Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4HY34

Protein Details
Accession A0A3N4HY34    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
299-324NTAMTSASSRRRRRKGRMARSETSNYHydrophilic
388-408HDKGKAGRKVVKKGKYQTGLEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
308-316RRRRRKGRM
394-397GRKV
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12, nucl 11.5, cyto 11.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MAPGKKKWIDKKTATTFALVHRPQTDPLINDPEASDMVFTKISEPAKKPEATSSKAAKVKTTADLEEILGEEAAKVRKNEGQAAEFGIFYDDTKYDYMQHLRDIEHTGDSVFLEAPVPKSQQKGKQKMSLDEAIRAKDETDLLPKELLASDVQIKKTYQDQQNIPDAIAGFKPDMDLRLREVLEALEDEAFVDPDAEDDFFQELTAEGEAGPDEFFDDEFDEDDGWQSDDTVKAKGQYSHSAVTAPKDLPQFEDAEDGEDLGEGGWLEQYKQFKKDTKAPKKVEFDDGASSMMSFGTVNTAMTSASSRRRRRKGRMARSETSNYSMTSSSLFRTEGLSTLDARFDKIEEEYEEDDEDDDDLISMDGVPVKETRLDFDNILDEFLDNYHDKGKAGRKVVKKGKYQTGLEQLDEIRSGLGKARIRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.68
3 0.6
4 0.56
5 0.58
6 0.48
7 0.43
8 0.38
9 0.39
10 0.37
11 0.41
12 0.39
13 0.31
14 0.36
15 0.4
16 0.37
17 0.35
18 0.33
19 0.29
20 0.25
21 0.22
22 0.17
23 0.1
24 0.12
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.17
29 0.21
30 0.27
31 0.3
32 0.35
33 0.41
34 0.43
35 0.43
36 0.47
37 0.5
38 0.47
39 0.52
40 0.52
41 0.53
42 0.56
43 0.55
44 0.48
45 0.45
46 0.44
47 0.42
48 0.4
49 0.33
50 0.31
51 0.31
52 0.28
53 0.25
54 0.21
55 0.15
56 0.11
57 0.09
58 0.08
59 0.1
60 0.12
61 0.14
62 0.14
63 0.16
64 0.2
65 0.23
66 0.29
67 0.3
68 0.3
69 0.28
70 0.31
71 0.29
72 0.25
73 0.22
74 0.17
75 0.13
76 0.11
77 0.13
78 0.09
79 0.1
80 0.11
81 0.12
82 0.13
83 0.18
84 0.22
85 0.21
86 0.25
87 0.25
88 0.25
89 0.27
90 0.28
91 0.25
92 0.21
93 0.2
94 0.16
95 0.14
96 0.13
97 0.12
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.1
103 0.13
104 0.15
105 0.16
106 0.21
107 0.27
108 0.36
109 0.45
110 0.53
111 0.57
112 0.62
113 0.64
114 0.64
115 0.64
116 0.61
117 0.52
118 0.49
119 0.45
120 0.38
121 0.34
122 0.3
123 0.24
124 0.19
125 0.18
126 0.13
127 0.16
128 0.17
129 0.17
130 0.17
131 0.16
132 0.16
133 0.15
134 0.14
135 0.08
136 0.09
137 0.14
138 0.17
139 0.18
140 0.19
141 0.19
142 0.2
143 0.25
144 0.32
145 0.32
146 0.36
147 0.38
148 0.41
149 0.47
150 0.46
151 0.41
152 0.33
153 0.27
154 0.21
155 0.18
156 0.14
157 0.08
158 0.07
159 0.08
160 0.07
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.12
165 0.16
166 0.16
167 0.15
168 0.16
169 0.14
170 0.12
171 0.11
172 0.1
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.03
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.04
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.1
220 0.11
221 0.13
222 0.17
223 0.19
224 0.22
225 0.24
226 0.24
227 0.24
228 0.24
229 0.23
230 0.21
231 0.21
232 0.17
233 0.17
234 0.17
235 0.17
236 0.17
237 0.18
238 0.17
239 0.15
240 0.17
241 0.13
242 0.13
243 0.13
244 0.11
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.05
249 0.05
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.08
256 0.14
257 0.16
258 0.2
259 0.24
260 0.3
261 0.35
262 0.44
263 0.53
264 0.58
265 0.66
266 0.69
267 0.73
268 0.74
269 0.72
270 0.69
271 0.6
272 0.51
273 0.43
274 0.38
275 0.3
276 0.22
277 0.19
278 0.13
279 0.1
280 0.08
281 0.05
282 0.04
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.09
291 0.11
292 0.2
293 0.29
294 0.39
295 0.49
296 0.59
297 0.69
298 0.77
299 0.85
300 0.87
301 0.89
302 0.91
303 0.9
304 0.85
305 0.83
306 0.78
307 0.69
308 0.62
309 0.52
310 0.41
311 0.34
312 0.29
313 0.22
314 0.18
315 0.17
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.12
320 0.14
321 0.15
322 0.15
323 0.16
324 0.16
325 0.16
326 0.17
327 0.2
328 0.18
329 0.18
330 0.17
331 0.15
332 0.15
333 0.14
334 0.17
335 0.14
336 0.19
337 0.2
338 0.2
339 0.2
340 0.19
341 0.18
342 0.15
343 0.14
344 0.09
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.11
357 0.15
358 0.15
359 0.18
360 0.19
361 0.22
362 0.21
363 0.23
364 0.26
365 0.22
366 0.22
367 0.19
368 0.15
369 0.13
370 0.13
371 0.15
372 0.11
373 0.13
374 0.16
375 0.17
376 0.17
377 0.24
378 0.32
379 0.35
380 0.44
381 0.51
382 0.56
383 0.66
384 0.75
385 0.77
386 0.78
387 0.79
388 0.81
389 0.81
390 0.76
391 0.74
392 0.74
393 0.68
394 0.6
395 0.54
396 0.45
397 0.39
398 0.35
399 0.27
400 0.17
401 0.15
402 0.15
403 0.16
404 0.23