Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1IPF6

Protein Details
Accession A0A4V1IPF6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
440-469TPSSIRTRKKELDGTKRKAQAKRSKNDLPSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
447-464RKKELDGTKRKAQAKRSK
Subcellular Location(s) cyto 15, cyto_nucl 13, nucl 7, cysk 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047042  BipA_II  
IPR047043  BipA_III  
IPR035651  BipA_V  
IPR035647  EFG_III/V  
IPR000640  EFG_V-like  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
IPR042116  TypA/BipA_C  
Pfam View protein in Pfam  
PF00679  EFG_C  
CDD cd16263  BipA_III  
cd03710  BipA_TypA_C  
cd03691  BipA_TypA_II  
Amino Acid Sequences ELLELFIGLDANEHQLEYPILYASAKDGWASTTLDGERKDILPLLDTILEQVPHPKIDRSAPFSMLVTQIESDPYVGKCYLGKIESGILRVGDKIKSIHPERGVVSDGRCTKIFLRRGLEQVSVEAAGAGDIVSVAGLAGASVNHTVCAPAVEKSLPFTKVDPPTIAMEFYVNDSPLGGREGKHLTSQVLRERLFREIETNVALQVTETGEHYEVKGRGELQIGVLIETMRREGFELSLSPPRVIYQIEGEGKGRIVKEPVEEVTIDVEHTDAGTVIEKMSKGKGDLKSYTESGDKARLIFHIPTRGLLGYPAEFKNDTRGQGTLNHLLLGYEPYKGPLDKSRKGSLISTAAGEATAHALGGIEPRGKLFITPGTKVYPGMIIGEHSREQDLEVNPVKAKATSNVRNVIKEDVIRLTPVEPLSLEKLIAYIQDDEVIEVTPSSIRTRKKELDGTKRKAQAKRSKNDLPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.12
3 0.12
4 0.12
5 0.12
6 0.09
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.11
11 0.12
12 0.12
13 0.11
14 0.11
15 0.12
16 0.14
17 0.16
18 0.14
19 0.17
20 0.18
21 0.23
22 0.23
23 0.23
24 0.24
25 0.23
26 0.24
27 0.21
28 0.2
29 0.18
30 0.17
31 0.18
32 0.16
33 0.15
34 0.16
35 0.16
36 0.15
37 0.14
38 0.19
39 0.19
40 0.2
41 0.23
42 0.23
43 0.24
44 0.32
45 0.39
46 0.4
47 0.41
48 0.41
49 0.4
50 0.38
51 0.37
52 0.31
53 0.25
54 0.19
55 0.16
56 0.14
57 0.14
58 0.13
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.14
63 0.14
64 0.14
65 0.14
66 0.16
67 0.2
68 0.18
69 0.18
70 0.16
71 0.21
72 0.22
73 0.22
74 0.21
75 0.16
76 0.16
77 0.18
78 0.19
79 0.15
80 0.15
81 0.16
82 0.19
83 0.27
84 0.3
85 0.35
86 0.34
87 0.37
88 0.36
89 0.37
90 0.36
91 0.3
92 0.27
93 0.28
94 0.28
95 0.28
96 0.27
97 0.26
98 0.28
99 0.34
100 0.39
101 0.38
102 0.4
103 0.41
104 0.45
105 0.46
106 0.44
107 0.35
108 0.3
109 0.25
110 0.2
111 0.16
112 0.12
113 0.09
114 0.06
115 0.05
116 0.04
117 0.03
118 0.02
119 0.02
120 0.02
121 0.02
122 0.02
123 0.02
124 0.02
125 0.02
126 0.02
127 0.02
128 0.03
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.09
139 0.1
140 0.1
141 0.13
142 0.17
143 0.16
144 0.16
145 0.17
146 0.23
147 0.27
148 0.29
149 0.27
150 0.25
151 0.27
152 0.26
153 0.24
154 0.17
155 0.13
156 0.11
157 0.13
158 0.12
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.1
165 0.08
166 0.08
167 0.12
168 0.15
169 0.16
170 0.17
171 0.17
172 0.17
173 0.19
174 0.23
175 0.25
176 0.27
177 0.27
178 0.29
179 0.3
180 0.31
181 0.29
182 0.26
183 0.23
184 0.17
185 0.18
186 0.16
187 0.15
188 0.12
189 0.1
190 0.1
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.12
201 0.12
202 0.12
203 0.13
204 0.12
205 0.13
206 0.14
207 0.13
208 0.09
209 0.11
210 0.1
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.1
225 0.15
226 0.15
227 0.14
228 0.14
229 0.14
230 0.14
231 0.13
232 0.12
233 0.09
234 0.13
235 0.14
236 0.15
237 0.15
238 0.14
239 0.14
240 0.16
241 0.14
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.12
247 0.13
248 0.12
249 0.12
250 0.11
251 0.11
252 0.1
253 0.09
254 0.07
255 0.06
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.03
260 0.03
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.06
265 0.07
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.1
270 0.17
271 0.22
272 0.25
273 0.28
274 0.3
275 0.32
276 0.32
277 0.32
278 0.26
279 0.23
280 0.2
281 0.21
282 0.19
283 0.16
284 0.16
285 0.15
286 0.17
287 0.19
288 0.2
289 0.22
290 0.22
291 0.22
292 0.23
293 0.22
294 0.19
295 0.17
296 0.16
297 0.1
298 0.14
299 0.14
300 0.14
301 0.15
302 0.15
303 0.22
304 0.23
305 0.24
306 0.21
307 0.21
308 0.21
309 0.25
310 0.29
311 0.27
312 0.24
313 0.23
314 0.21
315 0.21
316 0.2
317 0.18
318 0.14
319 0.1
320 0.1
321 0.11
322 0.13
323 0.13
324 0.15
325 0.21
326 0.29
327 0.35
328 0.41
329 0.44
330 0.45
331 0.47
332 0.46
333 0.42
334 0.38
335 0.32
336 0.27
337 0.22
338 0.19
339 0.17
340 0.15
341 0.1
342 0.07
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.07
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.1
353 0.11
354 0.11
355 0.11
356 0.12
357 0.17
358 0.21
359 0.22
360 0.25
361 0.26
362 0.27
363 0.27
364 0.26
365 0.19
366 0.15
367 0.15
368 0.13
369 0.12
370 0.13
371 0.16
372 0.17
373 0.16
374 0.16
375 0.15
376 0.16
377 0.21
378 0.2
379 0.24
380 0.26
381 0.28
382 0.28
383 0.29
384 0.28
385 0.23
386 0.24
387 0.24
388 0.3
389 0.36
390 0.41
391 0.49
392 0.51
393 0.52
394 0.53
395 0.5
396 0.44
397 0.37
398 0.34
399 0.29
400 0.27
401 0.25
402 0.24
403 0.2
404 0.21
405 0.2
406 0.18
407 0.14
408 0.16
409 0.2
410 0.19
411 0.19
412 0.14
413 0.15
414 0.14
415 0.15
416 0.14
417 0.12
418 0.11
419 0.14
420 0.14
421 0.14
422 0.14
423 0.14
424 0.11
425 0.09
426 0.1
427 0.08
428 0.1
429 0.15
430 0.21
431 0.27
432 0.33
433 0.43
434 0.5
435 0.57
436 0.65
437 0.7
438 0.76
439 0.8
440 0.81
441 0.81
442 0.82
443 0.82
444 0.79
445 0.79
446 0.79
447 0.78
448 0.8
449 0.8