Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9WIP2

Protein Details
Accession A0A4P9WIP2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
118-138GVAPRAKMNQQRARRFRTAKDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
396-397KR
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 9, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR016494  5_3_exoribonuclease_1  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR041385  SH3_12  
IPR040992  XRN1_D1  
IPR047007  XRN1_D1_sf  
IPR041106  XRN1_D2_D3  
IPR040486  Xrn1_D3  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR047008  XRN1_SH3_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF18129  SH3_12  
PF18332  XRN1_D1  
PF18334  XRN1_D2_D3  
PF18194  Xrn1_D3  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPKVRKREGAWYCVQSRWKHGLWPLGFTLVIVSQFFRWISERYPLCSQLIQENRIPEFDNLYLDMNGIIHNCSHPNDNDVHFRMTEDQIFLAIFTYIDHLFAKIKPQRLFFLAVDGVAPRAKMNQQRARRFRTAKDAVEAQKQALRRGEELPKEPPFDSNCITPGTPFMTRLQEQLKYFINKKVTEDKSWQGIEIILSGHEVPGEGEHKIMEYLRLAKSQPDYPPNLRHCLYGLDADLIMLGLLSHEPHFALLREEVTFGRTKKKAPGANTDAQNFYLMHLSLFREYLDLEFSPLKDVISFNYDLERIIDDFILMSYFVGNDFLPNLPSLHINEGALALMFKVYKQVVVETGGYLNDAGELNLARCEAMLRELAKQEREVFEIERGDVKWLKGKRPGPSSAKPAKNVQQKSQTVISTNQKTLYERIKNFVLMRSEGGRLTFPTSLPARDRSFIISVAEDLGLQHSIDALSGKKHHIILEWDDDDDESDEESNDARQRVLKKYDRAEVVDEAEIAANLKAEEEKKLDEAFLVWRKTYYKEKLEFDFDQGPDLEKLVFSYVEGLQWVLYYYYIGVPSWEWFYPYHYAPKITDLVNLDRFNFKNHFDIGRPFLPFEQLMGVLPAASSTHIPEAFRGLMTDPGSPILDFYPVDFECDMNGKKAEWEAVIKIPFIDEKRLLKALEARANQLTKEERSRNRHGNSFSFMFDPATPHLYKSVLPEVFPSITQCLCTMKVSHLPLKGKGGFKKGLCDGALLGARSLPGFPSLHTVPHTATLGFHGVNVFMAESKNESMVVTISNRFDGKTAEEIAKSKVGQRIYIGWPFLIEAFVTSLTDEYFRYEVREGGAGRIDVVKHPHSNEGQDRFYRTIDRVDAYYSKRCGTLLGPIEFTLQVRVLKGMKLQEDGSLAKDFGPDDQDQDVALQTVIDSLEMDDPRYKEKPPPPVEEEFPLNSHVFFLGYQKYGSEGEVTGYDENNVHIRLLVNAAQTPLETATRSLAREAEREERYSPSWAVAKQTGISSMALSKVASNLHVISKKGDQRFNVGLCLKFDGKKRKVLGYSRKSETGWEYSGKAADLISRFQARFPEFVAGLERRNRNDFYEDTDFYPPEVAAERMAEIKEWLKAEGIRDLEKVSLDTRALTKEYVRRVEETVDQTLVEFGATKGRPMVVKNVPRQSVLKPAHSKHRLSGQVFDLGDRVVHVLDVGTAPLGAKGTVVGIEGSFCDIVFDVPFMGGNTLEDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.61
3 0.64
4 0.57
5 0.57
6 0.57
7 0.51
8 0.49
9 0.51
10 0.54
11 0.49
12 0.5
13 0.44
14 0.39
15 0.37
16 0.3
17 0.27
18 0.19
19 0.18
20 0.14
21 0.14
22 0.12
23 0.15
24 0.15
25 0.16
26 0.17
27 0.18
28 0.21
29 0.29
30 0.31
31 0.34
32 0.4
33 0.4
34 0.41
35 0.4
36 0.39
37 0.4
38 0.44
39 0.42
40 0.4
41 0.43
42 0.41
43 0.41
44 0.41
45 0.32
46 0.3
47 0.27
48 0.26
49 0.22
50 0.23
51 0.21
52 0.19
53 0.18
54 0.13
55 0.13
56 0.12
57 0.11
58 0.09
59 0.11
60 0.14
61 0.15
62 0.2
63 0.2
64 0.23
65 0.27
66 0.3
67 0.36
68 0.37
69 0.38
70 0.33
71 0.34
72 0.35
73 0.34
74 0.32
75 0.25
76 0.22
77 0.2
78 0.19
79 0.18
80 0.14
81 0.1
82 0.07
83 0.06
84 0.09
85 0.09
86 0.1
87 0.1
88 0.11
89 0.13
90 0.14
91 0.24
92 0.27
93 0.35
94 0.38
95 0.41
96 0.44
97 0.45
98 0.5
99 0.4
100 0.41
101 0.33
102 0.29
103 0.26
104 0.22
105 0.2
106 0.15
107 0.15
108 0.09
109 0.13
110 0.19
111 0.27
112 0.37
113 0.45
114 0.54
115 0.65
116 0.74
117 0.79
118 0.82
119 0.81
120 0.76
121 0.77
122 0.75
123 0.68
124 0.64
125 0.64
126 0.58
127 0.6
128 0.55
129 0.47
130 0.42
131 0.4
132 0.39
133 0.37
134 0.36
135 0.3
136 0.36
137 0.42
138 0.45
139 0.48
140 0.5
141 0.49
142 0.49
143 0.47
144 0.46
145 0.41
146 0.39
147 0.38
148 0.33
149 0.3
150 0.29
151 0.29
152 0.24
153 0.23
154 0.22
155 0.21
156 0.21
157 0.22
158 0.26
159 0.27
160 0.32
161 0.34
162 0.35
163 0.35
164 0.38
165 0.41
166 0.4
167 0.43
168 0.44
169 0.46
170 0.42
171 0.46
172 0.52
173 0.5
174 0.49
175 0.52
176 0.5
177 0.51
178 0.49
179 0.44
180 0.35
181 0.31
182 0.25
183 0.2
184 0.16
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.08
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.11
199 0.11
200 0.1
201 0.11
202 0.16
203 0.18
204 0.21
205 0.21
206 0.24
207 0.27
208 0.31
209 0.35
210 0.36
211 0.41
212 0.45
213 0.53
214 0.54
215 0.56
216 0.51
217 0.46
218 0.4
219 0.37
220 0.32
221 0.25
222 0.22
223 0.17
224 0.16
225 0.15
226 0.13
227 0.1
228 0.08
229 0.05
230 0.04
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.11
241 0.11
242 0.12
243 0.13
244 0.14
245 0.13
246 0.15
247 0.19
248 0.18
249 0.26
250 0.26
251 0.29
252 0.36
253 0.44
254 0.47
255 0.48
256 0.56
257 0.56
258 0.61
259 0.63
260 0.57
261 0.5
262 0.45
263 0.42
264 0.31
265 0.24
266 0.19
267 0.15
268 0.12
269 0.12
270 0.14
271 0.13
272 0.13
273 0.12
274 0.1
275 0.1
276 0.11
277 0.12
278 0.1
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.15
283 0.15
284 0.14
285 0.12
286 0.13
287 0.12
288 0.15
289 0.16
290 0.13
291 0.16
292 0.16
293 0.15
294 0.16
295 0.15
296 0.11
297 0.11
298 0.11
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.06
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.08
317 0.1
318 0.12
319 0.13
320 0.14
321 0.13
322 0.13
323 0.12
324 0.12
325 0.1
326 0.08
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.04
331 0.07
332 0.08
333 0.09
334 0.09
335 0.1
336 0.11
337 0.14
338 0.14
339 0.12
340 0.12
341 0.11
342 0.11
343 0.1
344 0.08
345 0.07
346 0.06
347 0.05
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.07
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.07
358 0.1
359 0.11
360 0.14
361 0.18
362 0.21
363 0.21
364 0.23
365 0.25
366 0.23
367 0.24
368 0.23
369 0.2
370 0.21
371 0.21
372 0.19
373 0.18
374 0.17
375 0.19
376 0.19
377 0.19
378 0.22
379 0.25
380 0.29
381 0.35
382 0.4
383 0.43
384 0.47
385 0.55
386 0.56
387 0.58
388 0.63
389 0.64
390 0.64
391 0.6
392 0.59
393 0.6
394 0.61
395 0.6
396 0.57
397 0.57
398 0.54
399 0.55
400 0.53
401 0.46
402 0.39
403 0.41
404 0.42
405 0.37
406 0.37
407 0.35
408 0.32
409 0.33
410 0.35
411 0.38
412 0.38
413 0.34
414 0.37
415 0.36
416 0.37
417 0.37
418 0.37
419 0.3
420 0.23
421 0.24
422 0.22
423 0.22
424 0.19
425 0.19
426 0.15
427 0.13
428 0.15
429 0.14
430 0.12
431 0.15
432 0.16
433 0.18
434 0.2
435 0.25
436 0.24
437 0.24
438 0.25
439 0.23
440 0.23
441 0.22
442 0.2
443 0.15
444 0.13
445 0.12
446 0.12
447 0.08
448 0.07
449 0.07
450 0.06
451 0.06
452 0.05
453 0.04
454 0.04
455 0.05
456 0.06
457 0.05
458 0.07
459 0.09
460 0.1
461 0.12
462 0.14
463 0.14
464 0.15
465 0.18
466 0.2
467 0.24
468 0.23
469 0.21
470 0.2
471 0.19
472 0.18
473 0.15
474 0.12
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.06
480 0.08
481 0.09
482 0.09
483 0.1
484 0.13
485 0.17
486 0.23
487 0.32
488 0.36
489 0.4
490 0.44
491 0.49
492 0.48
493 0.46
494 0.43
495 0.35
496 0.31
497 0.25
498 0.2
499 0.15
500 0.12
501 0.1
502 0.08
503 0.06
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.06
508 0.06
509 0.09
510 0.09
511 0.1
512 0.12
513 0.12
514 0.12
515 0.1
516 0.11
517 0.14
518 0.19
519 0.19
520 0.17
521 0.18
522 0.2
523 0.23
524 0.3
525 0.31
526 0.33
527 0.38
528 0.41
529 0.43
530 0.48
531 0.45
532 0.41
533 0.39
534 0.31
535 0.27
536 0.24
537 0.23
538 0.17
539 0.16
540 0.12
541 0.07
542 0.07
543 0.07
544 0.06
545 0.05
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.04
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.06
564 0.09
565 0.08
566 0.09
567 0.09
568 0.12
569 0.14
570 0.15
571 0.2
572 0.18
573 0.2
574 0.19
575 0.22
576 0.21
577 0.18
578 0.2
579 0.17
580 0.2
581 0.24
582 0.24
583 0.22
584 0.23
585 0.23
586 0.24
587 0.23
588 0.21
589 0.18
590 0.2
591 0.2
592 0.18
593 0.21
594 0.22
595 0.23
596 0.22
597 0.19
598 0.18
599 0.18
600 0.16
601 0.13
602 0.1
603 0.07
604 0.07
605 0.07
606 0.06
607 0.05
608 0.05
609 0.04
610 0.03
611 0.04
612 0.04
613 0.04
614 0.06
615 0.07
616 0.07
617 0.07
618 0.1
619 0.09
620 0.09
621 0.09
622 0.08
623 0.1
624 0.11
625 0.11
626 0.09
627 0.1
628 0.1
629 0.09
630 0.09
631 0.07
632 0.07
633 0.06
634 0.06
635 0.1
636 0.1
637 0.11
638 0.11
639 0.1
640 0.1
641 0.13
642 0.14
643 0.11
644 0.11
645 0.1
646 0.1
647 0.11
648 0.11
649 0.09
650 0.1
651 0.1
652 0.13
653 0.13
654 0.12
655 0.12
656 0.11
657 0.13
658 0.12
659 0.14
660 0.14
661 0.15
662 0.18
663 0.2
664 0.2
665 0.19
666 0.23
667 0.26
668 0.29
669 0.28
670 0.28
671 0.29
672 0.29
673 0.28
674 0.26
675 0.23
676 0.19
677 0.25
678 0.3
679 0.35
680 0.42
681 0.5
682 0.55
683 0.56
684 0.59
685 0.56
686 0.52
687 0.48
688 0.42
689 0.36
690 0.28
691 0.25
692 0.2
693 0.17
694 0.16
695 0.12
696 0.15
697 0.14
698 0.13
699 0.14
700 0.14
701 0.14
702 0.16
703 0.22
704 0.18
705 0.18
706 0.19
707 0.2
708 0.2
709 0.19
710 0.17
711 0.11
712 0.11
713 0.11
714 0.11
715 0.1
716 0.11
717 0.12
718 0.11
719 0.12
720 0.18
721 0.21
722 0.24
723 0.28
724 0.29
725 0.3
726 0.35
727 0.37
728 0.36
729 0.37
730 0.38
731 0.38
732 0.36
733 0.39
734 0.34
735 0.33
736 0.28
737 0.25
738 0.19
739 0.18
740 0.19
741 0.14
742 0.13
743 0.1
744 0.09
745 0.09
746 0.09
747 0.06
748 0.07
749 0.07
750 0.07
751 0.12
752 0.13
753 0.14
754 0.16
755 0.17
756 0.15
757 0.17
758 0.17
759 0.12
760 0.12
761 0.12
762 0.12
763 0.11
764 0.1
765 0.08
766 0.08
767 0.08
768 0.07
769 0.06
770 0.05
771 0.05
772 0.05
773 0.07
774 0.07
775 0.07
776 0.07
777 0.07
778 0.07
779 0.07
780 0.08
781 0.09
782 0.11
783 0.11
784 0.12
785 0.13
786 0.12
787 0.13
788 0.12
789 0.13
790 0.13
791 0.15
792 0.15
793 0.16
794 0.17
795 0.19
796 0.2
797 0.18
798 0.2
799 0.22
800 0.21
801 0.2
802 0.2
803 0.24
804 0.25
805 0.28
806 0.24
807 0.2
808 0.19
809 0.19
810 0.17
811 0.12
812 0.08
813 0.05
814 0.06
815 0.06
816 0.06
817 0.05
818 0.06
819 0.06
820 0.07
821 0.06
822 0.08
823 0.09
824 0.09
825 0.11
826 0.12
827 0.12
828 0.13
829 0.16
830 0.15
831 0.15
832 0.17
833 0.14
834 0.14
835 0.15
836 0.14
837 0.12
838 0.16
839 0.18
840 0.19
841 0.21
842 0.25
843 0.25
844 0.3
845 0.36
846 0.37
847 0.37
848 0.37
849 0.39
850 0.36
851 0.36
852 0.32
853 0.27
854 0.26
855 0.24
856 0.23
857 0.2
858 0.22
859 0.25
860 0.27
861 0.31
862 0.29
863 0.28
864 0.27
865 0.26
866 0.24
867 0.2
868 0.24
869 0.25
870 0.25
871 0.25
872 0.24
873 0.26
874 0.25
875 0.24
876 0.17
877 0.12
878 0.11
879 0.11
880 0.13
881 0.13
882 0.14
883 0.17
884 0.19
885 0.19
886 0.21
887 0.21
888 0.2
889 0.21
890 0.21
891 0.21
892 0.18
893 0.16
894 0.14
895 0.14
896 0.13
897 0.11
898 0.15
899 0.12
900 0.14
901 0.14
902 0.14
903 0.13
904 0.14
905 0.13
906 0.09
907 0.09
908 0.06
909 0.05
910 0.06
911 0.05
912 0.05
913 0.05
914 0.05
915 0.1
916 0.1
917 0.12
918 0.15
919 0.16
920 0.21
921 0.23
922 0.24
923 0.28
924 0.35
925 0.44
926 0.47
927 0.53
928 0.54
929 0.57
930 0.58
931 0.53
932 0.51
933 0.42
934 0.36
935 0.32
936 0.26
937 0.21
938 0.19
939 0.15
940 0.12
941 0.1
942 0.13
943 0.13
944 0.14
945 0.14
946 0.13
947 0.15
948 0.15
949 0.15
950 0.13
951 0.1
952 0.11
953 0.11
954 0.13
955 0.12
956 0.12
957 0.12
958 0.11
959 0.12
960 0.13
961 0.12
962 0.1
963 0.11
964 0.11
965 0.11
966 0.14
967 0.15
968 0.14
969 0.14
970 0.15
971 0.14
972 0.13
973 0.14
974 0.12
975 0.11
976 0.1
977 0.1
978 0.13
979 0.16
980 0.17
981 0.17
982 0.2
983 0.21
984 0.23
985 0.27
986 0.31
987 0.32
988 0.34
989 0.34
990 0.34
991 0.34
992 0.34
993 0.3
994 0.26
995 0.27
996 0.26
997 0.29
998 0.27
999 0.27
1000 0.24
1001 0.24
1002 0.22
1003 0.19
1004 0.18
1005 0.14
1006 0.13
1007 0.13
1008 0.12
1009 0.12
1010 0.11
1011 0.11
1012 0.12
1013 0.11
1014 0.12
1015 0.13
1016 0.19
1017 0.22
1018 0.22
1019 0.23
1020 0.3
1021 0.37
1022 0.42
1023 0.45
1024 0.4
1025 0.44
1026 0.5
1027 0.48
1028 0.47
1029 0.44
1030 0.39
1031 0.35
1032 0.38
1033 0.34
1034 0.32
1035 0.39
1036 0.43
1037 0.44
1038 0.5
1039 0.52
1040 0.56
1041 0.61
1042 0.67
1043 0.69
1044 0.69
1045 0.73
1046 0.7
1047 0.69
1048 0.62
1049 0.57
1050 0.53
1051 0.47
1052 0.4
1053 0.34
1054 0.31
1055 0.29
1056 0.3
1057 0.26
1058 0.21
1059 0.16
1060 0.17
1061 0.16
1062 0.16
1063 0.19
1064 0.24
1065 0.24
1066 0.25
1067 0.32
1068 0.3
1069 0.29
1070 0.29
1071 0.3
1072 0.24
1073 0.25
1074 0.3
1075 0.25
1076 0.28
1077 0.34
1078 0.38
1079 0.37
1080 0.42
1081 0.43
1082 0.4
1083 0.43
1084 0.39
1085 0.4
1086 0.42
1087 0.4
1088 0.38
1089 0.4
1090 0.37
1091 0.32
1092 0.32
1093 0.23
1094 0.17
1095 0.17
1096 0.15
1097 0.12
1098 0.13
1099 0.13
1100 0.15
1101 0.15
1102 0.14
1103 0.14
1104 0.15
1105 0.18
1106 0.18
1107 0.18
1108 0.18
1109 0.2
1110 0.22
1111 0.26
1112 0.27
1113 0.25
1114 0.25
1115 0.26
1116 0.24
1117 0.23
1118 0.22
1119 0.17
1120 0.18
1121 0.16
1122 0.17
1123 0.18
1124 0.2
1125 0.21
1126 0.21
1127 0.26
1128 0.3
1129 0.38
1130 0.42
1131 0.43
1132 0.42
1133 0.43
1134 0.45
1135 0.46
1136 0.44
1137 0.39
1138 0.33
1139 0.3
1140 0.27
1141 0.25
1142 0.21
1143 0.14
1144 0.1
1145 0.07
1146 0.15
1147 0.15
1148 0.16
1149 0.17
1150 0.2
1151 0.22
1152 0.24
1153 0.32
1154 0.34
1155 0.43
1156 0.51
1157 0.58
1158 0.58
1159 0.59
1160 0.6
1161 0.54
1162 0.55
1163 0.51
1164 0.52
1165 0.52
1166 0.55
1167 0.62
1168 0.67
1169 0.66
1170 0.62
1171 0.66
1172 0.65
1173 0.59
1174 0.6
1175 0.52
1176 0.52
1177 0.49
1178 0.44
1179 0.35
1180 0.26
1181 0.24
1182 0.18
1183 0.16
1184 0.09
1185 0.08
1186 0.08
1187 0.07
1188 0.08
1189 0.08
1190 0.08
1191 0.07
1192 0.07
1193 0.07
1194 0.08
1195 0.08
1196 0.07
1197 0.07
1198 0.06
1199 0.07
1200 0.07
1201 0.08
1202 0.08
1203 0.07
1204 0.08
1205 0.08
1206 0.11
1207 0.1
1208 0.09
1209 0.09
1210 0.09
1211 0.1
1212 0.1
1213 0.1
1214 0.08
1215 0.08
1216 0.09
1217 0.09
1218 0.1
1219 0.09