FuNGI

A0A3M2TFD0

Protein Details

Accession

A0A3M2TFD0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
434-459	DDKTSAQTKRKGAKYKRGKNGNEAAG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
442-452	KRKGAKYKRGK

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, mito 10, cyto_nucl 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPRKQWIDKKNAATYQLLHRPQNDPLIHDSGADDRVLHQVSGSASAGPSESSKGVRHLSDLESEFGTEPIRRNEGEAANYGIYFDDTKYDYMQHLRELGTGGGNSHFVEPSQKEKGKAKGMKLEDALRQTSLDDSRSEFGGAGGSVYGSDMRSTVSSYARPQTYQNQQDVPDAIAGFQPDMDPRLREALEALEDDAFVDDEDDEDVFGELTNRAEEVDPGDWEDTLFGQEEEDDGWESDATEKAPVQRGITEAAPDEADTAGPAAEETTPGEMPSDNAPIPDLQPEDQGWMREFAKFKKDIKANAAPPAPSMAPSEQRTLASTAFTAGGTPIRTKKRKGALTNPSSHSMSSSALARTEGHKLLDDRFEKVEALYAVDEEDELDDSMSLASGMTGKTGISAASSQAPSLVDANGAVPSGHNFNNVMDDFLAGWDDKTSAQTKRKGAKYKRGKNGNEAAGMRMLDEVRQGLGPVKMPGKVPGRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.58
3	0.57
4	0.58
5	0.55
6	0.5
7	0.49
8	0.49
9	0.5
10	0.55
11	0.47
12	0.41
13	0.41
14	0.42
15	0.38
16	0.35
17	0.32
18	0.26
19	0.26
20	0.22
21	0.17
22	0.13
23	0.18
24	0.19
25	0.18
26	0.14
27	0.16
28	0.17
29	0.2
30	0.19
31	0.14
32	0.13
33	0.13
34	0.14
35	0.12
36	0.12
37	0.11
38	0.12
39	0.14
40	0.16
41	0.21
42	0.24
43	0.24
44	0.25
45	0.26
46	0.27
47	0.3
48	0.3
49	0.28
50	0.24
51	0.25
52	0.23
53	0.2
54	0.19
55	0.15
56	0.18
57	0.2
58	0.23
59	0.22
60	0.24
61	0.3
62	0.32
63	0.32
64	0.3
65	0.29
66	0.26
67	0.25
68	0.23
69	0.17
70	0.14
71	0.12
72	0.1
73	0.1
74	0.11
75	0.12
76	0.13
77	0.15
78	0.17
79	0.21
80	0.22
81	0.21
82	0.22
83	0.22
84	0.22
85	0.21
86	0.19
87	0.16
88	0.15
89	0.13
90	0.11
91	0.12
92	0.12
93	0.11
94	0.11
95	0.09
96	0.15
97	0.16
98	0.21
99	0.3
100	0.32
101	0.35
102	0.41
103	0.48
104	0.53
105	0.57
106	0.56
107	0.56
108	0.56
109	0.57
110	0.54
111	0.51
112	0.45
113	0.43
114	0.39
115	0.3
116	0.27
117	0.23
118	0.23
119	0.2
120	0.17
121	0.15
122	0.16
123	0.16
124	0.17
125	0.17
126	0.13
127	0.11
128	0.11
129	0.1
130	0.07
131	0.06
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.05
136	0.04
137	0.05
138	0.05
139	0.06
140	0.06
141	0.07
142	0.09
143	0.11
144	0.13
145	0.16
146	0.22
147	0.23
148	0.23
149	0.25
150	0.31
151	0.38
152	0.42
153	0.42
154	0.39
155	0.39
156	0.4
157	0.38
158	0.31
159	0.23
160	0.17
161	0.14
162	0.11
163	0.1
164	0.08
165	0.07
166	0.07
167	0.06
168	0.08
169	0.09
170	0.09
171	0.09
172	0.13
173	0.13
174	0.13
175	0.13
176	0.12
177	0.12
178	0.12
179	0.11
180	0.08
181	0.07
182	0.08
183	0.07
184	0.06
185	0.04
186	0.04
187	0.03
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.06
203	0.06
204	0.07
205	0.08
206	0.08
207	0.09
208	0.09
209	0.08
210	0.08
211	0.08
212	0.06
213	0.05
214	0.06
215	0.05
216	0.04
217	0.04
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.04
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.08
232	0.13
233	0.13
234	0.13
235	0.13
236	0.14
237	0.15
238	0.15
239	0.14
240	0.1
241	0.09
242	0.09
243	0.08
244	0.07
245	0.06
246	0.05
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.04
255	0.04
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.07
260	0.06
261	0.07
262	0.09
263	0.11
264	0.09
265	0.09
266	0.1
267	0.1
268	0.11
269	0.12
270	0.11
271	0.09
272	0.11
273	0.11
274	0.13
275	0.14
276	0.14
277	0.13
278	0.15
279	0.15
280	0.16
281	0.18
282	0.19
283	0.24
284	0.28
285	0.3
286	0.36
287	0.4
288	0.4
289	0.46
290	0.51
291	0.47
292	0.48
293	0.48
294	0.39
295	0.35
296	0.34
297	0.27
298	0.19
299	0.19
300	0.15
301	0.19
302	0.21
303	0.24
304	0.23
305	0.23
306	0.24
307	0.23
308	0.21
309	0.16
310	0.13
311	0.12
312	0.11
313	0.1
314	0.09
315	0.07
316	0.09
317	0.09
318	0.12
319	0.18
320	0.27
321	0.32
322	0.35
323	0.43
324	0.5
325	0.58
326	0.63
327	0.66
328	0.67
329	0.71
330	0.76
331	0.71
332	0.66
333	0.58
334	0.5
335	0.41
336	0.32
337	0.24
338	0.18
339	0.17
340	0.14
341	0.14
342	0.15
343	0.14
344	0.15
345	0.19
346	0.19
347	0.17
348	0.2
349	0.21
350	0.23
351	0.3
352	0.29
353	0.27
354	0.27
355	0.27
356	0.25
357	0.23
358	0.24
359	0.16
360	0.16
361	0.13
362	0.12
363	0.11
364	0.1
365	0.1
366	0.07
367	0.07
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.05
375	0.05
376	0.04
377	0.04
378	0.05
379	0.05
380	0.05
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.09
389	0.14
390	0.14
391	0.13
392	0.14
393	0.15
394	0.15
395	0.15
396	0.14
397	0.09
398	0.09
399	0.1
400	0.09
401	0.09
402	0.07
403	0.07
404	0.08
405	0.12
406	0.12
407	0.13
408	0.14
409	0.14
410	0.2
411	0.2
412	0.2
413	0.16
414	0.16
415	0.15
416	0.14
417	0.15
418	0.09
419	0.09
420	0.08
421	0.09
422	0.09
423	0.13
424	0.17
425	0.24
426	0.32
427	0.39
428	0.47
429	0.56
430	0.64
431	0.71
432	0.76
433	0.79
434	0.83
435	0.86
436	0.88
437	0.89
438	0.85
439	0.84
440	0.83
441	0.78
442	0.74
443	0.65
444	0.56
445	0.49
446	0.44
447	0.35
448	0.27
449	0.22
450	0.15
451	0.16
452	0.14
453	0.12
454	0.13
455	0.13
456	0.14
457	0.17
458	0.18
459	0.21
460	0.23
461	0.25
462	0.26
463	0.33

A0A3M2TFD0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer