Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4HHN6

Protein Details
Accession A0A3N4HHN6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
229-254PQETSRAVRKRGKRNKKKAAASSQASHydrophilic
406-439GMGRVDRVMGWRKRKKQRKWRRDGRGGRRLIPVPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
235-247AVRKRGKRNKKKA
381-435GRRRVPGRLRLMRRRWGDGGMGRKGGMGRVDRVMGWRKRKKQRKWRRDGRGGRRL
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 10, nucl 7.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000868  Isochorismatase-like  
IPR036380  Isochorismatase-like_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00857  Isochorismatase  
Amino Acid Sequences MTLQARLVTEVHICGALTNTSVYATVADAVQRGFKVYLPVDCCGYRFESAHRDAVSEMTGRLGVESMPWAKVCEMWRAQADKTLEPATVMDTTKLQQVVENAIRAGEGGVVLSDPSSDSDDDDDYEYYPRGNRSAAQREERQAQIAASHAQLPKHLDEINRLLALHGGVPTQEPPAQAARTGPRVLPADRPRVRVPAQPAQVRRDAAKRTSMIHPDDTTAPIALDDPVPQETSRAVRKRGKRNKKKAAASSQASYEEVDPTPLLADAPKPAQPHKLDPAIEDGTGLPLSELKPVVPNIPTLAHRRAALGSSGLSLLDAAEPQGRRVLDLAAEDDASPALLEADSDDGSGEEGVYSSVRSGYIRASEAAGLARVVRPMPMLGRRRVPGRLRLMRRRWGDGGMGRKGGMGRVDRVMGWRKRKKQRKWRRDGRGGRRLIPVPN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.12
4 0.11
5 0.1
6 0.1
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.09
11 0.08
12 0.08
13 0.09
14 0.09
15 0.1
16 0.1
17 0.13
18 0.12
19 0.14
20 0.14
21 0.15
22 0.2
23 0.21
24 0.27
25 0.28
26 0.29
27 0.3
28 0.3
29 0.3
30 0.26
31 0.27
32 0.24
33 0.22
34 0.25
35 0.3
36 0.33
37 0.38
38 0.35
39 0.33
40 0.31
41 0.31
42 0.28
43 0.2
44 0.17
45 0.12
46 0.13
47 0.11
48 0.11
49 0.1
50 0.08
51 0.07
52 0.11
53 0.12
54 0.13
55 0.13
56 0.14
57 0.14
58 0.19
59 0.2
60 0.25
61 0.25
62 0.28
63 0.33
64 0.35
65 0.35
66 0.37
67 0.38
68 0.31
69 0.32
70 0.3
71 0.24
72 0.22
73 0.21
74 0.18
75 0.18
76 0.17
77 0.14
78 0.14
79 0.15
80 0.18
81 0.19
82 0.16
83 0.14
84 0.16
85 0.22
86 0.23
87 0.23
88 0.19
89 0.19
90 0.18
91 0.16
92 0.15
93 0.08
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.05
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.1
107 0.11
108 0.12
109 0.13
110 0.12
111 0.11
112 0.12
113 0.12
114 0.11
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.14
119 0.16
120 0.24
121 0.33
122 0.39
123 0.42
124 0.46
125 0.49
126 0.52
127 0.5
128 0.43
129 0.34
130 0.28
131 0.22
132 0.19
133 0.17
134 0.12
135 0.17
136 0.16
137 0.16
138 0.17
139 0.19
140 0.18
141 0.19
142 0.21
143 0.17
144 0.19
145 0.23
146 0.23
147 0.21
148 0.2
149 0.18
150 0.16
151 0.15
152 0.12
153 0.09
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.1
160 0.09
161 0.1
162 0.13
163 0.13
164 0.13
165 0.15
166 0.16
167 0.19
168 0.2
169 0.18
170 0.19
171 0.22
172 0.23
173 0.29
174 0.31
175 0.38
176 0.4
177 0.45
178 0.42
179 0.45
180 0.46
181 0.41
182 0.43
183 0.4
184 0.42
185 0.43
186 0.45
187 0.43
188 0.44
189 0.41
190 0.36
191 0.34
192 0.31
193 0.28
194 0.3
195 0.27
196 0.27
197 0.31
198 0.34
199 0.31
200 0.29
201 0.28
202 0.25
203 0.24
204 0.22
205 0.18
206 0.13
207 0.1
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.06
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.08
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.12
220 0.19
221 0.22
222 0.28
223 0.34
224 0.43
225 0.54
226 0.64
227 0.72
228 0.76
229 0.83
230 0.88
231 0.9
232 0.89
233 0.87
234 0.85
235 0.82
236 0.74
237 0.64
238 0.55
239 0.47
240 0.39
241 0.31
242 0.22
243 0.16
244 0.12
245 0.12
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.05
252 0.06
253 0.07
254 0.09
255 0.12
256 0.13
257 0.15
258 0.21
259 0.23
260 0.28
261 0.31
262 0.34
263 0.32
264 0.31
265 0.36
266 0.3
267 0.27
268 0.23
269 0.18
270 0.14
271 0.13
272 0.12
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.11
280 0.12
281 0.14
282 0.13
283 0.13
284 0.13
285 0.16
286 0.18
287 0.21
288 0.24
289 0.23
290 0.23
291 0.24
292 0.23
293 0.22
294 0.2
295 0.15
296 0.12
297 0.11
298 0.11
299 0.09
300 0.08
301 0.06
302 0.06
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.14
310 0.14
311 0.14
312 0.15
313 0.15
314 0.12
315 0.13
316 0.14
317 0.11
318 0.12
319 0.11
320 0.1
321 0.09
322 0.08
323 0.06
324 0.05
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.11
348 0.13
349 0.15
350 0.15
351 0.16
352 0.16
353 0.16
354 0.16
355 0.14
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.11
360 0.1
361 0.1
362 0.1
363 0.11
364 0.17
365 0.25
366 0.3
367 0.35
368 0.41
369 0.45
370 0.48
371 0.55
372 0.56
373 0.56
374 0.6
375 0.65
376 0.68
377 0.75
378 0.79
379 0.8
380 0.79
381 0.76
382 0.68
383 0.61
384 0.58
385 0.54
386 0.54
387 0.5
388 0.46
389 0.39
390 0.38
391 0.36
392 0.31
393 0.3
394 0.26
395 0.24
396 0.26
397 0.27
398 0.26
399 0.32
400 0.39
401 0.42
402 0.49
403 0.56
404 0.64
405 0.74
406 0.84
407 0.89
408 0.9
409 0.93
410 0.94
411 0.95
412 0.95
413 0.96
414 0.96
415 0.96
416 0.96
417 0.94
418 0.89
419 0.84
420 0.81