Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3M2T4A2

Protein Details
Accession A0A3M2T4A2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
57-101DILERPVKRRKANPADSTRKTPSKTTPSKGASRSPRKVKEPRSALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-99PVKRRKANPADSTRKTPSKTTPSKGASRSPRKVKEPRS
Subcellular Location(s) mito 15.5, mito_nucl 13.333, nucl 10, cyto_nucl 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
IPR000445  HhH_motif  
IPR030841  NTH1  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0140078  F:class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000703  F:oxidized pyrimidine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00633  HHH  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MRTSRTSQESARVWQALSPVRRQTRQTGQRPQDPPVKEPPSSDDASLSSMDTVDMEDILERPVKRRKANPADSTRKTPSKTTPSKGASRSPRKVKEPRSALKTEPPADWDRIYATVKKMRENNPTAPVDTVGCAELYWRGSSPRDRRFHTLIALMLSSQTKDTVTALAMQRLHTELGDTSPPAEPPIVKVETEDDSKPPASSKDSKLNLENILAVSPERLNELIRAVGFHNNKTKYIKAVAPILRDQHDSDIPATAKDLMALPGVGPKMTYLCMSAAWGKHEGIGVDVHVHRITNLWGWHKTKSPEESRAALESWLPKDKWHEINKLLVGLGQTVCLPVGRRCGECDLSGSGLCKGEIKSGKPKKSSATVKEESDGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.4
3 0.4
4 0.4
5 0.41
6 0.45
7 0.51
8 0.55
9 0.58
10 0.6
11 0.63
12 0.7
13 0.73
14 0.74
15 0.75
16 0.79
17 0.79
18 0.76
19 0.73
20 0.66
21 0.61
22 0.6
23 0.58
24 0.49
25 0.48
26 0.47
27 0.45
28 0.43
29 0.39
30 0.3
31 0.25
32 0.26
33 0.25
34 0.19
35 0.14
36 0.12
37 0.11
38 0.09
39 0.09
40 0.07
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.06
45 0.08
46 0.13
47 0.13
48 0.18
49 0.27
50 0.35
51 0.41
52 0.49
53 0.58
54 0.65
55 0.74
56 0.78
57 0.8
58 0.83
59 0.81
60 0.81
61 0.77
62 0.73
63 0.65
64 0.6
65 0.59
66 0.6
67 0.63
68 0.61
69 0.63
70 0.63
71 0.68
72 0.66
73 0.66
74 0.66
75 0.68
76 0.72
77 0.72
78 0.74
79 0.76
80 0.81
81 0.81
82 0.81
83 0.8
84 0.79
85 0.76
86 0.72
87 0.66
88 0.64
89 0.63
90 0.55
91 0.46
92 0.43
93 0.39
94 0.38
95 0.36
96 0.28
97 0.22
98 0.23
99 0.25
100 0.23
101 0.24
102 0.28
103 0.29
104 0.34
105 0.4
106 0.43
107 0.5
108 0.53
109 0.53
110 0.55
111 0.55
112 0.5
113 0.43
114 0.37
115 0.28
116 0.22
117 0.18
118 0.1
119 0.09
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.09
124 0.09
125 0.08
126 0.1
127 0.13
128 0.22
129 0.31
130 0.38
131 0.43
132 0.46
133 0.52
134 0.54
135 0.53
136 0.47
137 0.4
138 0.32
139 0.27
140 0.24
141 0.17
142 0.14
143 0.12
144 0.09
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.11
153 0.12
154 0.15
155 0.15
156 0.15
157 0.15
158 0.15
159 0.15
160 0.1
161 0.1
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.07
172 0.08
173 0.13
174 0.13
175 0.12
176 0.12
177 0.14
178 0.15
179 0.18
180 0.17
181 0.13
182 0.14
183 0.14
184 0.14
185 0.13
186 0.13
187 0.15
188 0.2
189 0.24
190 0.31
191 0.33
192 0.35
193 0.37
194 0.38
195 0.34
196 0.29
197 0.25
198 0.16
199 0.13
200 0.11
201 0.09
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.16
215 0.17
216 0.2
217 0.26
218 0.27
219 0.3
220 0.32
221 0.31
222 0.28
223 0.3
224 0.29
225 0.24
226 0.31
227 0.31
228 0.32
229 0.33
230 0.33
231 0.31
232 0.3
233 0.29
234 0.24
235 0.22
236 0.2
237 0.18
238 0.19
239 0.18
240 0.16
241 0.16
242 0.13
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.09
251 0.1
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.1
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.1
262 0.14
263 0.14
264 0.16
265 0.17
266 0.16
267 0.17
268 0.17
269 0.16
270 0.13
271 0.12
272 0.1
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.11
279 0.12
280 0.14
281 0.14
282 0.18
283 0.21
284 0.28
285 0.3
286 0.33
287 0.38
288 0.41
289 0.43
290 0.48
291 0.5
292 0.51
293 0.53
294 0.53
295 0.5
296 0.49
297 0.43
298 0.34
299 0.3
300 0.28
301 0.28
302 0.31
303 0.29
304 0.28
305 0.34
306 0.41
307 0.46
308 0.49
309 0.52
310 0.48
311 0.56
312 0.55
313 0.5
314 0.43
315 0.35
316 0.28
317 0.23
318 0.2
319 0.13
320 0.11
321 0.1
322 0.11
323 0.1
324 0.13
325 0.12
326 0.21
327 0.24
328 0.25
329 0.29
330 0.35
331 0.36
332 0.35
333 0.35
334 0.29
335 0.28
336 0.28
337 0.26
338 0.23
339 0.21
340 0.2
341 0.2
342 0.18
343 0.24
344 0.28
345 0.33
346 0.41
347 0.5
348 0.59
349 0.61
350 0.64
351 0.63
352 0.67
353 0.72
354 0.7
355 0.7
356 0.67
357 0.65