Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4HIV1

Protein Details
Accession A0A3N4HIV1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
390-413QHMPEIKRIARHRHVPKPIKKAGEBasic
418-452ELESIKRKEENRRRHEKKLERRRRVPEREKVVLHQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
396-445KRIARHRHVPKPIKKAGEIKKIELESIKRKEENRRRHEKKLERRRRVPER
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 7.5, cyto_nucl 7.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR007287  Sof1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF04158  Sof1  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MKIKALSRSTQTYLPPGTGDTSRTPRNLDPALHPFEKAREYTRALTATKMERMFAKPFLGQLGDGHIDGVYSLAKDIRNLNRFASGSGDGVVKMWDLSSQEEILSVKAHEGIVWGLCFATIGAVGGGSEGEQRILTCAADKSVKLWDAEVMDAASKPLMTYLGLNGFNSVTHHRKDRIFATGSGAVDIWDVTRSKPVSTLTWGADTINAVRFNMVETSVLASVGTDRTLTLYDIRTNSPVTKLVTTLRTNNVCWNPMEAFNLATASEDHNVYIFDTRNLKRAINVLKDHVAAVMDVDYSPTGEEIVTASYDRTIRIFNARSGHSRDIYHTKRMQRVFQAKFSVDSRYILSGSDDGNVRLWRTKASDRSHVRSAKERAKLEYDEALKTRYQHMPEIKRIARHRHVPKPIKKAGEIKKIELESIKRKEENRRRHEKKLERRRRVPEREKVVLHQEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.34
3 0.29
4 0.29
5 0.26
6 0.27
7 0.27
8 0.32
9 0.36
10 0.38
11 0.41
12 0.4
13 0.46
14 0.47
15 0.43
16 0.44
17 0.47
18 0.52
19 0.48
20 0.46
21 0.41
22 0.4
23 0.41
24 0.37
25 0.33
26 0.32
27 0.36
28 0.39
29 0.43
30 0.43
31 0.39
32 0.39
33 0.4
34 0.39
35 0.4
36 0.37
37 0.33
38 0.32
39 0.36
40 0.37
41 0.34
42 0.33
43 0.27
44 0.27
45 0.28
46 0.25
47 0.21
48 0.18
49 0.2
50 0.17
51 0.16
52 0.16
53 0.13
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.06
58 0.05
59 0.06
60 0.08
61 0.09
62 0.11
63 0.19
64 0.28
65 0.32
66 0.34
67 0.34
68 0.38
69 0.38
70 0.36
71 0.33
72 0.25
73 0.21
74 0.21
75 0.2
76 0.14
77 0.14
78 0.13
79 0.09
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.08
84 0.1
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.13
89 0.13
90 0.12
91 0.12
92 0.1
93 0.08
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.05
106 0.05
107 0.03
108 0.04
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.09
125 0.11
126 0.13
127 0.13
128 0.13
129 0.16
130 0.18
131 0.16
132 0.16
133 0.16
134 0.15
135 0.16
136 0.15
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.07
149 0.12
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.13
154 0.12
155 0.14
156 0.17
157 0.16
158 0.17
159 0.22
160 0.25
161 0.27
162 0.3
163 0.31
164 0.32
165 0.31
166 0.29
167 0.3
168 0.3
169 0.28
170 0.24
171 0.22
172 0.16
173 0.13
174 0.12
175 0.08
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.11
180 0.11
181 0.12
182 0.14
183 0.15
184 0.15
185 0.18
186 0.21
187 0.18
188 0.19
189 0.19
190 0.16
191 0.15
192 0.13
193 0.11
194 0.12
195 0.11
196 0.1
197 0.1
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.05
203 0.05
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.07
218 0.08
219 0.11
220 0.13
221 0.14
222 0.14
223 0.15
224 0.15
225 0.15
226 0.16
227 0.15
228 0.14
229 0.14
230 0.16
231 0.2
232 0.21
233 0.23
234 0.26
235 0.26
236 0.27
237 0.32
238 0.31
239 0.27
240 0.26
241 0.25
242 0.21
243 0.2
244 0.21
245 0.15
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.1
260 0.09
261 0.11
262 0.18
263 0.19
264 0.24
265 0.26
266 0.25
267 0.24
268 0.3
269 0.34
270 0.34
271 0.35
272 0.32
273 0.32
274 0.32
275 0.31
276 0.25
277 0.19
278 0.12
279 0.1
280 0.07
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.09
300 0.1
301 0.11
302 0.18
303 0.2
304 0.22
305 0.26
306 0.29
307 0.32
308 0.37
309 0.4
310 0.35
311 0.34
312 0.35
313 0.41
314 0.42
315 0.46
316 0.46
317 0.49
318 0.54
319 0.56
320 0.57
321 0.57
322 0.63
323 0.59
324 0.59
325 0.57
326 0.5
327 0.5
328 0.46
329 0.41
330 0.32
331 0.29
332 0.25
333 0.21
334 0.21
335 0.18
336 0.18
337 0.15
338 0.14
339 0.15
340 0.14
341 0.13
342 0.16
343 0.17
344 0.17
345 0.19
346 0.19
347 0.2
348 0.24
349 0.32
350 0.37
351 0.42
352 0.51
353 0.55
354 0.6
355 0.66
356 0.66
357 0.62
358 0.62
359 0.65
360 0.63
361 0.64
362 0.6
363 0.56
364 0.57
365 0.55
366 0.49
367 0.48
368 0.42
369 0.39
370 0.37
371 0.35
372 0.31
373 0.3
374 0.33
375 0.31
376 0.31
377 0.35
378 0.44
379 0.5
380 0.56
381 0.64
382 0.62
383 0.64
384 0.68
385 0.7
386 0.69
387 0.71
388 0.72
389 0.73
390 0.8
391 0.83
392 0.85
393 0.85
394 0.84
395 0.8
396 0.76
397 0.76
398 0.75
399 0.75
400 0.7
401 0.65
402 0.65
403 0.6
404 0.56
405 0.52
406 0.49
407 0.49
408 0.52
409 0.55
410 0.52
411 0.57
412 0.66
413 0.71
414 0.74
415 0.75
416 0.79
417 0.79
418 0.85
419 0.9
420 0.89
421 0.9
422 0.91
423 0.91
424 0.91
425 0.93
426 0.94
427 0.94
428 0.94
429 0.93
430 0.92
431 0.9
432 0.88
433 0.82
434 0.76