Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9VZ88

Protein Details
Accession A0A4P9VZ88    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-150VEEAPKKKQKAAKKKKKVAAEKPEAVBasic
411-436VQDGRLKQKLKSRVKKNKRIATFASAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
129-146PKKKQKAAKKKKKVAAEK
417-429KQKLKSRVKKNKR
Subcellular Location(s) mito 15, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17946  DEADc_DDX24  
Amino Acid Sequences MARARVVAEAGTGRVSSLPNQKLTPVDEHPPSLEEIDGVDVEYVYGPGGGKTIKFKTVDQPGKKPAPRKPFDLSQMRFIDVDDFVEGQTAAKGIPGPGGAGVEDEGVGAGENDGVDAEEEVDAEVEEAPKKKQKAAKKKKKVAAEKPEAVKNAEVVDLHEGGFLVRALRHPHVRGSGTSLTAHRGIVTSDLDMSAWETLSLAPEIISGLRSQGFATPTEIQLRSLPVALAGDRDLIGAAQTGSGKTLAFGLPILQALAVRPPATEDQGCTALILVPTRELAMQVTEHLVAIAKFMRVRIVSIVGGMSLQKQRRQIASKPDVIVATPGRLWELMQEDETLLPRIRRTRFLAIDEADRMLESGHFKDLDHILNAISLFRKNTTDGDEKDSTEDASPDAAVQTRRTFIFSATLVQDGRLKQKLKSRVKKNKRIATFASAPARACEWHRCC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.18
4 0.27
5 0.31
6 0.34
7 0.35
8 0.37
9 0.39
10 0.41
11 0.41
12 0.36
13 0.38
14 0.37
15 0.38
16 0.37
17 0.35
18 0.33
19 0.27
20 0.23
21 0.16
22 0.13
23 0.13
24 0.12
25 0.11
26 0.09
27 0.08
28 0.08
29 0.08
30 0.07
31 0.05
32 0.06
33 0.06
34 0.06
35 0.08
36 0.08
37 0.1
38 0.16
39 0.2
40 0.24
41 0.27
42 0.29
43 0.36
44 0.46
45 0.55
46 0.55
47 0.6
48 0.63
49 0.71
50 0.74
51 0.73
52 0.71
53 0.72
54 0.69
55 0.68
56 0.66
57 0.64
58 0.68
59 0.7
60 0.64
61 0.62
62 0.6
63 0.55
64 0.48
65 0.4
66 0.34
67 0.24
68 0.22
69 0.14
70 0.12
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.08
75 0.08
76 0.07
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.06
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.03
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.05
109 0.04
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.08
114 0.1
115 0.13
116 0.19
117 0.2
118 0.26
119 0.32
120 0.42
121 0.51
122 0.61
123 0.7
124 0.76
125 0.84
126 0.85
127 0.88
128 0.88
129 0.87
130 0.87
131 0.84
132 0.8
133 0.74
134 0.72
135 0.63
136 0.54
137 0.44
138 0.34
139 0.25
140 0.19
141 0.15
142 0.12
143 0.13
144 0.12
145 0.11
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.08
154 0.12
155 0.15
156 0.19
157 0.2
158 0.23
159 0.26
160 0.27
161 0.26
162 0.28
163 0.27
164 0.24
165 0.24
166 0.22
167 0.2
168 0.19
169 0.19
170 0.13
171 0.11
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.08
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.05
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.04
193 0.05
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.08
200 0.09
201 0.1
202 0.13
203 0.13
204 0.14
205 0.17
206 0.17
207 0.15
208 0.15
209 0.16
210 0.13
211 0.12
212 0.11
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.08
249 0.09
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.13
254 0.14
255 0.14
256 0.12
257 0.11
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.07
280 0.08
281 0.08
282 0.11
283 0.11
284 0.12
285 0.12
286 0.13
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.1
294 0.14
295 0.17
296 0.2
297 0.25
298 0.29
299 0.35
300 0.41
301 0.43
302 0.49
303 0.53
304 0.55
305 0.52
306 0.5
307 0.43
308 0.38
309 0.35
310 0.25
311 0.2
312 0.15
313 0.13
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.11
318 0.14
319 0.13
320 0.13
321 0.14
322 0.14
323 0.14
324 0.16
325 0.15
326 0.13
327 0.13
328 0.17
329 0.24
330 0.26
331 0.32
332 0.37
333 0.43
334 0.46
335 0.49
336 0.51
337 0.45
338 0.46
339 0.41
340 0.36
341 0.26
342 0.22
343 0.18
344 0.12
345 0.12
346 0.11
347 0.12
348 0.14
349 0.14
350 0.14
351 0.19
352 0.21
353 0.22
354 0.2
355 0.19
356 0.16
357 0.17
358 0.17
359 0.15
360 0.13
361 0.13
362 0.13
363 0.15
364 0.17
365 0.17
366 0.2
367 0.25
368 0.31
369 0.32
370 0.38
371 0.39
372 0.38
373 0.38
374 0.36
375 0.31
376 0.24
377 0.22
378 0.15
379 0.14
380 0.13
381 0.1
382 0.11
383 0.13
384 0.14
385 0.17
386 0.19
387 0.22
388 0.22
389 0.25
390 0.24
391 0.22
392 0.25
393 0.23
394 0.25
395 0.23
396 0.26
397 0.23
398 0.24
399 0.27
400 0.24
401 0.31
402 0.33
403 0.34
404 0.36
405 0.44
406 0.54
407 0.6
408 0.68
409 0.72
410 0.77
411 0.86
412 0.92
413 0.94
414 0.93
415 0.89
416 0.87
417 0.82
418 0.79
419 0.74
420 0.71
421 0.68
422 0.61
423 0.54
424 0.48
425 0.43
426 0.37
427 0.35