Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9WPB0

Protein Details
Accession A0A4P9WPB0    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MAPPSKKKRREVEEEEGDDQAcidic
62-84AANPTPAPKRRKPDPPSPQPAPLHydrophilic
519-539GGGPKRKPRGKEPGKELGKNABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-73PKRRK
500-550GGGGGGNGRGGPGGGGGGPGGGPKRKPRGKEPGKELGKNAGKEKGSGKHAA
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.5, nucl 10.5, cyto 9.5, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033312  DDB2  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0080008  C:Cul4-RING E3 ubiquitin ligase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MAPPSKKKRREVEEEEGDDQVESRTSQPSELSADLRSRLRSAFSYQGKFTAPSPAPAPPPPAANPTPAPKRRKPDPPSPQPAPLPPSYHFDTVPPHIPRGPLPRRLARSLAETHPMSARRYMDLSLPSYVRSLRAFRVSDTLGGHFDRRVTVIQWHPDSRFPTTLALASKGGDVIWWDQAKYAAHRGFAREGADPEVDAPDAPFLYGQGAGGSITAMKFHPTEPNMIFTASIDGTLRKQDFEGRSGASFLDTMHREKWFTALDVQPELKLLLAGSNTGVCSLVDFEGRVAWSGKLHKGKCHDVEFHPVESHLVVTAGNDKVARVWDVRMMRKKAVDELPAPLQVMEHQGIINCATFSPFAPYTLLTTSQNSECRFYDLSDPSPALAPACILPHPHRPFQHLTPIKAEWSPVHPDLCVVGRYPEDAADRRTVDVFQYKPGAPCPVALVARIEDPRVGGIQCLAKFNNTGDVLATCSGFTTYLWTASDLSSTNAGGARSGGGGGGGGNGRGGPGGGGGGPGGGPKRKPRGKEPGKELGKNAGKEKGSGKHAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.74
3 0.64
4 0.55
5 0.44
6 0.35
7 0.25
8 0.16
9 0.12
10 0.11
11 0.16
12 0.17
13 0.18
14 0.19
15 0.21
16 0.24
17 0.25
18 0.25
19 0.23
20 0.25
21 0.28
22 0.31
23 0.3
24 0.28
25 0.27
26 0.28
27 0.28
28 0.31
29 0.36
30 0.41
31 0.44
32 0.43
33 0.45
34 0.43
35 0.42
36 0.37
37 0.37
38 0.3
39 0.28
40 0.3
41 0.31
42 0.33
43 0.35
44 0.39
45 0.31
46 0.34
47 0.33
48 0.38
49 0.35
50 0.36
51 0.37
52 0.41
53 0.5
54 0.54
55 0.6
56 0.61
57 0.67
58 0.71
59 0.78
60 0.77
61 0.77
62 0.8
63 0.82
64 0.84
65 0.81
66 0.78
67 0.71
68 0.69
69 0.64
70 0.57
71 0.5
72 0.43
73 0.44
74 0.42
75 0.4
76 0.35
77 0.31
78 0.32
79 0.32
80 0.39
81 0.35
82 0.33
83 0.33
84 0.34
85 0.38
86 0.43
87 0.46
88 0.46
89 0.51
90 0.57
91 0.6
92 0.63
93 0.61
94 0.52
95 0.51
96 0.47
97 0.44
98 0.42
99 0.36
100 0.34
101 0.35
102 0.35
103 0.31
104 0.31
105 0.29
106 0.25
107 0.26
108 0.26
109 0.25
110 0.26
111 0.26
112 0.25
113 0.24
114 0.22
115 0.22
116 0.21
117 0.2
118 0.19
119 0.2
120 0.2
121 0.27
122 0.27
123 0.27
124 0.31
125 0.29
126 0.29
127 0.28
128 0.26
129 0.21
130 0.21
131 0.21
132 0.17
133 0.17
134 0.14
135 0.14
136 0.14
137 0.13
138 0.19
139 0.23
140 0.29
141 0.33
142 0.35
143 0.35
144 0.38
145 0.39
146 0.37
147 0.33
148 0.28
149 0.26
150 0.24
151 0.25
152 0.22
153 0.21
154 0.17
155 0.16
156 0.15
157 0.13
158 0.11
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.13
163 0.13
164 0.13
165 0.13
166 0.16
167 0.17
168 0.18
169 0.24
170 0.2
171 0.22
172 0.24
173 0.26
174 0.26
175 0.27
176 0.26
177 0.2
178 0.2
179 0.2
180 0.19
181 0.16
182 0.14
183 0.13
184 0.11
185 0.09
186 0.08
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.07
206 0.08
207 0.13
208 0.14
209 0.19
210 0.19
211 0.22
212 0.21
213 0.2
214 0.19
215 0.14
216 0.15
217 0.1
218 0.1
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.11
226 0.17
227 0.18
228 0.2
229 0.21
230 0.18
231 0.18
232 0.18
233 0.18
234 0.12
235 0.1
236 0.08
237 0.11
238 0.11
239 0.13
240 0.14
241 0.15
242 0.15
243 0.15
244 0.18
245 0.14
246 0.13
247 0.15
248 0.15
249 0.16
250 0.17
251 0.18
252 0.15
253 0.14
254 0.13
255 0.09
256 0.07
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.09
279 0.11
280 0.17
281 0.24
282 0.25
283 0.28
284 0.32
285 0.38
286 0.41
287 0.42
288 0.41
289 0.35
290 0.44
291 0.42
292 0.38
293 0.32
294 0.27
295 0.23
296 0.19
297 0.17
298 0.08
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.09
308 0.1
309 0.11
310 0.08
311 0.09
312 0.14
313 0.19
314 0.26
315 0.34
316 0.36
317 0.37
318 0.38
319 0.39
320 0.39
321 0.39
322 0.35
323 0.28
324 0.29
325 0.29
326 0.27
327 0.26
328 0.2
329 0.16
330 0.12
331 0.14
332 0.11
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.1
337 0.1
338 0.1
339 0.07
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.12
345 0.11
346 0.12
347 0.13
348 0.13
349 0.14
350 0.15
351 0.17
352 0.13
353 0.14
354 0.16
355 0.19
356 0.23
357 0.23
358 0.24
359 0.23
360 0.26
361 0.25
362 0.24
363 0.28
364 0.26
365 0.27
366 0.26
367 0.26
368 0.22
369 0.22
370 0.21
371 0.14
372 0.11
373 0.09
374 0.07
375 0.09
376 0.09
377 0.11
378 0.15
379 0.25
380 0.29
381 0.35
382 0.35
383 0.4
384 0.45
385 0.45
386 0.53
387 0.48
388 0.46
389 0.45
390 0.45
391 0.41
392 0.36
393 0.34
394 0.25
395 0.23
396 0.27
397 0.24
398 0.24
399 0.21
400 0.21
401 0.22
402 0.22
403 0.18
404 0.13
405 0.13
406 0.12
407 0.14
408 0.14
409 0.15
410 0.17
411 0.18
412 0.21
413 0.23
414 0.24
415 0.24
416 0.25
417 0.22
418 0.22
419 0.26
420 0.24
421 0.23
422 0.27
423 0.27
424 0.28
425 0.3
426 0.31
427 0.24
428 0.24
429 0.24
430 0.24
431 0.22
432 0.22
433 0.21
434 0.18
435 0.22
436 0.22
437 0.2
438 0.15
439 0.15
440 0.16
441 0.15
442 0.14
443 0.1
444 0.13
445 0.18
446 0.19
447 0.22
448 0.22
449 0.21
450 0.22
451 0.23
452 0.27
453 0.22
454 0.21
455 0.18
456 0.18
457 0.19
458 0.18
459 0.18
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.09
464 0.09
465 0.12
466 0.12
467 0.14
468 0.15
469 0.16
470 0.16
471 0.16
472 0.18
473 0.14
474 0.15
475 0.14
476 0.13
477 0.13
478 0.14
479 0.14
480 0.12
481 0.12
482 0.11
483 0.1
484 0.1
485 0.08
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.04
498 0.04
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.08
506 0.11
507 0.15
508 0.19
509 0.28
510 0.39
511 0.45
512 0.52
513 0.59
514 0.67
515 0.74
516 0.8
517 0.8
518 0.8
519 0.82
520 0.8
521 0.73
522 0.72
523 0.69
524 0.63
525 0.59
526 0.56
527 0.48
528 0.47
529 0.51
530 0.48