Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3M2STV2

Protein Details
Accession A0A3M2STV2    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
73-97QVNGRATRTARRRERRKPASAAKPLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
78-93ATRTARRRERRKPASA
157-159KRR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018545  Btz_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0035145  C:exon-exon junction complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0006417  P:regulation of translation  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09405  Btz  
Amino Acid Sequences MSHRRNIGASRRRRRDEEGEDEGSGNGELDEDSLSDGSVITHQDEDDADGEGTEESDGDASIPVPKNKTNGPQVNGRATRTARRRERRKPASAAKPLMNSTASDTEAMLNGMKAAGEGSGVAEIHFDELKEEPGTQTERTPSAPPTEPRRETFAERKRREHERHVKERDANPAFVPTRGRFFLHDKRSSDAGCNGHRSSNKPKSRPYGLIVDGNIRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.78
3 0.77
4 0.75
5 0.71
6 0.64
7 0.58
8 0.53
9 0.45
10 0.36
11 0.26
12 0.18
13 0.1
14 0.07
15 0.06
16 0.05
17 0.06
18 0.05
19 0.06
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.07
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.08
30 0.09
31 0.09
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.09
36 0.08
37 0.09
38 0.08
39 0.08
40 0.06
41 0.05
42 0.04
43 0.04
44 0.04
45 0.04
46 0.04
47 0.04
48 0.1
49 0.13
50 0.15
51 0.17
52 0.19
53 0.22
54 0.25
55 0.31
56 0.36
57 0.39
58 0.4
59 0.45
60 0.47
61 0.53
62 0.52
63 0.47
64 0.42
65 0.38
66 0.43
67 0.43
68 0.49
69 0.51
70 0.59
71 0.68
72 0.73
73 0.83
74 0.84
75 0.84
76 0.83
77 0.82
78 0.81
79 0.79
80 0.73
81 0.64
82 0.57
83 0.5
84 0.43
85 0.34
86 0.24
87 0.19
88 0.17
89 0.14
90 0.12
91 0.12
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.07
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.02
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.04
108 0.03
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.06
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.1
121 0.13
122 0.12
123 0.14
124 0.14
125 0.15
126 0.17
127 0.19
128 0.18
129 0.21
130 0.25
131 0.28
132 0.35
133 0.43
134 0.44
135 0.44
136 0.48
137 0.47
138 0.48
139 0.54
140 0.55
141 0.57
142 0.59
143 0.64
144 0.64
145 0.71
146 0.71
147 0.72
148 0.74
149 0.73
150 0.79
151 0.79
152 0.8
153 0.77
154 0.74
155 0.74
156 0.66
157 0.57
158 0.47
159 0.47
160 0.41
161 0.35
162 0.36
163 0.28
164 0.29
165 0.3
166 0.3
167 0.27
168 0.35
169 0.42
170 0.47
171 0.52
172 0.49
173 0.52
174 0.55
175 0.52
176 0.48
177 0.45
178 0.42
179 0.39
180 0.43
181 0.4
182 0.42
183 0.44
184 0.46
185 0.51
186 0.55
187 0.6
188 0.6
189 0.68
190 0.7
191 0.75
192 0.74
193 0.68
194 0.66
195 0.61
196 0.59
197 0.52