Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8NKS6

Protein Details
Accession B8NKS6    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-41AEKQKKLVKAAEKRKAAKKAAHydrophilic
267-288LEKINDLKKKRKANPSGPTDNDHydrophilic
312-333GGPNLKRQKKNEKYGFGGKKRHBasic
347-372SFSVKKMKGGAKRPGKSKRAAAKGRMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-41KQKKLVKAAEKRKAAKKAA
222-279KKKLYDEAAGKKAAAEARKQRDLKKFGKQVQVAKLQQRAKEKRETLEKINDLKKKRKA
302-339KGRKRGREDGGGPNLKRQKKNEKYGFGGKKRHAKSGDA
346-372RSFSVKKMKGGAKRPGKSKRAAAKGRM
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008610  Ebp2  
Gene Ontology GO:0034399  C:nuclear periphery  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0000280  P:nuclear division  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF05890  Ebp2  
Amino Acid Sequences MPKRSKLLQALDDHRGRDYEAEKQKKLVKAAEKRKAAKKAAAGEDGVQVKDKAEDLKSKKREAEEEVEEEGSSDEEEEEEKEETSDKEEEEDDNDEEEEEEEEEEEEDIPLSDLTDDEREDVVPHQRLTINNSAAINASLKRISFITPKTPFSEHNSLVSQEPIDVPDPNDDLARELAFYKVCQAAASTARGLLKKEGIPFTRPGDYFAEMVKTDEHMGKIKKKLYDEAAGKKAAAEARKQRDLKKFGKQVQVAKLQQRAKEKRETLEKINDLKKKRKANPSGPTDNDNDMFDIAIDNSESKGRKRGREDGGGPNLKRQKKNEKYGFGGKKRHAKSGDAMSSGDLRSFSVKKMKGGAKRPGKSKRAAAKGRM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.44
3 0.38
4 0.34
5 0.3
6 0.32
7 0.38
8 0.46
9 0.46
10 0.51
11 0.57
12 0.57
13 0.6
14 0.58
15 0.58
16 0.6
17 0.69
18 0.73
19 0.75
20 0.78
21 0.82
22 0.83
23 0.78
24 0.74
25 0.7
26 0.69
27 0.66
28 0.61
29 0.53
30 0.46
31 0.46
32 0.41
33 0.35
34 0.27
35 0.21
36 0.18
37 0.19
38 0.18
39 0.17
40 0.18
41 0.27
42 0.33
43 0.44
44 0.49
45 0.54
46 0.57
47 0.57
48 0.59
49 0.56
50 0.56
51 0.51
52 0.49
53 0.46
54 0.41
55 0.36
56 0.32
57 0.25
58 0.17
59 0.12
60 0.08
61 0.06
62 0.05
63 0.06
64 0.07
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.11
70 0.11
71 0.14
72 0.15
73 0.13
74 0.14
75 0.15
76 0.15
77 0.16
78 0.19
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.13
83 0.13
84 0.12
85 0.1
86 0.08
87 0.07
88 0.06
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.04
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.12
109 0.17
110 0.18
111 0.18
112 0.19
113 0.21
114 0.22
115 0.27
116 0.32
117 0.27
118 0.26
119 0.26
120 0.24
121 0.22
122 0.22
123 0.17
124 0.11
125 0.12
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.11
130 0.12
131 0.16
132 0.18
133 0.25
134 0.28
135 0.3
136 0.33
137 0.34
138 0.34
139 0.37
140 0.41
141 0.33
142 0.32
143 0.31
144 0.29
145 0.28
146 0.26
147 0.18
148 0.12
149 0.11
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.1
173 0.11
174 0.12
175 0.1
176 0.11
177 0.13
178 0.13
179 0.14
180 0.13
181 0.14
182 0.15
183 0.18
184 0.21
185 0.21
186 0.22
187 0.24
188 0.25
189 0.28
190 0.26
191 0.25
192 0.23
193 0.23
194 0.21
195 0.19
196 0.19
197 0.14
198 0.14
199 0.12
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.14
205 0.18
206 0.24
207 0.29
208 0.32
209 0.34
210 0.35
211 0.38
212 0.37
213 0.41
214 0.41
215 0.43
216 0.43
217 0.39
218 0.37
219 0.33
220 0.32
221 0.26
222 0.23
223 0.22
224 0.27
225 0.34
226 0.43
227 0.46
228 0.51
229 0.57
230 0.63
231 0.63
232 0.64
233 0.66
234 0.65
235 0.71
236 0.68
237 0.66
238 0.65
239 0.68
240 0.62
241 0.59
242 0.59
243 0.55
244 0.54
245 0.58
246 0.58
247 0.55
248 0.6
249 0.58
250 0.57
251 0.63
252 0.63
253 0.59
254 0.6
255 0.61
256 0.59
257 0.63
258 0.63
259 0.6
260 0.64
261 0.66
262 0.67
263 0.71
264 0.74
265 0.76
266 0.8
267 0.83
268 0.83
269 0.83
270 0.76
271 0.71
272 0.64
273 0.57
274 0.48
275 0.39
276 0.3
277 0.21
278 0.18
279 0.14
280 0.11
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.07
286 0.12
287 0.14
288 0.15
289 0.24
290 0.3
291 0.38
292 0.45
293 0.53
294 0.56
295 0.64
296 0.67
297 0.68
298 0.72
299 0.72
300 0.65
301 0.64
302 0.66
303 0.64
304 0.66
305 0.64
306 0.66
307 0.68
308 0.78
309 0.79
310 0.78
311 0.77
312 0.81
313 0.84
314 0.81
315 0.8
316 0.76
317 0.77
318 0.73
319 0.74
320 0.67
321 0.6
322 0.59
323 0.6
324 0.59
325 0.5
326 0.48
327 0.4
328 0.4
329 0.36
330 0.3
331 0.2
332 0.15
333 0.19
334 0.2
335 0.23
336 0.29
337 0.32
338 0.34
339 0.43
340 0.5
341 0.53
342 0.61
343 0.67
344 0.68
345 0.73
346 0.8
347 0.81
348 0.8
349 0.79
350 0.79
351 0.79
352 0.79