FuNGI

A0A3M2T4V5

Protein Details

Accession

A0A3M2T4V5

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-49	APMKMRRPKAADPLVRPKRKPAPKPGAATPS	Hydrophilic
133-156	DEAQFTRPVRLQRRNPRAKSQEIY	Hydrophilic
518-541	GTDTSRKKTKSKHPSAQPTPQPGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
19-46	APMKMRRPKAADPLVRPKRKPAPKPGAA
413-434	EKKEKEAQRVLGKKVRKALQKR
501-507	AAAPRKR
524-529	KKTKSK
556-558	KKR

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSTPTNNLNPRPASGPNGAPMKMRRPKAADPLVRPKRKPAPKPGAATPSGNGTASKPPSTRPPPSSTPLSRSHAEKTIPTPAENSLAVNGFSGPLLTPNYVDYPLVITKRELREGLKHHVARFASKKNIDPRDEAQFTRPVRLQRRNPRAKSQEIYEGRDQGMQNTGSDSGLPMDEAEREDFEARRAARDRERADNLAQIAPSVASGPKRSHVPKQKTQQVYKTDMTPEEVAKTKIKYEEALPWHVEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAAFVLENTGKMRMIPVEKWYKFTAKSQFKPLSIEEAEKYMAKKVKDPRWFMEKQQESAQQKELESYAKQRRVFAGKQGTPARADGLEGDEMDFEEDRFADDEEHEDLFNDDEDAKVAEKRIKQDQLKANVFDLKEEKEYENEEVKEKKEKEAQRVLGKKVRKALQKREKNYDYSSGSDVNPYSDESSDESEAEEQKDEEKKTEEEKNRKESGSSSKDHGTPSGRQKHTDALKGAAAPRKRPGSPNVSDASGTDTSRKKTKSKHPSAQPTPQPGSRPMSPAPSSSIQPGKKRVRNVRGGGGPGSDIDAGAGSAGEMSESGKPKKLKLNPPGVSSPSGTPQGSRAGSPTPLSARGLSGSRASSPEQGSSTAGGAALPPGSQSFPSPAEIHASIPATGILSSDLLKKFRPRIGDSRENHRRFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGPLKEG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.4
3	0.39
4	0.42
5	0.4
6	0.4
7	0.42
8	0.47
9	0.5
10	0.52
11	0.53
12	0.55
13	0.62
14	0.67
15	0.72
16	0.7
17	0.71
18	0.78
19	0.81
20	0.82
21	0.77
22	0.76
23	0.76
24	0.78
25	0.79
26	0.79
27	0.79
28	0.78
29	0.83
30	0.82
31	0.79
32	0.72
33	0.65
34	0.54
35	0.5
36	0.43
37	0.37
38	0.29
39	0.24
40	0.29
41	0.31
42	0.35
43	0.3
44	0.32
45	0.42
46	0.49
47	0.55
48	0.53
49	0.56
50	0.57
51	0.63
52	0.69
53	0.64
54	0.62
55	0.6
56	0.59
57	0.55
58	0.52
59	0.51
60	0.48
61	0.45
62	0.43
63	0.4
64	0.44
65	0.43
66	0.4
67	0.37
68	0.32
69	0.34
70	0.3
71	0.26
72	0.19
73	0.18
74	0.17
75	0.16
76	0.14
77	0.11
78	0.1
79	0.09
80	0.07
81	0.08
82	0.11
83	0.11
84	0.11
85	0.13
86	0.15
87	0.16
88	0.16
89	0.13
90	0.15
91	0.19
92	0.2
93	0.19
94	0.19
95	0.26
96	0.31
97	0.34
98	0.33
99	0.32
100	0.39
101	0.43
102	0.5
103	0.52
104	0.51
105	0.48
106	0.52
107	0.49
108	0.49
109	0.5
110	0.49
111	0.48
112	0.48
113	0.54
114	0.58
115	0.65
116	0.61
117	0.59
118	0.55
119	0.56
120	0.56
121	0.5
122	0.44
123	0.43
124	0.41
125	0.41
126	0.41
127	0.4
128	0.46
129	0.55
130	0.62
131	0.65
132	0.76
133	0.81
134	0.83
135	0.85
136	0.82
137	0.8
138	0.74
139	0.67
140	0.66
141	0.6
142	0.6
143	0.53
144	0.49
145	0.42
146	0.42
147	0.38
148	0.29
149	0.29
150	0.24
151	0.2
152	0.19
153	0.19
154	0.14
155	0.14
156	0.13
157	0.09
158	0.08
159	0.08
160	0.06
161	0.06
162	0.08
163	0.09
164	0.1
165	0.09
166	0.11
167	0.13
168	0.13
169	0.14
170	0.18
171	0.17
172	0.22
173	0.25
174	0.29
175	0.35
176	0.43
177	0.45
178	0.48
179	0.53
180	0.5
181	0.48
182	0.46
183	0.4
184	0.34
185	0.3
186	0.21
187	0.17
188	0.13
189	0.12
190	0.09
191	0.09
192	0.09
193	0.12
194	0.13
195	0.16
196	0.22
197	0.26
198	0.35
199	0.44
200	0.51
201	0.57
202	0.66
203	0.73
204	0.75
205	0.78
206	0.76
207	0.71
208	0.69
209	0.62
210	0.55
211	0.49
212	0.41
213	0.37
214	0.31
215	0.26
216	0.22
217	0.22
218	0.21
219	0.21
220	0.21
221	0.21
222	0.22
223	0.23
224	0.21
225	0.21
226	0.27
227	0.28
228	0.31
229	0.29
230	0.26
231	0.26
232	0.25
233	0.23
234	0.18
235	0.18
236	0.18
237	0.19
238	0.18
239	0.18
240	0.18
241	0.18
242	0.16
243	0.12
244	0.09
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.07
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.06
257	0.06
258	0.09
259	0.08
260	0.09
261	0.09
262	0.1
263	0.1
264	0.1
265	0.11
266	0.1
267	0.12
268	0.13
269	0.19
270	0.28
271	0.29
272	0.32
273	0.33
274	0.34
275	0.33
276	0.38
277	0.42
278	0.41
279	0.43
280	0.49
281	0.51
282	0.49
283	0.5
284	0.45
285	0.41
286	0.33
287	0.32
288	0.23
289	0.2
290	0.2
291	0.18
292	0.18
293	0.16
294	0.19
295	0.17
296	0.23
297	0.31
298	0.39
299	0.45
300	0.49
301	0.49
302	0.54
303	0.55
304	0.52
305	0.54
306	0.47
307	0.42
308	0.42
309	0.46
310	0.4
311	0.41
312	0.41
313	0.32
314	0.3
315	0.28
316	0.24
317	0.19
318	0.17
319	0.23
320	0.27
321	0.31
322	0.32
323	0.32
324	0.35
325	0.39
326	0.39
327	0.38
328	0.4
329	0.36
330	0.41
331	0.43
332	0.41
333	0.35
334	0.34
335	0.28
336	0.18
337	0.16
338	0.1
339	0.09
340	0.08
341	0.07
342	0.07
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.07
356	0.09
357	0.09
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.06
364	0.05
365	0.04
366	0.05
367	0.05
368	0.06
369	0.06
370	0.08
371	0.11
372	0.14
373	0.17
374	0.24
375	0.31
376	0.33
377	0.4
378	0.46
379	0.51
380	0.52
381	0.5
382	0.44
383	0.41
384	0.38
385	0.32
386	0.26
387	0.19
388	0.18
389	0.19
390	0.18
391	0.15
392	0.18
393	0.19
394	0.21
395	0.2
396	0.22
397	0.22
398	0.24
399	0.31
400	0.3
401	0.31
402	0.35
403	0.39
404	0.43
405	0.5
406	0.54
407	0.54
408	0.59
409	0.6
410	0.57
411	0.56
412	0.51
413	0.5
414	0.5
415	0.5
416	0.53
417	0.59
418	0.64
419	0.7
420	0.73
421	0.76
422	0.73
423	0.69
424	0.63
425	0.59
426	0.51
427	0.43
428	0.4
429	0.32
430	0.28
431	0.26
432	0.23
433	0.17
434	0.15
435	0.14
436	0.12
437	0.1
438	0.11
439	0.11
440	0.14
441	0.13
442	0.13
443	0.12
444	0.13
445	0.14
446	0.14
447	0.13
448	0.1
449	0.14
450	0.19
451	0.19
452	0.19
453	0.21
454	0.22
455	0.26
456	0.35
457	0.4
458	0.46
459	0.52
460	0.58
461	0.6
462	0.58
463	0.54
464	0.49
465	0.5
466	0.46
467	0.41
468	0.37
469	0.36
470	0.38
471	0.38
472	0.37
473	0.31
474	0.32
475	0.39
476	0.46
477	0.44
478	0.44
479	0.45
480	0.49
481	0.5
482	0.49
483	0.41
484	0.33
485	0.33
486	0.33
487	0.35
488	0.33
489	0.31
490	0.27
491	0.32
492	0.35
493	0.35
494	0.38
495	0.4
496	0.43
497	0.44
498	0.47
499	0.42
500	0.38
501	0.36
502	0.32
503	0.31
504	0.24
505	0.22
506	0.22
507	0.24
508	0.26
509	0.33
510	0.36
511	0.37
512	0.44
513	0.55
514	0.6
515	0.67
516	0.74
517	0.77
518	0.85
519	0.86
520	0.87
521	0.83
522	0.8
523	0.74
524	0.67
525	0.6
526	0.54
527	0.52
528	0.44
529	0.42
530	0.35
531	0.38
532	0.36
533	0.34
534	0.35
535	0.32
536	0.3
537	0.31
538	0.37
539	0.35
540	0.4
541	0.48
542	0.54
543	0.56
544	0.65
545	0.7
546	0.72
547	0.76
548	0.75
549	0.73
550	0.67
551	0.64
552	0.56
553	0.46
554	0.36
555	0.27
556	0.24
557	0.16
558	0.11
559	0.08
560	0.07
561	0.06
562	0.06
563	0.05
564	0.03
565	0.03
566	0.03
567	0.03
568	0.03
569	0.05
570	0.1
571	0.14
572	0.17
573	0.23
574	0.25
575	0.3
576	0.4
577	0.48
578	0.54
579	0.59
580	0.68
581	0.66
582	0.7
583	0.71
584	0.64
585	0.57
586	0.49
587	0.42
588	0.35
589	0.35
590	0.29
591	0.24
592	0.24
593	0.28
594	0.27
595	0.25
596	0.23
597	0.22
598	0.24
599	0.25
600	0.26
601	0.22
602	0.24
603	0.25
604	0.24
605	0.22
606	0.22
607	0.23
608	0.21
609	0.2
610	0.2
611	0.19
612	0.21
613	0.23
614	0.26
615	0.26
616	0.27
617	0.26
618	0.26
619	0.25
620	0.23
621	0.22
622	0.16
623	0.14
624	0.11
625	0.09
626	0.09
627	0.08
628	0.07
629	0.07
630	0.08
631	0.09
632	0.1
633	0.11
634	0.15
635	0.16
636	0.2
637	0.2
638	0.2
639	0.24
640	0.24
641	0.24
642	0.24
643	0.23
644	0.2
645	0.19
646	0.19
647	0.14
648	0.13
649	0.12
650	0.09
651	0.08
652	0.1
653	0.15
654	0.18
655	0.2
656	0.24
657	0.31
658	0.37
659	0.41
660	0.47
661	0.48
662	0.55
663	0.63
664	0.69
665	0.66
666	0.7
667	0.77
668	0.73
669	0.68
670	0.59
671	0.51
672	0.42
673	0.46
674	0.42
675	0.36
676	0.35
677	0.34
678	0.34
679	0.33
680	0.32
681	0.25
682	0.19
683	0.17
684	0.18
685	0.21
686	0.22
687	0.23
688	0.29
689	0.31
690	0.33
691	0.38

A0A3M2T4V5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer