Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9VYD6

Protein Details
Accession A0A4P9VYD6    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-55ELENNPPSSPKRRRNEPSSPPRTKRARTETDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-50PKRRRNEPSSPPRTKRA
273-274KA
317-331KKPVKSSSPQKKAKE
338-357LRSKAVAKKIKDPKKEKAKG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
Amino Acid Sequences AASTTDAPTTQPTEPSAPVASAALELENNPPSSPKRRRNEPSSPPRTKRARTETDDAAKKSEEKASPGTEAGVAMETAGAMHDEPKSRSGSETEMDAANSVPSNTQDLDQTVVSASPPTAKKLSSSPESSPVAAPDARRRRKTKIDSDSESGAEETVKVPAKVRARVKKDPAVVEDSDSAADKPAVPASPKKRVATSKAKKSVAEESDSAVEEPAEPSPKNARVRAKKASDEDSGSATEATVSKVKRATKAKAKSTSDEESASALKSTKRSTKAKKNKDAVDEESDDGTEVDSENAGRPSILFYPPKADEVASGSPKKPVKSSSPQKKAKETLSSDVLRSKAVAKKIKDPKKEKAKGGSASLMLAVAEEAKNKDRVKWEAGKSVPYAALCTTFEEIEVITSRLQISAILTDFFKTVIRLTPDDLIPCIYLCLNRICPEYEGKELGIGESLLIKAIANATACTPKAIKEKMAKEGDLGKVAQASRTKQKTIGTRDPLTVNKVFSTLKSIAELSGHQSQDKKIKSINSLLVACCGNEAKYLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.3
3 0.28
4 0.24
5 0.22
6 0.2
7 0.17
8 0.13
9 0.13
10 0.1
11 0.09
12 0.1
13 0.13
14 0.16
15 0.16
16 0.16
17 0.19
18 0.24
19 0.34
20 0.44
21 0.5
22 0.56
23 0.67
24 0.76
25 0.82
26 0.87
27 0.88
28 0.89
29 0.89
30 0.9
31 0.85
32 0.85
33 0.85
34 0.82
35 0.81
36 0.8
37 0.79
38 0.76
39 0.77
40 0.76
41 0.76
42 0.76
43 0.67
44 0.6
45 0.52
46 0.47
47 0.44
48 0.42
49 0.35
50 0.32
51 0.36
52 0.36
53 0.36
54 0.35
55 0.32
56 0.25
57 0.22
58 0.18
59 0.14
60 0.1
61 0.08
62 0.07
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.04
68 0.06
69 0.09
70 0.13
71 0.15
72 0.18
73 0.21
74 0.21
75 0.23
76 0.24
77 0.25
78 0.22
79 0.23
80 0.21
81 0.2
82 0.19
83 0.17
84 0.15
85 0.12
86 0.11
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.11
91 0.12
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.15
96 0.14
97 0.14
98 0.11
99 0.11
100 0.1
101 0.09
102 0.09
103 0.13
104 0.14
105 0.17
106 0.19
107 0.19
108 0.21
109 0.26
110 0.32
111 0.31
112 0.35
113 0.34
114 0.39
115 0.4
116 0.4
117 0.35
118 0.29
119 0.27
120 0.24
121 0.24
122 0.28
123 0.36
124 0.44
125 0.51
126 0.55
127 0.6
128 0.69
129 0.76
130 0.76
131 0.76
132 0.76
133 0.74
134 0.73
135 0.67
136 0.57
137 0.48
138 0.37
139 0.27
140 0.18
141 0.13
142 0.09
143 0.11
144 0.12
145 0.12
146 0.13
147 0.19
148 0.24
149 0.31
150 0.4
151 0.46
152 0.52
153 0.6
154 0.66
155 0.67
156 0.67
157 0.63
158 0.57
159 0.53
160 0.45
161 0.39
162 0.32
163 0.26
164 0.21
165 0.18
166 0.14
167 0.1
168 0.1
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.1
173 0.11
174 0.19
175 0.25
176 0.34
177 0.39
178 0.4
179 0.44
180 0.48
181 0.54
182 0.58
183 0.61
184 0.62
185 0.66
186 0.66
187 0.61
188 0.59
189 0.59
190 0.51
191 0.45
192 0.35
193 0.28
194 0.27
195 0.26
196 0.23
197 0.15
198 0.12
199 0.08
200 0.09
201 0.08
202 0.1
203 0.09
204 0.11
205 0.16
206 0.23
207 0.27
208 0.32
209 0.4
210 0.46
211 0.53
212 0.59
213 0.59
214 0.58
215 0.57
216 0.57
217 0.5
218 0.43
219 0.37
220 0.31
221 0.26
222 0.21
223 0.17
224 0.12
225 0.1
226 0.08
227 0.08
228 0.1
229 0.1
230 0.12
231 0.16
232 0.19
233 0.25
234 0.3
235 0.36
236 0.42
237 0.5
238 0.57
239 0.61
240 0.62
241 0.58
242 0.58
243 0.54
244 0.46
245 0.39
246 0.31
247 0.23
248 0.21
249 0.18
250 0.12
251 0.11
252 0.1
253 0.12
254 0.15
255 0.2
256 0.26
257 0.34
258 0.43
259 0.53
260 0.62
261 0.7
262 0.77
263 0.78
264 0.77
265 0.74
266 0.7
267 0.63
268 0.57
269 0.49
270 0.4
271 0.32
272 0.27
273 0.21
274 0.16
275 0.12
276 0.07
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.06
283 0.06
284 0.05
285 0.05
286 0.07
287 0.1
288 0.13
289 0.13
290 0.13
291 0.18
292 0.19
293 0.2
294 0.19
295 0.16
296 0.13
297 0.17
298 0.2
299 0.2
300 0.21
301 0.2
302 0.26
303 0.28
304 0.28
305 0.26
306 0.26
307 0.3
308 0.38
309 0.49
310 0.54
311 0.62
312 0.7
313 0.72
314 0.75
315 0.73
316 0.67
317 0.65
318 0.58
319 0.52
320 0.5
321 0.47
322 0.41
323 0.39
324 0.34
325 0.25
326 0.22
327 0.23
328 0.2
329 0.27
330 0.32
331 0.32
332 0.41
333 0.52
334 0.6
335 0.65
336 0.68
337 0.7
338 0.75
339 0.8
340 0.76
341 0.74
342 0.73
343 0.66
344 0.62
345 0.55
346 0.44
347 0.37
348 0.31
349 0.22
350 0.14
351 0.1
352 0.07
353 0.05
354 0.05
355 0.07
356 0.08
357 0.11
358 0.17
359 0.17
360 0.22
361 0.26
362 0.3
363 0.35
364 0.42
365 0.44
366 0.46
367 0.47
368 0.47
369 0.42
370 0.4
371 0.34
372 0.26
373 0.23
374 0.15
375 0.16
376 0.14
377 0.15
378 0.14
379 0.12
380 0.12
381 0.11
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.09
386 0.08
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.08
392 0.08
393 0.09
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.11
398 0.11
399 0.11
400 0.1
401 0.08
402 0.09
403 0.13
404 0.17
405 0.18
406 0.2
407 0.23
408 0.24
409 0.24
410 0.24
411 0.2
412 0.16
413 0.15
414 0.14
415 0.11
416 0.11
417 0.12
418 0.16
419 0.18
420 0.2
421 0.22
422 0.23
423 0.25
424 0.29
425 0.31
426 0.29
427 0.28
428 0.25
429 0.25
430 0.23
431 0.22
432 0.17
433 0.13
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.07
438 0.07
439 0.06
440 0.06
441 0.07
442 0.09
443 0.08
444 0.09
445 0.11
446 0.15
447 0.15
448 0.17
449 0.17
450 0.21
451 0.28
452 0.31
453 0.36
454 0.41
455 0.46
456 0.53
457 0.58
458 0.52
459 0.47
460 0.51
461 0.46
462 0.4
463 0.35
464 0.27
465 0.26
466 0.26
467 0.28
468 0.26
469 0.29
470 0.36
471 0.41
472 0.43
473 0.43
474 0.49
475 0.54
476 0.58
477 0.63
478 0.61
479 0.59
480 0.61
481 0.62
482 0.58
483 0.55
484 0.49
485 0.4
486 0.33
487 0.33
488 0.3
489 0.26
490 0.3
491 0.25
492 0.23
493 0.24
494 0.24
495 0.21
496 0.22
497 0.23
498 0.21
499 0.26
500 0.26
501 0.26
502 0.28
503 0.33
504 0.4
505 0.43
506 0.42
507 0.4
508 0.45
509 0.49
510 0.54
511 0.55
512 0.53
513 0.52
514 0.49
515 0.47
516 0.41
517 0.35
518 0.29
519 0.24
520 0.18