
290	0.1
291	0.09
292	0.09
293	0.12
294	0.13
295	0.13
296	0.13
297	0.14
298	0.16
299	0.18
300	0.2
301	0.16
302	0.17
303	0.17
304	0.18
305	0.16
306	0.14
307	0.14
308	0.11
309	0.11
310	0.1
311	0.11
312	0.1
313	0.13
314	0.16
315	0.16
316	0.18
317	0.2
318	0.2
319	0.19
320	0.21
321	0.2
322	0.16
323	0.18
324	0.2
325	0.18
326	0.19
327	0.18
328	0.15
329	0.19
330	0.22
331	0.2
332	0.18
333	0.18
334	0.18
335	0.18
336	0.18
337	0.14
338	0.1
339	0.11
340	0.09
341	0.09
342	0.09
343	0.08
344	0.07
345	0.06
346	0.05
347	0.03
348	0.04
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.09
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.1
360	0.08
361	0.1
362	0.1
363	0.09
364	0.11
365	0.12
366	0.12
367	0.11
368	0.12
369	0.12
370	0.19
371	0.22
372	0.25
373	0.32
374	0.37
375	0.39
376	0.39
377	0.37
378	0.33
379	0.32
380	0.28
381	0.21
382	0.19
383	0.17
384	0.19
385	0.19
386	0.18
387	0.17
388	0.18
389	0.17
390	0.16
391	0.2
392	0.21
393	0.23
394	0.23
395	0.24
396	0.26
397	0.28
398	0.29
399	0.25
400	0.21
401	0.17
402	0.17
403	0.16
404	0.12
405	0.11
406	0.09
407	0.12
408	0.13
409	0.14
410	0.14
411	0.13
412	0.13
413	0.14
414	0.16
415	0.14
416	0.18
417	0.2
418	0.24
419	0.28
420	0.34
421	0.35
422	0.34
423	0.35
424	0.35
425	0.33
426	0.29
427	0.25
428	0.19
429	0.18
430	0.17
431	0.16
432	0.14
433	0.13
434	0.14
435	0.18
436	0.18
437	0.19
438	0.19
439	0.21
440	0.2
441	0.22
442	0.26
443	0.23
444	0.25
445	0.24
446	0.27
447	0.28
448	0.28
449	0.32
450	0.29
451	0.35
452	0.37
453	0.37
454	0.35
455	0.35
456	0.36
457	0.3
458	0.3
459	0.25
460	0.22
461	0.26
462	0.24
463	0.23
464	0.24
465	0.24
466	0.22
467	0.24
468	0.25
469	0.21
470	0.24
471	0.26
472	0.27
473	0.31
474	0.34
475	0.33
476	0.32
477	0.31
478	0.29
479	0.26
480	0.25
481	0.23
482	0.25
483	0.23
484	0.2
485	0.2
486	0.19
487	0.18
488	0.21
489	0.23
490	0.18
491	0.18
492	0.29
493	0.29
494	0.33
495	0.36
496	0.33
497	0.28
498	0.29
499	0.28
500	0.19
501	0.19
502	0.16
503	0.12
504	0.13
505	0.12
506	0.11
507	0.11
508	0.1
509	0.1
510	0.09
511	0.08
512	0.07
513	0.07
514	0.08
515	0.09
516	0.09
517	0.09
518	0.09
519	0.09
520	0.11

A0A3N4HMX5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer