Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1IRX4

Protein Details
Accession A0A4V1IRX4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-125KAAAPKPASSEKKKKKSGKKGAAASKDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
101-121APKPASSEKKKKKSGKKGAAA
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 11.833, cyto 10.5, mito_nucl 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF13414  TPR_11  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MQLESHEIRQFGLGSYRGSGWSGLAKIAKDDSREKSRESPVDVTKDTLEAAPAKDQSQPLDSALPNPPQLQLARNSQVTPGKSVAAVAAGTWYVVSSKAAAPKPASSEKKKKKSGKKGAAASKDIPVDAKPAASASASPEAQPAISTAAEEPFAAYPAHLFPEDVDALERSERANIAKEAKTLGNQFYQEKKYSQALDLYSQAIKLVPDDAVFYSNRAACYSMMQNYEKVIDDCTSALTYDAKYIKALNRRAGAYEILEKWEPALNDYTSMCLLEEYKAESSLKAMDRILKHVGKVKATELFQSHNLILLVFDALAYMDSFRITSRGAPEIADREAVEEGDVLIKAAFAAVAERKWAEARKACIEGIETGKISAGFESLAYNLRGTFGFLMGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.22
4 0.21
5 0.21
6 0.19
7 0.16
8 0.18
9 0.17
10 0.19
11 0.21
12 0.2
13 0.21
14 0.26
15 0.28
16 0.28
17 0.34
18 0.38
19 0.45
20 0.48
21 0.5
22 0.53
23 0.59
24 0.6
25 0.59
26 0.58
27 0.56
28 0.6
29 0.56
30 0.51
31 0.43
32 0.38
33 0.33
34 0.25
35 0.21
36 0.16
37 0.17
38 0.19
39 0.2
40 0.2
41 0.23
42 0.24
43 0.25
44 0.25
45 0.24
46 0.22
47 0.25
48 0.24
49 0.25
50 0.29
51 0.29
52 0.28
53 0.28
54 0.27
55 0.25
56 0.26
57 0.25
58 0.25
59 0.29
60 0.32
61 0.33
62 0.33
63 0.34
64 0.39
65 0.36
66 0.35
67 0.29
68 0.24
69 0.23
70 0.22
71 0.17
72 0.13
73 0.11
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.04
81 0.05
82 0.06
83 0.07
84 0.09
85 0.17
86 0.18
87 0.21
88 0.23
89 0.25
90 0.3
91 0.38
92 0.43
93 0.45
94 0.55
95 0.63
96 0.71
97 0.79
98 0.83
99 0.85
100 0.89
101 0.91
102 0.9
103 0.88
104 0.87
105 0.86
106 0.83
107 0.76
108 0.66
109 0.59
110 0.49
111 0.4
112 0.32
113 0.23
114 0.19
115 0.15
116 0.13
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.09
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.13
127 0.13
128 0.13
129 0.12
130 0.1
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.06
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.06
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.1
157 0.06
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.11
162 0.12
163 0.17
164 0.17
165 0.18
166 0.19
167 0.19
168 0.2
169 0.2
170 0.19
171 0.17
172 0.18
173 0.2
174 0.23
175 0.25
176 0.25
177 0.24
178 0.24
179 0.25
180 0.25
181 0.23
182 0.21
183 0.19
184 0.19
185 0.19
186 0.18
187 0.15
188 0.13
189 0.12
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.12
206 0.1
207 0.13
208 0.15
209 0.16
210 0.18
211 0.18
212 0.18
213 0.18
214 0.19
215 0.17
216 0.15
217 0.13
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.1
222 0.09
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.11
228 0.13
229 0.12
230 0.12
231 0.15
232 0.2
233 0.27
234 0.31
235 0.32
236 0.34
237 0.34
238 0.35
239 0.34
240 0.3
241 0.24
242 0.24
243 0.2
244 0.19
245 0.19
246 0.17
247 0.16
248 0.18
249 0.16
250 0.13
251 0.16
252 0.13
253 0.15
254 0.15
255 0.15
256 0.13
257 0.13
258 0.11
259 0.08
260 0.09
261 0.08
262 0.09
263 0.1
264 0.11
265 0.12
266 0.13
267 0.12
268 0.12
269 0.17
270 0.18
271 0.17
272 0.17
273 0.21
274 0.23
275 0.27
276 0.33
277 0.29
278 0.29
279 0.35
280 0.38
281 0.34
282 0.35
283 0.34
284 0.32
285 0.31
286 0.33
287 0.28
288 0.27
289 0.27
290 0.28
291 0.25
292 0.22
293 0.21
294 0.17
295 0.15
296 0.12
297 0.1
298 0.07
299 0.07
300 0.04
301 0.04
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.06
309 0.08
310 0.08
311 0.11
312 0.14
313 0.17
314 0.18
315 0.18
316 0.21
317 0.23
318 0.24
319 0.22
320 0.18
321 0.17
322 0.17
323 0.16
324 0.13
325 0.1
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.03
336 0.07
337 0.09
338 0.1
339 0.13
340 0.13
341 0.15
342 0.19
343 0.24
344 0.29
345 0.33
346 0.39
347 0.43
348 0.46
349 0.44
350 0.41
351 0.39
352 0.36
353 0.34
354 0.31
355 0.25
356 0.22
357 0.23
358 0.22
359 0.2
360 0.16
361 0.12
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.1
366 0.13
367 0.13
368 0.13
369 0.13
370 0.14
371 0.14
372 0.15
373 0.15