FuNGI

A0A4V1IRV0

Protein Details

Accession

A0A4V1IRV0

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-23	MSNLFRKQKQKANAPLRRKPATP	Hydrophilic
40-70	ASTDTIVFRRNRKDKEKKEKSASSKQTTPRS	Hydrophilic
328-347	MEQSRKGRARRDRKGKAGAD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
49-59	RNRKDKEKKEK
332-346	RKGRARRDRKGKAGA

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012890 GCFC2-like
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome

Amino Acid Sequences

MSNLFRKQKQKANAPLRRKPATPIDSDPDSDDNDTNDATASTDTIVFRRNRKDKEKKEKSASSKQTTPRSDQPDETVSVEVSDDHTPVPDTPRKTVAATKKPRLQKAVANTLSFEDEEEEEEVGKKVEGRMGEGRDGGASATSQFKIRKTAASRRMAKSKLARDLLPNSATPAAAPEASSAPSYSRESLEALRNSQLTRPSPQATPAPLQEVEADIPDASAIHAARKLREARRAAALSGEAPTGADFVKLDGKDEESKPARYAESSLVTEDQEADGPEVFEDYEGDRIVFGSRALREVEERHKTEMEGNIIEAQEEEIEDEEVQRWEMEQSRKGRARRDRKGKAGADAEPTPVRKPIRIPAISPLPTFNDAHARLVATLQNLEIDVSSRTSELAQTRRDLEASVAKSAELEGESKLSSQRYNYFQDLRTFIGDFAAFLDAKVPELQALQDQYHSVLRERANAVGARRVELADDCFAEFTTFQLPLDPTAPSTHAALSQAHAARIQRATASNARRRLRIDAAAMRDEPEPSLGMSTDDDMDADEDTAWDDIK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.86
3	0.86
4	0.82
5	0.74
6	0.69
7	0.69
8	0.65
9	0.61
10	0.58
11	0.56
12	0.54
13	0.53
14	0.5
15	0.42
16	0.38
17	0.35
18	0.29
19	0.24
20	0.23
21	0.21
22	0.18
23	0.16
24	0.13
25	0.11
26	0.1
27	0.09
28	0.08
29	0.11
30	0.12
31	0.13
32	0.2
33	0.24
34	0.31
35	0.41
36	0.5
37	0.56
38	0.67
39	0.76
40	0.8
41	0.87
42	0.91
43	0.91
44	0.91
45	0.92
46	0.9
47	0.9
48	0.88
49	0.85
50	0.82
51	0.8
52	0.8
53	0.75
54	0.73
55	0.71
56	0.69
57	0.66
58	0.6
59	0.57
60	0.51
61	0.48
62	0.43
63	0.35
64	0.26
65	0.22
66	0.2
67	0.15
68	0.14
69	0.12
70	0.11
71	0.1
72	0.11
73	0.12
74	0.13
75	0.2
76	0.24
77	0.26
78	0.29
79	0.33
80	0.34
81	0.36
82	0.42
83	0.45
84	0.5
85	0.56
86	0.62
87	0.66
88	0.72
89	0.76
90	0.74
91	0.68
92	0.64
93	0.63
94	0.65
95	0.61
96	0.54
97	0.48
98	0.43
99	0.4
100	0.33
101	0.24
102	0.15
103	0.12
104	0.13
105	0.13
106	0.12
107	0.1
108	0.11
109	0.11
110	0.1
111	0.09
112	0.09
113	0.09
114	0.12
115	0.11
116	0.15
117	0.21
118	0.23
119	0.25
120	0.24
121	0.23
122	0.2
123	0.2
124	0.15
125	0.1
126	0.07
127	0.07
128	0.09
129	0.1
130	0.14
131	0.16
132	0.17
133	0.23
134	0.24
135	0.31
136	0.35
137	0.45
138	0.5
139	0.58
140	0.65
141	0.64
142	0.71
143	0.66
144	0.65
145	0.64
146	0.62
147	0.61
148	0.55
149	0.51
150	0.48
151	0.5
152	0.48
153	0.41
154	0.34
155	0.27
156	0.25
157	0.23
158	0.18
159	0.15
160	0.12
161	0.1
162	0.1
163	0.09
164	0.09
165	0.1
166	0.11
167	0.09
168	0.09
169	0.12
170	0.14
171	0.14
172	0.14
173	0.14
174	0.16
175	0.19
176	0.25
177	0.24
178	0.24
179	0.24
180	0.25
181	0.24
182	0.25
183	0.27
184	0.23
185	0.24
186	0.27
187	0.27
188	0.27
189	0.29
190	0.3
191	0.28
192	0.28
193	0.26
194	0.25
195	0.22
196	0.22
197	0.19
198	0.17
199	0.14
200	0.11
201	0.11
202	0.07
203	0.06
204	0.06
205	0.05
206	0.04
207	0.06
208	0.05
209	0.06
210	0.09
211	0.1
212	0.11
213	0.16
214	0.23
215	0.26
216	0.34
217	0.36
218	0.35
219	0.41
220	0.41
221	0.36
222	0.3
223	0.26
224	0.19
225	0.17
226	0.14
227	0.07
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.05
232	0.05
233	0.04
234	0.05
235	0.09
236	0.09
237	0.11
238	0.1
239	0.13
240	0.17
241	0.18
242	0.24
243	0.22
244	0.23
245	0.23
246	0.24
247	0.22
248	0.18
249	0.2
250	0.16
251	0.16
252	0.16
253	0.15
254	0.15
255	0.14
256	0.14
257	0.12
258	0.09
259	0.07
260	0.06
261	0.06
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.07
279	0.08
280	0.09
281	0.1
282	0.1
283	0.11
284	0.15
285	0.22
286	0.26
287	0.27
288	0.28
289	0.28
290	0.28
291	0.3
292	0.29
293	0.24
294	0.17
295	0.16
296	0.16
297	0.15
298	0.15
299	0.11
300	0.09
301	0.06
302	0.06
303	0.05
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.05
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.07
314	0.13
315	0.16
316	0.21
317	0.25
318	0.34
319	0.4
320	0.43
321	0.5
322	0.55
323	0.62
324	0.67
325	0.74
326	0.73
327	0.75
328	0.82
329	0.75
330	0.71
331	0.64
332	0.56
333	0.49
334	0.42
335	0.37
336	0.3
337	0.29
338	0.24
339	0.24
340	0.23
341	0.2
342	0.22
343	0.26
344	0.34
345	0.34
346	0.34
347	0.36
348	0.43
349	0.43
350	0.4
351	0.35
352	0.29
353	0.3
354	0.29
355	0.24
356	0.23
357	0.22
358	0.23
359	0.22
360	0.19
361	0.17
362	0.18
363	0.18
364	0.12
365	0.11
366	0.09
367	0.09
368	0.09
369	0.09
370	0.07
371	0.07
372	0.06
373	0.07
374	0.08
375	0.07
376	0.08
377	0.08
378	0.12
379	0.16
380	0.21
381	0.22
382	0.24
383	0.27
384	0.28
385	0.27
386	0.24
387	0.22
388	0.23
389	0.23
390	0.22
391	0.2
392	0.19
393	0.18
394	0.18
395	0.16
396	0.1
397	0.09
398	0.07
399	0.09
400	0.09
401	0.1
402	0.12
403	0.13
404	0.14
405	0.16
406	0.21
407	0.25
408	0.3
409	0.35
410	0.37
411	0.39
412	0.43
413	0.42
414	0.38
415	0.35
416	0.31
417	0.26
418	0.23
419	0.19
420	0.14
421	0.13
422	0.13
423	0.1
424	0.09
425	0.12
426	0.1
427	0.11
428	0.12
429	0.11
430	0.09
431	0.1
432	0.1
433	0.11
434	0.14
435	0.13
436	0.14
437	0.14
438	0.16
439	0.18
440	0.19
441	0.17
442	0.21
443	0.21
444	0.26
445	0.27
446	0.27
447	0.28
448	0.3
449	0.3
450	0.31
451	0.3
452	0.26
453	0.25
454	0.24
455	0.21
456	0.2
457	0.21
458	0.17
459	0.17
460	0.16
461	0.15
462	0.15
463	0.15
464	0.13
465	0.11
466	0.12
467	0.11
468	0.1
469	0.14
470	0.14
471	0.15
472	0.17
473	0.16
474	0.15
475	0.17
476	0.19
477	0.16
478	0.17
479	0.16
480	0.16
481	0.18
482	0.17
483	0.16
484	0.22
485	0.22
486	0.22
487	0.23
488	0.23
489	0.26
490	0.27
491	0.27
492	0.23
493	0.23
494	0.29
495	0.34
496	0.43
497	0.46
498	0.54
499	0.57
500	0.58
501	0.59
502	0.6
503	0.58
504	0.54
505	0.54
506	0.52
507	0.54
508	0.54
509	0.51
510	0.46
511	0.4
512	0.35
513	0.28
514	0.22
515	0.17
516	0.13
517	0.14
518	0.12
519	0.13
520	0.13
521	0.14
522	0.14
523	0.13
524	0.12
525	0.11
526	0.12
527	0.11
528	0.1
529	0.08
530	0.07
531	0.09

A0A4V1IRV0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer