Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A4P9XCD9

Protein Details
Accession A0A4P9XCD9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
427-446YEKRRKRRESHNAVERRRRDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
429-444KRRKRRESHNAVERRR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 9, extr 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11387  bHLHzip_USF_MITF  
Amino Acid Sequences MASNPPDPRALAAAAAAAAAMGGQGLTDLNHFVGLQDFNAFGDYAAFAAAAAAAAAAAAATAAGASGAARTPVSPPMSAPASGNPDPTATLTSPTPDLFQQSIYTAFFNNAAAAAAAAGATSQPGASAASTAYNLLASSAPTGHPLAFDRPQHLDAASVPGGGLLFDPSHDLGGHGAPAPHHPHSLGPGPGQGQAHAHHHHHHHHAHRSGSGSLHSKGHRSKHAPSDHVGSLGSTPPIHVMDPGTTGFAAAAAAAAAAAGMPPSGATTATATTPSHPSSPSPHFQMSPAPGAGTSGMGMSMGMGLGGLSRGTSAPKTVLFASQTQAIPMQADGPGGPGSASGAYGAAASMPHPLAPSRHYHHHHHRAHGPSLAASGLHALTSPTSLPSERDLLSEESGTLGSLLPHSSSLSGLPGNPGSLPSLDVIYEKRRKRRESHNAVERRRRDNINEKIQELASLLPAMDVTSSLMAGGGDRDAGGEGGSGGGGGPNGAYPASGSLGDGDLVMGATPTSSAPTSAQAAAAQNKPNKGVILRRSVDYIRSLQRFAATAAARAETLESLLQALMGRYGAQFEPGVADEVARGMAMYPLDAAMEAREAQAAAASAQALAQEEEEIDGMGMGGVNGGGGSGSGGVMTHGGGSSATPLSASGATGRTAAAKAAMTAAAGLRAPLDPTLAAKLPARLKPSSASLVAPAPKHASSAVMGMMAPSNPASGAPSGSSSGTATPVAPRSLPAPHAPPGYAASSQPATSAAAAIAHAQAHAHAHVHAQQQAQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHHQHQQATASGDAALAGKPLSAQHGVDPLMGMMDMVTLSSFPSGVPGLGSLDAFMDQDEAMTPGSGSGPGPDFDGGHGHGQSNGHGGAHPPGRGATHAGLTSSGDFEFDAAF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.09
4 0.06
5 0.05
6 0.04
7 0.03
8 0.02
9 0.02
10 0.02
11 0.02
12 0.03
13 0.04
14 0.05
15 0.06
16 0.07
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.11
21 0.12
22 0.11
23 0.12
24 0.12
25 0.11
26 0.13
27 0.12
28 0.09
29 0.09
30 0.08
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.05
35 0.05
36 0.05
37 0.04
38 0.03
39 0.03
40 0.03
41 0.02
42 0.02
43 0.02
44 0.02
45 0.02
46 0.02
47 0.02
48 0.02
49 0.02
50 0.02
51 0.02
52 0.02
53 0.03
54 0.04
55 0.05
56 0.06
57 0.07
58 0.09
59 0.16
60 0.18
61 0.18
62 0.18
63 0.23
64 0.25
65 0.25
66 0.25
67 0.24
68 0.29
69 0.3
70 0.31
71 0.27
72 0.25
73 0.25
74 0.25
75 0.24
76 0.16
77 0.18
78 0.17
79 0.19
80 0.2
81 0.2
82 0.2
83 0.17
84 0.21
85 0.19
86 0.19
87 0.18
88 0.18
89 0.2
90 0.19
91 0.19
92 0.15
93 0.15
94 0.14
95 0.13
96 0.12
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.05
103 0.04
104 0.04
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.04
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.07
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.11
129 0.13
130 0.12
131 0.13
132 0.15
133 0.2
134 0.24
135 0.26
136 0.28
137 0.31
138 0.32
139 0.32
140 0.29
141 0.24
142 0.19
143 0.23
144 0.19
145 0.15
146 0.14
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.11
151 0.06
152 0.05
153 0.06
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.15
166 0.2
167 0.2
168 0.21
169 0.2
170 0.2
171 0.24
172 0.28
173 0.26
174 0.22
175 0.23
176 0.23
177 0.26
178 0.25
179 0.21
180 0.18
181 0.19
182 0.23
183 0.25
184 0.26
185 0.28
186 0.32
187 0.38
188 0.43
189 0.48
190 0.5
191 0.55
192 0.58
193 0.55
194 0.52
195 0.49
196 0.43
197 0.37
198 0.34
199 0.29
200 0.26
201 0.29
202 0.28
203 0.32
204 0.36
205 0.41
206 0.46
207 0.47
208 0.52
209 0.56
210 0.62
211 0.58
212 0.55
213 0.55
214 0.47
215 0.42
216 0.35
217 0.26
218 0.2
219 0.18
220 0.16
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.12
230 0.12
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.07
236 0.06
237 0.04
238 0.04
239 0.03
240 0.03
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.02
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.06
255 0.07
256 0.07
257 0.09
258 0.09
259 0.11
260 0.15
261 0.16
262 0.16
263 0.16
264 0.17
265 0.22
266 0.28
267 0.3
268 0.31
269 0.31
270 0.3
271 0.31
272 0.34
273 0.31
274 0.28
275 0.24
276 0.2
277 0.17
278 0.17
279 0.16
280 0.11
281 0.08
282 0.05
283 0.05
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.03
288 0.03
289 0.02
290 0.02
291 0.02
292 0.02
293 0.03
294 0.02
295 0.02
296 0.03
297 0.04
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.09
303 0.11
304 0.11
305 0.13
306 0.14
307 0.15
308 0.15
309 0.18
310 0.18
311 0.17
312 0.17
313 0.14
314 0.13
315 0.11
316 0.11
317 0.06
318 0.07
319 0.06
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.03
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.07
341 0.08
342 0.1
343 0.16
344 0.19
345 0.27
346 0.32
347 0.39
348 0.49
349 0.59
350 0.61
351 0.61
352 0.63
353 0.6
354 0.58
355 0.52
356 0.42
357 0.31
358 0.27
359 0.22
360 0.14
361 0.09
362 0.08
363 0.06
364 0.05
365 0.05
366 0.04
367 0.04
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.06
372 0.07
373 0.08
374 0.1
375 0.13
376 0.12
377 0.13
378 0.15
379 0.15
380 0.15
381 0.14
382 0.12
383 0.1
384 0.09
385 0.09
386 0.07
387 0.05
388 0.04
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.06
409 0.07
410 0.06
411 0.07
412 0.09
413 0.16
414 0.23
415 0.27
416 0.35
417 0.42
418 0.47
419 0.53
420 0.62
421 0.66
422 0.68
423 0.74
424 0.75
425 0.77
426 0.79
427 0.81
428 0.75
429 0.69
430 0.64
431 0.56
432 0.53
433 0.54
434 0.56
435 0.57
436 0.54
437 0.49
438 0.46
439 0.43
440 0.37
441 0.28
442 0.19
443 0.09
444 0.07
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.04
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.03
464 0.03
465 0.03
466 0.03
467 0.03
468 0.03
469 0.03
470 0.02
471 0.02
472 0.02
473 0.02
474 0.02
475 0.02
476 0.02
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.04
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.02
495 0.02
496 0.02
497 0.03
498 0.04
499 0.04
500 0.05
501 0.05
502 0.07
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.11
508 0.14
509 0.17
510 0.21
511 0.21
512 0.22
513 0.23
514 0.22
515 0.21
516 0.2
517 0.24
518 0.24
519 0.31
520 0.31
521 0.31
522 0.33
523 0.33
524 0.32
525 0.28
526 0.27
527 0.25
528 0.25
529 0.25
530 0.23
531 0.23
532 0.22
533 0.2
534 0.21
535 0.15
536 0.15
537 0.15
538 0.15
539 0.14
540 0.13
541 0.13
542 0.07
543 0.08
544 0.06
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.04
552 0.04
553 0.05
554 0.04
555 0.06
556 0.06
557 0.07
558 0.07
559 0.07
560 0.08
561 0.08
562 0.1
563 0.08
564 0.08
565 0.07
566 0.07
567 0.07
568 0.05
569 0.05
570 0.03
571 0.05
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.04
577 0.05
578 0.04
579 0.03
580 0.05
581 0.05
582 0.05
583 0.05
584 0.05
585 0.05
586 0.05
587 0.05
588 0.04
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.05
594 0.05
595 0.05
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.05
602 0.04
603 0.04
604 0.03
605 0.03
606 0.03
607 0.02
608 0.02
609 0.02
610 0.02
611 0.02
612 0.02
613 0.02
614 0.02
615 0.02
616 0.02
617 0.02
618 0.02
619 0.02
620 0.03
621 0.03
622 0.03
623 0.03
624 0.03
625 0.04
626 0.04
627 0.04
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.05
632 0.05
633 0.07
634 0.07
635 0.07
636 0.07
637 0.08
638 0.09
639 0.09
640 0.09
641 0.09
642 0.09
643 0.09
644 0.09
645 0.08
646 0.08
647 0.08
648 0.08
649 0.06
650 0.07
651 0.07
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.06
657 0.07
658 0.06
659 0.07
660 0.06
661 0.08
662 0.11
663 0.11
664 0.12
665 0.13
666 0.18
667 0.23
668 0.27
669 0.3
670 0.28
671 0.29
672 0.3
673 0.33
674 0.31
675 0.27
676 0.24
677 0.21
678 0.25
679 0.27
680 0.24
681 0.22
682 0.22
683 0.2
684 0.21
685 0.19
686 0.16
687 0.13
688 0.14
689 0.13
690 0.1
691 0.09
692 0.09
693 0.1
694 0.08
695 0.08
696 0.06
697 0.06
698 0.06
699 0.06
700 0.07
701 0.07
702 0.08
703 0.08
704 0.1
705 0.11
706 0.11
707 0.12
708 0.11
709 0.11
710 0.11
711 0.11
712 0.1
713 0.13
714 0.15
715 0.16
716 0.15
717 0.15
718 0.16
719 0.18
720 0.2
721 0.21
722 0.23
723 0.26
724 0.27
725 0.27
726 0.26
727 0.25
728 0.26
729 0.23
730 0.19
731 0.19
732 0.18
733 0.18
734 0.17
735 0.15
736 0.13
737 0.12
738 0.12
739 0.08
740 0.08
741 0.08
742 0.09
743 0.09
744 0.08
745 0.07
746 0.07
747 0.07
748 0.08
749 0.09
750 0.09
751 0.08
752 0.1
753 0.16
754 0.19
755 0.23
756 0.22
757 0.27
758 0.34
759 0.4
760 0.43
761 0.43
762 0.45
763 0.49
764 0.55
765 0.58
766 0.58
767 0.6
768 0.64
769 0.67
770 0.7
771 0.7
772 0.71
773 0.71
774 0.73
775 0.73
776 0.73
777 0.73
778 0.73
779 0.73
780 0.73
781 0.73
782 0.73
783 0.73
784 0.73
785 0.73
786 0.73
787 0.72
788 0.72
789 0.71
790 0.73
791 0.75
792 0.76
793 0.76
794 0.74
795 0.7
796 0.65
797 0.6
798 0.54
799 0.47
800 0.38
801 0.29
802 0.23
803 0.19
804 0.16
805 0.14
806 0.1
807 0.07
808 0.07
809 0.06
810 0.06
811 0.07
812 0.11
813 0.12
814 0.13
815 0.14
816 0.19
817 0.2
818 0.19
819 0.19
820 0.15
821 0.13
822 0.12
823 0.1
824 0.05
825 0.05
826 0.04
827 0.04
828 0.04
829 0.04
830 0.04
831 0.05
832 0.05
833 0.04
834 0.07
835 0.08
836 0.08
837 0.08
838 0.08
839 0.1
840 0.11
841 0.11
842 0.09
843 0.09
844 0.09
845 0.09
846 0.08
847 0.07
848 0.06
849 0.07
850 0.07
851 0.08
852 0.08
853 0.08
854 0.07
855 0.07
856 0.08
857 0.09
858 0.08
859 0.1
860 0.12
861 0.12
862 0.14
863 0.14
864 0.14
865 0.14
866 0.17
867 0.17
868 0.19
869 0.19
870 0.18
871 0.2
872 0.2
873 0.2
874 0.21
875 0.19
876 0.16
877 0.15
878 0.16
879 0.21
880 0.24
881 0.23
882 0.21
883 0.22
884 0.22
885 0.23
886 0.26
887 0.22
888 0.22
889 0.22
890 0.22
891 0.21
892 0.22
893 0.21
894 0.18
895 0.15
896 0.12
897 0.11