Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1IRX5

Protein Details
Accession A0A4V1IRX5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-70DEYKLRKRKTFEDVIRRNRMNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
619-626KAVKKRRR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.833, cyto 7, cyto_mito 4.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
Amino Acid Sequences MSKVLLASVKNKNPAAVQITAEQILREASERQDADAAVPTQKITDREELDEYKLRKRKTFEDVIRRNRMNIGAWLKYAAWEESQEELDRARSVFERSLDIDHRNQTLWLKYAEMEMKHRNVNRARNIFDRAVTMLPRVDAFWYKYAYMEELIENVAGARQVFERWLKWEPAEDAWAAYVKMEKRYHETDRAREILRRFVGVHPQPKNWLKWAKFEESVGKPENARAIYEECIDTLGDDFLDQNVFISFAKFETRLKEIDRARIIYKYALDKYSKGKADNLYNVYSQFEKQYGGKEGIEDVIIGKRRVKYEEELAANPKNYDVWFDYARLEESGGDAEKVREVYERAISQVPPIAEKRYWRRYIYLWIFYAVWEETEAKDADRAKQVYTQLLQLIPHKSFTFAKAWLLYARFLLRQMDPTTARRVLFTALHTCPKERLFKGYIELEIQLREFDRVRALYERYLQWNAANCAAWIKYAELESFVGDIERARGIFEIAVGQPVLDMPEVLWKAYIDFEVGTATGHKDPDWERARELYERLLQRTEHVKVWISFAKFESTALDNLPPPGPIERARAVLTRAYSQLKKKESKEERVVLLEAWKELERALGTDANLAAVVEKMPKAVKKRRRVEGGEGWEEYFDYIFPDDETDRPNFKLLAMAHQWKMKMAEMAKKKDEGKDEEEEEEEEEEGRGKRDKGKGPASDRDADDDDDEEENGAASDDMDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.44
3 0.37
4 0.33
5 0.29
6 0.31
7 0.31
8 0.3
9 0.23
10 0.18
11 0.16
12 0.15
13 0.14
14 0.13
15 0.14
16 0.22
17 0.22
18 0.23
19 0.25
20 0.25
21 0.24
22 0.28
23 0.27
24 0.21
25 0.21
26 0.2
27 0.2
28 0.23
29 0.24
30 0.23
31 0.29
32 0.3
33 0.34
34 0.39
35 0.4
36 0.42
37 0.46
38 0.44
39 0.46
40 0.5
41 0.5
42 0.51
43 0.54
44 0.56
45 0.57
46 0.65
47 0.66
48 0.71
49 0.77
50 0.81
51 0.85
52 0.79
53 0.71
54 0.65
55 0.58
56 0.49
57 0.47
58 0.44
59 0.36
60 0.36
61 0.35
62 0.31
63 0.3
64 0.29
65 0.22
66 0.17
67 0.16
68 0.18
69 0.18
70 0.21
71 0.19
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.18
76 0.16
77 0.16
78 0.15
79 0.18
80 0.22
81 0.22
82 0.24
83 0.24
84 0.3
85 0.32
86 0.34
87 0.36
88 0.36
89 0.36
90 0.33
91 0.33
92 0.32
93 0.31
94 0.3
95 0.25
96 0.23
97 0.21
98 0.26
99 0.28
100 0.27
101 0.3
102 0.33
103 0.36
104 0.42
105 0.44
106 0.48
107 0.51
108 0.57
109 0.61
110 0.61
111 0.62
112 0.6
113 0.63
114 0.57
115 0.5
116 0.43
117 0.35
118 0.31
119 0.27
120 0.24
121 0.19
122 0.17
123 0.16
124 0.15
125 0.15
126 0.16
127 0.18
128 0.2
129 0.21
130 0.21
131 0.22
132 0.22
133 0.21
134 0.18
135 0.16
136 0.13
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.09
141 0.08
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.11
149 0.14
150 0.15
151 0.18
152 0.23
153 0.24
154 0.24
155 0.27
156 0.26
157 0.26
158 0.26
159 0.22
160 0.18
161 0.17
162 0.17
163 0.13
164 0.11
165 0.13
166 0.13
167 0.21
168 0.23
169 0.24
170 0.3
171 0.36
172 0.42
173 0.48
174 0.52
175 0.51
176 0.55
177 0.57
178 0.53
179 0.51
180 0.48
181 0.46
182 0.41
183 0.36
184 0.31
185 0.3
186 0.38
187 0.39
188 0.46
189 0.42
190 0.42
191 0.48
192 0.51
193 0.51
194 0.49
195 0.52
196 0.45
197 0.5
198 0.53
199 0.51
200 0.47
201 0.47
202 0.46
203 0.4
204 0.44
205 0.37
206 0.33
207 0.28
208 0.28
209 0.31
210 0.24
211 0.21
212 0.18
213 0.18
214 0.18
215 0.19
216 0.18
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.1
221 0.08
222 0.07
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.09
237 0.09
238 0.11
239 0.13
240 0.16
241 0.17
242 0.2
243 0.27
244 0.27
245 0.34
246 0.35
247 0.35
248 0.34
249 0.34
250 0.32
251 0.27
252 0.27
253 0.24
254 0.24
255 0.25
256 0.25
257 0.25
258 0.29
259 0.34
260 0.34
261 0.3
262 0.32
263 0.32
264 0.37
265 0.4
266 0.39
267 0.34
268 0.32
269 0.31
270 0.28
271 0.25
272 0.2
273 0.15
274 0.12
275 0.11
276 0.12
277 0.15
278 0.16
279 0.18
280 0.17
281 0.16
282 0.16
283 0.15
284 0.14
285 0.1
286 0.08
287 0.09
288 0.12
289 0.12
290 0.15
291 0.17
292 0.19
293 0.21
294 0.24
295 0.23
296 0.26
297 0.32
298 0.31
299 0.3
300 0.32
301 0.32
302 0.29
303 0.26
304 0.21
305 0.16
306 0.13
307 0.14
308 0.12
309 0.13
310 0.13
311 0.14
312 0.15
313 0.15
314 0.16
315 0.13
316 0.11
317 0.08
318 0.07
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.12
331 0.12
332 0.13
333 0.15
334 0.14
335 0.14
336 0.15
337 0.13
338 0.13
339 0.14
340 0.14
341 0.14
342 0.19
343 0.27
344 0.33
345 0.38
346 0.37
347 0.38
348 0.37
349 0.46
350 0.46
351 0.42
352 0.33
353 0.3
354 0.29
355 0.26
356 0.25
357 0.16
358 0.11
359 0.07
360 0.08
361 0.07
362 0.09
363 0.09
364 0.08
365 0.11
366 0.12
367 0.13
368 0.18
369 0.19
370 0.17
371 0.21
372 0.22
373 0.22
374 0.22
375 0.21
376 0.17
377 0.17
378 0.17
379 0.16
380 0.18
381 0.16
382 0.16
383 0.15
384 0.16
385 0.16
386 0.18
387 0.17
388 0.15
389 0.17
390 0.16
391 0.17
392 0.16
393 0.17
394 0.14
395 0.13
396 0.13
397 0.12
398 0.12
399 0.14
400 0.12
401 0.15
402 0.16
403 0.19
404 0.2
405 0.22
406 0.26
407 0.27
408 0.27
409 0.23
410 0.22
411 0.2
412 0.19
413 0.19
414 0.2
415 0.19
416 0.25
417 0.25
418 0.25
419 0.26
420 0.28
421 0.33
422 0.28
423 0.32
424 0.29
425 0.29
426 0.32
427 0.31
428 0.28
429 0.23
430 0.23
431 0.17
432 0.15
433 0.14
434 0.11
435 0.09
436 0.1
437 0.1
438 0.09
439 0.12
440 0.12
441 0.14
442 0.17
443 0.18
444 0.19
445 0.22
446 0.24
447 0.25
448 0.26
449 0.25
450 0.24
451 0.27
452 0.25
453 0.24
454 0.21
455 0.17
456 0.17
457 0.17
458 0.15
459 0.11
460 0.1
461 0.09
462 0.1
463 0.1
464 0.09
465 0.1
466 0.1
467 0.09
468 0.08
469 0.07
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.07
474 0.06
475 0.06
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.08
481 0.07
482 0.08
483 0.08
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.05
489 0.05
490 0.04
491 0.11
492 0.11
493 0.11
494 0.12
495 0.11
496 0.11
497 0.12
498 0.12
499 0.07
500 0.06
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.06
505 0.06
506 0.09
507 0.1
508 0.1
509 0.1
510 0.14
511 0.15
512 0.25
513 0.3
514 0.29
515 0.3
516 0.32
517 0.36
518 0.34
519 0.34
520 0.29
521 0.31
522 0.32
523 0.33
524 0.33
525 0.3
526 0.31
527 0.36
528 0.34
529 0.29
530 0.28
531 0.3
532 0.28
533 0.33
534 0.34
535 0.29
536 0.28
537 0.26
538 0.27
539 0.23
540 0.23
541 0.21
542 0.18
543 0.18
544 0.17
545 0.18
546 0.15
547 0.17
548 0.17
549 0.15
550 0.14
551 0.15
552 0.17
553 0.17
554 0.22
555 0.22
556 0.24
557 0.26
558 0.27
559 0.27
560 0.27
561 0.26
562 0.24
563 0.25
564 0.29
565 0.32
566 0.37
567 0.44
568 0.49
569 0.55
570 0.56
571 0.64
572 0.67
573 0.71
574 0.74
575 0.71
576 0.66
577 0.62
578 0.58
579 0.48
580 0.42
581 0.34
582 0.24
583 0.21
584 0.18
585 0.15
586 0.14
587 0.16
588 0.12
589 0.12
590 0.15
591 0.14
592 0.14
593 0.16
594 0.16
595 0.14
596 0.13
597 0.12
598 0.09
599 0.07
600 0.08
601 0.08
602 0.08
603 0.1
604 0.13
605 0.18
606 0.28
607 0.38
608 0.47
609 0.55
610 0.65
611 0.72
612 0.79
613 0.8
614 0.8
615 0.79
616 0.78
617 0.73
618 0.65
619 0.56
620 0.46
621 0.4
622 0.31
623 0.21
624 0.13
625 0.09
626 0.08
627 0.08
628 0.08
629 0.11
630 0.13
631 0.14
632 0.18
633 0.21
634 0.23
635 0.24
636 0.26
637 0.23
638 0.22
639 0.26
640 0.24
641 0.28
642 0.32
643 0.37
644 0.38
645 0.41
646 0.41
647 0.38
648 0.39
649 0.33
650 0.32
651 0.31
652 0.36
653 0.42
654 0.5
655 0.51
656 0.55
657 0.56
658 0.56
659 0.59
660 0.57
661 0.53
662 0.53
663 0.52
664 0.48
665 0.46
666 0.41
667 0.35
668 0.29
669 0.23
670 0.16
671 0.13
672 0.15
673 0.14
674 0.17
675 0.2
676 0.22
677 0.3
678 0.38
679 0.46
680 0.52
681 0.6
682 0.66
683 0.69
684 0.76
685 0.74
686 0.72
687 0.65
688 0.61
689 0.55
690 0.47
691 0.41
692 0.33
693 0.29
694 0.23
695 0.22
696 0.16
697 0.13
698 0.11
699 0.1
700 0.09
701 0.07