Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1DQ53

Protein Details
Accession A0A0D1DQ53    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
131-170TSKPSSLKAKKPSKQKADGTETKPKPKKPKKKSTTGAATTHydrophilic
187-209ASTAPKPKKTSKNKASDKDKSKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-162LKAKKPSKQKADGTETKPKPKKPKKK
192-201KPKKTSKNKA
233-265KESKPKAKKAGGSKVGTKAGSKARSSTARSASR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
KEGG uma:UMAG_11192  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MSSSQQTQGDGSMQGSHLPNMSGESAIPASFFDIPIEYESTDGNINMDFASISGFPATDTPMPNAPDFDALTVQIAANMPPLDSFSTYPMASPSQMAQAPQPNPTNMAIKMELDDLSSIAPSPSIASEVSTSKPSSLKAKKPSKQKADGTETKPKPKKPKKKSTTGAATTDATAFSSSAQPSNVTAASTAPKPKKTSKNKASDKDKSKEEAHQQPTSTAASPAPFATPVSSSKESKPKAKKAGGSKVGTKAGSKARSSTARSASRKSSMGRDATTPAASRVDSQRPNDEANDDDEPASNVQAPPPEEDEEAEDEEADADDGVEELGRDHFSTQEAIYAAQQRNMGLLSMVMDEDQLDRHMASRRGALNKTNVRKLVNHVLSQSVSQHVAMVVSGVAKIFVGEIIETAREIQSIRGEHGPLRPNHLREAHRQYYLKRERPGHYPPGTNTGHPGVGKRRRLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.2
4 0.18
5 0.18
6 0.17
7 0.17
8 0.18
9 0.13
10 0.12
11 0.14
12 0.14
13 0.13
14 0.13
15 0.1
16 0.12
17 0.12
18 0.13
19 0.1
20 0.1
21 0.12
22 0.14
23 0.16
24 0.13
25 0.13
26 0.13
27 0.14
28 0.14
29 0.13
30 0.11
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.09
35 0.07
36 0.06
37 0.08
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.12
45 0.14
46 0.15
47 0.18
48 0.22
49 0.25
50 0.25
51 0.26
52 0.23
53 0.22
54 0.21
55 0.19
56 0.15
57 0.13
58 0.14
59 0.13
60 0.12
61 0.11
62 0.11
63 0.09
64 0.11
65 0.11
66 0.1
67 0.09
68 0.11
69 0.11
70 0.13
71 0.14
72 0.13
73 0.16
74 0.16
75 0.17
76 0.17
77 0.17
78 0.16
79 0.16
80 0.14
81 0.16
82 0.17
83 0.18
84 0.2
85 0.26
86 0.27
87 0.32
88 0.34
89 0.29
90 0.31
91 0.32
92 0.32
93 0.25
94 0.27
95 0.22
96 0.2
97 0.2
98 0.19
99 0.17
100 0.13
101 0.13
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.09
115 0.11
116 0.13
117 0.15
118 0.15
119 0.15
120 0.17
121 0.18
122 0.26
123 0.32
124 0.39
125 0.47
126 0.57
127 0.62
128 0.71
129 0.8
130 0.79
131 0.8
132 0.78
133 0.77
134 0.76
135 0.78
136 0.74
137 0.74
138 0.69
139 0.71
140 0.7
141 0.68
142 0.7
143 0.73
144 0.77
145 0.78
146 0.85
147 0.83
148 0.87
149 0.88
150 0.86
151 0.85
152 0.79
153 0.71
154 0.62
155 0.54
156 0.44
157 0.37
158 0.27
159 0.17
160 0.12
161 0.09
162 0.07
163 0.09
164 0.09
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.13
170 0.12
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.11
175 0.13
176 0.19
177 0.21
178 0.24
179 0.29
180 0.37
181 0.46
182 0.55
183 0.64
184 0.67
185 0.74
186 0.8
187 0.85
188 0.86
189 0.85
190 0.82
191 0.76
192 0.7
193 0.64
194 0.57
195 0.53
196 0.52
197 0.52
198 0.49
199 0.46
200 0.43
201 0.39
202 0.38
203 0.34
204 0.26
205 0.18
206 0.13
207 0.1
208 0.11
209 0.11
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.09
216 0.15
217 0.17
218 0.19
219 0.23
220 0.31
221 0.33
222 0.4
223 0.47
224 0.49
225 0.55
226 0.58
227 0.6
228 0.6
229 0.67
230 0.66
231 0.6
232 0.56
233 0.51
234 0.49
235 0.44
236 0.36
237 0.3
238 0.29
239 0.31
240 0.28
241 0.25
242 0.27
243 0.32
244 0.35
245 0.37
246 0.38
247 0.43
248 0.45
249 0.47
250 0.46
251 0.45
252 0.44
253 0.4
254 0.37
255 0.34
256 0.34
257 0.32
258 0.3
259 0.28
260 0.27
261 0.26
262 0.21
263 0.17
264 0.15
265 0.14
266 0.14
267 0.17
268 0.23
269 0.27
270 0.28
271 0.33
272 0.34
273 0.35
274 0.34
275 0.3
276 0.24
277 0.23
278 0.23
279 0.18
280 0.16
281 0.14
282 0.15
283 0.13
284 0.13
285 0.1
286 0.09
287 0.09
288 0.12
289 0.13
290 0.14
291 0.17
292 0.18
293 0.17
294 0.17
295 0.18
296 0.17
297 0.17
298 0.15
299 0.12
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.07
304 0.05
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.04
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.08
318 0.1
319 0.09
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.14
324 0.2
325 0.2
326 0.22
327 0.22
328 0.2
329 0.2
330 0.2
331 0.17
332 0.1
333 0.09
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.1
346 0.16
347 0.19
348 0.2
349 0.25
350 0.3
351 0.36
352 0.39
353 0.41
354 0.45
355 0.51
356 0.57
357 0.57
358 0.55
359 0.52
360 0.51
361 0.54
362 0.55
363 0.5
364 0.46
365 0.4
366 0.4
367 0.38
368 0.36
369 0.31
370 0.23
371 0.19
372 0.16
373 0.15
374 0.12
375 0.12
376 0.1
377 0.09
378 0.07
379 0.06
380 0.06
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.09
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.11
398 0.16
399 0.17
400 0.2
401 0.23
402 0.24
403 0.27
404 0.34
405 0.39
406 0.35
407 0.43
408 0.47
409 0.45
410 0.51
411 0.56
412 0.54
413 0.55
414 0.64
415 0.61
416 0.62
417 0.63
418 0.6
419 0.63
420 0.69
421 0.67
422 0.66
423 0.68
424 0.64
425 0.68
426 0.72
427 0.71
428 0.67
429 0.66
430 0.61
431 0.62
432 0.6
433 0.53
434 0.5
435 0.43
436 0.41
437 0.35
438 0.38
439 0.4
440 0.47