FuNGI

A0A4P9WJF2

Protein Details

Accession

A0A4P9WJF2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1170-1197	KYIDKNPSRLLRSKKDKEKETTVRRGWS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
136-146	ARARAPPKSGK

Subcellular Location(s)

cyto 11.5, cyto_nucl 10.5, nucl 8.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015699 DNA-dir_RNA_pol1_lsu_N IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR044893 RNA_pol_Rpb1_clamp_domain IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd01435 RNAP_I_RPA1_N

Amino Acid Sequences

EVTSVSFSFMNSDEIRKLSVKQINNPQLFDNLDHPTVGGLYDPALGPSGEHDRCSTCTLGYFACPGHFGHIDLVAPVYHPINFKLMYKLLQSLCYYCHKLRVSRLVVRHFAAKLELIYAGMISAAADLDIHVSPRARARAPPKSGKKSLPIDDEAEEDEEDDDAEFGPESLTEEDLLARIDNYVASCLAEGPVDARPVKATLATDALRRLERQFLASIPTASCANCRGQSPKFRKEGQEKIFEKPLTSKQRHVMNARGLKFEKLFAAGSNIEDLHSEAASSRITLTTAAAAEAEDATKNKDKYLTPLQVQEHLRLLWARERTILDLLYGSSLKPTGKRTSSHTIFFIDVVSVTPTRFRPVSKMGDMQYEHPQNSHLTKVLQANLYLHDLNVEDRSEPPRTDARLERERKADILRRTVDAWMRLQSAVTFLIDSANAPKLPTGRDAPMGIRQLLEKKEGLFRKHMMGKRVNYAARSVISPDPYIEANEIGIPPVFATRLTYPEPVTAHNASELRKAVINGPNIWPGATHVQNEDGSLVNLAMLDETGRTALAMQLMTPTVTKGADEIGSHLADTNKKVMRHLRNGDFLLLNRQPTLHKPSIMAHTARVLPGEKTIRMHYANCNTYNADFDGDEMNAHLPQNEVARAEAMLIARTDLQYLVPTDGGVLRGLIQDHVDAGVLMTARDTVLTREEYMQIVYAALRPEGMRGSVGNGNIEPELIVGKQGRVITVEPAYIKPRRLWTGKQVITTILLNLTEGSEPLNLKSKAKIPSKAWGPTAPEEQSVLFMDGHLLTGVLDKSQFGASAHGLVHAMYEVYGPPYAGKLLSTLGRLFTTYLQLIGFTCRMDDLRLTPAGDSKRRALIARASTMGAEAAREYVGLQDKDGVSLAPADDSPHASSLRLTHRLENVLRNDERMAGLDSAMKSRTNRVTSAIIAACVPDELLKPFPANNMQMMTVSGAKGSNVNVSQISCLLGQQELEGRRVPTMVSGKTLPSFRAFDTSARAGGYITGRFLTGIKPQEYYFHCMAGREGLIDTAVKTSRSGYLQRCLIKHLEGLRVHYDHTVRDVDGSVLQFHYGEDSLDVIKQKTLTDFDFCAINHRALARRYSPAELAAGGSIDTETVVRWRKKISKAAASSEAGKKDYSSETALNRFAPSRYLGATSEKFADDLQKYIDKNPSRLLRSKKDKEKETTVRRGWSGEAVRDSRFKILMQLKYMNSLVEPGEAVGLLAAQSIGEPSTQMTLNTFHFAGFGAVSV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.27
3	0.26
4	0.28
5	0.31
6	0.38
7	0.4
8	0.46
9	0.56
10	0.63
11	0.65
12	0.64
13	0.57
14	0.53
15	0.49
16	0.43
17	0.36
18	0.31
19	0.28
20	0.26
21	0.24
22	0.2
23	0.18
24	0.16
25	0.12
26	0.07
27	0.07
28	0.09
29	0.09
30	0.09
31	0.1
32	0.09
33	0.09
34	0.12
35	0.21
36	0.2
37	0.22
38	0.23
39	0.25
40	0.28
41	0.32
42	0.29
43	0.21
44	0.22
45	0.23
46	0.23
47	0.21
48	0.21
49	0.19
50	0.18
51	0.19
52	0.17
53	0.2
54	0.19
55	0.19
56	0.18
57	0.19
58	0.18
59	0.17
60	0.17
61	0.12
62	0.12
63	0.12
64	0.11
65	0.12
66	0.13
67	0.15
68	0.18
69	0.2
70	0.21
71	0.25
72	0.27
73	0.27
74	0.28
75	0.34
76	0.31
77	0.34
78	0.34
79	0.3
80	0.31
81	0.36
82	0.39
83	0.34
84	0.41
85	0.41
86	0.45
87	0.52
88	0.58
89	0.59
90	0.6
91	0.67
92	0.66
93	0.65
94	0.61
95	0.58
96	0.48
97	0.42
98	0.36
99	0.3
100	0.23
101	0.2
102	0.18
103	0.13
104	0.12
105	0.1
106	0.08
107	0.06
108	0.05
109	0.04
110	0.04
111	0.04
112	0.03
113	0.03
114	0.03
115	0.06
116	0.07
117	0.08
118	0.09
119	0.1
120	0.13
121	0.19
122	0.24
123	0.24
124	0.31
125	0.4
126	0.48
127	0.56
128	0.65
129	0.69
130	0.74
131	0.79
132	0.77
133	0.77
134	0.75
135	0.73
136	0.69
137	0.62
138	0.56
139	0.5
140	0.46
141	0.39
142	0.33
143	0.25
144	0.19
145	0.15
146	0.12
147	0.11
148	0.09
149	0.07
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.05
154	0.05
155	0.05
156	0.08
157	0.08
158	0.09
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.1
163	0.1
164	0.08
165	0.07
166	0.07
167	0.07
168	0.08
169	0.08
170	0.09
171	0.08
172	0.08
173	0.08
174	0.08
175	0.09
176	0.08
177	0.07
178	0.07
179	0.1
180	0.13
181	0.13
182	0.13
183	0.14
184	0.15
185	0.16
186	0.16
187	0.15
188	0.13
189	0.18
190	0.19
191	0.2
192	0.22
193	0.25
194	0.24
195	0.25
196	0.25
197	0.27
198	0.27
199	0.27
200	0.26
201	0.24
202	0.26
203	0.26
204	0.26
205	0.19
206	0.2
207	0.18
208	0.17
209	0.17
210	0.15
211	0.18
212	0.19
213	0.21
214	0.26
215	0.32
216	0.42
217	0.5
218	0.56
219	0.58
220	0.61
221	0.67
222	0.7
223	0.74
224	0.7
225	0.72
226	0.65
227	0.64
228	0.66
229	0.58
230	0.5
231	0.46
232	0.49
233	0.49
234	0.5
235	0.51
236	0.49
237	0.57
238	0.62
239	0.61
240	0.59
241	0.58
242	0.62
243	0.59
244	0.59
245	0.52
246	0.48
247	0.44
248	0.38
249	0.3
250	0.24
251	0.22
252	0.16
253	0.19
254	0.16
255	0.16
256	0.16
257	0.15
258	0.13
259	0.12
260	0.12
261	0.09
262	0.08
263	0.08
264	0.06
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.08
269	0.07
270	0.08
271	0.08
272	0.08
273	0.09
274	0.09
275	0.09
276	0.08
277	0.07
278	0.08
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.11
284	0.17
285	0.18
286	0.19
287	0.23
288	0.23
289	0.3
290	0.39
291	0.41
292	0.38
293	0.45
294	0.45
295	0.48
296	0.49
297	0.44
298	0.37
299	0.3
300	0.29
301	0.23
302	0.23
303	0.22
304	0.22
305	0.21
306	0.22
307	0.23
308	0.24
309	0.25
310	0.23
311	0.18
312	0.16
313	0.15
314	0.13
315	0.12
316	0.1
317	0.08
318	0.1
319	0.1
320	0.13
321	0.18
322	0.24
323	0.27
324	0.3
325	0.36
326	0.45
327	0.48
328	0.47
329	0.44
330	0.38
331	0.35
332	0.33
333	0.26
334	0.16
335	0.12
336	0.1
337	0.11
338	0.09
339	0.09
340	0.12
341	0.12
342	0.15
343	0.16
344	0.17
345	0.2
346	0.26
347	0.33
348	0.34
349	0.38
350	0.36
351	0.41
352	0.41
353	0.39
354	0.4
355	0.38
356	0.34
357	0.29
358	0.29
359	0.26
360	0.27
361	0.25
362	0.19
363	0.15
364	0.19
365	0.23
366	0.25
367	0.23
368	0.22
369	0.21
370	0.21
371	0.23
372	0.19
373	0.15
374	0.12
375	0.12
376	0.12
377	0.12
378	0.11
379	0.09
380	0.11
381	0.15
382	0.17
383	0.16
384	0.19
385	0.22
386	0.24
387	0.29
388	0.33
389	0.37
390	0.45
391	0.49
392	0.5
393	0.48
394	0.47
395	0.45
396	0.46
397	0.45
398	0.4
399	0.44
400	0.41
401	0.39
402	0.39
403	0.4
404	0.36
405	0.31
406	0.28
407	0.23
408	0.23
409	0.21
410	0.2
411	0.16
412	0.15
413	0.13
414	0.11
415	0.08
416	0.06
417	0.07
418	0.07
419	0.07
420	0.08
421	0.09
422	0.09
423	0.09
424	0.1
425	0.11
426	0.13
427	0.16
428	0.17
429	0.17
430	0.19
431	0.2
432	0.2
433	0.24
434	0.25
435	0.22
436	0.19
437	0.19
438	0.22
439	0.22
440	0.23
441	0.18
442	0.17
443	0.25
444	0.29
445	0.3
446	0.3
447	0.3
448	0.34
449	0.41
450	0.43
451	0.42
452	0.45
453	0.45
454	0.46
455	0.5
456	0.45
457	0.38
458	0.36
459	0.31
460	0.25
461	0.23
462	0.21
463	0.17
464	0.17
465	0.16
466	0.15
467	0.15
468	0.14
469	0.14
470	0.11
471	0.09
472	0.08
473	0.08
474	0.08
475	0.07
476	0.06
477	0.05
478	0.05
479	0.05
480	0.05
481	0.04
482	0.07
483	0.08
484	0.11
485	0.14
486	0.15
487	0.16
488	0.18
489	0.19
490	0.18
491	0.22
492	0.19
493	0.17
494	0.18
495	0.2
496	0.18
497	0.2
498	0.19
499	0.16
500	0.16
501	0.16
502	0.19
503	0.22
504	0.23
505	0.22
506	0.23
507	0.25
508	0.23
509	0.23
510	0.17
511	0.14
512	0.17
513	0.16
514	0.15
515	0.13
516	0.16
517	0.16
518	0.16
519	0.14
520	0.1
521	0.09
522	0.08
523	0.07
524	0.05
525	0.05
526	0.04
527	0.03
528	0.03
529	0.03
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.03
534	0.03
535	0.03
536	0.04
537	0.05
538	0.05
539	0.05
540	0.06
541	0.06
542	0.06
543	0.06
544	0.06
545	0.05
546	0.05
547	0.05
548	0.05
549	0.06
550	0.06
551	0.06
552	0.08
553	0.09
554	0.09
555	0.09
556	0.1
557	0.11
558	0.11
559	0.12
560	0.16
561	0.17
562	0.18
563	0.21
564	0.28
565	0.34
566	0.41
567	0.47
568	0.46
569	0.47
570	0.47
571	0.46
572	0.38
573	0.31
574	0.29
575	0.24
576	0.2
577	0.15
578	0.16
579	0.15
580	0.18
581	0.25
582	0.21
583	0.2
584	0.21
585	0.24
586	0.27
587	0.29
588	0.26
589	0.19
590	0.19
591	0.19
592	0.18
593	0.16
594	0.13
595	0.1
596	0.14
597	0.15
598	0.14
599	0.15
600	0.16
601	0.18
602	0.19
603	0.2
604	0.21
605	0.26
606	0.29
607	0.29
608	0.29
609	0.26
610	0.24
611	0.24
612	0.19
613	0.13
614	0.09
615	0.09
616	0.09
617	0.08
618	0.08
619	0.07
620	0.07
621	0.06
622	0.06
623	0.06
624	0.05
625	0.06
626	0.07
627	0.08
628	0.07
629	0.07
630	0.07
631	0.07
632	0.07
633	0.07
634	0.06
635	0.06
636	0.06
637	0.06
638	0.06
639	0.06
640	0.06
641	0.05
642	0.05
643	0.05
644	0.06
645	0.07
646	0.06
647	0.06
648	0.06
649	0.06
650	0.07
651	0.06
652	0.05
653	0.05
654	0.06
655	0.06
656	0.06
657	0.06
658	0.05
659	0.05
660	0.05
661	0.05
662	0.04
663	0.04
664	0.04
665	0.04
666	0.04
667	0.04
668	0.04
669	0.04
670	0.04
671	0.05
672	0.04
673	0.07
674	0.08
675	0.09
676	0.1
677	0.11
678	0.11
679	0.11
680	0.11
681	0.08
682	0.08
683	0.07
684	0.08
685	0.07
686	0.07
687	0.07
688	0.07
689	0.07
690	0.08
691	0.08
692	0.06
693	0.06
694	0.09
695	0.11
696	0.11
697	0.11
698	0.1
699	0.11
700	0.11
701	0.1
702	0.07
703	0.05
704	0.05
705	0.05
706	0.06
707	0.06
708	0.06
709	0.09
710	0.09
711	0.09
712	0.1
713	0.11
714	0.12
715	0.12
716	0.13
717	0.11
718	0.13
719	0.17
720	0.18
721	0.19
722	0.2
723	0.24
724	0.28
725	0.31
726	0.33
727	0.38
728	0.46
729	0.47
730	0.46
731	0.42
732	0.37
733	0.34
734	0.31
735	0.22
736	0.13
737	0.09
738	0.08
739	0.07
740	0.07
741	0.06
742	0.05
743	0.06
744	0.07
745	0.07
746	0.08
747	0.16
748	0.16
749	0.17
750	0.19
751	0.24
752	0.31
753	0.37
754	0.42
755	0.36
756	0.43
757	0.49
758	0.5
759	0.46
760	0.41
761	0.4
762	0.37
763	0.38
764	0.32
765	0.26
766	0.23
767	0.21
768	0.19
769	0.16
770	0.14
771	0.1
772	0.08
773	0.09
774	0.08
775	0.08
776	0.06
777	0.06
778	0.04
779	0.06
780	0.06
781	0.05
782	0.06
783	0.05
784	0.07
785	0.07
786	0.08
787	0.06
788	0.08
789	0.08
790	0.1
791	0.1
792	0.1
793	0.1
794	0.09
795	0.08
796	0.06
797	0.06
798	0.04
799	0.04
800	0.04
801	0.05
802	0.06
803	0.05
804	0.06
805	0.06
806	0.07
807	0.06
808	0.06
809	0.06
810	0.07
811	0.09
812	0.1
813	0.1
814	0.11
815	0.11
816	0.11
817	0.12
818	0.11
819	0.12
820	0.11
821	0.11
822	0.1
823	0.1
824	0.1
825	0.11
826	0.11
827	0.08
828	0.08
829	0.08
830	0.09
831	0.09
832	0.1
833	0.1
834	0.13
835	0.14
836	0.15
837	0.14
838	0.19
839	0.23
840	0.26
841	0.27
842	0.26
843	0.28
844	0.3
845	0.3
846	0.29
847	0.31
848	0.31
849	0.31
850	0.3
851	0.26
852	0.24
853	0.24
854	0.21
855	0.13
856	0.09
857	0.06
858	0.06
859	0.05
860	0.05
861	0.05
862	0.08
863	0.13
864	0.13
865	0.13
866	0.16
867	0.16
868	0.17
869	0.17
870	0.13
871	0.08
872	0.09
873	0.09
874	0.06
875	0.06
876	0.07
877	0.08
878	0.1
879	0.11
880	0.12
881	0.12
882	0.12
883	0.13
884	0.17
885	0.23
886	0.28
887	0.28
888	0.3
889	0.33
890	0.39
891	0.41
892	0.42
893	0.4
894	0.4
895	0.39
896	0.36
897	0.34
898	0.29
899	0.27
900	0.22
901	0.2
902	0.13
903	0.13
904	0.15
905	0.15
906	0.15
907	0.16
908	0.16
909	0.15
910	0.21
911	0.28
912	0.27
913	0.28
914	0.3
915	0.31
916	0.3
917	0.35
918	0.28
919	0.22
920	0.19
921	0.18
922	0.14
923	0.11
924	0.1
925	0.06
926	0.07
927	0.08
928	0.1
929	0.11
930	0.12
931	0.13
932	0.16
933	0.2
934	0.2
935	0.2
936	0.19
937	0.19
938	0.19
939	0.18
940	0.17
941	0.13
942	0.12
943	0.1
944	0.09
945	0.09
946	0.1
947	0.1
948	0.13
949	0.12
950	0.14
951	0.14
952	0.15
953	0.15
954	0.14
955	0.15
956	0.1
957	0.1
958	0.1
959	0.09
960	0.09
961	0.09
962	0.14
963	0.14
964	0.16
965	0.18
966	0.18
967	0.18
968	0.18
969	0.17
970	0.18
971	0.22
972	0.21
973	0.22
974	0.22
975	0.24
976	0.27
977	0.28
978	0.23
979	0.22
980	0.23
981	0.21
982	0.25
983	0.24
984	0.22
985	0.27
986	0.27
987	0.24
988	0.22
989	0.22
990	0.17
991	0.18
992	0.19
993	0.14
994	0.13
995	0.12
996	0.12
997	0.13
998	0.13
999	0.13
1000	0.16
1001	0.22
1002	0.22
1003	0.24
1004	0.24
1005	0.3
1006	0.33
1007	0.37
1008	0.32
1009	0.29
1010	0.28
1011	0.27
1012	0.28
1013	0.24
1014	0.21
1015	0.15
1016	0.14
1017	0.11
1018	0.11
1019	0.11
1020	0.11
1021	0.11
1022	0.12
1023	0.11
1024	0.12
1025	0.13
1026	0.17
1027	0.2
1028	0.27
1029	0.28
1030	0.34
1031	0.4
1032	0.45
1033	0.44
1034	0.44
1035	0.43
1036	0.38
1037	0.38
1038	0.35
1039	0.36
1040	0.33
1041	0.37
1042	0.38
1043	0.36
1044	0.36
1045	0.35
1046	0.32
1047	0.25
1048	0.27
1049	0.25
1050	0.19
1051	0.2
1052	0.19
1053	0.16
1054	0.18
1055	0.18
1056	0.15
1057	0.14
1058	0.14
1059	0.12
1060	0.12
1061	0.13
1062	0.1
1063	0.09
1064	0.08
1065	0.09
1066	0.1
1067	0.12
1068	0.14
1069	0.13
1070	0.14
1071	0.15
1072	0.16
1073	0.17
1074	0.2
1075	0.2
1076	0.22
1077	0.23
1078	0.22
1079	0.24
1080	0.23
1081	0.26
1082	0.25
1083	0.24
1084	0.22
1085	0.24
1086	0.28
1087	0.28
1088	0.34
1089	0.31
1090	0.35
1091	0.38
1092	0.39
1093	0.37
1094	0.33
1095	0.32
1096	0.26
1097	0.23
1098	0.17
1099	0.14
1100	0.1
1101	0.09
1102	0.07
1103	0.06
1104	0.06
1105	0.05
1106	0.05
1107	0.11
1108	0.2
1109	0.23
1110	0.26
1111	0.34
1112	0.42
1113	0.51
1114	0.6
1115	0.63
1116	0.64
1117	0.67
1118	0.71
1119	0.69
1120	0.63
1121	0.61
1122	0.58
1123	0.52
1124	0.43
1125	0.37
1126	0.31
1127	0.29
1128	0.29
1129	0.26
1130	0.25
1131	0.26
1132	0.3
1133	0.35
1134	0.36
1135	0.34
1136	0.33
1137	0.32
1138	0.28
1139	0.26
1140	0.24
1141	0.22
1142	0.21
1143	0.23
1144	0.22
1145	0.28
1146	0.29
1147	0.29
1148	0.29
1149	0.27
1150	0.25
1151	0.23
1152	0.29
1153	0.23
1154	0.23
1155	0.25
1156	0.28
1157	0.29
1158	0.34
1159	0.42
1160	0.39
1161	0.41
1162	0.48
1163	0.52
1164	0.53
1165	0.6
1166	0.65
1167	0.66
1168	0.73
1169	0.8
1170	0.82
1171	0.83
1172	0.85
1173	0.85
1174	0.86
1175	0.86
1176	0.85
1177	0.85
1178	0.81
1179	0.78
1180	0.71
1181	0.65
1182	0.56
1183	0.54
1184	0.49
1185	0.44
1186	0.45
1187	0.42
1188	0.43
1189	0.45
1190	0.45
1191	0.4
1192	0.37
1193	0.31
1194	0.33
1195	0.38
1196	0.41
1197	0.43
1198	0.47
1199	0.44
1200	0.48
1201	0.48
1202	0.39
1203	0.31
1204	0.27
1205	0.22
1206	0.16
1207	0.16
1208	0.11
1209	0.11
1210	0.1
1211	0.09
1212	0.07
1213	0.06
1214	0.05
1215	0.05
1216	0.04
1217	0.03
1218	0.04
1219	0.05
1220	0.05
1221	0.05
1222	0.06
1223	0.06
1224	0.1
1225	0.11
1226	0.11
1227	0.13
1228	0.16
1229	0.18
1230	0.21
1231	0.21
1232	0.17
1233	0.17
1234	0.17
1235	0.16

A0A4P9WJF2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer