Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9W4B4

Protein Details
Accession A0A4P9W4B4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-107LPMKAGTERERRRRRRENRRKGLELLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-114TERERRRRRRENRRKGLELLRKGEKAK
Subcellular Location(s) mito 11, cyto 10, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR044752  PIN-like_EXO1  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR019974  XPG_CS  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0035312  F:5'-3' DNA exonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
PF00752  XPG_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00842  XPG_2  
CDD cd09857  PIN_EXO1  
Amino Acid Sequences MGIQGLIPYLKSIHREVHIRNYAGCTLAVDSYVWLHKGAFSCAYELCQGLDTDKYVNFCMRKVKLLQDNGIRPLMVFDGGPLPMKAGTERERRRRRRENRRKGLELLRKGEKAKATDYFQKSVDVTPRMAHKLIQALKQANVDFVVAPYEADAQLAYLERSGAVAGVITEDSDLLVFGCKKVGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.33
3 0.37
4 0.46
5 0.5
6 0.48
7 0.46
8 0.45
9 0.41
10 0.36
11 0.31
12 0.22
13 0.16
14 0.15
15 0.14
16 0.1
17 0.09
18 0.1
19 0.12
20 0.11
21 0.1
22 0.1
23 0.12
24 0.13
25 0.15
26 0.16
27 0.15
28 0.17
29 0.16
30 0.18
31 0.16
32 0.15
33 0.13
34 0.11
35 0.11
36 0.1
37 0.11
38 0.1
39 0.11
40 0.12
41 0.13
42 0.13
43 0.17
44 0.17
45 0.18
46 0.25
47 0.24
48 0.27
49 0.28
50 0.34
51 0.37
52 0.4
53 0.43
54 0.42
55 0.43
56 0.42
57 0.4
58 0.33
59 0.25
60 0.22
61 0.17
62 0.11
63 0.08
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.06
71 0.07
72 0.07
73 0.1
74 0.15
75 0.24
76 0.32
77 0.42
78 0.53
79 0.61
80 0.71
81 0.78
82 0.83
83 0.85
84 0.89
85 0.9
86 0.91
87 0.91
88 0.85
89 0.8
90 0.79
91 0.76
92 0.7
93 0.64
94 0.58
95 0.52
96 0.48
97 0.46
98 0.39
99 0.33
100 0.3
101 0.29
102 0.28
103 0.35
104 0.37
105 0.36
106 0.34
107 0.33
108 0.31
109 0.29
110 0.31
111 0.24
112 0.21
113 0.21
114 0.25
115 0.26
116 0.26
117 0.24
118 0.2
119 0.26
120 0.29
121 0.32
122 0.33
123 0.32
124 0.34
125 0.37
126 0.35
127 0.27
128 0.24
129 0.2
130 0.14
131 0.12
132 0.12
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.06
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.09
163 0.09
164 0.1