Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4HTU4

Protein Details
Accession A0A3N4HTU4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
184-205PVTGSNRRRKHKPDKRYNSVVLHydrophilic
398-425DPLSCQPPTLHCKKKKPWYCRSAINGRWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
190-198RRRKHKPDK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.833, cyto 8, cyto_pero 5.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011659  PD40  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF07676  PD40  
Amino Acid Sequences MAVDPRSFSNRPEGHSLASRAVPTEVRKLVNGVADIYRDILKIDPSVYQITLPPEESSATPFGLELGDRLRPVRSIGVSPDGKLMGLGGEYGLIEVRHLTQQTVMSFDYLDCRYPLLGRDHWRQQSGTGWKDSYSPGPSFVDQISFSPDGRWLVAAYRHSSSSFFQDGPGCMVYDSTSRRGNGPVTGSNRRRKHKPDKRYNSVVLVRVWEIATREQRNAIFIHSLFDESHVSGLGYPAWYPQTWFSFSPDGQSIEISTMTGGSIIPLLRTPPVSELEHPSCGIRAPFSISISNDDPRPYRPFQHWSELASSYRKPLGDSRGSHWVYYGNKRIFCIPSHLGLVSFQIRGSILVLDALGPDDRSDGLLRWPPNEKKGPIAGNRRIIVLRFNPAGFTIDLDPLSCQPPTLHCKKKKPWYCRSAINGRWEERVPDDVLYPYAESAIWGDCWCCGSGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.47
3 0.48
4 0.41
5 0.4
6 0.36
7 0.3
8 0.3
9 0.3
10 0.27
11 0.32
12 0.33
13 0.32
14 0.33
15 0.34
16 0.34
17 0.33
18 0.31
19 0.25
20 0.22
21 0.21
22 0.21
23 0.2
24 0.19
25 0.15
26 0.15
27 0.14
28 0.14
29 0.14
30 0.15
31 0.15
32 0.17
33 0.19
34 0.19
35 0.18
36 0.2
37 0.22
38 0.23
39 0.23
40 0.2
41 0.19
42 0.2
43 0.19
44 0.2
45 0.18
46 0.16
47 0.14
48 0.13
49 0.13
50 0.12
51 0.11
52 0.09
53 0.1
54 0.12
55 0.13
56 0.14
57 0.15
58 0.15
59 0.17
60 0.21
61 0.2
62 0.21
63 0.23
64 0.31
65 0.31
66 0.31
67 0.31
68 0.26
69 0.23
70 0.2
71 0.17
72 0.09
73 0.08
74 0.07
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.06
83 0.07
84 0.1
85 0.11
86 0.11
87 0.13
88 0.16
89 0.17
90 0.19
91 0.18
92 0.15
93 0.15
94 0.15
95 0.17
96 0.15
97 0.15
98 0.13
99 0.13
100 0.13
101 0.14
102 0.18
103 0.19
104 0.24
105 0.3
106 0.37
107 0.45
108 0.48
109 0.5
110 0.46
111 0.42
112 0.44
113 0.45
114 0.42
115 0.37
116 0.33
117 0.31
118 0.33
119 0.33
120 0.29
121 0.25
122 0.22
123 0.21
124 0.22
125 0.22
126 0.22
127 0.21
128 0.19
129 0.15
130 0.15
131 0.17
132 0.16
133 0.16
134 0.15
135 0.16
136 0.15
137 0.15
138 0.14
139 0.1
140 0.11
141 0.15
142 0.17
143 0.18
144 0.18
145 0.19
146 0.19
147 0.2
148 0.19
149 0.2
150 0.2
151 0.18
152 0.18
153 0.19
154 0.19
155 0.2
156 0.19
157 0.14
158 0.11
159 0.11
160 0.1
161 0.12
162 0.14
163 0.15
164 0.18
165 0.18
166 0.2
167 0.22
168 0.22
169 0.21
170 0.22
171 0.24
172 0.27
173 0.36
174 0.42
175 0.49
176 0.55
177 0.59
178 0.63
179 0.67
180 0.72
181 0.73
182 0.77
183 0.8
184 0.83
185 0.85
186 0.85
187 0.77
188 0.73
189 0.66
190 0.58
191 0.47
192 0.38
193 0.3
194 0.24
195 0.21
196 0.15
197 0.13
198 0.14
199 0.2
200 0.2
201 0.2
202 0.22
203 0.22
204 0.23
205 0.22
206 0.18
207 0.14
208 0.12
209 0.13
210 0.11
211 0.12
212 0.1
213 0.11
214 0.1
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.09
229 0.12
230 0.14
231 0.15
232 0.17
233 0.19
234 0.19
235 0.21
236 0.2
237 0.19
238 0.16
239 0.16
240 0.13
241 0.11
242 0.11
243 0.08
244 0.06
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.03
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.09
259 0.13
260 0.14
261 0.16
262 0.22
263 0.24
264 0.25
265 0.24
266 0.22
267 0.19
268 0.18
269 0.17
270 0.11
271 0.09
272 0.12
273 0.13
274 0.14
275 0.17
276 0.16
277 0.2
278 0.22
279 0.23
280 0.2
281 0.21
282 0.2
283 0.22
284 0.27
285 0.25
286 0.27
287 0.31
288 0.37
289 0.39
290 0.46
291 0.44
292 0.4
293 0.41
294 0.4
295 0.36
296 0.33
297 0.29
298 0.24
299 0.25
300 0.23
301 0.21
302 0.24
303 0.29
304 0.33
305 0.35
306 0.36
307 0.44
308 0.44
309 0.42
310 0.38
311 0.35
312 0.32
313 0.37
314 0.42
315 0.37
316 0.38
317 0.39
318 0.43
319 0.4
320 0.36
321 0.37
322 0.3
323 0.27
324 0.28
325 0.27
326 0.23
327 0.21
328 0.23
329 0.17
330 0.15
331 0.12
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.09
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.14
352 0.2
353 0.21
354 0.24
355 0.32
356 0.35
357 0.42
358 0.49
359 0.45
360 0.45
361 0.51
362 0.55
363 0.55
364 0.61
365 0.61
366 0.61
367 0.6
368 0.57
369 0.52
370 0.45
371 0.43
372 0.36
373 0.35
374 0.3
375 0.29
376 0.27
377 0.27
378 0.29
379 0.22
380 0.21
381 0.17
382 0.16
383 0.16
384 0.16
385 0.16
386 0.16
387 0.18
388 0.15
389 0.14
390 0.13
391 0.2
392 0.28
393 0.37
394 0.46
395 0.53
396 0.64
397 0.74
398 0.83
399 0.86
400 0.88
401 0.89
402 0.88
403 0.86
404 0.85
405 0.84
406 0.83
407 0.8
408 0.8
409 0.76
410 0.69
411 0.66
412 0.58
413 0.52
414 0.45
415 0.43
416 0.34
417 0.27
418 0.27
419 0.23
420 0.23
421 0.22
422 0.19
423 0.15
424 0.14
425 0.12
426 0.11
427 0.11
428 0.11
429 0.11
430 0.11
431 0.11
432 0.11
433 0.14