Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1IRS6

Protein Details
Accession A0A4V1IRS6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-87SYETNLERLRRKRKRRLRLDRAPDKKKGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
66-88RLRRKRKRRLRLDRAPDKKKGEK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 8, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR013949  Utp6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF08640  U3_assoc_6  
Amino Acid Sequences MADSVQYHLERMVPELEDLEQKGVFTKAEIKAIVKRRTAFEYAVHRLSPTRSDYLRYISYETNLERLRRKRKRRLRLDRAPDKKKGEKGMTLSDYSILRRIHGLYSKMLARFPGDVEVWKQYFQWGRAAKSGKTLGKSFARAIQLHPTKPTFWILASAWEFEENNNVNSARTLLQRGIRINRDNQLLWHEYFKLELLYTEKLKERRRVM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.17
4 0.17
5 0.18
6 0.17
7 0.15
8 0.14
9 0.15
10 0.15
11 0.14
12 0.12
13 0.18
14 0.19
15 0.22
16 0.24
17 0.25
18 0.32
19 0.41
20 0.46
21 0.44
22 0.44
23 0.44
24 0.48
25 0.49
26 0.43
27 0.4
28 0.42
29 0.42
30 0.42
31 0.38
32 0.33
33 0.32
34 0.32
35 0.3
36 0.25
37 0.25
38 0.23
39 0.27
40 0.28
41 0.32
42 0.33
43 0.3
44 0.29
45 0.25
46 0.26
47 0.26
48 0.24
49 0.25
50 0.25
51 0.27
52 0.31
53 0.39
54 0.49
55 0.56
56 0.66
57 0.7
58 0.78
59 0.86
60 0.9
61 0.92
62 0.92
63 0.92
64 0.93
65 0.92
66 0.92
67 0.87
68 0.82
69 0.78
70 0.73
71 0.67
72 0.64
73 0.57
74 0.51
75 0.48
76 0.47
77 0.43
78 0.37
79 0.32
80 0.27
81 0.24
82 0.2
83 0.22
84 0.16
85 0.13
86 0.14
87 0.14
88 0.15
89 0.17
90 0.18
91 0.14
92 0.16
93 0.18
94 0.18
95 0.17
96 0.15
97 0.13
98 0.12
99 0.11
100 0.12
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.15
105 0.14
106 0.14
107 0.14
108 0.15
109 0.18
110 0.18
111 0.24
112 0.23
113 0.25
114 0.3
115 0.33
116 0.3
117 0.32
118 0.37
119 0.32
120 0.32
121 0.31
122 0.31
123 0.32
124 0.34
125 0.3
126 0.29
127 0.3
128 0.28
129 0.29
130 0.34
131 0.35
132 0.34
133 0.36
134 0.33
135 0.3
136 0.31
137 0.31
138 0.22
139 0.17
140 0.2
141 0.16
142 0.21
143 0.22
144 0.21
145 0.19
146 0.19
147 0.19
148 0.15
149 0.22
150 0.17
151 0.16
152 0.18
153 0.18
154 0.17
155 0.17
156 0.19
157 0.14
158 0.15
159 0.17
160 0.19
161 0.23
162 0.27
163 0.33
164 0.39
165 0.44
166 0.46
167 0.48
168 0.5
169 0.5
170 0.46
171 0.42
172 0.41
173 0.38
174 0.35
175 0.33
176 0.29
177 0.24
178 0.25
179 0.23
180 0.18
181 0.14
182 0.15
183 0.16
184 0.2
185 0.22
186 0.25
187 0.31
188 0.38
189 0.46