Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9VXT9

Protein Details
Accession A0A4P9VXT9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-52WGSLKKPCWGRPKMSRSPLYHydrophilic
111-130LELQRKRREKHMIKEKKFDSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-127RKRREKHMIKEKK
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 7, cyto_nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR004859  Xrn1_N  
Gene Ontology GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03159  XRN_N  
Amino Acid Sequences MSTNKLRAARRERVLGWGVVVDDAGSGPNATLWGSLKKPCWGRPKMSRSPLYALPAFSMTPTRPMVARILPRQLPPQAKTTRAVKLALTRDVDAKEVIRMAIDGPAPIAKLELQRKRREKHMIKEKKFDSRKLTPGTLFVERNTLRSDVWNSMLPVTPAMPDRSVILDGSNVPGEDEAKLFQHILNAQRPESGKPTTHAIIGVDNGILVQGDNSPPRQPFRKQSFITRPHFIKSSSGEAIASLSKGLFYDDQCRLEVLYGYCQALTHRLPDRSGRQKDQPPFFARNLDQRRLGRKQQKAAESSVTLPARVSQVESLGDDDIEDGEVSDADEGFGDDKEVLDVPMTASEGDVNSKCYLDSILWCLVSRPIFQFYKALPRFRFFSRYPLNHLFNSRRPPLARMQDMYVQGNCDDYFHFYAAPPPTMSDLIDFIDKAIANPSGPAFWSPSMLSSAAHSF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.51
3 0.43
4 0.35
5 0.29
6 0.21
7 0.2
8 0.12
9 0.08
10 0.08
11 0.07
12 0.06
13 0.05
14 0.05
15 0.06
16 0.06
17 0.06
18 0.08
19 0.1
20 0.15
21 0.18
22 0.24
23 0.27
24 0.34
25 0.4
26 0.47
27 0.54
28 0.57
29 0.63
30 0.69
31 0.76
32 0.79
33 0.82
34 0.8
35 0.75
36 0.73
37 0.68
38 0.64
39 0.56
40 0.47
41 0.39
42 0.34
43 0.28
44 0.24
45 0.23
46 0.17
47 0.19
48 0.2
49 0.2
50 0.19
51 0.2
52 0.24
53 0.27
54 0.34
55 0.35
56 0.41
57 0.43
58 0.46
59 0.5
60 0.53
61 0.53
62 0.47
63 0.51
64 0.48
65 0.48
66 0.51
67 0.51
68 0.5
69 0.45
70 0.44
71 0.38
72 0.41
73 0.43
74 0.43
75 0.4
76 0.34
77 0.35
78 0.34
79 0.33
80 0.26
81 0.21
82 0.17
83 0.16
84 0.14
85 0.11
86 0.1
87 0.09
88 0.12
89 0.11
90 0.1
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.16
98 0.25
99 0.33
100 0.4
101 0.5
102 0.6
103 0.63
104 0.69
105 0.73
106 0.73
107 0.75
108 0.79
109 0.8
110 0.77
111 0.83
112 0.79
113 0.78
114 0.75
115 0.71
116 0.68
117 0.64
118 0.66
119 0.62
120 0.61
121 0.51
122 0.49
123 0.47
124 0.44
125 0.37
126 0.29
127 0.32
128 0.29
129 0.3
130 0.28
131 0.25
132 0.2
133 0.22
134 0.25
135 0.19
136 0.21
137 0.21
138 0.2
139 0.2
140 0.21
141 0.18
142 0.15
143 0.13
144 0.12
145 0.12
146 0.13
147 0.12
148 0.11
149 0.12
150 0.13
151 0.13
152 0.11
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.1
157 0.1
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.08
169 0.1
170 0.12
171 0.16
172 0.21
173 0.22
174 0.22
175 0.25
176 0.25
177 0.25
178 0.26
179 0.24
180 0.2
181 0.2
182 0.24
183 0.21
184 0.21
185 0.19
186 0.15
187 0.13
188 0.13
189 0.11
190 0.07
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.05
199 0.06
200 0.07
201 0.1
202 0.11
203 0.14
204 0.19
205 0.22
206 0.31
207 0.38
208 0.46
209 0.45
210 0.54
211 0.61
212 0.65
213 0.65
214 0.61
215 0.54
216 0.47
217 0.47
218 0.38
219 0.32
220 0.25
221 0.25
222 0.21
223 0.19
224 0.17
225 0.16
226 0.16
227 0.13
228 0.1
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.13
237 0.16
238 0.18
239 0.18
240 0.18
241 0.17
242 0.16
243 0.17
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.13
252 0.13
253 0.15
254 0.19
255 0.2
256 0.22
257 0.27
258 0.35
259 0.41
260 0.46
261 0.46
262 0.49
263 0.55
264 0.62
265 0.63
266 0.61
267 0.57
268 0.56
269 0.52
270 0.5
271 0.44
272 0.46
273 0.47
274 0.44
275 0.45
276 0.44
277 0.51
278 0.52
279 0.59
280 0.59
281 0.59
282 0.63
283 0.64
284 0.66
285 0.61
286 0.58
287 0.51
288 0.44
289 0.38
290 0.37
291 0.3
292 0.24
293 0.21
294 0.19
295 0.18
296 0.16
297 0.16
298 0.09
299 0.11
300 0.11
301 0.12
302 0.12
303 0.1
304 0.1
305 0.08
306 0.08
307 0.07
308 0.06
309 0.05
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.11
337 0.11
338 0.13
339 0.13
340 0.13
341 0.13
342 0.13
343 0.14
344 0.11
345 0.13
346 0.14
347 0.16
348 0.17
349 0.17
350 0.18
351 0.2
352 0.21
353 0.21
354 0.19
355 0.23
356 0.23
357 0.25
358 0.28
359 0.26
360 0.36
361 0.38
362 0.43
363 0.4
364 0.43
365 0.45
366 0.45
367 0.5
368 0.41
369 0.46
370 0.48
371 0.5
372 0.55
373 0.6
374 0.6
375 0.57
376 0.63
377 0.59
378 0.57
379 0.61
380 0.56
381 0.54
382 0.51
383 0.52
384 0.54
385 0.56
386 0.55
387 0.5
388 0.5
389 0.5
390 0.51
391 0.51
392 0.42
393 0.34
394 0.28
395 0.27
396 0.23
397 0.18
398 0.16
399 0.18
400 0.19
401 0.18
402 0.19
403 0.17
404 0.24
405 0.26
406 0.27
407 0.23
408 0.21
409 0.24
410 0.24
411 0.25
412 0.2
413 0.17
414 0.17
415 0.18
416 0.16
417 0.13
418 0.16
419 0.15
420 0.14
421 0.16
422 0.16
423 0.14
424 0.16
425 0.17
426 0.14
427 0.15
428 0.17
429 0.17
430 0.17
431 0.19
432 0.18
433 0.19
434 0.21
435 0.2
436 0.19