Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9W040

Protein Details
Accession A0A4P9W040    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-115PVKDPKAAKRAAKRERKKGKKGSGGERSSSBasic
316-335ASASGKKSNKGKNPPPNPYPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-124KDPKAAKRAAKRERKKGKKGSGGERSSSRKEKAQNRA
164-170KKARKAK
200-207GKNKPEAK
319-327SGKKSNKGK
Subcellular Location(s) mito 9, cyto 7.5, cyto_nucl 7.5, nucl 6.5, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015965  tRNA_lig_PDEase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003972  F:RNA ligase (ATP) activity  
GO:0006388  P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08302  tRNA_lig_CPD  
Amino Acid Sequences GERDNGVDPISLLDPVFAQSSKETILFWEEMKSGGRLAAATGKGWHVTMSLAKKGVSEKNDALFEAHRRAIAERRTMPGEVPVPVPVKDPKAAKRAAKRERKKGKKGSGGERSSSRKEKAQNRAAARAASADDVTAQRAQPLADTSRLQQNPQHSPLSSPALGKKARKAKGQPPASDSAAPAQQQQQQPRSGSPSRPASGKNKPEAKKSAPDGPSASAASRQQKQQLELELAPVPSPGKNQNEAKKSAPGASYASAAASSEQQQQQQARSRSPPPSASGKTTNEVKNSVSDWPSPSAAAPSKQPQSSRSRSPSPPASASGKKSNKGKNPPPNPYPAPSTGPCQVPNPAPSTPLPTTEDPTAQIPIPLTLIAAVFDTRLIALEVGLPLPLGLESFNAHPHITLVTASDDVPPKTSNELFTAIDEGVKGKIKRVVFKEPVVVRGVMREFWG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.14
4 0.11
5 0.12
6 0.12
7 0.14
8 0.15
9 0.16
10 0.14
11 0.14
12 0.19
13 0.18
14 0.18
15 0.19
16 0.18
17 0.19
18 0.21
19 0.2
20 0.15
21 0.15
22 0.15
23 0.11
24 0.13
25 0.17
26 0.16
27 0.17
28 0.18
29 0.19
30 0.19
31 0.19
32 0.17
33 0.11
34 0.12
35 0.18
36 0.21
37 0.24
38 0.25
39 0.25
40 0.26
41 0.32
42 0.36
43 0.33
44 0.35
45 0.35
46 0.38
47 0.39
48 0.37
49 0.34
50 0.31
51 0.32
52 0.31
53 0.28
54 0.24
55 0.24
56 0.27
57 0.33
58 0.35
59 0.39
60 0.37
61 0.4
62 0.43
63 0.42
64 0.4
65 0.38
66 0.34
67 0.27
68 0.24
69 0.24
70 0.23
71 0.23
72 0.26
73 0.23
74 0.25
75 0.28
76 0.32
77 0.35
78 0.41
79 0.46
80 0.51
81 0.57
82 0.65
83 0.7
84 0.75
85 0.78
86 0.82
87 0.87
88 0.9
89 0.91
90 0.91
91 0.9
92 0.89
93 0.88
94 0.87
95 0.87
96 0.8
97 0.74
98 0.7
99 0.66
100 0.63
101 0.61
102 0.53
103 0.49
104 0.54
105 0.59
106 0.62
107 0.65
108 0.66
109 0.64
110 0.67
111 0.63
112 0.55
113 0.46
114 0.37
115 0.28
116 0.21
117 0.17
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.12
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.1
128 0.13
129 0.13
130 0.15
131 0.16
132 0.17
133 0.26
134 0.27
135 0.27
136 0.27
137 0.32
138 0.36
139 0.39
140 0.39
141 0.3
142 0.31
143 0.33
144 0.36
145 0.3
146 0.25
147 0.24
148 0.27
149 0.31
150 0.31
151 0.35
152 0.4
153 0.43
154 0.49
155 0.53
156 0.55
157 0.62
158 0.67
159 0.62
160 0.58
161 0.57
162 0.52
163 0.46
164 0.37
165 0.3
166 0.25
167 0.22
168 0.19
169 0.18
170 0.22
171 0.26
172 0.31
173 0.33
174 0.35
175 0.36
176 0.36
177 0.39
178 0.37
179 0.35
180 0.35
181 0.37
182 0.34
183 0.35
184 0.37
185 0.37
186 0.43
187 0.47
188 0.48
189 0.51
190 0.52
191 0.57
192 0.59
193 0.56
194 0.53
195 0.5
196 0.51
197 0.43
198 0.42
199 0.38
200 0.32
201 0.3
202 0.24
203 0.21
204 0.15
205 0.17
206 0.2
207 0.21
208 0.22
209 0.26
210 0.28
211 0.3
212 0.3
213 0.28
214 0.27
215 0.24
216 0.25
217 0.19
218 0.17
219 0.15
220 0.13
221 0.11
222 0.09
223 0.1
224 0.14
225 0.15
226 0.21
227 0.27
228 0.34
229 0.38
230 0.41
231 0.41
232 0.39
233 0.37
234 0.35
235 0.29
236 0.24
237 0.21
238 0.19
239 0.18
240 0.14
241 0.12
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.07
246 0.08
247 0.13
248 0.15
249 0.16
250 0.2
251 0.21
252 0.26
253 0.33
254 0.34
255 0.32
256 0.36
257 0.4
258 0.41
259 0.43
260 0.39
261 0.35
262 0.4
263 0.39
264 0.39
265 0.4
266 0.38
267 0.38
268 0.42
269 0.42
270 0.36
271 0.35
272 0.31
273 0.26
274 0.26
275 0.26
276 0.21
277 0.2
278 0.2
279 0.21
280 0.21
281 0.19
282 0.17
283 0.18
284 0.18
285 0.18
286 0.19
287 0.23
288 0.27
289 0.3
290 0.31
291 0.33
292 0.4
293 0.45
294 0.5
295 0.51
296 0.53
297 0.54
298 0.59
299 0.6
300 0.57
301 0.53
302 0.48
303 0.48
304 0.45
305 0.47
306 0.51
307 0.48
308 0.48
309 0.54
310 0.59
311 0.61
312 0.67
313 0.72
314 0.73
315 0.77
316 0.81
317 0.77
318 0.77
319 0.71
320 0.64
321 0.6
322 0.53
323 0.49
324 0.42
325 0.42
326 0.38
327 0.37
328 0.35
329 0.32
330 0.32
331 0.3
332 0.32
333 0.32
334 0.27
335 0.27
336 0.26
337 0.32
338 0.29
339 0.28
340 0.3
341 0.28
342 0.31
343 0.3
344 0.31
345 0.25
346 0.26
347 0.24
348 0.19
349 0.19
350 0.16
351 0.14
352 0.13
353 0.11
354 0.1
355 0.08
356 0.08
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.05
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.04
377 0.04
378 0.05
379 0.07
380 0.08
381 0.11
382 0.13
383 0.13
384 0.13
385 0.14
386 0.13
387 0.13
388 0.12
389 0.1
390 0.11
391 0.12
392 0.12
393 0.16
394 0.19
395 0.19
396 0.21
397 0.21
398 0.21
399 0.26
400 0.27
401 0.25
402 0.25
403 0.28
404 0.26
405 0.26
406 0.27
407 0.21
408 0.2
409 0.17
410 0.15
411 0.15
412 0.21
413 0.2
414 0.22
415 0.28
416 0.32
417 0.4
418 0.46
419 0.53
420 0.52
421 0.56
422 0.61
423 0.58
424 0.57
425 0.52
426 0.47
427 0.37
428 0.37
429 0.35