Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9WHD5

Protein Details
Accession A0A4P9WHD5    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MDPPKKVEAERRRSRKRSSSISSGSHydrophilic
50-76QSDSPPRQQHQRGRCSQQKRRAVYSRGHydrophilic
78-135SSSSPSRRSNSGSPKRRRREMHILPQKPRETSDSRSPKRLRSSSRKRQRRYPSSDSISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-17EAERRRSRKR
83-127SRRSNSGSPKRRRREMHILPQKPRETSDSRSPKRLRSSSRKRQRR
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MDPPKKVEAERRRSRKRSSSISSGSESDEAYSFSQEKSHAGAPSSSRAQQSDSPPRQQHQRGRCSQQKRRAVYSRGSSSSSPSRRSNSGSPKRRRREMHILPQKPRETSDSRSPKRLRSSSRKRQRRYPSSDSISSSTDRSQQKLNILHRGRSGSRHWSPRSNRPADLPFAGGSIAYGGPEERPSHPGWARGKPKLTHGFGHWGSPPRNSGMRMPPPPPSKTIMISRLDPLATIADVRFALKPFGPVDEIRLPKNRGIAFVDFADPSFARRVVEAEPPLMIFGRDVRISYAEPLLHRHSWKGVEADAPKMGFGHRASTNYTGPQDASAPQHSQRLEPISKTLVLAGLDHMNTEADIRFALQHYGSVVQIRLNRQRAIAFIDMADIPTATRVVEAAHPLIVSGRNVGVNYAKRFPCRKSESPPDSDRAMRTDHHDPDDLYYKTSWESDEQDMFLERGARFGSSSIGQRSKSPMDVPSHVLLLGNLHPSTLEHHIQESLKEFGDVQMIIQGRDVTARFAGRSSVRDASTLVESAAASVLPPSAEPQQPFPQNPLAPHRTRDADLQDPPAIDDPSLSADSRAAVLFAREFFCSLGLVSMVEPIDKTQPKWDAGPLTDYPI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.89
3 0.87
4 0.87
5 0.84
6 0.83
7 0.79
8 0.76
9 0.7
10 0.61
11 0.55
12 0.46
13 0.38
14 0.29
15 0.23
16 0.19
17 0.17
18 0.18
19 0.17
20 0.16
21 0.18
22 0.17
23 0.18
24 0.21
25 0.24
26 0.23
27 0.24
28 0.28
29 0.28
30 0.34
31 0.37
32 0.37
33 0.35
34 0.34
35 0.36
36 0.38
37 0.45
38 0.5
39 0.52
40 0.58
41 0.6
42 0.64
43 0.7
44 0.73
45 0.73
46 0.72
47 0.75
48 0.75
49 0.79
50 0.84
51 0.85
52 0.86
53 0.86
54 0.86
55 0.81
56 0.82
57 0.81
58 0.78
59 0.75
60 0.75
61 0.72
62 0.66
63 0.63
64 0.54
65 0.51
66 0.55
67 0.53
68 0.49
69 0.47
70 0.49
71 0.49
72 0.55
73 0.58
74 0.59
75 0.64
76 0.69
77 0.74
78 0.8
79 0.85
80 0.88
81 0.85
82 0.83
83 0.83
84 0.83
85 0.84
86 0.84
87 0.83
88 0.81
89 0.84
90 0.79
91 0.69
92 0.61
93 0.56
94 0.51
95 0.49
96 0.52
97 0.54
98 0.55
99 0.63
100 0.65
101 0.66
102 0.71
103 0.72
104 0.72
105 0.72
106 0.79
107 0.8
108 0.87
109 0.9
110 0.86
111 0.88
112 0.89
113 0.88
114 0.87
115 0.84
116 0.83
117 0.8
118 0.78
119 0.71
120 0.63
121 0.54
122 0.46
123 0.4
124 0.31
125 0.32
126 0.3
127 0.28
128 0.31
129 0.32
130 0.38
131 0.44
132 0.46
133 0.49
134 0.5
135 0.51
136 0.49
137 0.51
138 0.46
139 0.43
140 0.42
141 0.42
142 0.46
143 0.52
144 0.53
145 0.57
146 0.61
147 0.67
148 0.72
149 0.67
150 0.62
151 0.58
152 0.58
153 0.52
154 0.47
155 0.38
156 0.28
157 0.23
158 0.22
159 0.15
160 0.11
161 0.09
162 0.07
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.08
168 0.11
169 0.11
170 0.15
171 0.16
172 0.23
173 0.25
174 0.32
175 0.35
176 0.42
177 0.47
178 0.5
179 0.55
180 0.49
181 0.56
182 0.57
183 0.55
184 0.48
185 0.44
186 0.46
187 0.41
188 0.42
189 0.37
190 0.35
191 0.33
192 0.32
193 0.31
194 0.26
195 0.28
196 0.27
197 0.29
198 0.32
199 0.39
200 0.41
201 0.42
202 0.47
203 0.49
204 0.49
205 0.46
206 0.41
207 0.35
208 0.34
209 0.38
210 0.36
211 0.33
212 0.33
213 0.31
214 0.29
215 0.26
216 0.23
217 0.18
218 0.12
219 0.09
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.12
230 0.11
231 0.13
232 0.13
233 0.12
234 0.17
235 0.23
236 0.24
237 0.25
238 0.3
239 0.3
240 0.3
241 0.35
242 0.3
243 0.26
244 0.28
245 0.26
246 0.22
247 0.21
248 0.21
249 0.15
250 0.15
251 0.14
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.11
259 0.12
260 0.16
261 0.16
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.14
266 0.12
267 0.1
268 0.05
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.1
275 0.1
276 0.11
277 0.12
278 0.11
279 0.11
280 0.14
281 0.18
282 0.18
283 0.19
284 0.18
285 0.19
286 0.19
287 0.2
288 0.18
289 0.15
290 0.17
291 0.18
292 0.18
293 0.17
294 0.16
295 0.14
296 0.13
297 0.12
298 0.1
299 0.1
300 0.12
301 0.12
302 0.14
303 0.16
304 0.19
305 0.2
306 0.19
307 0.2
308 0.16
309 0.15
310 0.14
311 0.12
312 0.11
313 0.13
314 0.13
315 0.14
316 0.15
317 0.19
318 0.19
319 0.19
320 0.19
321 0.23
322 0.22
323 0.21
324 0.21
325 0.19
326 0.19
327 0.18
328 0.16
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.09
333 0.09
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.06
338 0.06
339 0.07
340 0.06
341 0.04
342 0.04
343 0.05
344 0.05
345 0.06
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.09
353 0.08
354 0.1
355 0.14
356 0.18
357 0.25
358 0.28
359 0.28
360 0.29
361 0.29
362 0.27
363 0.29
364 0.25
365 0.18
366 0.14
367 0.14
368 0.13
369 0.12
370 0.11
371 0.06
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.05
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.1
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.09
391 0.09
392 0.1
393 0.14
394 0.17
395 0.2
396 0.26
397 0.28
398 0.32
399 0.37
400 0.39
401 0.44
402 0.48
403 0.51
404 0.52
405 0.61
406 0.63
407 0.66
408 0.67
409 0.6
410 0.54
411 0.51
412 0.44
413 0.35
414 0.31
415 0.25
416 0.27
417 0.31
418 0.31
419 0.32
420 0.32
421 0.3
422 0.32
423 0.38
424 0.33
425 0.27
426 0.23
427 0.21
428 0.2
429 0.2
430 0.18
431 0.13
432 0.17
433 0.19
434 0.2
435 0.2
436 0.19
437 0.2
438 0.18
439 0.16
440 0.17
441 0.12
442 0.13
443 0.13
444 0.12
445 0.12
446 0.12
447 0.14
448 0.12
449 0.16
450 0.21
451 0.24
452 0.25
453 0.27
454 0.32
455 0.32
456 0.32
457 0.31
458 0.3
459 0.31
460 0.33
461 0.35
462 0.31
463 0.29
464 0.27
465 0.24
466 0.19
467 0.16
468 0.15
469 0.14
470 0.13
471 0.12
472 0.12
473 0.12
474 0.16
475 0.19
476 0.19
477 0.16
478 0.18
479 0.22
480 0.23
481 0.24
482 0.23
483 0.2
484 0.18
485 0.17
486 0.17
487 0.14
488 0.16
489 0.14
490 0.11
491 0.13
492 0.14
493 0.13
494 0.14
495 0.14
496 0.11
497 0.14
498 0.14
499 0.12
500 0.14
501 0.15
502 0.14
503 0.15
504 0.19
505 0.19
506 0.21
507 0.25
508 0.27
509 0.26
510 0.27
511 0.27
512 0.25
513 0.24
514 0.22
515 0.17
516 0.13
517 0.12
518 0.12
519 0.11
520 0.08
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.05
525 0.06
526 0.08
527 0.13
528 0.18
529 0.2
530 0.26
531 0.34
532 0.4
533 0.41
534 0.43
535 0.46
536 0.44
537 0.48
538 0.51
539 0.51
540 0.48
541 0.49
542 0.5
543 0.47
544 0.46
545 0.48
546 0.45
547 0.43
548 0.43
549 0.46
550 0.43
551 0.38
552 0.38
553 0.36
554 0.3
555 0.23
556 0.19
557 0.15
558 0.17
559 0.19
560 0.17
561 0.14
562 0.14
563 0.15
564 0.16
565 0.14
566 0.1
567 0.09
568 0.11
569 0.12
570 0.14
571 0.16
572 0.15
573 0.16
574 0.15
575 0.16
576 0.14
577 0.12
578 0.11
579 0.09
580 0.09
581 0.09
582 0.11
583 0.11
584 0.11
585 0.11
586 0.12
587 0.21
588 0.23
589 0.25
590 0.3
591 0.36
592 0.38
593 0.41
594 0.45
595 0.42
596 0.41
597 0.46