Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9WIM2

Protein Details
Accession A0A4P9WIM2    Localization Confidence Low Confidence Score 7.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
219-238HQGHSREREKREQERKELRLBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10, nucl 9.5, cyto 9.5, cysk 4, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005378  Vps35  
IPR042491  Vps35_C  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0030906  C:retromer, cargo-selective complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF03635  Vps35  
Amino Acid Sequences MPAGTGPTASGPGGGLGSVPHSPSAEQDQAKILDEALNVVKVQAFHFKRCLDHHKLMDALKHCSTMLAELRTSSLTPKNYYELYMAIFDELRHLTNYLYDAHMSNRHHLSDLYELVQYAGNIIPRLYLMITVGSVYMRSENKEEDVPPIKELMKDMLEMSRGVQHPTRGLFLRYYLSGMTRDYLPDGLVDGPHGTIHDSIQFILQNFIEMNKLWVRLQHQGHSREREKREQERKELRLLVGSNLVRLSQLEDLDLTMYKSLVLPSILEEIVSCKDIIAQEYLMEVIIQVFQDDFHLRSLDSFLSATAQLQRSVNVKQIVISLIDRFASYAARARDDADAVAKAKPISGIPDDVQLFDVFWGQITELVKARPEFTIQDVVALLLSLVNLSLNCYPEHLEYVDKVLGFAKERILEAQAAKAHELRNQQTTTLLLQLLLGPVSAYKANILTVLKFPSSITQTNGAGQSLSLAGNYADLLFLQPYSTRRQVAHAVASTALRAYSSSGFIISDADGVNAILGELCSIMVREQKDGGLFGPKPIPIPEDGAPRYAGRARVEELPLDWEDVVEEQNMVAKLVHLIRTTDGDTDREFMLLSTARKHFGEGGDIRIRFTLPPLVIASIKLARKYRARQEEYFADDDDSGPLFKDENPAPTNSAHIGHGLMTPPDMALRLFLMAAQAADEAGFEELSYEFFVQAFTIYEESINESKSQFAAITLIIGTLHPTTVFGHENYETLVSKAAVHCSRLLKRVDQCRAVTLVSHLFWTDEARTREEGKPAYRDGRRVLECLKKALKIADSVMDRVVNVELFVEILERYIWYFEMRNDQITVKYLTTMMDLIQTNLGSLNTTPGSHPDPHAPPHAFKAPGPLSPAGSSASLFDDSRTARRSTASPLASEDVLKRFRNVVAYVELKKEEERAEAKEAGVVPGMESGFGGDNGRWGDLGVRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.06
4 0.09
5 0.1
6 0.11
7 0.11
8 0.12
9 0.13
10 0.16
11 0.23
12 0.28
13 0.28
14 0.29
15 0.33
16 0.34
17 0.36
18 0.32
19 0.26
20 0.21
21 0.2
22 0.21
23 0.18
24 0.18
25 0.15
26 0.15
27 0.16
28 0.14
29 0.16
30 0.23
31 0.25
32 0.29
33 0.35
34 0.37
35 0.4
36 0.48
37 0.55
38 0.54
39 0.59
40 0.59
41 0.57
42 0.59
43 0.57
44 0.56
45 0.51
46 0.48
47 0.41
48 0.37
49 0.32
50 0.29
51 0.26
52 0.26
53 0.28
54 0.25
55 0.24
56 0.23
57 0.25
58 0.25
59 0.25
60 0.23
61 0.24
62 0.25
63 0.28
64 0.31
65 0.33
66 0.33
67 0.35
68 0.31
69 0.26
70 0.24
71 0.22
72 0.19
73 0.16
74 0.16
75 0.14
76 0.16
77 0.16
78 0.15
79 0.14
80 0.15
81 0.14
82 0.15
83 0.17
84 0.15
85 0.15
86 0.15
87 0.15
88 0.18
89 0.25
90 0.25
91 0.3
92 0.32
93 0.31
94 0.31
95 0.31
96 0.3
97 0.29
98 0.29
99 0.25
100 0.21
101 0.2
102 0.2
103 0.2
104 0.16
105 0.13
106 0.12
107 0.12
108 0.12
109 0.12
110 0.11
111 0.1
112 0.12
113 0.1
114 0.09
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.12
124 0.13
125 0.15
126 0.18
127 0.19
128 0.22
129 0.25
130 0.26
131 0.28
132 0.35
133 0.33
134 0.31
135 0.33
136 0.31
137 0.29
138 0.29
139 0.26
140 0.2
141 0.19
142 0.19
143 0.19
144 0.18
145 0.18
146 0.17
147 0.2
148 0.19
149 0.22
150 0.23
151 0.23
152 0.26
153 0.27
154 0.3
155 0.25
156 0.27
157 0.24
158 0.24
159 0.25
160 0.21
161 0.21
162 0.18
163 0.17
164 0.17
165 0.17
166 0.16
167 0.14
168 0.14
169 0.15
170 0.14
171 0.12
172 0.11
173 0.12
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.13
188 0.14
189 0.14
190 0.15
191 0.14
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.12
196 0.1
197 0.13
198 0.13
199 0.15
200 0.14
201 0.18
202 0.21
203 0.28
204 0.31
205 0.35
206 0.4
207 0.46
208 0.53
209 0.59
210 0.62
211 0.64
212 0.66
213 0.69
214 0.7
215 0.73
216 0.77
217 0.76
218 0.79
219 0.8
220 0.78
221 0.75
222 0.7
223 0.6
224 0.55
225 0.47
226 0.38
227 0.36
228 0.32
229 0.26
230 0.22
231 0.21
232 0.16
233 0.15
234 0.16
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.09
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.09
256 0.1
257 0.11
258 0.12
259 0.1
260 0.07
261 0.09
262 0.1
263 0.12
264 0.11
265 0.1
266 0.09
267 0.1
268 0.1
269 0.08
270 0.07
271 0.06
272 0.04
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.07
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.12
286 0.1
287 0.1
288 0.09
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.13
294 0.14
295 0.15
296 0.15
297 0.17
298 0.18
299 0.19
300 0.24
301 0.21
302 0.2
303 0.18
304 0.19
305 0.18
306 0.17
307 0.16
308 0.12
309 0.1
310 0.11
311 0.1
312 0.09
313 0.08
314 0.07
315 0.07
316 0.12
317 0.12
318 0.14
319 0.14
320 0.16
321 0.16
322 0.16
323 0.16
324 0.12
325 0.13
326 0.12
327 0.13
328 0.12
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.1
333 0.12
334 0.12
335 0.14
336 0.13
337 0.18
338 0.18
339 0.17
340 0.18
341 0.14
342 0.13
343 0.11
344 0.11
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.08
350 0.08
351 0.1
352 0.1
353 0.11
354 0.13
355 0.13
356 0.14
357 0.12
358 0.13
359 0.12
360 0.14
361 0.18
362 0.16
363 0.16
364 0.15
365 0.15
366 0.13
367 0.11
368 0.09
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.02
373 0.03
374 0.03
375 0.05
376 0.06
377 0.07
378 0.07
379 0.08
380 0.1
381 0.1
382 0.12
383 0.11
384 0.1
385 0.1
386 0.12
387 0.13
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.11
392 0.12
393 0.12
394 0.12
395 0.11
396 0.12
397 0.12
398 0.12
399 0.13
400 0.11
401 0.14
402 0.14
403 0.14
404 0.14
405 0.16
406 0.15
407 0.18
408 0.22
409 0.21
410 0.25
411 0.24
412 0.24
413 0.22
414 0.23
415 0.19
416 0.16
417 0.14
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.06
423 0.05
424 0.04
425 0.03
426 0.05
427 0.05
428 0.04
429 0.04
430 0.05
431 0.05
432 0.07
433 0.08
434 0.08
435 0.09
436 0.11
437 0.1
438 0.1
439 0.1
440 0.11
441 0.15
442 0.15
443 0.15
444 0.16
445 0.16
446 0.18
447 0.18
448 0.15
449 0.11
450 0.1
451 0.09
452 0.07
453 0.06
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.03
464 0.03
465 0.03
466 0.05
467 0.07
468 0.12
469 0.14
470 0.16
471 0.16
472 0.19
473 0.23
474 0.24
475 0.26
476 0.21
477 0.2
478 0.18
479 0.18
480 0.15
481 0.11
482 0.08
483 0.05
484 0.05
485 0.06
486 0.06
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.08
493 0.06
494 0.06
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.04
500 0.04
501 0.03
502 0.02
503 0.02
504 0.02
505 0.02
506 0.02
507 0.03
508 0.03
509 0.04
510 0.07
511 0.08
512 0.09
513 0.1
514 0.1
515 0.11
516 0.11
517 0.11
518 0.13
519 0.13
520 0.13
521 0.15
522 0.14
523 0.15
524 0.15
525 0.16
526 0.11
527 0.15
528 0.16
529 0.21
530 0.21
531 0.21
532 0.22
533 0.21
534 0.22
535 0.2
536 0.21
537 0.16
538 0.17
539 0.18
540 0.21
541 0.22
542 0.2
543 0.18
544 0.18
545 0.16
546 0.15
547 0.13
548 0.09
549 0.08
550 0.09
551 0.09
552 0.06
553 0.05
554 0.04
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.07
559 0.06
560 0.08
561 0.1
562 0.13
563 0.11
564 0.11
565 0.12
566 0.14
567 0.15
568 0.15
569 0.14
570 0.13
571 0.13
572 0.15
573 0.14
574 0.12
575 0.11
576 0.09
577 0.1
578 0.11
579 0.11
580 0.14
581 0.15
582 0.17
583 0.17
584 0.18
585 0.18
586 0.16
587 0.22
588 0.19
589 0.24
590 0.28
591 0.28
592 0.27
593 0.25
594 0.25
595 0.19
596 0.19
597 0.17
598 0.12
599 0.13
600 0.14
601 0.15
602 0.15
603 0.15
604 0.16
605 0.16
606 0.17
607 0.19
608 0.21
609 0.24
610 0.31
611 0.38
612 0.45
613 0.51
614 0.56
615 0.54
616 0.58
617 0.58
618 0.56
619 0.51
620 0.42
621 0.32
622 0.26
623 0.24
624 0.19
625 0.15
626 0.1
627 0.08
628 0.08
629 0.07
630 0.08
631 0.12
632 0.13
633 0.18
634 0.2
635 0.21
636 0.23
637 0.22
638 0.24
639 0.2
640 0.2
641 0.14
642 0.13
643 0.13
644 0.11
645 0.12
646 0.11
647 0.1
648 0.09
649 0.08
650 0.07
651 0.07
652 0.07
653 0.06
654 0.05
655 0.06
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.05
661 0.05
662 0.05
663 0.05
664 0.04
665 0.04
666 0.04
667 0.04
668 0.04
669 0.04
670 0.04
671 0.04
672 0.05
673 0.05
674 0.07
675 0.06
676 0.06
677 0.06
678 0.07
679 0.06
680 0.06
681 0.06
682 0.07
683 0.07
684 0.07
685 0.07
686 0.08
687 0.12
688 0.13
689 0.13
690 0.13
691 0.13
692 0.14
693 0.13
694 0.14
695 0.09
696 0.08
697 0.09
698 0.08
699 0.08
700 0.07
701 0.07
702 0.06
703 0.06
704 0.07
705 0.06
706 0.06
707 0.06
708 0.07
709 0.08
710 0.11
711 0.13
712 0.12
713 0.15
714 0.16
715 0.16
716 0.16
717 0.17
718 0.14
719 0.13
720 0.14
721 0.11
722 0.12
723 0.13
724 0.2
725 0.19
726 0.2
727 0.24
728 0.3
729 0.34
730 0.38
731 0.4
732 0.4
733 0.46
734 0.55
735 0.58
736 0.57
737 0.54
738 0.51
739 0.5
740 0.43
741 0.36
742 0.29
743 0.26
744 0.19
745 0.19
746 0.16
747 0.14
748 0.14
749 0.16
750 0.16
751 0.2
752 0.22
753 0.25
754 0.27
755 0.32
756 0.35
757 0.38
758 0.4
759 0.37
760 0.4
761 0.41
762 0.48
763 0.46
764 0.48
765 0.47
766 0.51
767 0.48
768 0.47
769 0.49
770 0.49
771 0.48
772 0.51
773 0.5
774 0.43
775 0.42
776 0.43
777 0.38
778 0.32
779 0.32
780 0.3
781 0.28
782 0.28
783 0.27
784 0.23
785 0.21
786 0.2
787 0.19
788 0.12
789 0.1
790 0.09
791 0.07
792 0.06
793 0.07
794 0.06
795 0.05
796 0.05
797 0.06
798 0.06
799 0.06
800 0.07
801 0.08
802 0.09
803 0.11
804 0.13
805 0.23
806 0.24
807 0.26
808 0.27
809 0.28
810 0.28
811 0.29
812 0.29
813 0.2
814 0.2
815 0.18
816 0.17
817 0.17
818 0.15
819 0.12
820 0.15
821 0.14
822 0.15
823 0.16
824 0.15
825 0.14
826 0.15
827 0.14
828 0.1
829 0.1
830 0.13
831 0.12
832 0.13
833 0.13
834 0.17
835 0.21
836 0.23
837 0.25
838 0.29
839 0.32
840 0.36
841 0.43
842 0.43
843 0.4
844 0.44
845 0.49
846 0.43
847 0.38
848 0.44
849 0.39
850 0.38
851 0.41
852 0.36
853 0.32
854 0.31
855 0.32
856 0.24
857 0.21
858 0.19
859 0.15
860 0.16
861 0.16
862 0.15
863 0.14
864 0.18
865 0.2
866 0.26
867 0.28
868 0.27
869 0.26
870 0.29
871 0.31
872 0.33
873 0.4
874 0.36
875 0.34
876 0.36
877 0.38
878 0.35
879 0.35
880 0.31
881 0.29
882 0.33
883 0.33
884 0.31
885 0.31
886 0.33
887 0.36
888 0.34
889 0.31
890 0.31
891 0.36
892 0.38
893 0.39
894 0.38
895 0.35
896 0.34
897 0.34
898 0.29
899 0.3
900 0.31
901 0.31
902 0.35
903 0.35
904 0.34
905 0.34
906 0.33
907 0.27
908 0.25
909 0.21
910 0.15
911 0.17
912 0.16
913 0.12
914 0.11
915 0.11
916 0.11
917 0.12
918 0.13
919 0.09
920 0.13
921 0.15
922 0.15
923 0.14
924 0.13