FuNGI

A0A4P9W996

Protein Details

Accession

A0A4P9W996

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
806-828	VKETQIRLRSRYKPKGEQASFKD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 15, nucl 8, cyto_mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019321 Nucleoporin_Nup88 IPR037700 NUP88/NUP82 IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF10168 Nup88

Amino Acid Sequences

MHAEDADPSETWLQALSEHPISLPPTVPALPPPPPPAPPLPRSLQDPDATASTIQDPTLPDISFIAPDRSSHLLDVSGAQLDSDAPPTSACPAALERELSRDAVIGHRLVAAREGDLFICINAGMGNDVGAVSLTPVIRGLNLRAWKRAVTDCDFDVEKAVERIDYEEFATPSIDYRVRQMVVNPSGKLMAVVGDKAVTVICLPHSVRFEKKGNPRGVVLKTLSVGSIYHSSEFARIVKVLWHPLSYGDSHLAVLSSDGYLRMYNVPIDCEEPERVFHFFDPALCETGGFPTSRRNRRGMFDADKAEKETISFCFGSINGGWEMFTAYGLSQNGDIYALCPVMPNRSRLTNANIAALKAANDANWQRSDPNNADLQKQFFWRSRFIEDLINEAKESRSFPQTVSEPAGSSILSVPRSIARYVVVPSGPYYILPDPKDQAAWGDASDIVYVQGAPVNAIVVAYQKGMLQVCVEVDLPQPRWEFQGARQSSGTSPNLPSVTVLEYIDLGLSGPTHDKNEDEDDAALLGSNPVMLILDGKHPDTFYCYHERGVHRVNLGAALASLEDVAGGKGDIEGENLSQVSWMVNTRMLESSEPSPVVGFTIISELFLGYSYVLLTSSLQLHGAVLPIRLPLVDAVLGTAPGASPPRVTKPPNSGPFGYIPVLREPAFGIPDQLSRLQPKVLLPPGGAGKRFYPEFIDEESLLVFQRKVHDLSADWTKLFKVGTQISDRAVLQKQEQMNQTGTLASAEGHLKKRLAPAIARLKERAATIHEQHARICKKADVVLQILLDRAQPMLSAAEIRCLDEVKETQIRLRSRYKPKGEQASFKDGFQLKEQKKHVLADLAKALGNTPAQAPVVSAAAPTLGTAQTQRIKEAIRLETDLLAAAREQVRRIAEMAEAVEAKRRLEEEGSDAGKRVVGAAGVLAHR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.13
3	0.16
4	0.16
5	0.16
6	0.17
7	0.19
8	0.21
9	0.21
10	0.2
11	0.16
12	0.18
13	0.2
14	0.2
15	0.22
16	0.25
17	0.28
18	0.32
19	0.37
20	0.37
21	0.38
22	0.42
23	0.47
24	0.5
25	0.49
26	0.5
27	0.49
28	0.49
29	0.53
30	0.54
31	0.5
32	0.44
33	0.43
34	0.39
35	0.35
36	0.33
37	0.27
38	0.23
39	0.2
40	0.19
41	0.16
42	0.16
43	0.16
44	0.19
45	0.23
46	0.21
47	0.19
48	0.2
49	0.21
50	0.21
51	0.22
52	0.21
53	0.17
54	0.18
55	0.22
56	0.24
57	0.24
58	0.22
59	0.21
60	0.18
61	0.18
62	0.19
63	0.16
64	0.14
65	0.12
66	0.11
67	0.1
68	0.11
69	0.11
70	0.12
71	0.11
72	0.1
73	0.1
74	0.11
75	0.14
76	0.14
77	0.13
78	0.13
79	0.14
80	0.18
81	0.2
82	0.22
83	0.2
84	0.24
85	0.25
86	0.23
87	0.21
88	0.18
89	0.17
90	0.18
91	0.2
92	0.16
93	0.15
94	0.18
95	0.18
96	0.17
97	0.2
98	0.16
99	0.14
100	0.15
101	0.15
102	0.12
103	0.13
104	0.13
105	0.09
106	0.09
107	0.08
108	0.07
109	0.06
110	0.06
111	0.06
112	0.05
113	0.05
114	0.05
115	0.05
116	0.05
117	0.05
118	0.04
119	0.04
120	0.07
121	0.07
122	0.07
123	0.07
124	0.08
125	0.09
126	0.11
127	0.13
128	0.18
129	0.25
130	0.28
131	0.32
132	0.34
133	0.34
134	0.36
135	0.4
136	0.39
137	0.37
138	0.38
139	0.34
140	0.36
141	0.35
142	0.31
143	0.28
144	0.22
145	0.18
146	0.16
147	0.16
148	0.12
149	0.12
150	0.14
151	0.13
152	0.13
153	0.13
154	0.16
155	0.15
156	0.16
157	0.16
158	0.13
159	0.13
160	0.16
161	0.17
162	0.14
163	0.18
164	0.22
165	0.23
166	0.24
167	0.26
168	0.31
169	0.36
170	0.4
171	0.36
172	0.32
173	0.32
174	0.3
175	0.27
176	0.18
177	0.13
178	0.1
179	0.1
180	0.09
181	0.09
182	0.09
183	0.09
184	0.08
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.06
189	0.1
190	0.11
191	0.15
192	0.19
193	0.23
194	0.27
195	0.32
196	0.36
197	0.41
198	0.5
199	0.56
200	0.57
201	0.56
202	0.55
203	0.55
204	0.53
205	0.5
206	0.41
207	0.33
208	0.29
209	0.27
210	0.23
211	0.17
212	0.15
213	0.12
214	0.14
215	0.13
216	0.13
217	0.14
218	0.14
219	0.15
220	0.17
221	0.15
222	0.13
223	0.12
224	0.12
225	0.15
226	0.18
227	0.23
228	0.22
229	0.22
230	0.2
231	0.22
232	0.23
233	0.2
234	0.19
235	0.14
236	0.13
237	0.13
238	0.13
239	0.11
240	0.09
241	0.08
242	0.07
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.06
247	0.06
248	0.07
249	0.09
250	0.09
251	0.11
252	0.11
253	0.13
254	0.13
255	0.15
256	0.14
257	0.16
258	0.17
259	0.15
260	0.17
261	0.17
262	0.17
263	0.17
264	0.16
265	0.16
266	0.14
267	0.15
268	0.17
269	0.17
270	0.18
271	0.16
272	0.16
273	0.14
274	0.15
275	0.16
276	0.11
277	0.1
278	0.18
279	0.27
280	0.36
281	0.39
282	0.43
283	0.45
284	0.49
285	0.55
286	0.54
287	0.5
288	0.48
289	0.5
290	0.47
291	0.45
292	0.43
293	0.37
294	0.29
295	0.23
296	0.19
297	0.14
298	0.15
299	0.14
300	0.12
301	0.12
302	0.12
303	0.14
304	0.13
305	0.14
306	0.1
307	0.1
308	0.1
309	0.09
310	0.1
311	0.07
312	0.07
313	0.05
314	0.05
315	0.07
316	0.07
317	0.08
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.05
324	0.06
325	0.06
326	0.05
327	0.06
328	0.07
329	0.14
330	0.16
331	0.19
332	0.2
333	0.23
334	0.25
335	0.27
336	0.32
337	0.31
338	0.29
339	0.31
340	0.3
341	0.27
342	0.25
343	0.23
344	0.17
345	0.12
346	0.11
347	0.07
348	0.1
349	0.11
350	0.14
351	0.15
352	0.15
353	0.16
354	0.17
355	0.23
356	0.21
357	0.22
358	0.25
359	0.25
360	0.28
361	0.28
362	0.29
363	0.25
364	0.26
365	0.27
366	0.26
367	0.28
368	0.29
369	0.3
370	0.31
371	0.3
372	0.29
373	0.31
374	0.26
375	0.28
376	0.25
377	0.22
378	0.19
379	0.18
380	0.17
381	0.13
382	0.14
383	0.12
384	0.14
385	0.14
386	0.15
387	0.19
388	0.2
389	0.21
390	0.22
391	0.2
392	0.17
393	0.17
394	0.17
395	0.12
396	0.11
397	0.1
398	0.09
399	0.09
400	0.09
401	0.09
402	0.11
403	0.13
404	0.12
405	0.12
406	0.1
407	0.11
408	0.12
409	0.13
410	0.11
411	0.1
412	0.1
413	0.12
414	0.11
415	0.09
416	0.11
417	0.11
418	0.15
419	0.16
420	0.17
421	0.16
422	0.17
423	0.17
424	0.14
425	0.13
426	0.1
427	0.09
428	0.07
429	0.07
430	0.06
431	0.07
432	0.06
433	0.06
434	0.05
435	0.04
436	0.04
437	0.03
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.05
450	0.05
451	0.06
452	0.07
453	0.07
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.07
461	0.1
462	0.11
463	0.14
464	0.14
465	0.14
466	0.15
467	0.16
468	0.16
469	0.17
470	0.26
471	0.24
472	0.25
473	0.25
474	0.25
475	0.24
476	0.28
477	0.25
478	0.17
479	0.17
480	0.17
481	0.17
482	0.16
483	0.16
484	0.11
485	0.12
486	0.11
487	0.1
488	0.08
489	0.08
490	0.07
491	0.07
492	0.06
493	0.04
494	0.03
495	0.03
496	0.03
497	0.05
498	0.06
499	0.07
500	0.07
501	0.08
502	0.1
503	0.14
504	0.14
505	0.13
506	0.13
507	0.12
508	0.12
509	0.11
510	0.08
511	0.05
512	0.04
513	0.03
514	0.03
515	0.02
516	0.02
517	0.02
518	0.02
519	0.03
520	0.04
521	0.07
522	0.08
523	0.09
524	0.1
525	0.1
526	0.1
527	0.13
528	0.14
529	0.14
530	0.2
531	0.2
532	0.22
533	0.28
534	0.3
535	0.31
536	0.34
537	0.33
538	0.27
539	0.27
540	0.25
541	0.2
542	0.18
543	0.13
544	0.08
545	0.05
546	0.05
547	0.04
548	0.04
549	0.03
550	0.03
551	0.03
552	0.03
553	0.03
554	0.03
555	0.03
556	0.03
557	0.04
558	0.04
559	0.05
560	0.05
561	0.05
562	0.06
563	0.06
564	0.06
565	0.05
566	0.05
567	0.04
568	0.05
569	0.06
570	0.06
571	0.09
572	0.09
573	0.11
574	0.12
575	0.13
576	0.13
577	0.14
578	0.15
579	0.15
580	0.14
581	0.13
582	0.11
583	0.1
584	0.1
585	0.08
586	0.06
587	0.05
588	0.07
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.06
593	0.06
594	0.06
595	0.06
596	0.04
597	0.04
598	0.04
599	0.04
600	0.04
601	0.04
602	0.05
603	0.06
604	0.07
605	0.07
606	0.07
607	0.07
608	0.07
609	0.07
610	0.08
611	0.08
612	0.07
613	0.07
614	0.07
615	0.07
616	0.07
617	0.07
618	0.05
619	0.06
620	0.06
621	0.05
622	0.06
623	0.06
624	0.06
625	0.05
626	0.05
627	0.04
628	0.05
629	0.07
630	0.06
631	0.08
632	0.1
633	0.16
634	0.22
635	0.25
636	0.3
637	0.38
638	0.47
639	0.52
640	0.54
641	0.5
642	0.46
643	0.45
644	0.43
645	0.35
646	0.27
647	0.23
648	0.2
649	0.22
650	0.19
651	0.18
652	0.15
653	0.16
654	0.16
655	0.14
656	0.14
657	0.13
658	0.14
659	0.15
660	0.17
661	0.17
662	0.19
663	0.2
664	0.19
665	0.2
666	0.2
667	0.25
668	0.27
669	0.26
670	0.23
671	0.25
672	0.3
673	0.31
674	0.3
675	0.24
676	0.22
677	0.24
678	0.25
679	0.22
680	0.19
681	0.19
682	0.21
683	0.22
684	0.24
685	0.2
686	0.2
687	0.19
688	0.17
689	0.14
690	0.13
691	0.1
692	0.09
693	0.13
694	0.15
695	0.17
696	0.17
697	0.18
698	0.18
699	0.22
700	0.29
701	0.26
702	0.24
703	0.23
704	0.22
705	0.22
706	0.21
707	0.18
708	0.17
709	0.19
710	0.24
711	0.28
712	0.29
713	0.28
714	0.31
715	0.29
716	0.27
717	0.27
718	0.24
719	0.22
720	0.26
721	0.28
722	0.31
723	0.34
724	0.32
725	0.31
726	0.3
727	0.28
728	0.22
729	0.2
730	0.14
731	0.11
732	0.08
733	0.09
734	0.12
735	0.16
736	0.19
737	0.22
738	0.22
739	0.25
740	0.3
741	0.32
742	0.33
743	0.3
744	0.36
745	0.44
746	0.49
747	0.5
748	0.46
749	0.43
750	0.41
751	0.4
752	0.33
753	0.28
754	0.29
755	0.29
756	0.38
757	0.41
758	0.4
759	0.42
760	0.48
761	0.45
762	0.41
763	0.4
764	0.33
765	0.31
766	0.35
767	0.37
768	0.32
769	0.32
770	0.32
771	0.31
772	0.28
773	0.26
774	0.22
775	0.18
776	0.13
777	0.11
778	0.08
779	0.07
780	0.07
781	0.08
782	0.08
783	0.11
784	0.11
785	0.17
786	0.17
787	0.18
788	0.18
789	0.18
790	0.18
791	0.19
792	0.2
793	0.21
794	0.25
795	0.25
796	0.29
797	0.35
798	0.38
799	0.4
800	0.48
801	0.51
802	0.57
803	0.67
804	0.72
805	0.74
806	0.8
807	0.85
808	0.82
809	0.81
810	0.77
811	0.77
812	0.69
813	0.59
814	0.58
815	0.5
816	0.46
817	0.44
818	0.48
819	0.43
820	0.51
821	0.55
822	0.55
823	0.55
824	0.56
825	0.52
826	0.51
827	0.47
828	0.44
829	0.44
830	0.37
831	0.34
832	0.31
833	0.28
834	0.22
835	0.2
836	0.16
837	0.13
838	0.14
839	0.14
840	0.14
841	0.14
842	0.12
843	0.13
844	0.11
845	0.1
846	0.08
847	0.08
848	0.07
849	0.07
850	0.08
851	0.07
852	0.08
853	0.1
854	0.17
855	0.23
856	0.24
857	0.26
858	0.27
859	0.29
860	0.32
861	0.38
862	0.36
863	0.33
864	0.35
865	0.35
866	0.33
867	0.31
868	0.28
869	0.21
870	0.16
871	0.12
872	0.14
873	0.17
874	0.18
875	0.19
876	0.22
877	0.24
878	0.25
879	0.26
880	0.23
881	0.2
882	0.2
883	0.2
884	0.18
885	0.17
886	0.16
887	0.22
888	0.22
889	0.21
890	0.22
891	0.22
892	0.22
893	0.23
894	0.25
895	0.24
896	0.31
897	0.33
898	0.32
899	0.32
900	0.29
901	0.27
902	0.24
903	0.2
904	0.13
905	0.1
906	0.09
907	0.09

A0A4P9W996

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer