Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H9CNZ7

Protein Details
Accession H9CNZ7    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MLNIIKSKLKNTYKKKSLNSENVTIRHydrophilic
71-98NLNIESKLRKEKLRRRLRKLSTNKIFISHydrophilic
250-272TQPLVLKLRKKRKLLRYLKALVRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
78-89LRKEKLRRRLRK
256-278KLRKKRKLLRYLKALVRKAKIKD
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 10, cyto_nucl 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007980  Ribosomal_VAR1  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05316  VAR1  
Amino Acid Sequences MLNIIKSKLKNTYKKKSLNSENVTIRNKDLVPAVRDWKNSIYVYNKNSLSLIPVASRLVMKLIKGYFNSYNLNIESKLRKEKLRRRLRKLSTNKIFISDGEFKHTNDNVNITLYVYNRQRLNYLLKLRKRYLSLFRKVTFVRKLQLIRNVGLNILNKQQEKSKILTNVLPNYSSKVYSVQNLYYRNFIKKSLKRLKYYMYYKQLLYINKAKFENSYLQGLINLVRKIYKKNVEFNIINLKYFYYNSDIFTQPLVLKLRKKRKLLRYLKALVRKAKIKDIKLNERSKYFFELENLFKLNNLDTTNNLLNKLIEQNKTSSKDLKKVVLNDIKFKRVSGVRLEAAGRLTRRYTASRSQHKVRYSGNLINAYSSIKGYPSAVIRGNYKPNIQYTKLNSKSRIGSFGVKGWVSGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.86
3 0.87
4 0.87
5 0.88
6 0.84
7 0.82
8 0.8
9 0.79
10 0.75
11 0.67
12 0.58
13 0.53
14 0.46
15 0.39
16 0.38
17 0.36
18 0.35
19 0.38
20 0.43
21 0.43
22 0.45
23 0.46
24 0.43
25 0.42
26 0.39
27 0.38
28 0.38
29 0.4
30 0.43
31 0.47
32 0.44
33 0.39
34 0.39
35 0.34
36 0.3
37 0.25
38 0.22
39 0.16
40 0.17
41 0.16
42 0.16
43 0.17
44 0.13
45 0.15
46 0.15
47 0.14
48 0.19
49 0.21
50 0.24
51 0.24
52 0.3
53 0.29
54 0.31
55 0.34
56 0.3
57 0.31
58 0.28
59 0.3
60 0.25
61 0.27
62 0.29
63 0.31
64 0.39
65 0.4
66 0.46
67 0.55
68 0.63
69 0.69
70 0.75
71 0.8
72 0.8
73 0.87
74 0.88
75 0.89
76 0.89
77 0.89
78 0.87
79 0.84
80 0.75
81 0.67
82 0.59
83 0.48
84 0.46
85 0.41
86 0.33
87 0.32
88 0.33
89 0.3
90 0.35
91 0.36
92 0.32
93 0.26
94 0.29
95 0.22
96 0.23
97 0.22
98 0.17
99 0.18
100 0.15
101 0.21
102 0.2
103 0.24
104 0.24
105 0.25
106 0.25
107 0.26
108 0.32
109 0.33
110 0.41
111 0.45
112 0.5
113 0.56
114 0.58
115 0.59
116 0.56
117 0.54
118 0.55
119 0.56
120 0.58
121 0.58
122 0.56
123 0.57
124 0.55
125 0.56
126 0.52
127 0.45
128 0.4
129 0.39
130 0.42
131 0.41
132 0.47
133 0.43
134 0.38
135 0.38
136 0.34
137 0.29
138 0.28
139 0.25
140 0.19
141 0.2
142 0.23
143 0.21
144 0.22
145 0.26
146 0.28
147 0.3
148 0.3
149 0.31
150 0.31
151 0.32
152 0.35
153 0.35
154 0.34
155 0.32
156 0.31
157 0.26
158 0.26
159 0.24
160 0.2
161 0.16
162 0.15
163 0.15
164 0.17
165 0.19
166 0.19
167 0.22
168 0.25
169 0.25
170 0.27
171 0.28
172 0.29
173 0.28
174 0.29
175 0.34
176 0.36
177 0.46
178 0.52
179 0.56
180 0.57
181 0.59
182 0.59
183 0.58
184 0.6
185 0.58
186 0.54
187 0.49
188 0.46
189 0.47
190 0.46
191 0.38
192 0.36
193 0.36
194 0.3
195 0.31
196 0.32
197 0.28
198 0.24
199 0.26
200 0.26
201 0.2
202 0.21
203 0.17
204 0.17
205 0.16
206 0.16
207 0.16
208 0.15
209 0.13
210 0.12
211 0.14
212 0.16
213 0.19
214 0.25
215 0.31
216 0.31
217 0.38
218 0.41
219 0.45
220 0.44
221 0.43
222 0.46
223 0.39
224 0.35
225 0.28
226 0.25
227 0.2
228 0.2
229 0.19
230 0.13
231 0.13
232 0.15
233 0.18
234 0.18
235 0.18
236 0.18
237 0.18
238 0.13
239 0.17
240 0.19
241 0.19
242 0.25
243 0.34
244 0.45
245 0.51
246 0.6
247 0.65
248 0.71
249 0.79
250 0.82
251 0.82
252 0.8
253 0.8
254 0.79
255 0.78
256 0.74
257 0.69
258 0.64
259 0.62
260 0.55
261 0.57
262 0.57
263 0.53
264 0.56
265 0.58
266 0.64
267 0.67
268 0.72
269 0.65
270 0.63
271 0.6
272 0.54
273 0.5
274 0.42
275 0.34
276 0.3
277 0.31
278 0.29
279 0.3
280 0.28
281 0.23
282 0.22
283 0.21
284 0.18
285 0.16
286 0.16
287 0.14
288 0.14
289 0.2
290 0.24
291 0.24
292 0.24
293 0.21
294 0.19
295 0.2
296 0.26
297 0.27
298 0.25
299 0.26
300 0.3
301 0.37
302 0.41
303 0.42
304 0.43
305 0.42
306 0.47
307 0.49
308 0.51
309 0.5
310 0.49
311 0.56
312 0.56
313 0.53
314 0.55
315 0.55
316 0.54
317 0.49
318 0.45
319 0.42
320 0.37
321 0.39
322 0.36
323 0.38
324 0.34
325 0.36
326 0.37
327 0.32
328 0.31
329 0.31
330 0.26
331 0.22
332 0.22
333 0.23
334 0.26
335 0.29
336 0.33
337 0.38
338 0.47
339 0.55
340 0.62
341 0.67
342 0.7
343 0.7
344 0.7
345 0.64
346 0.62
347 0.59
348 0.57
349 0.55
350 0.53
351 0.49
352 0.44
353 0.41
354 0.33
355 0.27
356 0.22
357 0.16
358 0.12
359 0.13
360 0.13
361 0.16
362 0.17
363 0.21
364 0.25
365 0.27
366 0.3
367 0.36
368 0.43
369 0.43
370 0.45
371 0.45
372 0.48
373 0.53
374 0.52
375 0.54
376 0.54
377 0.61
378 0.66
379 0.69
380 0.64
381 0.63
382 0.68
383 0.63
384 0.6
385 0.53
386 0.51
387 0.47
388 0.48
389 0.47
390 0.39