Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9WKL8

Protein Details
Accession A0A4P9WKL8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
247-266KTKHTDRWLMHRKKEVRLRLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
165-173GAAPRRRKK
Subcellular Location(s) cyto 10, nucl 8, pero 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008851  TFIIF-alpha  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF05793  TFIIF_alpha  
Amino Acid Sequences MSWQGATANGHPGDHGTPPPPFPHQQLQQPPAAAPAPAPAKPQYLEFKLTSSATNLSHHIMKFSNPKLDVAALPRPLRMVRDIPPPSQAKLEYEAERAALVLDAKAADAAAEKRALMEKLDPGKIAPFGNAVKNRTNLFKKKTKSFYFGRDEEAEEEAKQAGKDGAAPRRRKKDPDRFPWLLTDAEGNNGHVGNVDGAQDSNYYLFVFSDDGFQVIPASKWYKFTPKLNYRTLTAEEADEQLKNVSKTKHTDRWLMHRKKEVRLRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.19
4 0.21
5 0.23
6 0.27
7 0.3
8 0.32
9 0.35
10 0.41
11 0.44
12 0.51
13 0.59
14 0.59
15 0.57
16 0.55
17 0.49
18 0.43
19 0.38
20 0.28
21 0.18
22 0.2
23 0.2
24 0.2
25 0.24
26 0.22
27 0.25
28 0.25
29 0.3
30 0.31
31 0.31
32 0.34
33 0.32
34 0.31
35 0.31
36 0.31
37 0.27
38 0.22
39 0.22
40 0.19
41 0.2
42 0.2
43 0.2
44 0.23
45 0.22
46 0.22
47 0.2
48 0.22
49 0.29
50 0.31
51 0.35
52 0.32
53 0.32
54 0.31
55 0.32
56 0.3
57 0.26
58 0.28
59 0.26
60 0.26
61 0.26
62 0.26
63 0.25
64 0.25
65 0.24
66 0.22
67 0.21
68 0.31
69 0.34
70 0.33
71 0.39
72 0.39
73 0.36
74 0.35
75 0.32
76 0.24
77 0.26
78 0.29
79 0.24
80 0.23
81 0.22
82 0.19
83 0.18
84 0.16
85 0.12
86 0.08
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.03
95 0.04
96 0.05
97 0.06
98 0.07
99 0.06
100 0.07
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.1
105 0.13
106 0.17
107 0.18
108 0.17
109 0.16
110 0.17
111 0.18
112 0.16
113 0.12
114 0.1
115 0.11
116 0.16
117 0.19
118 0.21
119 0.22
120 0.24
121 0.25
122 0.28
123 0.34
124 0.35
125 0.39
126 0.43
127 0.46
128 0.52
129 0.6
130 0.57
131 0.56
132 0.54
133 0.56
134 0.56
135 0.52
136 0.48
137 0.4
138 0.38
139 0.33
140 0.3
141 0.23
142 0.16
143 0.15
144 0.11
145 0.11
146 0.09
147 0.09
148 0.07
149 0.06
150 0.11
151 0.15
152 0.23
153 0.3
154 0.38
155 0.45
156 0.54
157 0.58
158 0.63
159 0.69
160 0.71
161 0.74
162 0.77
163 0.79
164 0.73
165 0.7
166 0.64
167 0.55
168 0.44
169 0.34
170 0.27
171 0.18
172 0.19
173 0.17
174 0.15
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.1
179 0.1
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.1
197 0.09
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.11
205 0.15
206 0.15
207 0.19
208 0.22
209 0.31
210 0.37
211 0.44
212 0.51
213 0.57
214 0.64
215 0.68
216 0.67
217 0.6
218 0.59
219 0.55
220 0.47
221 0.39
222 0.33
223 0.26
224 0.26
225 0.25
226 0.2
227 0.17
228 0.17
229 0.2
230 0.2
231 0.23
232 0.26
233 0.3
234 0.38
235 0.47
236 0.53
237 0.54
238 0.61
239 0.62
240 0.69
241 0.74
242 0.76
243 0.74
244 0.76
245 0.77
246 0.78