Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1DW34

Protein Details
Accession A0A0D1DW34    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-28CGDVVKKPKLQQHYNRCYAPHydrophilic
127-168VEPSSPTKKEKKEKNEKKEKKEKKEKKEKKEKKEQKTQSEEIBasic
372-402YLKKVERARVQKDKMERRKRKAEKLGTEVDDBasic
404-426SGMEKSRTFKQRKPVQKDVRDQAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-113RK
133-160TKKEKKEKNEKKEKKEKKEKKEKKEKKE
376-395VERARVQKDKMERRKRKAEK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 11.833, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0034462  P:small-subunit processome assembly  
KEGG uma:UMAG_04789  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51804  ZF_C2HC_LYAR  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MVSFNCDGCGDVVKKPKLQQHYNRCYAPVTCLDCSMQFNSPNEFKSHNSCISEAEKYERSVYRGPKHQGQQNGQTPQKSHHQPISTPAQVQQAAAEVATPAKESADKVNGKRKRREEQDEAAAVVAVEPSSPTKKEKKEKNEKKEKKEKKEKKEKKEKKEQKTQSEEIAEQVPESPSDTEIDSDDAEEHIQDDPMQAADQEEKIIKPLSTTELEAFKKKQRKLGIVYISRIPPGMTPAKVRHILSNFGELGRIYLQNGSRPGEAKKKHGVAHYTEGWIEFTSKKVAKAAAEMLNAQPIGGLAASNSKKSGSGGGSSKMGKSSKRFQDDVWTMKYLKGFKWHMLSEQMAQERASHAARLRTELSQSAYEQKDYLKKVERARVQKDKMERRKRKAEKLGTEVDDVSGMEKSRTFKQRKPVQKDVRDQA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.48
3 0.55
4 0.58
5 0.66
6 0.7
7 0.72
8 0.78
9 0.81
10 0.77
11 0.71
12 0.64
13 0.55
14 0.5
15 0.47
16 0.42
17 0.35
18 0.35
19 0.34
20 0.33
21 0.35
22 0.33
23 0.3
24 0.29
25 0.3
26 0.35
27 0.37
28 0.36
29 0.36
30 0.36
31 0.34
32 0.37
33 0.41
34 0.41
35 0.4
36 0.39
37 0.4
38 0.41
39 0.41
40 0.35
41 0.35
42 0.31
43 0.31
44 0.36
45 0.34
46 0.35
47 0.38
48 0.46
49 0.48
50 0.54
51 0.58
52 0.61
53 0.65
54 0.67
55 0.69
56 0.67
57 0.69
58 0.68
59 0.71
60 0.66
61 0.62
62 0.57
63 0.52
64 0.55
65 0.51
66 0.48
67 0.46
68 0.46
69 0.44
70 0.49
71 0.54
72 0.47
73 0.42
74 0.39
75 0.38
76 0.34
77 0.33
78 0.27
79 0.2
80 0.17
81 0.16
82 0.13
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.08
90 0.09
91 0.14
92 0.21
93 0.27
94 0.32
95 0.42
96 0.49
97 0.56
98 0.64
99 0.68
100 0.69
101 0.74
102 0.77
103 0.75
104 0.75
105 0.74
106 0.67
107 0.58
108 0.48
109 0.38
110 0.29
111 0.21
112 0.14
113 0.06
114 0.04
115 0.04
116 0.06
117 0.09
118 0.11
119 0.16
120 0.24
121 0.33
122 0.43
123 0.52
124 0.61
125 0.7
126 0.8
127 0.86
128 0.9
129 0.9
130 0.92
131 0.93
132 0.92
133 0.92
134 0.93
135 0.92
136 0.91
137 0.93
138 0.93
139 0.93
140 0.94
141 0.93
142 0.92
143 0.94
144 0.93
145 0.91
146 0.92
147 0.9
148 0.88
149 0.86
150 0.78
151 0.71
152 0.64
153 0.54
154 0.45
155 0.38
156 0.27
157 0.19
158 0.18
159 0.13
160 0.09
161 0.11
162 0.09
163 0.07
164 0.08
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.04
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.09
195 0.11
196 0.11
197 0.12
198 0.13
199 0.17
200 0.19
201 0.21
202 0.23
203 0.26
204 0.33
205 0.34
206 0.38
207 0.38
208 0.43
209 0.46
210 0.52
211 0.54
212 0.49
213 0.49
214 0.47
215 0.42
216 0.36
217 0.31
218 0.22
219 0.14
220 0.15
221 0.16
222 0.14
223 0.17
224 0.19
225 0.24
226 0.27
227 0.28
228 0.28
229 0.27
230 0.3
231 0.28
232 0.29
233 0.25
234 0.21
235 0.21
236 0.16
237 0.15
238 0.13
239 0.12
240 0.08
241 0.11
242 0.12
243 0.14
244 0.17
245 0.18
246 0.17
247 0.19
248 0.22
249 0.27
250 0.29
251 0.32
252 0.37
253 0.39
254 0.42
255 0.45
256 0.45
257 0.41
258 0.45
259 0.41
260 0.35
261 0.31
262 0.27
263 0.24
264 0.2
265 0.17
266 0.11
267 0.11
268 0.16
269 0.17
270 0.17
271 0.19
272 0.2
273 0.19
274 0.21
275 0.25
276 0.23
277 0.23
278 0.23
279 0.21
280 0.21
281 0.2
282 0.17
283 0.12
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.05
288 0.03
289 0.11
290 0.12
291 0.13
292 0.14
293 0.14
294 0.14
295 0.15
296 0.19
297 0.14
298 0.18
299 0.2
300 0.22
301 0.25
302 0.26
303 0.26
304 0.26
305 0.27
306 0.26
307 0.3
308 0.38
309 0.43
310 0.49
311 0.49
312 0.46
313 0.54
314 0.56
315 0.55
316 0.49
317 0.43
318 0.38
319 0.38
320 0.42
321 0.34
322 0.3
323 0.33
324 0.32
325 0.34
326 0.39
327 0.38
328 0.37
329 0.39
330 0.38
331 0.33
332 0.36
333 0.34
334 0.29
335 0.28
336 0.26
337 0.22
338 0.24
339 0.21
340 0.18
341 0.19
342 0.24
343 0.25
344 0.28
345 0.3
346 0.28
347 0.3
348 0.3
349 0.3
350 0.27
351 0.27
352 0.31
353 0.3
354 0.29
355 0.28
356 0.3
357 0.33
358 0.34
359 0.39
360 0.41
361 0.45
362 0.53
363 0.61
364 0.65
365 0.68
366 0.74
367 0.78
368 0.75
369 0.75
370 0.78
371 0.79
372 0.82
373 0.83
374 0.84
375 0.83
376 0.89
377 0.91
378 0.92
379 0.91
380 0.91
381 0.89
382 0.86
383 0.85
384 0.77
385 0.7
386 0.59
387 0.49
388 0.39
389 0.29
390 0.23
391 0.16
392 0.13
393 0.12
394 0.15
395 0.18
396 0.26
397 0.37
398 0.42
399 0.46
400 0.57
401 0.66
402 0.74
403 0.8
404 0.82
405 0.83
406 0.86