Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8N3K4

Protein Details
Accession B8N3K4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
354-382LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
360-373KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 16.5, mito_nucl 11.5, mito 5.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAGKKSSPAKLAQDKKGGGAPSFPPQLIASIEAFLTESGFTSTGKAFAKEQASKSVSKSLSDSKNAPSLLEIFQNWADNEKATEKSSESSSSESSSSSSSSEESSSSSDESSDSDVEMNDAPKAQSKKQSKNSSSSSSSSSSSSSSSSGSDSDADDESEEETAAPAPAKPQGTKRKAESDSSSSESESDSDKAPQNKKTKIAAKKESSSSDSSASSDSSSSESSSSASDSSDSSSDSNSDSDSSDSDSSDSSSSSSDSDEEDGKENKTSSSSQSSSGSETVQNSDSGVQKSTNISTPVTGSSSASPAPRNGPAQKKHTGARPTPLALLSEQPTDHLLSNDYVPYAYADRAFKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDISGGKSFKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.61
3 0.6
4 0.53
5 0.43
6 0.39
7 0.34
8 0.33
9 0.36
10 0.33
11 0.3
12 0.27
13 0.29
14 0.25
15 0.24
16 0.18
17 0.15
18 0.15
19 0.13
20 0.13
21 0.11
22 0.1
23 0.07
24 0.07
25 0.08
26 0.09
27 0.09
28 0.11
29 0.11
30 0.15
31 0.17
32 0.18
33 0.18
34 0.24
35 0.31
36 0.35
37 0.37
38 0.41
39 0.43
40 0.43
41 0.44
42 0.47
43 0.4
44 0.35
45 0.37
46 0.37
47 0.41
48 0.43
49 0.43
50 0.38
51 0.43
52 0.42
53 0.38
54 0.3
55 0.27
56 0.24
57 0.24
58 0.21
59 0.18
60 0.19
61 0.21
62 0.2
63 0.19
64 0.18
65 0.15
66 0.17
67 0.18
68 0.18
69 0.17
70 0.19
71 0.18
72 0.2
73 0.22
74 0.23
75 0.21
76 0.22
77 0.22
78 0.22
79 0.21
80 0.19
81 0.18
82 0.15
83 0.14
84 0.12
85 0.12
86 0.1
87 0.11
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.13
93 0.13
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.12
99 0.11
100 0.1
101 0.1
102 0.09
103 0.1
104 0.11
105 0.11
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.15
110 0.18
111 0.21
112 0.29
113 0.38
114 0.47
115 0.57
116 0.67
117 0.65
118 0.69
119 0.71
120 0.68
121 0.63
122 0.55
123 0.49
124 0.4
125 0.37
126 0.31
127 0.26
128 0.21
129 0.17
130 0.16
131 0.14
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.09
155 0.11
156 0.12
157 0.21
158 0.31
159 0.36
160 0.41
161 0.43
162 0.49
163 0.5
164 0.52
165 0.47
166 0.41
167 0.4
168 0.39
169 0.36
170 0.27
171 0.25
172 0.21
173 0.18
174 0.15
175 0.12
176 0.09
177 0.12
178 0.15
179 0.22
180 0.26
181 0.32
182 0.38
183 0.4
184 0.44
185 0.48
186 0.53
187 0.55
188 0.6
189 0.61
190 0.59
191 0.6
192 0.59
193 0.55
194 0.5
195 0.43
196 0.36
197 0.29
198 0.24
199 0.21
200 0.18
201 0.16
202 0.12
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.08
226 0.09
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.11
247 0.12
248 0.15
249 0.16
250 0.17
251 0.18
252 0.17
253 0.16
254 0.17
255 0.18
256 0.18
257 0.24
258 0.24
259 0.25
260 0.27
261 0.28
262 0.28
263 0.27
264 0.24
265 0.19
266 0.19
267 0.19
268 0.18
269 0.16
270 0.14
271 0.16
272 0.19
273 0.18
274 0.18
275 0.16
276 0.17
277 0.19
278 0.2
279 0.22
280 0.2
281 0.19
282 0.18
283 0.19
284 0.19
285 0.18
286 0.17
287 0.14
288 0.13
289 0.15
290 0.16
291 0.17
292 0.17
293 0.17
294 0.2
295 0.23
296 0.28
297 0.34
298 0.41
299 0.46
300 0.51
301 0.56
302 0.56
303 0.57
304 0.59
305 0.6
306 0.55
307 0.56
308 0.54
309 0.5
310 0.48
311 0.44
312 0.37
313 0.3
314 0.3
315 0.24
316 0.22
317 0.19
318 0.18
319 0.19
320 0.19
321 0.19
322 0.15
323 0.15
324 0.14
325 0.16
326 0.16
327 0.15
328 0.13
329 0.12
330 0.13
331 0.13
332 0.13
333 0.16
334 0.17
335 0.18
336 0.21
337 0.21
338 0.19
339 0.23
340 0.25
341 0.26
342 0.33
343 0.33
344 0.32
345 0.38
346 0.39
347 0.41
348 0.45
349 0.5
350 0.53
351 0.62
352 0.71
353 0.76
354 0.85
355 0.86
356 0.9
357 0.91
358 0.9
359 0.9
360 0.89
361 0.88
362 0.88
363 0.82
364 0.72
365 0.62
366 0.57
367 0.48
368 0.42
369 0.34
370 0.26
371 0.23