FuNGI

A0A4P9X4J4

Protein Details

Accession

A0A4P9X4J4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-47	TGPPAATTDPPRRRVRRRPGRYALTRRAPAA	Hydrophilic
631-654	VVLCQWDRVQRHKNKYKCAFRDGI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
27-59	PRRRVRRRPGRYALTRRAPAAAPAAASRAGAAA

Subcellular Location(s)

mito 10, nucl 8.5, cyto_nucl 6.5, extr 4, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004855 TFIIA_asu/bsu IPR009088 TFIIA_b-brl
Gene Ontology	GO:0005672 C:transcription factor TFIIA complex GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF03153 TFIIA
CDD	cd07976 TFIIA_alpha_beta_like

Amino Acid Sequences

MKACPPAVAPPPAPPPTGPPAATTDPPRRRVRRRPGRYALTRRAPAAAPAAASRAGAAAAAAGRRPGLVSRAAVHSDEEPRDASVKAIGHGHAIASLSPHSTTAAATNAPDPPPRIPGSPLRLPPPFAIGTSGSERVCASIIQTKPTEHAAPCASARACLPRSPPLLPRRRLPPGPRGPAAAAAMSNTTVPEIYKWVIDEVVEKMARDFSEMGVSETILQELQQTWENKLYAMNVAPFARPAGEYYDAQGNAIADVHEEGLGLPGLGAAGAAAGASSAAAHAASAGPGSTRHGGPPAGGYPPPHLAHHAPPALAHEPPLPRYEIPGTSMHPESAGAGGYRGPGGMNLTSAAAPPPLLQPPAHDKPLTHHHHAPPLPHPSHPPGYAGPAAASLSALASAAHGGYHDPHHAAPPPPAGAHHLHHPAPPQHLHRHHPAPAPPPSHAQQPPQPPPPQQGQQPPAAPSQPGDPHRMPKYEIPQFDGADGAAASGAARRGRTPRWLTLDGRALPRGGPSRAELDAALLHAAARWTADEPADADAGVASSMPAAAAPSAAHGLHFEGLRRLTPAEAAALKRRGVPQVDGAVTVGGDDDDDDDDDDGAAAGGGGGGAEDINSDLDDSSSDDEDLETDHVVLCQWDRVQRHKNKYKCAFRDGIVSVNGKDYLFTRATAEFEW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.39
3	0.39
4	0.44
5	0.38
6	0.32
7	0.36
8	0.39
9	0.43
10	0.44
11	0.49
12	0.51
13	0.59
14	0.67
15	0.7
16	0.76
17	0.83
18	0.87
19	0.87
20	0.89
21	0.91
22	0.91
23	0.92
24	0.92
25	0.92
26	0.91
27	0.89
28	0.83
29	0.73
30	0.66
31	0.56
32	0.48
33	0.43
34	0.34
35	0.25
36	0.22
37	0.23
38	0.2
39	0.19
40	0.16
41	0.11
42	0.1
43	0.08
44	0.07
45	0.06
46	0.07
47	0.08
48	0.09
49	0.09
50	0.09
51	0.09
52	0.1
53	0.11
54	0.12
55	0.15
56	0.16
57	0.19
58	0.23
59	0.25
60	0.25
61	0.25
62	0.26
63	0.29
64	0.28
65	0.27
66	0.23
67	0.23
68	0.24
69	0.22
70	0.19
71	0.17
72	0.17
73	0.17
74	0.19
75	0.18
76	0.18
77	0.18
78	0.17
79	0.14
80	0.13
81	0.12
82	0.1
83	0.11
84	0.1
85	0.1
86	0.11
87	0.1
88	0.1
89	0.1
90	0.11
91	0.12
92	0.12
93	0.12
94	0.14
95	0.17
96	0.18
97	0.2
98	0.21
99	0.21
100	0.26
101	0.27
102	0.27
103	0.28
104	0.34
105	0.39
106	0.44
107	0.46
108	0.47
109	0.46
110	0.47
111	0.43
112	0.4
113	0.33
114	0.26
115	0.25
116	0.2
117	0.22
118	0.23
119	0.26
120	0.21
121	0.21
122	0.2
123	0.18
124	0.17
125	0.14
126	0.13
127	0.17
128	0.18
129	0.22
130	0.23
131	0.23
132	0.24
133	0.28
134	0.3
135	0.23
136	0.26
137	0.24
138	0.25
139	0.24
140	0.28
141	0.24
142	0.21
143	0.22
144	0.25
145	0.25
146	0.26
147	0.29
148	0.3
149	0.34
150	0.37
151	0.43
152	0.46
153	0.54
154	0.55
155	0.57
156	0.58
157	0.62
158	0.66
159	0.64
160	0.65
161	0.65
162	0.69
163	0.64
164	0.59
165	0.52
166	0.47
167	0.42
168	0.32
169	0.21
170	0.15
171	0.14
172	0.11
173	0.1
174	0.07
175	0.06
176	0.06
177	0.06
178	0.06
179	0.09
180	0.09
181	0.09
182	0.1
183	0.1
184	0.1
185	0.1
186	0.12
187	0.1
188	0.15
189	0.15
190	0.14
191	0.14
192	0.16
193	0.15
194	0.16
195	0.15
196	0.1
197	0.14
198	0.14
199	0.15
200	0.13
201	0.14
202	0.12
203	0.12
204	0.12
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.08
210	0.12
211	0.13
212	0.15
213	0.19
214	0.19
215	0.18
216	0.18
217	0.18
218	0.14
219	0.14
220	0.14
221	0.12
222	0.13
223	0.13
224	0.12
225	0.12
226	0.1
227	0.09
228	0.09
229	0.11
230	0.13
231	0.13
232	0.14
233	0.19
234	0.18
235	0.18
236	0.18
237	0.14
238	0.11
239	0.11
240	0.09
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.04
246	0.04
247	0.05
248	0.05
249	0.04
250	0.04
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.02
256	0.02
257	0.02
258	0.02
259	0.01
260	0.01
261	0.01
262	0.02
263	0.02
264	0.02
265	0.02
266	0.02
267	0.02
268	0.02
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.04
275	0.06
276	0.08
277	0.08
278	0.09
279	0.11
280	0.11
281	0.11
282	0.12
283	0.12
284	0.12
285	0.12
286	0.12
287	0.13
288	0.17
289	0.18
290	0.17
291	0.18
292	0.18
293	0.2
294	0.25
295	0.24
296	0.19
297	0.18
298	0.22
299	0.2
300	0.18
301	0.16
302	0.14
303	0.15
304	0.16
305	0.17
306	0.15
307	0.14
308	0.16
309	0.17
310	0.14
311	0.16
312	0.16
313	0.16
314	0.18
315	0.18
316	0.15
317	0.13
318	0.13
319	0.1
320	0.09
321	0.08
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.04
329	0.04
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.07
342	0.07
343	0.09
344	0.08
345	0.11
346	0.19
347	0.22
348	0.24
349	0.23
350	0.22
351	0.25
352	0.35
353	0.38
354	0.35
355	0.37
356	0.37
357	0.44
358	0.46
359	0.44
360	0.39
361	0.42
362	0.38
363	0.34
364	0.35
365	0.32
366	0.34
367	0.32
368	0.29
369	0.21
370	0.23
371	0.22
372	0.19
373	0.15
374	0.12
375	0.11
376	0.09
377	0.08
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.03
383	0.03
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.04
389	0.05
390	0.06
391	0.07
392	0.08
393	0.09
394	0.11
395	0.14
396	0.15
397	0.16
398	0.17
399	0.16
400	0.15
401	0.16
402	0.18
403	0.17
404	0.17
405	0.21
406	0.23
407	0.23
408	0.25
409	0.29
410	0.28
411	0.29
412	0.33
413	0.33
414	0.37
415	0.42
416	0.45
417	0.48
418	0.5
419	0.51
420	0.51
421	0.51
422	0.48
423	0.5
424	0.48
425	0.42
426	0.42
427	0.38
428	0.41
429	0.4
430	0.37
431	0.37
432	0.44
433	0.49
434	0.52
435	0.54
436	0.48
437	0.49
438	0.52
439	0.5
440	0.46
441	0.48
442	0.45
443	0.46
444	0.46
445	0.44
446	0.4
447	0.37
448	0.31
449	0.22
450	0.24
451	0.26
452	0.26
453	0.3
454	0.3
455	0.36
456	0.4
457	0.42
458	0.39
459	0.39
460	0.45
461	0.45
462	0.44
463	0.42
464	0.41
465	0.4
466	0.37
467	0.31
468	0.21
469	0.15
470	0.13
471	0.08
472	0.04
473	0.04
474	0.04
475	0.04
476	0.07
477	0.08
478	0.09
479	0.11
480	0.16
481	0.2
482	0.29
483	0.33
484	0.38
485	0.45
486	0.49
487	0.49
488	0.51
489	0.55
490	0.5
491	0.48
492	0.41
493	0.34
494	0.29
495	0.32
496	0.3
497	0.24
498	0.22
499	0.2
500	0.23
501	0.23
502	0.24
503	0.19
504	0.16
505	0.15
506	0.13
507	0.11
508	0.08
509	0.07
510	0.07
511	0.07
512	0.06
513	0.05
514	0.06
515	0.07
516	0.08
517	0.09
518	0.09
519	0.1
520	0.11
521	0.11
522	0.1
523	0.09
524	0.07
525	0.07
526	0.06
527	0.05
528	0.03
529	0.03
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.03
534	0.03
535	0.04
536	0.04
537	0.05
538	0.07
539	0.07
540	0.08
541	0.08
542	0.09
543	0.11
544	0.12
545	0.12
546	0.14
547	0.16
548	0.16
549	0.18
550	0.17
551	0.15
552	0.16
553	0.15
554	0.15
555	0.18
556	0.2
557	0.26
558	0.29
559	0.29
560	0.32
561	0.34
562	0.36
563	0.35
564	0.35
565	0.33
566	0.36
567	0.36
568	0.33
569	0.3
570	0.25
571	0.21
572	0.18
573	0.12
574	0.05
575	0.05
576	0.04
577	0.05
578	0.06
579	0.07
580	0.07
581	0.08
582	0.08
583	0.08
584	0.08
585	0.07
586	0.05
587	0.05
588	0.04
589	0.03
590	0.03
591	0.03
592	0.02
593	0.02
594	0.02
595	0.02
596	0.02
597	0.03
598	0.04
599	0.04
600	0.05
601	0.05
602	0.05
603	0.06
604	0.07
605	0.08
606	0.1
607	0.11
608	0.11
609	0.11
610	0.11
611	0.11
612	0.12
613	0.11
614	0.09
615	0.08
616	0.09
617	0.09
618	0.09
619	0.1
620	0.09
621	0.13
622	0.15
623	0.21
624	0.26
625	0.35
626	0.46
627	0.54
628	0.65
629	0.71
630	0.76
631	0.81
632	0.87
633	0.89
634	0.85
635	0.84
636	0.78
637	0.69
638	0.7
639	0.61
640	0.55
641	0.49
642	0.44
643	0.36
644	0.34
645	0.33
646	0.24
647	0.23
648	0.19
649	0.21
650	0.2
651	0.2
652	0.2
653	0.2

A0A4P9X4J4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer