Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3M2TBS3

Protein Details
Accession A0A3M2TBS3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-123GVAPRAKMNQQRARRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
416-445EERRNANERRRKQEDRARNEGEHAKKRRRS
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 8, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSNKYPKIISSVIEQLPYEINGEEVPVDTTGPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPENEEQMMLEIFKYTDRVVNMVRPRKVLMIAVDGVAPRAKMNQQRARRFRSAQEAKEADEKKEEFQKMVAKQNGSKADQDLQEQVVQKTWDSNVITPGTPFMDILAASLRYWIAYKLNTDPAWEKLKIIISDATVPGEGEHKIMEFVRSQRSSPEHDPNTRHVIYGLDADLIMLGIATHEPHFRVLREDVFFQESKARKCGLCGQTGHKAEECRGQAKQKNGEFDEKQKGTSLKPFIWLHVSVLREYLAAELHVPRQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIRENGIDTLIAIWRDNIPAMGGYLTKDGHVDFKRAQLIMQGLAKQEGAIFRSRRQTEERRNANERRRKQEDRARNEGEHAKKRRRSSPDYSSSTANRSRRGAPAPNPSDMELITPSRGELPRQTRELTHSMVVNRGAVYRANEANKSAAAVLKGKLMKGSSGEPSPENGEATAEGDQPVEEQADQTSPSALGKRKAEAVTDQTPETGTPGRDSPAVPGPSKEDDLPPDTVRLWEEGYEERYYEQKFGVDPNDMEFRRKVARSYAEGLSWVLLYYFQGCPSWTWYFPYHYAPFASDFVDIGDMTTNFDKGQPFKPFEQLMGVLPASSNHALPEIFHDLMSNPSSEIIDFYPEDFPVDLNGKKFAWQGVVLLPFIDEKRLLAAMEKKYPHLTDDEKIRNTVGRDVLLISDGHPLYHDLRANFYSKKPGPPKFKLNMRVSEGLAGKAERNETYIPHSSLISPLEEYGMPTIEEDRSLTVNYEVPKSTHVHKSMLLRGVKFPPPALDNSDIQGVRNKAHNSGRSFGGAPLRNGGDRGGRVNYTGGRPNPFAAHLDPNFVPPPNVGASVMPSGWAPPTPGSANFSRGPPPPPRGGMSGSHRPPYPPGPGPQSGYYGGSQSQQGYYPPTSQYGQSMGPQGDYRGGGNRRGGYGSQYPPRGGGGGGGGGYGRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.47
3 0.49
4 0.47
5 0.41
6 0.36
7 0.4
8 0.37
9 0.35
10 0.33
11 0.29
12 0.28
13 0.27
14 0.23
15 0.14
16 0.13
17 0.11
18 0.12
19 0.1
20 0.09
21 0.1
22 0.09
23 0.1
24 0.09
25 0.12
26 0.17
27 0.18
28 0.19
29 0.19
30 0.2
31 0.21
32 0.22
33 0.21
34 0.19
35 0.2
36 0.19
37 0.18
38 0.17
39 0.15
40 0.14
41 0.12
42 0.09
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.1
48 0.12
49 0.17
50 0.2
51 0.2
52 0.28
53 0.37
54 0.44
55 0.52
56 0.52
57 0.54
58 0.57
59 0.59
60 0.53
61 0.48
62 0.4
63 0.34
64 0.32
65 0.25
66 0.18
67 0.16
68 0.14
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.14
73 0.15
74 0.18
75 0.2
76 0.28
77 0.37
78 0.44
79 0.46
80 0.45
81 0.46
82 0.45
83 0.44
84 0.39
85 0.32
86 0.29
87 0.27
88 0.25
89 0.24
90 0.21
91 0.2
92 0.18
93 0.15
94 0.1
95 0.13
96 0.19
97 0.26
98 0.36
99 0.45
100 0.54
101 0.65
102 0.74
103 0.79
104 0.8
105 0.77
106 0.73
107 0.75
108 0.74
109 0.67
110 0.68
111 0.61
112 0.56
113 0.6
114 0.56
115 0.47
116 0.45
117 0.42
118 0.36
119 0.44
120 0.42
121 0.34
122 0.36
123 0.42
124 0.4
125 0.49
126 0.5
127 0.45
128 0.47
129 0.54
130 0.56
131 0.51
132 0.47
133 0.41
134 0.42
135 0.39
136 0.38
137 0.34
138 0.28
139 0.3
140 0.31
141 0.28
142 0.26
143 0.24
144 0.22
145 0.22
146 0.21
147 0.23
148 0.22
149 0.23
150 0.24
151 0.26
152 0.26
153 0.23
154 0.24
155 0.19
156 0.17
157 0.15
158 0.11
159 0.1
160 0.09
161 0.1
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.1
167 0.09
168 0.1
169 0.11
170 0.12
171 0.13
172 0.16
173 0.2
174 0.27
175 0.26
176 0.29
177 0.3
178 0.32
179 0.36
180 0.33
181 0.29
182 0.26
183 0.32
184 0.28
185 0.29
186 0.25
187 0.21
188 0.24
189 0.24
190 0.21
191 0.15
192 0.15
193 0.13
194 0.13
195 0.12
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.13
203 0.17
204 0.25
205 0.27
206 0.27
207 0.31
208 0.34
209 0.4
210 0.43
211 0.5
212 0.48
213 0.53
214 0.56
215 0.56
216 0.6
217 0.53
218 0.46
219 0.37
220 0.31
221 0.25
222 0.24
223 0.19
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.06
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.05
236 0.07
237 0.08
238 0.11
239 0.13
240 0.14
241 0.18
242 0.2
243 0.24
244 0.25
245 0.26
246 0.25
247 0.28
248 0.27
249 0.24
250 0.29
251 0.29
252 0.29
253 0.31
254 0.32
255 0.27
256 0.31
257 0.4
258 0.36
259 0.38
260 0.38
261 0.4
262 0.46
263 0.49
264 0.48
265 0.41
266 0.37
267 0.33
268 0.37
269 0.34
270 0.28
271 0.29
272 0.36
273 0.38
274 0.44
275 0.51
276 0.47
277 0.52
278 0.51
279 0.56
280 0.5
281 0.52
282 0.55
283 0.46
284 0.44
285 0.4
286 0.39
287 0.34
288 0.38
289 0.36
290 0.27
291 0.34
292 0.34
293 0.32
294 0.34
295 0.32
296 0.27
297 0.26
298 0.26
299 0.19
300 0.19
301 0.17
302 0.13
303 0.13
304 0.11
305 0.07
306 0.06
307 0.07
308 0.08
309 0.11
310 0.13
311 0.14
312 0.14
313 0.16
314 0.17
315 0.17
316 0.2
317 0.21
318 0.21
319 0.23
320 0.23
321 0.22
322 0.22
323 0.22
324 0.17
325 0.13
326 0.11
327 0.09
328 0.08
329 0.07
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.12
345 0.15
346 0.16
347 0.15
348 0.16
349 0.16
350 0.15
351 0.14
352 0.1
353 0.05
354 0.06
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.08
371 0.07
372 0.08
373 0.08
374 0.14
375 0.15
376 0.18
377 0.18
378 0.21
379 0.24
380 0.24
381 0.23
382 0.19
383 0.19
384 0.18
385 0.19
386 0.16
387 0.14
388 0.14
389 0.14
390 0.11
391 0.11
392 0.1
393 0.1
394 0.14
395 0.15
396 0.18
397 0.27
398 0.28
399 0.3
400 0.37
401 0.45
402 0.5
403 0.59
404 0.64
405 0.62
406 0.69
407 0.74
408 0.77
409 0.76
410 0.73
411 0.72
412 0.72
413 0.71
414 0.72
415 0.74
416 0.75
417 0.73
418 0.74
419 0.69
420 0.61
421 0.59
422 0.58
423 0.55
424 0.54
425 0.54
426 0.55
427 0.56
428 0.61
429 0.65
430 0.66
431 0.66
432 0.65
433 0.67
434 0.68
435 0.68
436 0.64
437 0.59
438 0.52
439 0.49
440 0.47
441 0.4
442 0.34
443 0.31
444 0.32
445 0.33
446 0.37
447 0.39
448 0.38
449 0.46
450 0.45
451 0.44
452 0.42
453 0.39
454 0.34
455 0.28
456 0.23
457 0.14
458 0.12
459 0.1
460 0.09
461 0.08
462 0.11
463 0.12
464 0.12
465 0.17
466 0.23
467 0.27
468 0.29
469 0.3
470 0.27
471 0.31
472 0.33
473 0.28
474 0.23
475 0.21
476 0.19
477 0.2
478 0.19
479 0.15
480 0.13
481 0.11
482 0.1
483 0.09
484 0.1
485 0.12
486 0.14
487 0.15
488 0.15
489 0.16
490 0.16
491 0.14
492 0.13
493 0.11
494 0.09
495 0.08
496 0.09
497 0.09
498 0.12
499 0.13
500 0.13
501 0.13
502 0.13
503 0.12
504 0.12
505 0.14
506 0.12
507 0.12
508 0.14
509 0.13
510 0.14
511 0.15
512 0.14
513 0.12
514 0.09
515 0.09
516 0.07
517 0.08
518 0.08
519 0.07
520 0.07
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.06
526 0.04
527 0.04
528 0.05
529 0.05
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.06
535 0.1
536 0.12
537 0.16
538 0.17
539 0.18
540 0.22
541 0.22
542 0.23
543 0.21
544 0.25
545 0.25
546 0.25
547 0.24
548 0.2
549 0.2
550 0.18
551 0.18
552 0.14
553 0.1
554 0.1
555 0.11
556 0.12
557 0.13
558 0.13
559 0.14
560 0.18
561 0.21
562 0.19
563 0.19
564 0.22
565 0.23
566 0.24
567 0.22
568 0.16
569 0.16
570 0.19
571 0.21
572 0.18
573 0.17
574 0.16
575 0.16
576 0.15
577 0.14
578 0.11
579 0.09
580 0.1
581 0.11
582 0.14
583 0.13
584 0.13
585 0.12
586 0.15
587 0.16
588 0.15
589 0.14
590 0.12
591 0.12
592 0.14
593 0.15
594 0.14
595 0.13
596 0.15
597 0.22
598 0.21
599 0.23
600 0.21
601 0.21
602 0.24
603 0.25
604 0.24
605 0.23
606 0.27
607 0.29
608 0.33
609 0.31
610 0.26
611 0.26
612 0.25
613 0.19
614 0.15
615 0.11
616 0.06
617 0.05
618 0.05
619 0.07
620 0.07
621 0.07
622 0.08
623 0.08
624 0.09
625 0.14
626 0.17
627 0.15
628 0.18
629 0.2
630 0.23
631 0.25
632 0.3
633 0.26
634 0.25
635 0.25
636 0.22
637 0.22
638 0.2
639 0.18
640 0.12
641 0.11
642 0.1
643 0.1
644 0.09
645 0.07
646 0.08
647 0.07
648 0.08
649 0.09
650 0.09
651 0.08
652 0.1
653 0.12
654 0.14
655 0.21
656 0.25
657 0.29
658 0.3
659 0.35
660 0.33
661 0.32
662 0.31
663 0.25
664 0.2
665 0.19
666 0.17
667 0.12
668 0.11
669 0.11
670 0.11
671 0.11
672 0.1
673 0.08
674 0.09
675 0.09
676 0.09
677 0.14
678 0.15
679 0.15
680 0.15
681 0.15
682 0.14
683 0.17
684 0.18
685 0.13
686 0.09
687 0.09
688 0.09
689 0.09
690 0.1
691 0.08
692 0.09
693 0.09
694 0.11
695 0.11
696 0.11
697 0.12
698 0.11
699 0.1
700 0.1
701 0.14
702 0.14
703 0.14
704 0.16
705 0.15
706 0.17
707 0.18
708 0.17
709 0.15
710 0.14
711 0.14
712 0.16
713 0.17
714 0.15
715 0.14
716 0.14
717 0.13
718 0.13
719 0.13
720 0.09
721 0.07
722 0.09
723 0.1
724 0.09
725 0.12
726 0.19
727 0.22
728 0.29
729 0.3
730 0.3
731 0.33
732 0.33
733 0.3
734 0.28
735 0.28
736 0.26
737 0.34
738 0.4
739 0.38
740 0.39
741 0.38
742 0.36
743 0.34
744 0.34
745 0.27
746 0.2
747 0.19
748 0.19
749 0.18
750 0.16
751 0.15
752 0.1
753 0.14
754 0.13
755 0.13
756 0.12
757 0.14
758 0.15
759 0.2
760 0.22
761 0.17
762 0.21
763 0.23
764 0.26
765 0.27
766 0.26
767 0.32
768 0.32
769 0.41
770 0.47
771 0.54
772 0.6
773 0.64
774 0.72
775 0.71
776 0.77
777 0.77
778 0.74
779 0.73
780 0.69
781 0.65
782 0.56
783 0.53
784 0.45
785 0.36
786 0.3
787 0.24
788 0.19
789 0.18
790 0.2
791 0.14
792 0.16
793 0.16
794 0.16
795 0.22
796 0.26
797 0.26
798 0.25
799 0.25
800 0.22
801 0.24
802 0.24
803 0.19
804 0.14
805 0.13
806 0.13
807 0.13
808 0.13
809 0.11
810 0.11
811 0.09
812 0.09
813 0.11
814 0.1
815 0.1
816 0.1
817 0.11
818 0.11
819 0.12
820 0.13
821 0.12
822 0.15
823 0.16
824 0.19
825 0.18
826 0.18
827 0.2
828 0.22
829 0.26
830 0.31
831 0.32
832 0.32
833 0.35
834 0.41
835 0.44
836 0.49
837 0.47
838 0.41
839 0.43
840 0.46
841 0.47
842 0.42
843 0.36
844 0.32
845 0.31
846 0.32
847 0.33
848 0.31
849 0.27
850 0.27
851 0.32
852 0.29
853 0.27
854 0.3
855 0.26
856 0.25
857 0.31
858 0.3
859 0.31
860 0.39
861 0.45
862 0.43
863 0.45
864 0.45
865 0.41
866 0.41
867 0.37
868 0.38
869 0.35
870 0.31
871 0.32
872 0.32
873 0.3
874 0.29
875 0.28
876 0.24
877 0.22
878 0.25
879 0.24
880 0.23
881 0.23
882 0.26
883 0.28
884 0.27
885 0.33
886 0.33
887 0.34
888 0.35
889 0.36
890 0.35
891 0.33
892 0.32
893 0.28
894 0.33
895 0.29
896 0.33
897 0.31
898 0.33
899 0.33
900 0.3
901 0.28
902 0.19
903 0.22
904 0.19
905 0.2
906 0.16
907 0.15
908 0.17
909 0.18
910 0.18
911 0.15
912 0.13
913 0.12
914 0.13
915 0.13
916 0.12
917 0.11
918 0.15
919 0.18
920 0.19
921 0.23
922 0.24
923 0.29
924 0.29
925 0.3
926 0.31
927 0.32
928 0.36
929 0.39
930 0.43
931 0.45
932 0.46
933 0.47
934 0.46
935 0.46
936 0.47
937 0.48
938 0.52
939 0.5
940 0.51
941 0.48
942 0.47
943 0.48
944 0.47
945 0.47
946 0.42
947 0.44
948 0.47
949 0.5
950 0.53
951 0.5
952 0.49
953 0.42
954 0.39
955 0.33
956 0.28
957 0.25
958 0.22
959 0.22
960 0.2
961 0.19
962 0.18
963 0.19
964 0.23
965 0.24
966 0.26
967 0.26
968 0.28
969 0.28
970 0.28
971 0.29
972 0.27
973 0.26
974 0.26
975 0.3
976 0.27
977 0.27
978 0.27
979 0.26
980 0.25
981 0.24
982 0.22
983 0.26
984 0.28
985 0.31
986 0.36
987 0.38
988 0.36
989 0.39
990 0.38
991 0.35
992 0.4
993 0.43
994 0.45
995 0.46
996 0.44
997 0.42
998 0.43
999 0.37
1000 0.29
1001 0.22
1002 0.16
1003 0.14
1004 0.13
1005 0.12