Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A399GC77

Protein Details
Accession A0A399GC77    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-23ADNNPRKRKAEPRERQDGDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-39PRKRKAEPRERQDGDEKRAKGKRNWDMPRRGG
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MSGADNNPRKRKAEPRERQDGDEKRAKGKRNWDMPRRGGIQSRAIKPGDAGIWATCAMKKEAKSVSDLRDLFQEYATTLYGTAESNSTAAEDSSDSEGGDIEAEIKKELADIRKPATKPLFTSLKLDTQCLMFFRTRSPIEPVMFVHKICQDIANGAQPKNLRYVKRLTPITATDKATPQGLEAVAKEVLAPHFHGANQVGKKVSTSSFY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.73
3 0.8
4 0.8
5 0.78
6 0.77
7 0.74
8 0.71
9 0.69
10 0.62
11 0.6
12 0.63
13 0.64
14 0.61
15 0.63
16 0.65
17 0.67
18 0.75
19 0.76
20 0.79
21 0.77
22 0.78
23 0.71
24 0.65
25 0.6
26 0.54
27 0.54
28 0.53
29 0.52
30 0.49
31 0.45
32 0.42
33 0.36
34 0.35
35 0.26
36 0.18
37 0.16
38 0.11
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.11
43 0.12
44 0.13
45 0.16
46 0.17
47 0.21
48 0.25
49 0.25
50 0.29
51 0.32
52 0.33
53 0.37
54 0.37
55 0.32
56 0.31
57 0.32
58 0.28
59 0.23
60 0.19
61 0.11
62 0.12
63 0.12
64 0.09
65 0.07
66 0.06
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.06
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.04
88 0.04
89 0.05
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.05
94 0.06
95 0.09
96 0.11
97 0.13
98 0.15
99 0.18
100 0.23
101 0.24
102 0.29
103 0.31
104 0.29
105 0.28
106 0.31
107 0.34
108 0.29
109 0.33
110 0.29
111 0.31
112 0.3
113 0.29
114 0.24
115 0.19
116 0.19
117 0.17
118 0.17
119 0.12
120 0.12
121 0.14
122 0.19
123 0.19
124 0.21
125 0.25
126 0.28
127 0.27
128 0.28
129 0.28
130 0.29
131 0.29
132 0.27
133 0.24
134 0.21
135 0.21
136 0.2
137 0.2
138 0.13
139 0.14
140 0.16
141 0.21
142 0.22
143 0.21
144 0.24
145 0.24
146 0.24
147 0.31
148 0.35
149 0.3
150 0.3
151 0.37
152 0.42
153 0.5
154 0.51
155 0.45
156 0.44
157 0.47
158 0.5
159 0.48
160 0.44
161 0.38
162 0.38
163 0.37
164 0.34
165 0.29
166 0.23
167 0.2
168 0.17
169 0.16
170 0.14
171 0.16
172 0.14
173 0.14
174 0.13
175 0.12
176 0.13
177 0.13
178 0.15
179 0.13
180 0.15
181 0.15
182 0.19
183 0.2
184 0.26
185 0.27
186 0.29
187 0.29
188 0.28
189 0.29
190 0.29