FuNGI

A0A3M2SX26

Protein Details

Accession

A0A3M2SX26

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
78-100	EQQPKPTLKYKPRAVGRRSKEER	Basic
219-244	EGKAPPKKGKIPYRPKREKGLRPVRV	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
71-162	KPPGPAGEQQPKPTLKYKPRAVGRRSKEERDAIEKVEAQRHRERLAEAAAKQRGRGGAGPRGRGGFGRGGRIGGADGPLGSGAGARRGRGGR
221-243	KAPPKKGKIPYRPKREKGLRPVR

Subcellular Location(s)

mito 14, nucl 10, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKAAPRRPAARRNITTAPDGASGPTPQNNTPSASGSQSTPTPGPSRPPVQRLQSLNRKTPAGSIAPAAKPPGPAGEQQPKPTLKYKPRAVGRRSKEERDAIEKVEAQRHRERLAEAAAKQRGRGGAGPRGRGGFGRGGRIGGADGPLGSGAGARRGRGGRVGTESRVSSVSRSRTRSVVGGPGGAARDVSSDESDSEVRVNMDQINIESSDEEGEFEGKAPPKKGKIPYRPKREKGLRPVRVEGHEHKERVVSVNMESSSNKSAALREQAQARDAQDNALFVEQESEAQAKEGGPNIKEEPPDDDQPMTDAVPHAEEVVAIDDGPLPEQQVKVRRKLTEKKPEAVEEPDVEEPPIKDPRRLLRTAEEIEEFDRHEHDLDEMKKLFTADEEKPKEPRPEPQPTTEDGEEAAVQEKPHDEEEKPREEEEKLREEEEKPREEEELPKDKLAGHLFLMQFPPMTPNLLAPSVEGEPADTTGQAAPADTTNGNQPEPTPVKRETDGAEVQEVEGPTPAQEQSKVVTATDWQLQAGRVGKMNVHASGRVTVDWGGISFELDRSTGVDFLQEAVIMSEPPTAESEEVGEESKVWSMGQLSGKFTVTPDWEKML

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.79
2	0.76
3	0.7
4	0.63
5	0.56
6	0.48
7	0.39
8	0.35
9	0.29
10	0.24
11	0.22
12	0.22
13	0.25
14	0.25
15	0.25
16	0.29
17	0.3
18	0.31
19	0.31
20	0.32
21	0.29
22	0.29
23	0.29
24	0.26
25	0.27
26	0.25
27	0.27
28	0.24
29	0.25
30	0.26
31	0.26
32	0.32
33	0.36
34	0.43
35	0.46
36	0.51
37	0.55
38	0.58
39	0.64
40	0.65
41	0.68
42	0.7
43	0.7
44	0.72
45	0.68
46	0.63
47	0.56
48	0.52
49	0.47
50	0.4
51	0.33
52	0.29
53	0.32
54	0.31
55	0.32
56	0.31
57	0.28
58	0.25
59	0.25
60	0.25
61	0.21
62	0.23
63	0.3
64	0.37
65	0.4
66	0.43
67	0.5
68	0.48
69	0.49
70	0.53
71	0.55
72	0.55
73	0.6
74	0.65
75	0.66
76	0.74
77	0.79
78	0.8
79	0.81
80	0.79
81	0.8
82	0.79
83	0.76
84	0.74
85	0.7
86	0.67
87	0.64
88	0.59
89	0.51
90	0.48
91	0.45
92	0.41
93	0.44
94	0.41
95	0.4
96	0.45
97	0.46
98	0.44
99	0.43
100	0.41
101	0.36
102	0.4
103	0.4
104	0.35
105	0.39
106	0.43
107	0.41
108	0.4
109	0.39
110	0.33
111	0.3
112	0.32
113	0.29
114	0.32
115	0.36
116	0.39
117	0.38
118	0.38
119	0.36
120	0.31
121	0.29
122	0.27
123	0.24
124	0.27
125	0.25
126	0.24
127	0.24
128	0.23
129	0.21
130	0.14
131	0.13
132	0.08
133	0.07
134	0.07
135	0.06
136	0.06
137	0.05
138	0.06
139	0.05
140	0.12
141	0.13
142	0.13
143	0.18
144	0.2
145	0.21
146	0.24
147	0.26
148	0.22
149	0.28
150	0.31
151	0.28
152	0.3
153	0.3
154	0.26
155	0.26
156	0.23
157	0.19
158	0.22
159	0.29
160	0.32
161	0.37
162	0.38
163	0.38
164	0.39
165	0.39
166	0.35
167	0.33
168	0.27
169	0.23
170	0.21
171	0.2
172	0.19
173	0.16
174	0.13
175	0.07
176	0.07
177	0.08
178	0.09
179	0.08
180	0.08
181	0.09
182	0.11
183	0.11
184	0.11
185	0.1
186	0.1
187	0.09
188	0.09
189	0.1
190	0.09
191	0.09
192	0.09
193	0.09
194	0.1
195	0.09
196	0.09
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.08
201	0.08
202	0.06
203	0.06
204	0.06
205	0.07
206	0.1
207	0.13
208	0.16
209	0.18
210	0.22
211	0.26
212	0.33
213	0.41
214	0.48
215	0.55
216	0.64
217	0.71
218	0.79
219	0.85
220	0.82
221	0.84
222	0.83
223	0.81
224	0.81
225	0.82
226	0.79
227	0.73
228	0.73
229	0.66
230	0.6
231	0.56
232	0.5
233	0.47
234	0.44
235	0.4
236	0.36
237	0.33
238	0.31
239	0.28
240	0.24
241	0.18
242	0.13
243	0.16
244	0.16
245	0.16
246	0.16
247	0.15
248	0.15
249	0.14
250	0.14
251	0.11
252	0.11
253	0.13
254	0.17
255	0.17
256	0.17
257	0.21
258	0.22
259	0.22
260	0.23
261	0.22
262	0.19
263	0.17
264	0.16
265	0.12
266	0.12
267	0.12
268	0.1
269	0.08
270	0.06
271	0.08
272	0.06
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.07
279	0.05
280	0.06
281	0.1
282	0.11
283	0.11
284	0.13
285	0.15
286	0.18
287	0.18
288	0.17
289	0.19
290	0.2
291	0.22
292	0.21
293	0.19
294	0.16
295	0.16
296	0.17
297	0.12
298	0.08
299	0.07
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.04
310	0.04
311	0.05
312	0.05
313	0.06
314	0.06
315	0.05
316	0.06
317	0.07
318	0.1
319	0.19
320	0.22
321	0.28
322	0.33
323	0.37
324	0.44
325	0.53
326	0.61
327	0.63
328	0.64
329	0.63
330	0.61
331	0.59
332	0.53
333	0.46
334	0.38
335	0.28
336	0.26
337	0.22
338	0.19
339	0.17
340	0.15
341	0.12
342	0.14
343	0.21
344	0.19
345	0.2
346	0.24
347	0.33
348	0.38
349	0.4
350	0.39
351	0.35
352	0.4
353	0.4
354	0.38
355	0.31
356	0.25
357	0.25
358	0.23
359	0.19
360	0.13
361	0.12
362	0.1
363	0.1
364	0.09
365	0.09
366	0.15
367	0.16
368	0.2
369	0.2
370	0.19
371	0.19
372	0.19
373	0.18
374	0.13
375	0.18
376	0.18
377	0.27
378	0.32
379	0.33
380	0.37
381	0.42
382	0.47
383	0.43
384	0.46
385	0.45
386	0.5
387	0.52
388	0.55
389	0.53
390	0.49
391	0.53
392	0.45
393	0.37
394	0.27
395	0.24
396	0.18
397	0.15
398	0.14
399	0.09
400	0.08
401	0.09
402	0.1
403	0.1
404	0.13
405	0.15
406	0.15
407	0.23
408	0.3
409	0.36
410	0.37
411	0.36
412	0.36
413	0.35
414	0.41
415	0.37
416	0.38
417	0.33
418	0.33
419	0.35
420	0.35
421	0.42
422	0.42
423	0.4
424	0.35
425	0.35
426	0.35
427	0.34
428	0.38
429	0.38
430	0.4
431	0.38
432	0.36
433	0.35
434	0.33
435	0.37
436	0.32
437	0.26
438	0.18
439	0.22
440	0.22
441	0.24
442	0.24
443	0.19
444	0.17
445	0.15
446	0.16
447	0.11
448	0.13
449	0.11
450	0.12
451	0.15
452	0.15
453	0.15
454	0.13
455	0.15
456	0.14
457	0.14
458	0.12
459	0.1
460	0.1
461	0.11
462	0.11
463	0.08
464	0.08
465	0.08
466	0.1
467	0.09
468	0.08
469	0.08
470	0.08
471	0.11
472	0.1
473	0.1
474	0.15
475	0.18
476	0.18
477	0.17
478	0.17
479	0.24
480	0.29
481	0.31
482	0.3
483	0.31
484	0.35
485	0.36
486	0.38
487	0.32
488	0.34
489	0.34
490	0.3
491	0.3
492	0.25
493	0.24
494	0.25
495	0.22
496	0.16
497	0.13
498	0.11
499	0.1
500	0.12
501	0.13
502	0.11
503	0.12
504	0.13
505	0.15
506	0.2
507	0.2
508	0.18
509	0.18
510	0.18
511	0.2
512	0.23
513	0.22
514	0.17
515	0.18
516	0.18
517	0.22
518	0.24
519	0.22
520	0.2
521	0.21
522	0.22
523	0.25
524	0.28
525	0.27
526	0.25
527	0.25
528	0.24
529	0.27
530	0.27
531	0.21
532	0.2
533	0.17
534	0.16
535	0.14
536	0.13
537	0.11
538	0.1
539	0.11
540	0.1
541	0.1
542	0.1
543	0.1
544	0.1
545	0.1
546	0.11
547	0.11
548	0.1
549	0.1
550	0.1
551	0.11
552	0.11
553	0.1
554	0.09
555	0.09
556	0.1
557	0.09
558	0.09
559	0.1
560	0.1
561	0.11
562	0.12
563	0.13
564	0.13
565	0.13
566	0.14
567	0.13
568	0.15
569	0.15
570	0.13
571	0.12
572	0.12
573	0.14
574	0.12
575	0.1
576	0.1
577	0.11
578	0.17
579	0.24
580	0.26
581	0.28
582	0.3
583	0.31
584	0.3
585	0.29
586	0.29
587	0.27
588	0.3

A0A3M2SX26

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer