FuNGI

A0A4P9WDI3

Protein Details

Accession

A0A4P9WDI3

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
26-46	NDEPAKPSKRAPKASRDHGME	Hydrophilic
102-122	RAPVKGEKKKLTKTLKKVDVA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
34-35	KR
225-227	RER
261-282	RGGPSAPTRPSGPAAIAEKRKR

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

DGEAAPIAKVKSEPTEPKSWRSKILNDEPAKPSKRAPKASRDHGMEEDLDFEEDFADDENPDFGIEDREEAEEARQRQFGSLGRKSQMLEDDIDDSDEEEIRAPVKGEKKKLTKTLKKVDVANEYESGDEENPYLSEEDEEEQDEAEAEQAGDEKDELEKVLEKIKKPISKPDAAVAPQPSKPTPPVSAPRSGASSPRAPEQPAVPVKRAVGVERTASPAPAIKRERSASPAPRREGSMSPPHSQSLAGGARSPLGAGAGRGGPSAPTRPSGPAAIAEKRKRLEDDDAGDKKRKMNDEPPPPPTAAEVLAAQRMKRPIAAGAPMKRAGSASPLTGGASSPPSGSTTASPATSQRKAPVSRAVADARAAAASPASSSGRVTPRGGSATPVGDPLANMMSREDVIRVIRTLENPTVQEIVMACPLVKRNPNNKDIIRDVIKTCCSLRKDKEGGKTVLMLNSEYR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.5
3	0.53
4	0.6
5	0.67
6	0.65
7	0.66
8	0.63
9	0.65
10	0.65
11	0.71
12	0.73
13	0.67
14	0.71
15	0.68
16	0.71
17	0.67
18	0.59
19	0.56
20	0.56
21	0.62
22	0.65
23	0.67
24	0.68
25	0.74
26	0.81
27	0.83
28	0.78
29	0.72
30	0.64
31	0.6
32	0.5
33	0.4
34	0.34
35	0.25
36	0.21
37	0.16
38	0.13
39	0.1
40	0.09
41	0.09
42	0.08
43	0.07
44	0.07
45	0.07
46	0.08
47	0.08
48	0.08
49	0.08
50	0.07
51	0.11
52	0.11
53	0.11
54	0.12
55	0.13
56	0.14
57	0.14
58	0.17
59	0.2
60	0.22
61	0.24
62	0.25
63	0.24
64	0.25
65	0.28
66	0.29
67	0.33
68	0.37
69	0.39
70	0.39
71	0.4
72	0.4
73	0.4
74	0.38
75	0.31
76	0.26
77	0.22
78	0.23
79	0.21
80	0.21
81	0.17
82	0.14
83	0.12
84	0.11
85	0.09
86	0.08
87	0.08
88	0.08
89	0.09
90	0.09
91	0.14
92	0.22
93	0.29
94	0.35
95	0.44
96	0.52
97	0.59
98	0.68
99	0.74
100	0.75
101	0.78
102	0.81
103	0.8
104	0.76
105	0.73
106	0.7
107	0.67
108	0.6
109	0.53
110	0.44
111	0.36
112	0.32
113	0.27
114	0.23
115	0.15
116	0.12
117	0.09
118	0.08
119	0.08
120	0.09
121	0.09
122	0.07
123	0.07
124	0.08
125	0.09
126	0.09
127	0.1
128	0.09
129	0.09
130	0.09
131	0.08
132	0.07
133	0.06
134	0.06
135	0.04
136	0.04
137	0.05
138	0.05
139	0.05
140	0.05
141	0.05
142	0.06
143	0.06
144	0.06
145	0.06
146	0.09
147	0.09
148	0.17
149	0.2
150	0.21
151	0.27
152	0.35
153	0.39
154	0.39
155	0.48
156	0.47
157	0.48
158	0.48
159	0.45
160	0.43
161	0.38
162	0.4
163	0.34
164	0.31
165	0.28
166	0.29
167	0.26
168	0.23
169	0.24
170	0.23
171	0.22
172	0.25
173	0.31
174	0.32
175	0.37
176	0.36
177	0.35
178	0.35
179	0.33
180	0.3
181	0.26
182	0.27
183	0.22
184	0.24
185	0.25
186	0.22
187	0.23
188	0.21
189	0.25
190	0.28
191	0.29
192	0.27
193	0.27
194	0.26
195	0.28
196	0.28
197	0.21
198	0.17
199	0.16
200	0.16
201	0.16
202	0.19
203	0.16
204	0.15
205	0.14
206	0.15
207	0.14
208	0.21
209	0.23
210	0.21
211	0.25
212	0.26
213	0.27
214	0.29
215	0.35
216	0.37
217	0.44
218	0.49
219	0.47
220	0.46
221	0.47
222	0.45
223	0.4
224	0.35
225	0.35
226	0.32
227	0.33
228	0.33
229	0.32
230	0.29
231	0.27
232	0.22
233	0.19
234	0.16
235	0.13
236	0.13
237	0.13
238	0.12
239	0.12
240	0.12
241	0.06
242	0.05
243	0.05
244	0.04
245	0.05
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.08
252	0.1
253	0.1
254	0.11
255	0.12
256	0.14
257	0.16
258	0.15
259	0.15
260	0.15
261	0.18
262	0.23
263	0.3
264	0.31
265	0.34
266	0.35
267	0.36
268	0.34
269	0.34
270	0.34
271	0.31
272	0.33
273	0.38
274	0.42
275	0.43
276	0.45
277	0.43
278	0.41
279	0.4
280	0.4
281	0.37
282	0.41
283	0.47
284	0.54
285	0.59
286	0.59
287	0.57
288	0.53
289	0.47
290	0.39
291	0.31
292	0.2
293	0.15
294	0.13
295	0.11
296	0.15
297	0.16
298	0.15
299	0.17
300	0.18
301	0.18
302	0.17
303	0.17
304	0.15
305	0.17
306	0.23
307	0.27
308	0.29
309	0.33
310	0.34
311	0.33
312	0.3
313	0.28
314	0.22
315	0.2
316	0.17
317	0.14
318	0.13
319	0.14
320	0.14
321	0.13
322	0.13
323	0.09
324	0.1
325	0.1
326	0.09
327	0.09
328	0.1
329	0.11
330	0.12
331	0.12
332	0.13
333	0.14
334	0.15
335	0.15
336	0.19
337	0.25
338	0.27
339	0.28
340	0.3
341	0.36
342	0.38
343	0.41
344	0.45
345	0.42
346	0.41
347	0.44
348	0.41
349	0.34
350	0.33
351	0.29
352	0.21
353	0.17
354	0.14
355	0.09
356	0.07
357	0.06
358	0.06
359	0.08
360	0.08
361	0.09
362	0.1
363	0.16
364	0.2
365	0.23
366	0.25
367	0.24
368	0.27
369	0.3
370	0.29
371	0.26
372	0.24
373	0.23
374	0.22
375	0.21
376	0.18
377	0.14
378	0.14
379	0.13
380	0.14
381	0.12
382	0.12
383	0.11
384	0.12
385	0.13
386	0.13
387	0.12
388	0.12
389	0.14
390	0.15
391	0.15
392	0.18
393	0.2
394	0.22
395	0.26
396	0.28
397	0.29
398	0.28
399	0.3
400	0.28
401	0.25
402	0.24
403	0.19
404	0.18
405	0.16
406	0.15
407	0.13
408	0.14
409	0.18
410	0.23
411	0.3
412	0.37
413	0.45
414	0.54
415	0.6
416	0.66
417	0.67
418	0.68
419	0.65
420	0.64
421	0.59
422	0.55
423	0.51
424	0.49
425	0.47
426	0.42
427	0.41
428	0.41
429	0.41
430	0.46
431	0.5
432	0.54
433	0.61
434	0.65
435	0.72
436	0.73
437	0.71
438	0.64
439	0.62
440	0.54
441	0.49
442	0.43

A0A4P9WDI3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer